PubMed

Mortensen B, Murphy C, O'Grady J, Lucey M, Elsafi G, Barry L, Westphal V, Wellejus A, Lukjancenko O, Eklund AC, Nielsen HB, Baker A, Damholt A, van Hylckama Vlieg JET, Shanahan F, Buckley M.

Gastroenterology. 2019 Sep;157(3):637-646.e4. doi: 10.1053/j.gastro.2019.05.008. Epub 2019 May 13.

Taroncher-Oldenburg G, Jones S, Blaser M, Bonneau R, Christey P, Clemente JC, Elinav E, Ghedin E, Huttenhower C, Kelly D, Kyle D, Littman D, Maiti A, Maue A, Olle B, Segal L, van Hylckama Vlieg JET, Wang J.

Nat Biotechnol. 2018 Nov 9;36(11):1037-1042. doi: 10.1038/nbt.4287. No abstract available.

Kleerebezem M, Binda S, Bron PA, Gross G, Hill C, van Hylckama Vlieg JE, Lebeer S, Satokari R, Ouwehand AC.

Curr Opin Biotechnol. 2019 Apr;56:55-60. doi: 10.1016/j.copbio.2018.09.007. Epub 2018 Oct 5. Review.

Reid G, Kort R, Alvarez S, Bourdet-Sicard R, Benoit V, Cunningham M, Saulnier DM, van Hylckama Vlieg JET, Verstraelen H, Sybesma W.

Benef Microbes. 2018 Sep 18;9(5):707-715. doi: 10.3920/BM2018.0015. Epub 2018 May 25. Review.

Crouzet L, Derrien M, Cherbuy C, Plancade S, Foulon M, Chalin B, van Hylckama Vlieg JET, Grompone G, Rigottier-Gois L, Serror P.

Sci Rep. 2018 Mar 23;8(1):5098. doi: 10.1038/s41598-018-23437-9.

Tillisch K, Mayer EA, Gupta A, Gill Z, Brazeilles R, Le Nevé B, van Hylckama Vlieg JET, Guyonnet D, Derrien M, Labus JS.

Psychosom Med. 2017 Oct;79(8):905-913. doi: 10.1097/PSY.0000000000000493.

Zhang C, Derrien M, Levenez F, Brazeilles R, Ballal SA, Kim J, Degivry MC, Quéré G, Garault P, van Hylckama Vlieg JE, Garrett WS, Doré J, Veiga P.

ISME J. 2016 Sep;10(9):2235-45. doi: 10.1038/ismej.2016.13. Epub 2016 Mar 8.

Jacouton E, Mach N, Cadiou J, Lapaque N, Clément K, Doré J, van Hylckama Vlieg JE, Smokvina T, Blottière HM.

PLoS One. 2015 Oct 6;10(10):e0138880. doi: 10.1371/journal.pone.0138880. eCollection 2015.

Derrien M, van Hylckama Vlieg JE.

Trends Microbiol. 2015 Jun;23(6):354-66. doi: 10.1016/j.tim.2015.03.002. Epub 2015 Apr 1. Review.

Laval L, Martin R, Natividad JN, Chain F, Miquel S, Desclée de Maredsous C, Capronnier S, Sokol H, Verdu EF, van Hylckama Vlieg JE, Bermúdez-Humarán LG, Smokvina T, Langella P.

Gut Microbes. 2015;6(1):1-9. doi: 10.4161/19490976.2014.990784. Epub 2015 Jan 14.

Veiga P, Pons N, Agrawal A, Oozeer R, Guyonnet D, Brazeilles R, Faurie JM, van Hylckama Vlieg JE, Houghton LA, Whorwell PJ, Ehrlich SD, Kennedy SP.

Sci Rep. 2014 Sep 11;4:6328. doi: 10.1038/srep06328.

Wang J, Tang H, Zhang C, Zhao Y, Derrien M, Rocher E, van-Hylckama Vlieg JE, Strissel K, Zhao L, Obin M, Shen J.

ISME J. 2015 Jan;9(1):1-15. doi: 10.1038/ismej.2014.99. Epub 2014 Jun 17.

O' Connell Motherway M, Watson D, Bottacini F, Clark TA, Roberts RJ, Korlach J, Garault P, Chervaux C, van Hylckama Vlieg JE, Smokvina T, van Sinderen D.

PLoS One. 2014 Apr 17;9(4):e94875. doi: 10.1371/journal.pone.0094875. eCollection 2014.

Rooks MG, Veiga P, Wardwell-Scott LH, Tickle T, Segata N, Michaud M, Gallini CA, Beal C, van Hylckama-Vlieg JE, Ballal SA, Morgan XC, Glickman JN, Gevers D, Huttenhower C, Garrett WS.

ISME J. 2014 Jul;8(7):1403-17. doi: 10.1038/ismej.2014.3. Epub 2014 Feb 6.

Smokvina T, Wels M, Polka J, Chervaux C, Brisse S, Boekhorst J, van Hylckama Vlieg JE, Siezen RJ.

PLoS One. 2013 Jul 19;8(7):e68731. doi: 10.1371/journal.pone.0068731. Print 2013.

Vrieze A, Van Nood E, Holleman F, Salojärvi J, Kootte RS, Bartelsman JF, Dallinga-Thie GM, Ackermans MT, Serlie MJ, Oozeer R, Derrien M, Druesne A, Van Hylckama Vlieg JE, Bloks VW, Groen AK, Heilig HG, Zoetendal EG, Stroes ES, de Vos WM, Hoekstra JB, Nieuwdorp M.

Gastroenterology. 2012 Oct;143(4):913-6.e7. doi: 10.1053/j.gastro.2012.06.031. Epub 2012 Jun 20. Erratum in: Gastroenterology. 2013 Jan;144(1):250.

Bachmann H, Starrenburg MJ, Molenaar D, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

Genome Res. 2012 Jan;22(1):115-24. doi: 10.1101/gr.121285.111. Epub 2011 Nov 11.

Siezen RJ, van Hylckama Vlieg JE.

Microb Cell Fact. 2011 Aug 30;10 Suppl 1:S3. doi: 10.1186/1475-2859-10-S1-S3. Epub 2011 Aug 30. Review.

Chervaux C, Grimaldi C, Bolotin A, Quinquis B, Legrain-Raspaud S, van Hylckama Vlieg JE, Denariaz G, Smokvina T.

J Bacteriol. 2011 Oct;193(19):5560-1. doi: 10.1128/JB.05716-11.

de Bok FA, Janssen PW, Bayjanov JR, Sieuwerts S, Lommen A, van Hylckama Vlieg JE, Molenaar D.

Appl Environ Microbiol. 2011 Sep;77(17):6233-9. doi: 10.1128/AEM.00352-11. Epub 2011 Jul 8.

Kütahya OE, Starrenburg MJ, Rademaker JL, Klaassen CH, van Hylckama Vlieg JE, Smid EJ, Kleerebezem M.

Appl Environ Microbiol. 2011 Aug;77(15):5192-8. doi: 10.1128/AEM.00518-11. Epub 2011 Jun 10.

Siezen RJ, Bayjanov JR, Felis GE, van der Sijde MR, Starrenburg M, Molenaar D, Wels M, van Hijum SA, van Hylckama Vlieg JE.

Microb Biotechnol. 2011 May;4(3):383-402. doi: 10.1111/j.1751-7915.2011.00247.x. Epub 2011 Feb 21.

van Hylckama Vlieg JE, Veiga P, Zhang C, Derrien M, Zhao L.

Curr Opin Biotechnol. 2011 Apr;22(2):211-9. doi: 10.1016/j.copbio.2010.12.004. Epub 2011 Jan 19. Review.

Bachmann H, Molenaar D, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

ISME J. 2011 May;5(5):929-32. doi: 10.1038/ismej.2010.179. Epub 2010 Dec 9.

Machielsen R, Siezen RJ, van Hijum SA, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2011 Jan;77(2):555-63. doi: 10.1128/AEM.02283-10. Epub 2010 Nov 29.

Veiga P, Gallini CA, Beal C, Michaud M, Delaney ML, DuBois A, Khlebnikov A, van Hylckama Vlieg JE, Punit S, Glickman JN, Onderdonk A, Glimcher LH, Garrett WS.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Oct 19;107(42):18132-7. doi: 10.1073/pnas.1011737107. Epub 2010 Oct 4. Erratum in: Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Dec 14;107(50):21943.

Sieuwerts S, Molenaar D, van Hijum SA, Beerthuyzen M, Stevens MJ, Janssen PW, Ingham CJ, de Bok FA, de Vos WM, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2010 Dec;76(23):7775-84. doi: 10.1128/AEM.01122-10. Epub 2010 Oct 1.

Siezen RJ, Bayjanov J, Renckens B, Wels M, van Hijum SA, Molenaar D, van Hylckama Vlieg JE.

J Bacteriol. 2010 May;192(10):2649-50. doi: 10.1128/JB.00276-10. Epub 2010 Mar 26.

Bachmann H, de Wilt L, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

Environ Microbiol. 2010 May;12(5):1260-70. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02168.x. Epub 2010 Feb 18.

Machielsen R, van Alen-Boerrigter IJ, Koole LA, Bongers RS, Kleerebezem M, Van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2010 Mar;76(5):1587-95. doi: 10.1128/AEM.02595-09. Epub 2009 Dec 28.

Siezen RJ, Tzeneva VA, Castioni A, Wels M, Phan HT, Rademaker JL, Starrenburg MJ, Kleerebezem M, Molenaar D, van Hylckama Vlieg JE.

Environ Microbiol. 2010 Mar;12(3):758-73. doi: 10.1111/j.1462-2920.2009.02119.x. Epub 2009 Dec 4.

Bachmann H, Kruijswijk Z, Molenaar D, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

J Dairy Sci. 2009 Dec;92(12):5868-82. doi: 10.3168/jds.2009-2372.

Bachmann H, Starrenburg MJ, Dijkstra A, Molenaar D, Kleerebezem M, Rademaker JL, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2009 Sep;75(17):5687-94. doi: 10.1128/AEM.00919-09. Epub 2009 Jul 10.

Bayjanov JR, Wels M, Starrenburg M, van Hylckama Vlieg JE, Siezen RJ, Molenaar D.

Bioinformatics. 2009 Feb 1;25(3):309-14. doi: 10.1093/bioinformatics/btn632. Epub 2009 Jan 7.

Chambellon E, Rijnen L, Lorquet F, Gitton C, van Hylckama Vlieg JE, Wouters JA, Yvon M.

J Bacteriol. 2009 Feb;191(3):873-81. doi: 10.1128/JB.01114-08. Epub 2008 Dec 1.

Ingham CJ, van Hylckama Vlieg JE.

Lab Chip. 2008 Oct;8(10):1604-16. doi: 10.1039/b804790a. Epub 2008 Aug 18. Review.

Sieuwerts S, de Bok FA, Hugenholtz J, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2008 Aug;74(16):4997-5007. doi: 10.1128/AEM.00113-08. Epub 2008 Jun 20. Review. No abstract available.

Bachmann H, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2008 Aug;74(15):4727-36. doi: 10.1128/AEM.00297-08. Epub 2008 Jun 6.

Siezen RJ, Starrenburg MJ, Boekhorst J, Renckens B, Molenaar D, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2008 Jan;74(2):424-36. Epub 2007 Nov 26.

Ingham CJ, Sprenkels A, Bomer J, Molenaar D, van den Berg A, van Hylckama Vlieg JE, de Vos WM.

Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Nov 13;104(46):18217-22. Epub 2007 Nov 7.

Rademaker JL, Herbet H, Starrenburg MJ, Naser SM, Gevers D, Kelly WJ, Hugenholtz J, Swings J, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2007 Nov;73(22):7128-37. Epub 2007 Sep 21.

Felis GE, Molenaar D, Dellaglio F, van Hylckama Vlieg JE.

Nat Biotechnol. 2007 Aug;25(8):848-9. No abstract available.

den Besten HM, Ingham CJ, van Hylckama Vlieg JE, Beerthuyzen MM, Zwietering MH, Abee T.

Appl Environ Microbiol. 2007 Aug;73(15):4797-804. Epub 2007 Jun 1.

Bachmann H, Santos F, Kleerebezem M, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2007 Jul;73(14):4704-6. Epub 2007 May 18.

Hernández I, Molenaar D, Beekwilder J, Bouwmeester H, van Hylckama Vlieg JE.

Appl Environ Microbiol. 2007 Mar;73(5):1544-52. Epub 2007 Jan 5.

van Hylckama Vlieg JE, Rademaker JL, Bachmann H, Molenaar D, Kelly WJ, Siezen RJ.

Curr Opin Biotechnol. 2006 Apr;17(2):183-90. Epub 2006 Mar 6. Review.

Smit BA, van Hylckama Vlieg JE, Engels WJ, Meijer L, Wouters JT, Smit G.

Appl Environ Microbiol. 2005 Jan;71(1):303-11.

Smit BA, Engels WJ, Bruinsma J, van Hylckama Vlieg JE, Wouters JT, Smit G.

J Appl Microbiol. 2004;97(2):306-13.

van Hylckama Vlieg JE, Tang L, Lutje Spelberg JH, Smilda T, Poelarends GJ, Bosma T, van Merode AE, Fraaije MW, Janssen DB.

J Bacteriol. 2001 Sep;183(17):5058-66.

Smilda T, Kamminga AH, Reinders P, Baron W, van Hylckama Vlieg JE, Beintema JJ.

J Mol Evol. 2001 May;52(5):457-66.