PubMed

Pascual-García A, Arenas M, Bastolla U.

Syst Biol. 2019 Apr 23. pii: syz022. doi: 10.1093/sysbio/syz022. [Epub ahead of print]

Alfayate A, Caceres CR, Gomes Dos Santos H, Bastolla U.

Bioinformatics. 2019 Apr 30. pii: btz301. doi: 10.1093/bioinformatics/btz301. [Epub ahead of print]

Sequeira-Mendes J, Vergara Z, Peiró R, Morata J, Aragüez I, Costas C, Mendez-Giraldez R, Casacuberta JM, Bastolla U, Gutierrez C.

Genome Res. 2019 May;29(5):784-797. doi: 10.1101/gr.240986.118. Epub 2019 Mar 7.

Jiménez-Santos MJ, Arenas M, Bastolla U.

PeerJ. 2018 Oct 5;6:e5549. doi: 10.7717/peerj.5549. eCollection 2018.

Bastolla U, Arenas M.

Methods Mol Biol. 2019;1851:215-231. doi: 10.1007/978-1-4939-8736-8_11.

Jimenez MJ, Arenas M, Bastolla U.

Mol Biol Evol. 2017 Dec 26. doi: 10.1093/molbev/msx327. [Epub ahead of print]

Dehouck Y, Bastolla U.

Integr Biol (Camb). 2017 Jul 17;9(7):627-641. doi: 10.1039/c7ib00079k.

de la Higuera I, Ferrer-Orta C, de Ávila AI, Perales C, Sierra M, Singh K, Sarafianos SG, Dehouck Y, Bastolla U, Verdaguer N, Domingo E.

Genome Biol Evol. 2017 May 1;9(5):1212-1228. doi: 10.1093/gbe/evx075.

Pascual-García A, Bastolla U.

Nat Commun. 2017 Feb 24;8:14326. doi: 10.1038/ncomms14326.

Berezovsky IN, Bastolla U.

Curr Opin Struct Biol. 2017 Feb;42:viii-x. doi: 10.1016/j.sbi.2016.12.013. Epub 2017 Jan 10. No abstract available.

Arenas M, Weber CC, Liberles DA, Bastolla U.

Syst Biol. 2017 Nov 1;66(6):1054-1064. doi: 10.1093/sysbio/syw121.

Bastolla U, Dehouck Y, Echave J.

Curr Opin Struct Biol. 2017 Feb;42:59-66. doi: 10.1016/j.sbi.2016.10.020. Epub 2016 Nov 16. Review.

Arenas M, Sánchez-Cobos A, Bastolla U.

Mol Biol Evol. 2015 Aug;32(8):2195-207. doi: 10.1093/molbev/msv085. Epub 2015 Apr 2.

Pascual-García A, Tamames J, Bastolla U.

BMC Microbiol. 2014 Dec 4;14:284. doi: 10.1186/s12866-014-0284-5.

Treviño MA, García-Mayoral MF, Jiménez MÁ, Bastolla U, Bruix M.

Biochim Biophys Acta. 2014 Oct;1844(10):1808-19. doi: 10.1016/j.bbapap.2014.07.019. Epub 2014 Aug 1.

Bastolla U.

Biomolecules. 2014 Mar 7;4(1):291-314. doi: 10.3390/biom4010291. Review.

Sequeira-Mendes J, Aragüez I, Peiró R, Mendez-Giraldez R, Zhang X, Jacobsen SE, Bastolla U, Gutierrez C.

Plant Cell. 2014 Jun;26(6):2351-2366. Epub 2014 Jun 16.

Arenas M, Dos Santos HG, Posada D, Bastolla U.

Bioinformatics. 2013 Dec 1;29(23):3020-8. doi: 10.1093/bioinformatics/btt530. Epub 2013 Sep 12.

Lombraña R, Almeida R, Revuelta I, Madeira S, Herranz G, Saiz N, Bastolla U, Gómez M.

EMBO J. 2013 Oct 2;32(19):2631-44. doi: 10.1038/emboj.2013.195. Epub 2013 Aug 30.

Dos Santos HG, Abia D, Janowski R, Mortuza G, Bertero MG, Boutin M, Guarín N, Méndez-Giraldez R, Nuñez A, Pedrero JG, Redondo P, Sanz M, Speroni S, Teichert F, Bruix M, Carazo JM, Gonzalez C, Reina J, Valpuesta JM, Vernos I, Zabala JC, Montoya G, Coll M, Bastolla U, Serrano L.

PLoS One. 2013 May 9;8(5):e62633. doi: 10.1371/journal.pone.0062633. Print 2013.

Bastolla U, Porto M, Roman HE.

Biochim Biophys Acta. 2013 May;1834(5):817-9. doi: 10.1016/j.bbapap.2013.03.016. No abstract available.

Dos Santos HG, Klett J, Méndez R, Bastolla U.

Biochim Biophys Acta. 2013 May;1834(5):836-46. doi: 10.1016/j.bbapap.2013.02.010. Epub 2013 Feb 19.

Minning J, Porto M, Bastolla U.

Proteins. 2013 Jul;81(7):1102-12. doi: 10.1002/prot.24244. Epub 2013 Apr 10.

Bastolla U, Bruscolini P, Velasco JL.

Proteins. 2012 Aug;80(9):2287-304. doi: 10.1002/prot.24118. Epub 2012 Jun 18.

Liberles DA, Teichmann SA, Bahar I, Bastolla U, Bloom J, Bornberg-Bauer E, Colwell LJ, de Koning AP, Dokholyan NV, Echave J, Elofsson A, Gerloff DL, Goldstein RA, Grahnen JA, Holder MT, Lakner C, Lartillot N, Lovell SC, Naylor G, Perica T, Pollock DD, Pupko T, Regan L, Roger A, Rubinstein N, Shakhnovich E, Sjölander K, Sunyaev S, Teufel AI, Thorne JL, Thornton JW, Weinreich DM, Whelan S.

Protein Sci. 2012 Jun;21(6):769-85. doi: 10.1002/pro.2071. Epub 2012 Apr 23. Review.

Nido GS, Méndez R, Pascual-García A, Abia D, Bastolla U.

Mol Biosyst. 2012 Jan;8(1):353-67. doi: 10.1039/c1mb05199g. Epub 2011 Nov 11.

Mendez R, Bastolla U.

Phys Rev Lett. 2010 Jun 4;104(22):228103. Epub 2010 Jun 3.

Sammet SG, Bastolla U, Porto M.

BMC Evol Biol. 2010 Jun 14;10:178. doi: 10.1186/1471-2148-10-178.

Teichert F, Minning J, Bastolla U, Porto M.

BMC Bioinformatics. 2010 May 14;11:251. doi: 10.1186/1471-2105-11-251.

Mendez R, Fritsche M, Porto M, Bastolla U.

PLoS Comput Biol. 2010 May 6;6(5):e1000767. doi: 10.1371/journal.pcbi.1000767.

Abia D, Bastolla U, Chacón P, Fábrega C, Gago F, Morreale A, Tramontano A.

Proteins. 2010 Jan;78(1):iii-viii. doi: 10.1002/prot.22660. No abstract available.

Pascual-García A, Abia D, Méndez R, Nido GS, Bastolla U.

Proteins. 2010 Jan;78(1):181-96. doi: 10.1002/prot.22616.

Bastolla U, Fortuna MA, Pascual-García A, Ferrera A, Luque B, Bascompte J.

Nature. 2009 Apr 23;458(7241):1018-20. doi: 10.1038/nature07950.

Pascual-García A, Abia D, Ortiz AR, Bastolla U.

PLoS Comput Biol. 2009 Mar;5(3):e1000331. doi: 10.1371/journal.pcbi.1000331. Epub 2009 Mar 27.

Bastolla U, Ortíz AR, Porto M, Teichert F.

Proteins. 2008 Dec;73(4):872-88. doi: 10.1002/prot.22113.

Han R, Leo-Macias A, Zerbino D, Bastolla U, Contreras-Moreira B, Ortiz AR.

Proteins. 2008 Apr;71(1):175-88.

Teichert F, Bastolla U, Porto M.

BMC Bioinformatics. 2007 Oct 31;8:425.

Bastolla U, Porto M, Ortíz AR.

Proteins. 2008 Apr;71(1):278-99. Erratum in: Proteins. 2008 Sep;72(4):1377.

Bastolla U, Porto M, Roman HE, Vendruscolo M.

BMC Evol Biol. 2006 May 31;6:43.

Bastolla U, Demetrius L.

Protein Eng Des Sel. 2005 Sep;18(9):405-15. Epub 2005 Aug 5.

Bastolla U, Lässig M, Manrubia SC, Valleriani A.

J Theor Biol. 2005 Aug 21;235(4):531-9. Epub 2005 Mar 23.

Bastolla U, Lässig M, Manrubia SC, Valleriani A.

J Theor Biol. 2005 Aug 21;235(4):521-30. Epub 2005 Mar 31.

Bastolla U, Porto M, Roman HE, Vendruscolo M.

Gene. 2005 Mar 14;347(2):219-30.

Briones C, Bastolla U.

Gene. 2005 Mar 14;347(2):237-46. Epub 2005 Feb 17.

Porto M, Roman HE, Vendruscolo M, Bastolla U.

Mol Biol Evol. 2005 Mar;22(3):630-8. Epub 2004 Nov 10. Erratum in: Mol Biol Evol. 2005 Apr;22(4):1156. Mol Biol Evol. 2005 Apr;22(4):1159.

Bastolla U, Porto M, Roman HE, Vendruscolo M.

Proteins. 2005 Jan 1;58(1):22-30.

Bastolla U, Moya A, Viguera E, van Ham RC.

J Mol Biol. 2004 Nov 5;343(5):1451-66.

Porto M, Bastolla U, Roman HE, Vendruscolo M.

Phys Rev Lett. 2004 May 28;92(21):218101. Epub 2004 May 28.

Bastolla U, Porto M, Roman HE, Vendruscolo M.

J Mol Evol. 2003;57 Suppl 1:S103-19.

Bastolla U, Porto M, Eduardo Roman MH, Vendruscolo MH.

J Mol Evol. 2003 Mar;56(3):243-54.