The aim of the present study was to characterize the bacterial microbiota of anal sacs in healthy dogs using NGS. Swabs were used to sample the rectum and secretions from each anal sac in 15 healthy dogs. DNA was extracted from swabs and the V4 hypervariable region of the 16S rRNA gene was amplified and sequenced with Illumina MiSeq. Overall, 14 different bacterial phyla were identified in the rectum and in both anal sacs, the 5 main ones being Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria, and Fusobacteria. The rectum had higher microbial diversity and richness than the left and right anal sacs. Community membership and structure significantly differed between the rectum and both anal sacs, but not between the right and the left anal sacs. This study showed that the diversity and richness of the bacterial microbiota of the anal sacs in dogs is greater than what has been reported in previous studies with culture-based methods. In conclusion, the bacterial microbiota of the anal sacs in dogs varies between individuals and differs from the rectal bacterial microbiota.
L’objectif de la présente étude était de caractériser le microbiote bactérien des sacs anaux de chiens en santé en utilisant le séquençage d’ADN à haut débit. Des écouvillons ont été utilisés pour échantillonner le rectum et les sécrétions provenant de chaque sac anal chez 15 chiens en santé. L’ADN a été extrait des écouvillons et la région hypervariable V4 du gène codant pour l’ARN ribosomique 16S a été amplifiée et séquencée avec Illumina MiSeq. En tout, 14 phyla bactériens différents ont été identifiés dans les sacs anaux droit et gauche et le rectum, les cinq principaux étant Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria, Actinobacteria et Fusobacteria. Le microbiote bactérien du rectum avait une diversité et une richesse plus importantes que le microbiote bactérien des deux sacs anaux. L’appartenance à la communauté et sa structure différaient significativement entre le rectum et les sacs anaux, mais pas entre le sac anal droit et le sac anal gauche. Cette étude a démontré que la diversité et la richesse du microbiote bactérien des sacs anaux chez le chien sont plus importantes que ce qui a été rapportées dans les études précédentes avec des cultures. En conclusion, le microbiote bactérien des sacs anaux chez le chien varie d’un individu à l’autre et diffère de celui du rectum.(Traduit par les auteurs).
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