Format

Send to

Choose Destination
BMC Cancer. 2016 Jan 12;16:13. doi: 10.1186/s12885-015-2028-9.

GENESIS: a French national resource to study the missing heritability of breast cancer.

Author information

1
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France.
2
Unité Mixte de Génétique Constitutionnelle des Cancers Fréquents, Hospices Civils de Lyon, Centre Léon Bérard, Lyon, France.
3
Inserm, U900, Paris, France. mariegabrielle.dondon@curie.fr.
4
Institut Curie, Paris, France. mariegabrielle.dondon@curie.fr.
5
PSL Research University, Paris, France. mariegabrielle.dondon@curie.fr.
6
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. mariegabrielle.dondon@curie.fr.
7
Inserm, U900, Paris, France. severine.eonmarchais@curie.fr.
8
Institut Curie, Paris, France. severine.eonmarchais@curie.fr.
9
PSL Research University, Paris, France. severine.eonmarchais@curie.fr.
10
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. severine.eonmarchais@curie.fr.
11
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France. francesca.damiola@lyon.unicancer.fr.
12
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France. laure.barjhoux@lyon.unicancer.fr.
13
Inserm, U900, Paris, France. morgane.marcou@apr.aphp.fr.
14
Institut Curie, Paris, France. morgane.marcou@apr.aphp.fr.
15
PSL Research University, Paris, France. morgane.marcou@apr.aphp.fr.
16
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. morgane.marcou@apr.aphp.fr.
17
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France. carole.verny@lyon.unicancer.fr.
18
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France. valerie.sornin@lyon.unicancer.fr.
19
Inserm, U900, Paris, France. lucietoulemonde@hotmail.com.
20
Institut Curie, Paris, France. lucietoulemonde@hotmail.com.
21
PSL Research University, Paris, France. lucietoulemonde@hotmail.com.
22
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. lucietoulemonde@hotmail.com.
23
Inserm, U900, Paris, France. juana.beauvallet@curie.fr.
24
Institut Curie, Paris, France. juana.beauvallet@curie.fr.
25
PSL Research University, Paris, France. juana.beauvallet@curie.fr.
26
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. juana.beauvallet@curie.fr.
27
Inserm, U900, Paris, France. dorothee.legal@curie.fr.
28
Institut Curie, Paris, France. dorothee.legal@curie.fr.
29
PSL Research University, Paris, France. dorothee.legal@curie.fr.
30
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. dorothee.legal@curie.fr.
31
Inserm, U900, Paris, France. noura.mebirouk@curie.fr.
32
Institut Curie, Paris, France. noura.mebirouk@curie.fr.
33
PSL Research University, Paris, France. noura.mebirouk@curie.fr.
34
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. noura.mebirouk@curie.fr.
35
Institut Curie, Service de Génétique, Paris, France. muriel.belotti@curie.fr.
36
Institut de Cancérologie Gustave Roussy, Service d'Oncologie Génétique, Villejuif, France. olivier.caron@gustaveroussy.fr.
37
Institut Curie, Service de Génétique, Paris, France. marion.gauthier-villars@curie.fr.
38
Hôpital Arnaud de Villeneuve, CHU Montpellier, Service de Génétique médicale et Oncogénétique, Montpellier, France. i-coupier@chu-montpellier.fr.
39
ICM Val d'Aurel, Unité d'Oncogénétique, Montpellier, France. i-coupier@chu-montpellier.fr.
40
Institut Curie, Service de Génétique, Paris, France. bruno.buecher@curie.fr.
41
Centre Catherine de Sienne, Service d'Oncologie Médicale, Nantes, France. lortholary.alain@catherinedesienne.fr.
42
Centre Eugène-Marquis, Service de Génétique, Rennes, France. c.dugast@rennes.unicancer.fr.
43
CH Georges Renon, Service Oncogénétique pour la consultation oncogénétique régionale Poitou-Charentes, Niort, France. paul.gesta@ch-niort.fr.
44
Centre Paul Strauss, Unité d'Oncologie, Strasbourg, France. jfricker@strasbourg.unicancer.fr.
45
Institut Curie, Hôpital René Huguenin, Saint-Cloud, France. catherine.nogues@curie.fr.
46
Hôpital d'Enfants, Service de Génétique Médicale, Dijon, France. laurence.faivre@chu-dijon.fr.
47
Centre Georges François Leclerc, Oncogénétique, Dijon, France. laurence.faivre@chu-dijon.fr.
48
ICL Alexis Vautrin, Unité d'Oncogénétique, Vandœuvre-lès-Nancy, France. e.luporsi@nancy.unicancer.fr.
49
Centre François Baclesse, Unité de pathologie gynécologique, Caen, France. p.berthet@baclesse.fr.
50
Centre René Gauducheau, Unité d'Oncogénétique, Nantes Saint Herblain, France. capucine.delnatte@ico.unicancer.fr.
51
Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France. valerie.bonadona@lyon.unicancer.fr.
52
CNRS UMR 5558, Lyon, France. valerie.bonadona@lyon.unicancer.fr.
53
Centre Léon Bérard, Unité de Prévention et Epidémiologie Génétique, Lyon, France. valerie.bonadona@lyon.unicancer.fr.
54
Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, UF1422 Oncogénétique moléculaire, Laboratoire de diagnostic génétique, Strasbourg, France. christine.maugard@chru-strasbourg.fr.
55
Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, UF6948 Oncogénétique, Service d'Hémato-Oncologie, Strasbourg, France. christine.maugard@chru-strasbourg.fr.
56
Hôpital Arnaud de Villeneuve, CHU Montpellier, Service de Génétique médicale et Oncogénétique, Montpellier, France. p-pujol@chu-montpellier.fr.
57
Inserm, U896, CRCM Val d'Aurel, Montpellier, France. p-pujol@chu-montpellier.fr.
58
Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France. christine.lasset@lyon.unicancer.fr.
59
CNRS UMR 5558, Lyon, France. christine.lasset@lyon.unicancer.fr.
60
Centre Léon Bérard, Unité de Prévention et Epidémiologie Génétique, Lyon, France. christine.lasset@lyon.unicancer.fr.
61
Institut Bergonié, Bordeaux, France. m.longy@bordeaux.unicancer.fr.
62
Centre Jean-Perrin, Clermont-Ferrand, France. yves-jean.bignon@cjp.fr.
63
Centre Oscar-Lambret, Lille, France. cl-adenis@o-lambret.fr.
64
Hôpital Universitaire Dupuytren, Service d'Oncologie Médicale, Limoges, France. laurence.venat@chu-limoges.fr.
65
Polyclinique Courlancy, Reims, France.
66
Clinique Sainte Catherine, Avignon, France. h.dreyfus@isc84.org.
67
CHU de Grenoble, Hôpital Couple-Enfant, Département de Génétique, Grenoble, France. h.dreyfus@isc84.org.
68
Centre Antoine Lacassagne, Unité d'Oncogénétique, Nice, France. marc.frenay@nice.unicancer.fr.
69
Institut Claudius Regaud - IUCT-Oncopole, Service d'Oncologie Médicale, Toulouse, France. gladieff.laurence@iuct-oncopole.fr.
70
Hôpital Bretonneau, Service de Génétique, Tours, France. i.mortemousque@chu-tours.fr.
71
CHU Brest, Hôpital Morvan, Département de génétique médicale en pédiatrie, Brest, France. severine.audebert@chu-brest.fr.
72
Hôpital Tenon, Paris, France. florent.soubrier@psl.aphp.fr.
73
Hôpital Edouard Herriot, Service de Génétique Moléculaire, Lyon, France. sophie.giraud@chu-lyon.fr.
74
Hôpital Jeanne de Flandre, Service de génétique clinique Guy Fontaine, Lille, France. sophie.lejeune@chru-lille.fr.
75
Hôpital Universitaire de Rouen, Département de Génétique, Rouen, France. annie.chevrier@chu-rouen.fr.
76
Hôpital Pasteur, Service d'Onco-hématologie, Colmar, France. limacher@transgene.fr.
77
CHRU Hôpital Caremeau, Nîmes, France. jean.chiesa@chu-nimes.fr.
78
Hôpital Tenon, Service d'Oncogénétique, Paris, France. anne.fajac@tnn.aphp.fr.
79
Institut Bergonié, Bordeaux, France. a.floquet@bordeaux.unicancer.fr.
80
IPC, Département d'Anticipation et de Suivi des Cancers, Marseille, France. eisingerf@ipc.unicancer.fr.
81
Inserm, UMR 912, Marseille, France. eisingerf@ipc.unicancer.fr.
82
Hôpital Universitaire de Rouen, Département de Génétique, Rouen, France. julie.tinat@chu-rouen.fr.
83
Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, Département de Génétique, APHP, Paris, France. chrystelle.colas@psl.aphp.fr.
84
Centre Hospitalier de Chambéry, Chambéry, France. sandra.fertferrer@ch-chambery.fr.
85
Institut Jean-Godinot, Reims, France. cpenet@iccreims.fr.
86
ICC Courlancy, Cs Oncogénétique, Reims, France. cpenet@iccreims.fr.
87
Hôpital Universitaire de Rouen, Département de Génétique, Rouen, France. thierry.frebourg@chu-rouen.fr.
88
CHU Hôpital Saint-Jacques, Service Génétique et Biologie du Développement - Histologie, Besançon, France. macollongerame@chu-besancon.fr.
89
Institut Bergonié, Bordeaux, France. e.barouksimonet@bordeaux.unicancer.fr.
90
Hôpital Flaubert, Le Havre, France. vlayet@ch-havre.fr.
91
CHU de Grenoble, Hôpital Couple-Enfant, Département de Génétique, Grenoble, France. dleroux@chu-grenoble.fr.
92
Hôpital Saint-Louis, Paris, France. odile.cohen-haguenauer@sls.aphp.fr.
93
CHU de Saint-Etienne, Hôpital Nord, Service de Génétique, Saint-Etienne, France. fabienne.prieur@chu-st-etienne.fr.
94
Institut Curie, Hôpital René Huguenin, Saint-Cloud, France. emmanuelle.fourme@curie.fr.
95
Hôpital Lariboisière, Centre Viggo-Petersen, Paris, France. fcornelis@chu-clermontferrand.fr.
96
CHU Hôpital de Brabois, Laboratoire de Génétique, Vandœuvre-lès-Nancy, France. p.jonveaux@chu-nancy.fr.
97
CHU de Martinique, Unité d'Oncogénétique, Fort-de-France, France. odile.bera@chu-fortdefrance.fr.
98
Inserm, U900, Paris, France. eve.cavaciuti@curie.fr.
99
Institut Curie, Paris, France. eve.cavaciuti@curie.fr.
100
PSL Research University, Paris, France. eve.cavaciuti@curie.fr.
101
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. eve.cavaciuti@curie.fr.
102
Institut Curie, Département d'imagerie médicale, Paris, France. anne.tardivon@curie.fr.
103
Inserm, U900, Paris, France. fabienne.lesueur@curie.fr.
104
Institut Curie, Paris, France. fabienne.lesueur@curie.fr.
105
PSL Research University, Paris, France. fabienne.lesueur@curie.fr.
106
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. fabienne.lesueur@curie.fr.
107
Cancer Research Centre of Lyon, CNRS UMR5286, Inserm U1052, Université Claude Bernard Lyon 1, Centre Léon Bérard, Lyon, France. sylvie.mazoyer@lyon.unicancer.fr.
108
PSL Research University, Paris, France. dominique.stoppa-lyonnet@curie.fr.
109
Institut Curie, Service de Génétique, Paris, France. dominique.stoppa-lyonnet@curie.fr.
110
Inserm, U830, Paris, France. dominique.stoppa-lyonnet@curie.fr.
111
Université Paris-Descartes, Paris, France. dominique.stoppa-lyonnet@curie.fr.
112
Inserm, U900, Paris, France. nadine.andrieu@curie.fr.
113
Institut Curie, Paris, France. nadine.andrieu@curie.fr.
114
PSL Research University, Paris, France. nadine.andrieu@curie.fr.
115
Mines ParisTech, Fontainebleau, France. nadine.andrieu@curie.fr.

Abstract

BACKGROUND:

Less than 20% of familial breast cancer patients who undergo genetic testing for BRCA1 and BRCA2 carry a pathogenic mutation in one of these two genes. The GENESIS (GENE SISter) study was designed to identify new breast cancer susceptibility genes in women attending cancer genetics clinics and with no BRCA1/2 mutation.

METHODS:

The study involved the French national network of family cancer clinics. It was based on enrichment in genetic factors of the recruited population through case selection relying on familial criteria, but also on the consideration of environmental factors and endophenotypes like mammary density or tumor characteristics to assess potential genetic heterogeneity. One of the initial aims of GENESIS was to recruit affected sibpairs. Siblings were eligible when index cases and at least one affected sister were diagnosed with infiltrating mammary or ductal adenocarcinoma, with no BRCA1/2 mutation. In addition, unrelated controls and unaffected sisters were recruited. The enrolment of patients, their relatives and their controls, the collection of the clinical, epidemiological, familial and biological data were centralized by a coordinating center.

RESULTS:

Inclusion of participants started in February 2007 and ended in December 2013. A total of 1721 index cases, 826 affected sisters, 599 unaffected sisters and 1419 controls were included. 98% of participants completed the epidemiological questionnaire, 97% provided a blood sample, and 76% were able to provide mammograms. Index cases were on average 59 years old at inclusion, were born in 1950, and were 49.7 years of age at breast cancer diagnosis. The mean age at diagnosis of affected sisters was slightly higher (51.4 years). The representativeness of the control group was verified.

CONCLUSIONS:

The size of the study, the availability of biological specimens and the clinical data collection together with the detailed and complete epidemiological questionnaire make this a unique national resource for investigation of the missing heritability of breast cancer, by taking into account environmental and life style factors and stratifying data on endophenotypes to decrease genetic heterogeneity.

PMID:
26758370
PMCID:
PMC4711059
DOI:
10.1186/s12885-015-2028-9
[Indexed for MEDLINE]
Free PMC Article

Supplemental Content

Full text links

Icon for BioMed Central Icon for PubMed Central
Loading ...
Support Center