

GEO help: Mouse over screen elements for information. 

Status 
Public on Sep 05, 2013 
Title 
Intraspecific variation of recombination rate in maize 
Organism 
Zea mays 
Experiment type 
SNP genotyping by SNP array

Summary 
The data set submitted here contains the raw SNP genotyping data obtained from the analysis of 24 biparental segregating maize (Zea mays L.) populations and their respective parents. The processed and filtered data were used to construct genetic linkage maps which we used in our study of variation of recombination rate in maize. In sexually reproducing organisms, meiotic crossovers ensure the proper segregation of chromosomes and contribute to genetic diversity by shuffling allelic combinations. Such genetic reassortment is exploited in breeding to combine favorable alleles, and in genetic research to identify genetic factors underlying traits of interest via linkage or associationbased approaches. Crossover numbers and distributions along chromosomes vary between species, but little is known about their intraspecies variation. In our study, we report on the variation of recombination rates between 22 European maize inbred lines that belong to the Dent and Flint gene pools. We genotyped 23 doubledhaploid populations derived from crosses between these lines with a 50kSNP array and constructed highdensity genetic maps, showing good correspondence with the maize B73 genome sequence assembly. By aligning each genetic map to the B73 sequence, we obtained the recombination rates along chromosomes specific to each population. We identified significant differences in recombination rates at the genomewide, chromosome, and intrachromosomal levels between populations, as well as significant variation for genomewide recombination rates among maize lines. Crossover interference analysis using a twopathway modeling framework revealed a negative association between recombination rate and interference strength. To our knowledge, the present work provides the most comprehensive study on intraspecific variation of recombination rates and crossover interference strength in eukaryotes. Differences found in recombination rates will allow for selection of high or low recombining lines in crossing programs. Our methodology should pave the way for precise identification of genes controlling recombination rates in maize and other organisms.



Overall design 
We genotyped 2233 maize DH lines from 24 biparental populations, and the 23 parents of these populations using the Illumina MaizeSNP50 BeadChip. We created two large halfsib panels, one each for the Dent and the Flint germplasm. The Dent populations have the prefix CFD, the Flint populations have the prefix CFF. In each panel, a common central parent was crossed to diverse founder lines, and doubled haploids were generated from the respective F1 plants. For a detailed description of the material, see Bauer et al. (2013) Genome Biology (submitted). We submit here three datasets: 1) Dataset Parents comprises all 23 parental lines. 2) Dataset CFD comprises all 1005 DH lines from Dent crosses, 3) Dataset CFF comprises all 1262 DH lines from Flint crosses.



Contributor(s) 
Bauer E 
Citation(s) 
24050704, 25236445 
Submission date 
Sep 03, 2013 
Last update date 
Oct 07, 2014 
Contact name 
Eva Bauer 
Email(s) 
e.bauer@tum.de

Phone 
++49 8161 715243

Organization name 
Technical University of Munich

Department 
Plant Breeding

Street address 
LieselBeckmannStr. 2

City 
Freising 
ZIP/Postal code 
85354 
Country 
Germany 


Platforms (1) 

Samples (2290)

GSM1221236 
Parental line, D152 
GSM1221237 
Parental line, DK105 
GSM1221238 
Parental line, EC169 
GSM1221239 
Parental line, EP44 
GSM1221240 
Parental line, EZ5 
GSM1221241 
Parental line, F64 
GSM1221242 
Parental line, EC49A 
GSM1221243 
Parental line, F2 
GSM1221244 
Parental line, F283 
GSM1221245 
Parental line, F03802 
GSM1221246 
Parental line, F252 
GSM1221247 
Parental line, F353 
GSM1221248 
Parental line, F618 
GSM1221249 
Parental line, Mo17 
GSM1221250 
Parental line, UH006 
GSM1221251 
Parental line, UH007 
GSM1221252 
Parental line, UH009 
GSM1221253 
Parental line, UH250 
GSM1221254 
Parental line, UH304 
GSM1221255 
Parental line, W117 
GSM1221256 
DH line, CFD01003 
GSM1221257 
DH line, CFD01006 
GSM1221258 
DH line, CFD01008 
GSM1221259 
DH line, CFD01009 
GSM1221260 
DH line, CFD01010 
GSM1221261 
DH line, CFD01011 
GSM1221262 
DH line, CFD01012 
GSM1221263 
DH line, CFD01013 
GSM1221264 
DH line, CFD01022 
GSM1221265 
DH line, CFD01027 
GSM1221266 
DH line, CFD01028 
GSM1221267 
DH line, CFD01029 
GSM1221268 
DH line, CFD01030 
GSM1221269 
DH line, CFD01035 
GSM1221270 
DH line, CFD01036 
GSM1221271 
DH line, CFD01037 
GSM1221272 
DH line, CFD01038 
GSM1221273 
DH line, CFD01044 
GSM1221274 
DH line, CFD01046 
GSM1221275 
DH line, CFD01047 
GSM1221276 
DH line, CFD01051 
GSM1221277 
DH line, CFD01052 
GSM1221278 
DH line, CFD01055 
GSM1221279 
DH line, CFD01056 
GSM1221280 
DH line, CFD01057 
GSM1221281 
DH line, CFD01058 
GSM1221282 
DH line, CFD01059 
GSM1221283 
DH line, CFD01060 
GSM1221284 
DH line, CFD01062 
GSM1221285 
DH line, CFD01063 
GSM1221286 
DH line, CFD01064 
GSM1221287 
DH line, CFD01065 
GSM1221288 
DH line, CFD01066 
GSM1221289 
DH line, CFD01067 
GSM1221290 
DH line, CFD01068 
GSM1221291 
DH line, CFD01069 
GSM1221292 
DH line, CFD01070 
GSM1221293 
DH line, CFD01072 
GSM1221294 
DH line, CFD01073 
GSM1221295 
DH line, CFD01074 
GSM1221296 
DH line, CFD01076 
GSM1221297 
DH line, CFD01077 
GSM1221298 
DH line, CFD01078 
GSM1221299 
DH line, CFD01079 
GSM1221300 
DH line, CFD01080 
GSM1221301 
DH line, CFD01082 
GSM1221302 
DH line, CFD01083 
GSM1221303 
DH line, CFD01084 
GSM1221304 
DH line, CFD01085 
GSM1221305 
DH line, CFD01089 
GSM1221306 
DH line, CFD01090 
GSM1221307 
DH line, CFD01091 
GSM1221308 
DH line, CFD01092 
GSM1221309 
DH line, CFD01093 
GSM1221310 
DH line, CFD01094 
GSM1221311 
DH line, CFD01095 
GSM1221312 
DH line, CFD01097 
GSM1221313 
DH line, CFD01098 
GSM1221314 
DH line, CFD01099 
GSM1221315 
DH line, CFD01100 
GSM1221316 
DH line, CFD01101 
GSM1221317 
DH line, CFD01102 
GSM1221318 
DH line, CFD01103 
GSM1221319 
DH line, CFD01104 
GSM1221320 
DH line, CFD01105 
GSM1221321 
DH line, CFD01106 
GSM1221322 
DH line, CFD01107 
GSM1221323 
DH line, CFD01108 
GSM1221324 
DH line, CFD01301 
GSM1221325 
DH line, CFD01302 
GSM1221326 
DH line, CFD01303 
GSM1221327 
DH line, CFD01304 
GSM1221328 
DH line, CFD01305 
GSM1221329 
DH line, CFD01306 
GSM1221330 
DH line, CFD01307 
GSM1221331 
DH line, CFD01308 
GSM1221332 
DH line, CFD01309 
GSM1221333 
DH line, CFD01310 
GSM1221334 
DH line, CFD01311 
GSM1221335 
DH line, CFD01312 
GSM1221336 
DH line, CFD01313 
GSM1221337 
DH line, CFD01314 
GSM1221338 
DH line, CFD01315 
GSM1221339 
DH line, CFD01316 
GSM1221340 
DH line, CFD01317 
GSM1221341 
DH line, CFD01318 
GSM1221342 
DH line, CFD02001 
GSM1221343 
DH line, CFD02003 
GSM1221344 
DH line, CFD02006 
GSM1221345 
DH line, CFD02010 
GSM1221346 
DH line, CFD02013 
GSM1221347 
DH line, CFD02024 
GSM1221348 
DH line, CFD02027 
GSM1221349 
DH line, CFD02036 
GSM1221350 
DH line, CFD02038 
GSM1221351 
DH line, CFD02041 
GSM1221352 
DH line, CFD02043 
GSM1221353 
DH line, CFD02047 
GSM1221354 
DH line, CFD02048 
GSM1221355 
DH line, CFD02051 
GSM1221356 
DH line, CFD02053 
GSM1221357 
DH line, CFD02057 
GSM1221358 
DH line, CFD02058 
GSM1221359 
DH line, CFD02059 
GSM1221360 
DH line, CFD02060 
GSM1221361 
DH line, CFD02061 
GSM1221362 
DH line, CFD02063 
GSM1221363 
DH line, CFD02064 
GSM1221364 
DH line, CFD02067 
GSM1221365 
DH line, CFD02069 
GSM1221366 
DH line, CFD02072 
GSM1221367 
DH line, CFD02073 
GSM1221368 
DH line, CFD02074 
GSM1221369 
DH line, CFD02075 
GSM1221370 
DH line, CFD02076 
GSM1221371 
DH line, CFD02077 
GSM1221372 
DH line, CFD02078 
GSM1221373 
DH line, CFD02079 
GSM1221374 
DH line, CFD02081 
GSM1221375 
DH line, CFD02082 
GSM1221376 
DH line, CFD02085 
GSM1221377 
DH line, CFD02086 
GSM1221378 
DH line, CFD02088 
GSM1221379 
DH line, CFD02090 
GSM1221380 
DH line, CFD02091 
GSM1221381 
DH line, CFD02092 
GSM1221382 
DH line, CFD02095 
GSM1221383 
DH line, CFD02097 
GSM1221384 
DH line, CFD02098 
GSM1221385 
DH line, CFD02099 
GSM1221386 
DH line, CFD02100 
GSM1221387 
DH line, CFD02101 
GSM1221388 
DH line, CFD02102 
GSM1221389 
DH line, CFD02103 
GSM1221390 
DH line, CFD02104 
GSM1221391 
DH line, CFD02105 
GSM1221392 
DH line, CFD02106 
GSM1221393 
DH line, CFD02301 
GSM1221394 
DH line, CFD02302 
GSM1221395 
DH line, CFD02303 
GSM1221396 
DH line, CFD02304 
GSM1221397 
DH line, CFD02305 
GSM1221398 
DH line, CFD02306 
GSM1221399 
DH line, CFD02307 
GSM1221400 
DH line, CFD02308 
GSM1221401 
DH line, CFD02309 
GSM1221402 
DH line, CFD02310 
GSM1221403 
DH line, CFD02311 
GSM1221404 
DH line, CFD02312 
GSM1221405 
DH line, CFD02313 
GSM1221406 
DH line, CFD02314 
GSM1221407 
DH line, CFD02315 
GSM1221408 
DH line, CFD02316 
GSM1221409 
DH line, CFD02317 
GSM1221410 
DH line, CFD02318 
GSM1221411 
DH line, CFD02319 
GSM1221412 
DH line, CFD02320 
GSM1221413 
DH line, CFD02321 
GSM1221414 
DH line, CFD02322 
GSM1221415 
DH line, CFD03003 
GSM1221416 
DH line, CFD03004 
GSM1221417 
DH line, CFD03005 
GSM1221418 
DH line, CFD03006 
GSM1221419 
DH line, CFD03013 
GSM1221420 
DH line, CFD03016 
GSM1221421 
DH line, CFD03017 
GSM1221422 
DH line, CFD03020 
GSM1221423 
DH line, CFD03021 
GSM1221424 
DH line, CFD03022 
GSM1221425 
DH line, CFD03037 
GSM1221426 
DH line, CFD03038 
GSM1221427 
DH line, CFD03040 
GSM1221428 
DH line, CFD03041 
GSM1221429 
DH line, CFD03042 
GSM1221430 
DH line, CFD03043 
GSM1221431 
DH line, CFD03044 
GSM1221432 
DH line, CFD03045 
GSM1221433 
DH line, CFD03046 
GSM1221434 
DH line, CFD03047 
GSM1221435 
DH line, CFD03048 
GSM1221436 
DH line, CFD03049 
GSM1221437 
DH line, CFD03050 
GSM1221438 
DH line, CFD03051 
GSM1221439 
DH line, CFD03052 
GSM1221440 
DH line, CFD03053 
GSM1221441 
DH line, CFD03054 
GSM1221442 
DH line, CFD03056 
GSM1221443 
DH line, CFD03057 
GSM1221444 
DH line, CFD03058 
GSM1221445 
DH line, CFD03059 
GSM1221446 
DH line, CFD03060 
GSM1221447 
DH line, CFD03062 
GSM1221448 
DH line, CFD03063 
GSM1221449 
DH line, CFD03064 
GSM1221450 
DH line, CFD03065 
GSM1221451 
DH line, CFD03066 
GSM1221452 
DH line, CFD03067 
GSM1221453 
DH line, CFD03068 
GSM1221454 
DH line, CFD03069 
GSM1221455 
DH line, CFD03070 
GSM1221456 
DH line, CFD03071 
GSM1221457 
DH line, CFD03072 
GSM1221458 
DH line, CFD03073 
GSM1221459 
DH line, CFD03074 
GSM1221460 
DH line, CFD03075 
GSM1221461 
DH line, CFD03076 
GSM1221462 
DH line, CFD03077 
GSM1221463 
DH line, CFD03079 
GSM1221464 
DH line, CFD03080 
GSM1221465 
DH line, CFD03081 
GSM1221466 
DH line, CFD03082 
GSM1221467 
DH line, CFD03083 
GSM1221468 
DH line, CFD03084 
GSM1221469 
DH line, CFD03301 
GSM1221470 
DH line, CFD03302 
GSM1221471 
DH line, CFD03303 
GSM1221472 
DH line, CFD03304 
GSM1221473 
DH line, CFD03305 
GSM1221474 
DH line, CFD03306 
GSM1221475 
DH line, CFD03307 
GSM1221476 
DH line, CFD03308 
GSM1221477 
DH line, CFD03309 
GSM1221478 
DH line, CFD03310 
GSM1221479 
DH line, CFD03311 
GSM1221480 
DH line, CFD03312 
GSM1221481 
DH line, CFD03313 
GSM1221482 
DH line, CFD03314 
GSM1221483 
DH line, CFD03315 
GSM1221484 
DH line, CFD03317 
GSM1221485 
DH line, CFD03318 
GSM1221486 
DH line, CFD03320 
GSM1221487 
DH line, CFD03321 
GSM1221488 
DH line, CFD03322 
GSM1221489 
DH line, CFD03323 
GSM1221490 
DH line, CFD03324 
GSM1221491 
DH line, CFD03325 
GSM1221492 
DH line, CFD03326 
GSM1221493 
DH line, CFD03327 
GSM1221494 
DH line, CFD03328 
GSM1221495 
DH line, CFD03329 
GSM1221496 
DH line, CFD03330 
GSM1221497 
DH line, CFD03331 
GSM1221498 
DH line, CFD03332 
GSM1221499 
DH line, CFD03333 
GSM1221500 
DH line, CFD03334 
GSM1221501 
DH line, CFD03335 
GSM1221502 
DH line, CFD03337 
GSM1221503 
DH line, CFD03338 
GSM1221504 
DH line, CFD03339 
GSM1221505 
DH line, CFD03341 
GSM1221506 
DH line, CFD03342 
GSM1221507 
DH line, CFD03343 
GSM1221508 
DH line, CFD03345 
GSM1221509 
DH line, CFD03346 
GSM1221510 
DH line, CFD03347 
GSM1221511 
DH line, CFD03348 
GSM1221512 
DH line, CFD03349 
GSM1221513 
DH line, CFD03351 
GSM1221514 
DH line, CFD03353 
GSM1221515 
DH line, CFD03354 
GSM1221516 
DH line, CFD03355 
GSM1221517 
DH line, CFD03356 
GSM1221518 
DH line, CFD04002 
GSM1221519 
DH line, CFD04003 
GSM1221520 
DH line, CFD04004 
GSM1221521 
DH line, CFD04005 
GSM1221522 
DH line, CFD04007 
GSM1221523 
DH line, CFD04008 
GSM1221524 
DH line, CFD04013 
GSM1221525 
DH line, CFD04015 
GSM1221526 
DH line, CFD04034 
GSM1221527 
DH line, CFD04041 
GSM1221528 
DH line, CFD04042 
GSM1221529 
DH line, CFD04045 
GSM1221530 
DH line, CFD04046 
GSM1221531 
DH line, CFD04047 
GSM1221532 
DH line, CFD04048 
GSM1221533 
DH line, CFD04049 
GSM1221534 
DH line, CFD04053 
GSM1221535 
DH line, CFD04054 
GSM1221536 
DH line, CFD04057 
GSM1221537 
DH line, CFD04058 
GSM1221538 
DH line, CFD04059 
GSM1221539 
DH line, CFD04060 
GSM1221540 
DH line, CFD04061 
GSM1221541 
DH line, CFD04063 
GSM1221542 
DH line, CFD04073 
GSM1221543 
DH line, CFD04074 
GSM1221544 
DH line, CFD04075 
GSM1221545 
DH line, CFD04076 
GSM1221546 
DH line, CFD04079 
GSM1221547 
DH line, CFD04080 
GSM1221548 
DH line, CFD04082 
GSM1221549 
DH line, CFD04084 
GSM1221550 
DH line, CFD04085 
GSM1221551 
DH line, CFD04087 
GSM1221552 
DH line, CFD04088 
GSM1221553 
DH line, CFD04091 
GSM1221554 
DH line, CFD04092 
GSM1221555 
DH line, CFD04093 
GSM1221556 
DH line, CFD04094 
GSM1221557 
DH line, CFD04095 
GSM1221558 
DH line, CFD04096 
GSM1221559 
DH line, CFD04098 
GSM1221560 
DH line, CFD04099 
GSM1221561 
DH line, CFD04100 
GSM1221562 
DH line, CFD04101 
GSM1221563 
DH line, CFD04102 
GSM1221564 
DH line, CFD04103 
GSM1221565 
DH line, CFD04104 
GSM1221566 
DH line, CFD04106 
GSM1221567 
DH line, CFD04107 
GSM1221568 
DH line, CFD04108 
GSM1221569 
DH line, CFD04111 
GSM1221570 
DH line, CFD04114 
GSM1221571 
DH line, CFD04116 
GSM1221572 
DH line, CFD04117 
GSM1221573 
DH line, CFD04301 
GSM1221574 
DH line, CFD04302 
GSM1221575 
DH line, CFD04303 
GSM1221576 
DH line, CFD04304 
GSM1221577 
DH line, CFD04305 
GSM1221578 
DH line, CFD04306 
GSM1221579 
DH line, CFD04307 
GSM1221580 
DH line, CFD04308 
GSM1221581 
DH line, CFD04309 
GSM1221582 
DH line, CFD04310 
GSM1221583 
DH line, CFD04311 
GSM1221584 
DH line, CFD04312 
GSM1221585 
DH line, CFD04313 
GSM1221586 
DH line, CFD04314 
GSM1221587 
DH line, CFD04315 
GSM1221588 
DH line, CFD04316 
GSM1221589 
DH line, CFD04317 
GSM1221590 
DH line, CFD04318 
GSM1221591 
DH line, CFD04319 
GSM1221592 
DH line, CFD04320 
GSM1221593 
DH line, CFD04321 
GSM1221594 
DH line, CFD04322 
GSM1221595 
DH line, CFD04323 
GSM1221596 
DH line, CFD04324 
GSM1221597 
DH line, CFD04325 
GSM1221598 
DH line, CFD04326 
GSM1221599 
DH line, CFD04327 
GSM1221600 
DH line, CFD04328 
GSM1221601 
DH line, CFD04330 
GSM1221602 
DH line, CFD04331 
GSM1221603 
DH line, CFD04332 
GSM1221604 
DH line, CFD04333 
GSM1221605 
DH line, CFD04334 
GSM1221606 
DH line, CFD04335 
GSM1221607 
DH line, CFD04336 
GSM1221608 
DH line, CFD04337 
GSM1221609 
DH line, CFD04338 
GSM1221610 
DH line, CFD04339 
GSM1221611 
DH line, CFD04340 
GSM1221612 
DH line, CFD04341 
GSM1221613 
DH line, CFD04342 
GSM1221614 
DH line, CFD04343 
GSM1221615 
DH line, CFD04344 
GSM1221616 
DH line, CFD04345 
GSM1221617 
DH line, CFD04346 
GSM1221618 
DH line, CFD04347 
GSM1221619 
DH line, CFD04348 
GSM1221620 
DH line, CFD04349 
GSM1221621 
DH line, CFD04350 
GSM1221622 
DH line, CFD04351 
GSM1221623 
DH line, CFD05006 
GSM1221624 
DH line, CFD05009 
GSM1221625 
DH line, CFD05013 
GSM1221626 
DH line, CFD05015 
GSM1221627 
DH line, CFD05016 
GSM1221628 
DH line, CFD05018 
GSM1221629 
DH line, CFD05019 
GSM1221630 
DH line, CFD05020 
GSM1221631 
DH line, CFD05021 
GSM1221632 
DH line, CFD05022 
GSM1221633 
DH line, CFD05023 
GSM1221634 
DH line, CFD05024 
GSM1221635 
DH line, CFD05025 
GSM1221636 
DH line, CFD05026 
GSM1221637 
DH line, CFD05027 
GSM1221638 
DH line, CFD05028 
GSM1221639 
DH line, CFD05029 
GSM1221640 
DH line, CFD05031 
GSM1221641 
DH line, CFD05032 
GSM1221642 
DH line, CFD05033 
GSM1221643 
DH line, CFD05035 
GSM1221644 
DH line, CFD05036 
GSM1221645 
DH line, CFD05037 
GSM1221646 
DH line, CFD05039 
GSM1221647 
DH line, CFD05040 
GSM1221648 
DH line, CFD05042 
GSM1221649 
DH line, CFD05043 
GSM1221650 
DH line, CFD05044 
GSM1221651 
DH line, CFD05045 
GSM1221652 
DH line, CFD05046 
GSM1221653 
DH line, CFD05047 
GSM1221654 
DH line, CFD05048 
GSM1221655 
DH line, CFD05049 
GSM1221656 
DH line, CFD05050 
GSM1221657 
DH line, CFD05054 
GSM1221658 
DH line, CFD05055 
GSM1221659 
DH line, CFD05056 
GSM1221660 
DH line, CFD05057 
GSM1221661 
DH line, CFD05058 
GSM1221662 
DH line, CFD05059 
GSM1221663 
DH line, CFD05060 
GSM1221664 
DH line, CFD05061 
GSM1221665 
DH line, CFD05062 
GSM1221666 
DH line, CFD05063 
GSM1221667 
DH line, CFD05064 
GSM1221668 
DH line, CFD05065 
GSM1221669 
DH line, CFD05066 
GSM1221670 
DH line, CFD05067 
GSM1221671 
DH line, CFD05068 
GSM1221672 
DH line, CFD05069 
GSM1221673 
DH line, CFD05070 
GSM1221674 
DH line, CFD05071 
GSM1221675 
DH line, CFD05072 
GSM1221676 
DH line, CFD05073 
GSM1221677 
DH line, CFD05074 
GSM1221678 
DH line, CFD05301 
GSM1221679 
DH line, CFD05302 
GSM1221680 
DH line, CFD05303 
GSM1221681 
DH line, CFD05304 
GSM1221682 
DH line, CFD05306 
GSM1221683 
DH line, CFD05307 
GSM1221684 
DH line, CFD05308 
GSM1221685 
DH line, CFD05309 
GSM1221686 
DH line, CFD05310 
GSM1221687 
DH line, CFD05311 
GSM1221688 
DH line, CFD05312 
GSM1221689 
DH line, CFD05313 
GSM1221690 
DH line, CFD05314 
GSM1221691 
DH line, CFD05315 
GSM1221692 
DH line, CFD05316 
GSM1221693 
DH line, CFD05317 
GSM1221694 
DH line, CFD05318 
GSM1221695 
DH line, CFD05319 
GSM1221696 
DH line, CFD05320 
GSM1221697 
DH line, CFD05321 
GSM1221698 
DH line, CFD05322 
GSM1221699 
DH line, CFD05324 
GSM1221700 
DH line, CFD06002 
GSM1221701 
DH line, CFD06003 
GSM1221702 
DH line, CFD06004 
GSM1221703 
DH line, CFD06005 
GSM1221704 
DH line, CFD06007 
GSM1221705 
DH line, CFD06011 
GSM1221706 
DH line, CFD06013 
GSM1221707 
DH line, CFD06018 
GSM1221708 
DH line, CFD06019 
GSM1221709 
DH line, CFD06021 
GSM1221710 
DH line, CFD06022 
GSM1221711 
DH line, CFD06023 
GSM1221712 
DH line, CFD06024 
GSM1221713 
DH line, CFD06025 
GSM1221714 
DH line, CFD06026 
GSM1221715 
DH line, CFD06027 
GSM1221716 
DH line, CFD06033 
GSM1221717 
DH line, CFD06035 
GSM1221718 
DH line, CFD06037 
GSM1221719 
DH line, CFD06039 
GSM1221720 
DH line, CFD06041 
GSM1221721 
DH line, CFD06042 
GSM1221722 
DH line, CFD06044 
GSM1221723 
DH line, CFD06045 
GSM1221724 
DH line, CFD06047 
GSM1221725 
DH line, CFD06049 
GSM1221726 
DH line, CFD06051 
GSM1221727 
DH line, CFD06054 
GSM1221728 
DH line, CFD06056 
GSM1221729 
DH line, CFD06058 
GSM1221730 
DH line, CFD06059 
GSM1221731 
DH line, CFD06062 
GSM1221732 
DH line, CFD06063 
... Accession list truncated, click here to browse through all related public accessions You can also download a list of all accessions here 

Relations 
BioProject 
PRJNA218068 
Supplementary file 
Size 
Download 
File type/resource 
GSE50558_CFD_intensities_GEO.txt.gz 
716.8 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
GSE50558_CFD_matrix_GEO.txt.gz 
505.9 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
GSE50558_CFF_intensities_GEO.txt.gz 
898.5 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
GSE50558_CFF_matrix_GEO.txt.gz 
626.7 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
GSE50558_Parental_intensities_GEO.txt.gz 
17.1 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
GSE50558_Parental_matrix_GEO.txt.gz 
13.1 Mb 
(ftp)(http) 
TXT 
Raw data are available on Series record 
Processed data included within Sample table 
Processed data are available on Series record 




