 |
 |
GEO help: Mouse over screen elements for information. |
|
Status |
Public on Jan 05, 2008 |
Title |
Homo sapiens 1.2 K allele specific expression 2 |
Technology type |
oligonucleotide beads |
Distribution |
custom-commercial |
Organism |
Homo sapiens |
Manufacturer |
Illumina, Inc. |
Manufacture protocol |
See Supplementary file
|
|
|
|
|
Submission date |
Jun 06, 2007 |
Last update date |
Jan 05, 2008 |
Contact name |
Aik Choon Tan |
E-mail(s) |
actan@jhu.edu
|
Phone |
410-502-8743
|
Fax |
410-614-9006
|
Organization name |
Johns Hopkins University
|
Department |
The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center at Johns Hopkins
|
Street address |
1650 Orleans Street, RM 1M86
|
City |
Baltimore |
State/province |
MD |
ZIP/Postal code |
21231 |
Country |
USA |
|
|
Samples (516)
|
GSM200062, GSM200063, GSM200064, GSM200065, GSM200066, GSM200067
GSM200068, GSM200069, GSM200070, GSM200071, GSM200072, GSM200073, GSM200074, GSM200075, GSM200076, GSM200077, GSM200078, GSM200079, GSM200080, GSM200081, GSM200082, GSM200083, GSM200084, GSM200085, GSM200086, GSM200087, GSM200088, GSM200089, GSM200090, GSM200091, GSM200092, GSM200093, GSM200094, GSM200095, GSM200096, GSM200097, GSM200098, GSM200099, GSM200100, GSM200101, GSM200102, GSM200103, GSM200104, GSM200105, GSM200106, GSM200107, GSM200108, GSM200109, GSM200110, GSM200111, GSM200112, GSM200113, GSM200114, GSM200115, GSM200116, GSM200117, GSM200118, GSM200119, GSM200120, GSM200121, GSM200122, GSM200123, GSM200124, GSM200125, GSM200126, GSM200127, GSM200128, GSM200129, GSM200130, GSM200131, GSM200132, GSM200133, GSM200134, GSM200135, GSM200136, GSM200137, GSM200138, GSM200139, GSM200140, GSM200141, GSM200142, GSM200143, GSM200144, GSM200145, GSM200146, GSM200147, GSM200148, GSM200149, GSM200150, GSM200151, GSM200152, GSM200153, GSM200154, GSM200155, GSM200156, GSM200157, GSM200158, GSM200159, GSM200160, GSM200161, GSM200162, GSM200163, GSM200164, GSM200165, GSM200166, GSM200167, GSM200168, GSM200169, GSM200170, GSM200171, GSM200172, GSM200173, GSM200174, GSM200175, GSM200176, GSM200177, GSM200178, GSM200179, GSM200180, GSM200181, GSM200182, GSM200183, GSM200184, GSM200185, GSM200186, GSM200187, GSM200188, GSM200189, GSM200190, GSM200191, GSM200192, GSM200193, GSM200194, GSM200195, GSM200196, GSM200197, GSM200198, GSM200199, GSM200200, GSM200201, GSM200202, GSM200203, GSM200204, GSM200205, GSM200206, GSM200207, GSM200208, GSM200209, GSM200210, GSM200211, GSM200212, GSM200213, GSM200214, GSM200215, GSM200216, GSM200217, GSM200218, GSM200219, GSM200220, GSM200221, GSM200222, GSM200223, GSM200224, GSM200225, GSM200226, GSM200227, GSM200228, GSM200229, GSM200230, GSM200231, GSM200232, GSM200233, GSM200234, GSM200235, GSM200236, GSM200237, GSM200238, GSM200239, GSM200240, GSM200241, GSM200242, GSM200243, GSM200244, GSM200245, GSM200246, GSM200247, GSM200248, GSM200249, GSM200250, GSM200251, GSM200252, GSM200253, GSM200254, GSM200255, GSM200256, GSM200257, GSM200258, GSM200259, GSM200260, GSM200261, GSM200262, GSM200263, GSM200264, GSM200265, GSM200266, GSM200267, GSM200268, GSM200269, GSM200270, GSM200271, GSM200272, GSM200273, GSM200274, GSM200275, GSM200276, GSM200277, GSM200278, GSM200279, GSM200280, GSM200281, GSM200282, GSM200283, GSM200284, GSM200285, GSM200286, GSM200287, GSM200288, GSM200289, GSM200290, GSM200291, GSM200292, GSM200293, GSM200294, GSM200295, GSM200296, GSM200297, GSM200298, GSM200299, GSM200300, GSM200301, GSM200302, GSM200303, GSM200304, GSM200305, GSM200306, GSM200307, GSM200308, GSM200309, GSM200310, GSM200311, GSM200312, GSM200313, GSM200314, GSM200315, GSM200316, GSM200317, GSM200318, GSM200319, GSM200320, GSM200321, GSM200322, GSM200323, GSM200324, GSM200325, GSM200326, GSM200327, GSM200328, GSM200329, GSM200330, GSM200331, GSM200332, GSM200333, GSM200334, GSM200335, GSM200336, GSM200337, GSM200338, GSM200339, GSM200340, GSM200341, GSM200342, GSM200343, GSM200344, GSM200345, GSM200346, GSM200347, GSM200348, GSM200349, GSM200350, GSM200351, GSM200352, GSM200353, GSM200354, GSM200355, GSM200356, GSM200357, GSM200358, GSM200359, GSM200360, GSM200361, GSM200362, GSM200363, GSM200364, GSM200365, GSM200366, GSM200367, GSM200368, GSM200369, GSM200370, GSM200371, GSM200372, GSM200373, GSM200374, GSM200375, GSM200376, GSM200377, GSM200378, GSM200379, GSM200380, GSM200381, GSM200382, GSM200383, GSM200384, GSM200385, GSM200386, GSM200387, GSM200388, GSM200389, GSM200390, GSM200391, GSM200392, GSM200393, GSM200394, GSM200395, GSM200396, GSM200397, GSM200398, GSM200399, GSM200400, GSM200401, GSM200402, GSM200403, GSM200404, GSM200405, GSM200406, GSM200407, GSM200408, GSM200409, GSM200410, GSM200411, GSM200412, GSM200413, GSM200414, GSM200415, GSM200416, GSM200417, GSM200418, GSM200419, GSM200420, GSM200421, GSM200422, GSM200423, GSM200424, GSM200425, GSM200426, GSM200427, GSM200428, GSM200429, GSM200430, GSM200431, GSM200432, GSM200433, GSM200434, GSM200435, GSM200436, GSM200437, GSM200438, GSM200439, GSM200440, GSM200441, GSM200442, GSM200443, GSM200444, GSM200445, GSM200446, GSM200447, GSM200448, GSM200449, GSM200450, GSM200451, GSM200452, GSM200453, GSM200454, GSM200455, GSM200456, GSM200457, GSM200458, GSM200459, GSM200460, GSM200461, GSM200462, GSM200463, GSM200464, GSM200465, GSM200466, GSM200467, GSM200468, GSM200469, GSM200470, GSM200471, GSM200472, GSM200473, GSM200474, GSM200475, GSM200476, GSM200477, GSM200478, GSM200479, GSM200480, GSM200481, GSM200482, GSM200483, GSM200484, GSM200485, GSM200486, GSM200487, GSM200488, GSM200489, GSM200490, GSM200491, GSM200492, GSM200493, GSM200494, GSM200495, GSM200496, GSM200497, GSM200498, GSM200499, GSM200500, GSM200501, GSM200502, GSM200503, GSM200504, GSM200505, GSM200506, GSM200507, GSM200508, GSM200509, GSM200510, GSM200511, GSM200512, GSM200513, GSM200514, GSM200515, GSM200516, GSM200517, GSM200518, GSM200519, GSM200520, GSM200521, GSM200522, GSM200523, GSM200524, GSM200525, GSM200526, GSM200527, GSM200528, GSM200529, GSM200530, GSM200531, GSM200532, GSM200533, GSM200534, GSM200535, GSM200536, GSM200537, GSM200538, GSM200539, GSM200540, GSM200541, GSM200542, GSM200543, GSM200544, GSM200545, GSM200546, GSM200547, GSM200548, GSM200549, GSM200550, GSM200551, GSM200552, GSM200553, GSM200554, GSM200555, GSM200556, GSM200557, GSM200558, GSM200559, GSM200560, GSM200561... Accession list truncated, click here to browse through all related public accessions You can also download a list of all accessions here
|
Series (2) |
GSE8055 |
Allele-Specific Expression 2 |
GSE9596 |
Allele-specific expression in familial pancreatic cancer |
|
Data table header descriptions |
ID |
|
GENE |
Gene Symbol |
ASO1 |
Allele Specific Oligonucleotide 1 |
ASO2 |
Allele Specific Oligonucleotide 2 |
LSO |
Ligation Specific Oligonucleotide |
CLONE_ID |
|
Data table |
ID |
GENE |
ASO1 |
ASO2 |
LSO |
CLONE_ID |
rs8073904 |
AATK |
CAGTGAGGATGAGGACACGGCT |
CAGTGAGGATGAGGACACGGCC |
CATCTTCACCGACACGTC |
rs8073904 |
rs1056169 |
ABL1 |
GGGACCAGCCGTCTTCCACT |
GGGACCAGCCGTCTTCCACC |
CCTTCATCCCTCTCATATCAAC |
rs1056169 |
rs1056174 |
ABL1 |
CGGGCTCGCCCATACCCA |
CGGGCTCGCCCATACCCG |
GGACTAGTGAGTCAGCACCTT |
rs1056174 |
rs1064152 |
ABL1 |
CCGCAATGCCGCTGAGTATCT |
CCGCAATGCCGCTGAGTATCC |
GATCAATGGCAGCTTCTTG |
rs1064152 |
rs1064156 |
ABL1 |
CTGCTAGAGAAGGACTACCGCATGA |
CTGCTAGAGAAGGACTACCGCATGG |
CAGAGAAGGTCTATGAACTCATG |
rs1064156 |
rs2229068 |
ABL1 |
CCGGAGCGCAGAGGGGCT |
CCGGAGCGCAGAGGGGCC |
GAAGAGGGCCGAGACATC |
rs2229068 |
rs2229070 |
ABL1 |
GCACAGTAACGCCTCCCCCG |
GCACAGTAACGCCTCCCCCC |
GGCTGGTGAAAAAGAATGAG |
rs2229070 |
rs7457 |
ABL1 |
GGTACTGGTCCCTTCCTTTTGTTAAT |
GGTACTGGTCCCTTCCTTTTGTTAAC |
TGATGTGCCACTATATTTTACAC |
rs7457 |
rs1318056 |
ABL2 |
GGGACAGTTCTCCTTCCACCTAATAC |
GGGACAGTTCTCCTTCCACCTAATAG |
TATGGCAGAGATCAGGACACT |
rs1318056 |
rs2274230 |
ABL2 |
TGACCTGTCTCAGGTCTATGACCTACTA |
TGACCTGTCTCAGGTCTATGACCTACTC |
AAAAAGGATATCGAATGGAACA |
rs2274230 |
rs10206004 |
ACVR1 |
CCGTCCCCTGGCCAAGCT |
CCGTCCCCTGGCCAAGCC |
ACTGGTGTAACAGGAACATCAC |
rs10206004 |
rs1134723 |
ACVR1 |
AAAGGCAGGTATGGTGAGGTGTGA |
AAAGGCAGGTATGGTGAGGTGTGG |
AATGTTGCCGTGAAGATCTT |
rs1134723 |
rs1146031 |
ACVR1 |
GGCAGCTGGCAAGGGGAA |
GGCAGCTGGCAAGGGGAG |
ATGTTGCCGTGAAGATCTTCT |
rs1146031 |
rs2228947 |
ACVR1 |
CAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGT |
CAGCAGTGCTTTTCCTCACTGAGC |
CTTCCACGTCTACCAGAAAG |
rs2228947 |
rs6729964 |
ACVR1 |
GACTATCTTCAGCTTACTACTCTGGATACA |
GACTATCTTCAGCTTACTACTCTGGATACG |
TTAGCTGCCTTCGAATAGTG |
rs6729964 |
rs11169974 |
ACVR1B |
CCCTGCTGACCTCCCACCTATT |
CCCTGCTGACCTCCCACCTATC |
CGGTTTATAGGTAATGATGGAAC |
rs11169974 |
rs11831802 |
ACVR1B |
GGGATCTGCCAACACACGTCT |
GGGATCTGCCAACACACGTCC |
CTCCCAAGCCACTAGCC |
rs11831802 |
rs2641516 |
ACVR1B |
TGTGCTGATATTTATGCCCTCGGG |
TGTGCTGATATTTATGCCCTCGGC |
TTGTATATTGGGAGATTGCTC |
rs2641516 |
rs2641529 |
ACVR1B |
CTGCCCAGCCCTCTGTGGA |
CTGCCCAGCCCTCTGTGGC |
CAAGAGGGACAGAGCCC |
rs2641529 |
rs2714 |
ACVR1B |
GGCTGTGGGTGGTGATTTGGTA |
GGCTGTGGGTGGTGATTTGGTC |
AACTTTGAAGCCATAACTTTTAAC |
rs2714 |
Total number of rows: 1189
Table truncated, full table size 112 Kbytes.
Supplementary data files not provided |
|
|
|
|
 |