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NIAID Influenza Genome Sequencing Project Data Releasing Status
Status Complete set Virus Species Sample provider Country Subtype Host From year To year
Sample provider All subtypes Subtype breakdowns
H3N2 H1N1 H1N2 Other
Released + Partial To come All Released + Partial To come All Released + Partial To come All Released + Partial To come All Released + Partial To come All
Adelaide (NIGSP-AA)
46
2000-2005
5
2000-2005
51
29
2000-2005
2
2000-2005
31
17
2000-2005
3
2000-2000
20
0
0
0
0
0
0
Argentina (NIGSP-ARG)
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Australia (NIGSP_RB)
890 + 3
2002-2011
7
2007-2008
900
0
0
0
0
0
0
0
0
0
890 + 3
2002-2011
7
2007-2008
900
Australia (NIGSP_RB2)
720 + 2
214-2014
1
2014-2014
723
0
0
0
0
0
0
0
0
0
720 + 2
214-2014
1
2014-2014
723
Australian Animal Health Laboratory (NIGSP-AHL)
30
2004-2005
2
2004-2004
32
0
0
0
0
0
0
0
0
0
30
2004-2005
2
2004-2004
32
BCM (NIGSP-NIH)
4
1994-2007
3
1995-2007
7
2
1997-2007
1
1995-1995
3
0
2
2006-2007
2
0
0
0
2
1994-2004
0
2
Baylor (NIGSP-TM)
48
1997-2005
0
48
0
0
0
0
0
0
0
0
0
48
1997-2005
0
48
Baylor_WKS (NIGSP_WKS)
49
2009-2009
0
49
0
0
0
49
2009-2009
0
49
0
0
0
0
0
0
Berkeley (NIGSP-EH)
79
2007-2008
45
2007-2008
124
36
2007-2007
2
2007-2007
38
37
2008-2008
36
2008-2008
73
0
0
0
6
2008-2008
7
2007-2008
13
Beth Israel Deaconess Medical Center (NIGSP_DOA)
79 + 3
2011-2012
3
2012-2012
85
57
2011-2012
0
57
20 + 2
2011-2012
0
22
0
0
0
2 + 1
2011-2012
3
2012-2012
6
Beth Israel Deaconess Medical Center (NIGSP_DOA2)
131 + 1
2012-2013
18
2012-2013
150
130
2012-2013
0
130
1
2012-2012
0
1
0
0
0
0 + 1
2012-2012
18
2012-2013
19
Beth Israel Deaconess Medical Center (NIGSP_DOB)
1 + 2
2011-2011
0
3
0
0
0
0
0
0
0
0
0
1 + 2
2011-2011
0
3
Beth Israel Deaconess Medical Center (NIGSP_DOS)
49
2009-2009
1
2010-2010
50
0
0
0
49
2009-2009
1
2010-2010
50
0
0
0
0
0
0
Boston (NIGSP-FB)
55
2007-2008
42
2007-2008
97
48
2007-2008
19
2008-2008
67
7
2007-2008
17
2007-2008
24
0
0
0
0
6
2008-2008
6
Boston_FBS (NIGSP_FBS)
130
2009-2009
1
2009-2009
131
7
2009-2009
1
2009-2009
8
123
2009-2009
0
123
0
0
0
0
0
0
Brazil pdm (NIGSP_AVS)
7
2009-2011
6
2009-2011
13
0
0
0
7
2009-2011
6
2009-2011
13
0
0
0
0
0
0
Brazil seasonal (NIGSP_AV)
0
18
2009-2009
18
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
18
2009-2009
18
CBER, FDA (NIGSP_GN)
26
1986-2004
0
26
0
0
0
25
1986-2004
0
25
0
0
0
1
2002-2002
0
1
CDC (NIGSP-CDC)
100
1987-2006
1
1999-1999
101
0
0
0
0
0
0
0
0
0
100
1987-2006
1
1999-1999
101
CDPH (NIGSP_CAS)
122
2009-2010
0
122
0
0
0
122
2009-2010
0
122
0
0
0
0
0
0
CDPH_CA (NIGSP_CA)
244
2009-2009
1
2009-2009
245
145
2009-2009
0
145
95
2009-2009
0
95
0
0
0
4
2009-2009
1
2009-2009
5
CDPH_CAH1 (NIGSP_CAH1)
0
1
2009-2009
1
0
0
0
0
1
2009-2009
1
0
0
0
0
0
0
CEIRS H2 project (NIGSP_CEIRS_CIP047_H2EU)
51
1999-2010
0
51
0
0
0
0
0
0
0
0
0
51
1999-2010
0
51
CEIRS_OSU (NIGSP_CEIRS_UMN033_COH)
130 + 1
2008-2010
0
131
9
2008-2009
0
9
8
2009-2010
0
8
3
2008-2009
0
3
110 + 1
2008-2010
0
111
CIDM flu B (NIGSP_DDB)
11 + 1
2010-2010
0
12
0
0
0
0
0
0
0
0
0
11 + 1
2010-2010
0
12
CIDM pdm (NIGSP_DD3)
58
2009-2011
1
2010-2010
59
0
0
0
56
2009-2011
0
56
0
0
0
2
2010-2010
1
2010-2010
3
CIDM seasonal (NIGSP_DD2)
2
2010-2010
0
2
2
2010-2010
0
2
0
0
0
0
0
0
0
0
0
CLEVB (NIGSP_CAI)
32 + 9
2008-2011
4
2010-2011
45
0
0
0
0
0
0
0
0
0
32 + 9
2008-2011
4
2010-2011
45
CSIRO (NIGSP-DB)
84 + 1
1972-2007
20
1978-2007
105
2
2004-2004
0
2
4
1980-2005
1
2005-2005
5
2
2004-2004
0
2
76 + 1
1972-2007
19
1978-2007
96
Chang Gung (NIGSP-SS)
52 + 1
1999-2008
58
2001-2008
111
8
2004-2008
3
2005-2006
11
9
1999-2008
4
2005-2007
13
0
0
0
35 + 1
2001-2007
51
2001-2008
87
Chile (NIGSP_CEIRS_CIP056_CHS)
73
2009-2010
0
73
0
0
0
73
2009-2010
0
73
0
0
0
0
0
0
Christian Medical College/Duke-NUS (NIGSP_IND)
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
Duke Univ. (NIGSP_CW)
76
2005-2007
57
2005-2007
133
43
2005-2005
18
2005-2005
61
33
2007-2007
39
2007-2007
72
0
0
0
0
0
0
Egypt (NIGSP-EGY)
6
2004-2008
14
2005-2008
20
0
0
0
0
0
0
0
0
0
6
2004-2008
14
2005-2008
20
Emory Univ. (NIGSP_CEIRS_ATL022_ALC)