Uncertain significance for Hereditary breast ovarian cancer syndrome — the classification assigned by German Consortium for Hereditary Breast and Ovarian Cancer, University Hospital Cologne to NM_007194.4(CHEK2):c.190G>A (p.Glu64Lys), citing ACMG Guidelines, 2015. This variant lies in the CHEK2 gene (transcript NM_007194.4) at coding-DNA position 190, where G is replaced by A; at the protein level this means replaces glutamic acid at residue 64 with lysine — a missense variant. Submitter rationale: Neueste funkt. Daten von Stolarova et al. 2023 neutral in CHK2 assay intermediate in KAP1 Assay. Roeb 2012 kommt hier auf ein ´´damaging´´; Kleiblova 2019 auf ein ´´deleterious´´, Boonen 2021 kommt auf ein ´´intermediate´´ während Delimitosu 2019 die Veränderung als benign einstuft. Boonen et al diskutieren sehr schön die diskordanten Ergebnisse in Hefe und Mensch und zeigen noch ein weiteres Problem der Hefeassays auf, nämlich die Analyse bei 30 Grad statt 37 Grad, was natürlich Auswirkungen auf Proteinstabilitäten hat. Wu X, Dong X, Liu W, et al.: Characterization of CHEK2 mutations in prostate cancer. Hum Mutat 2006;27:742–7 ´´reduced autophosphorylation, CDC25C phosphorylation and severely impaired T68 phosphorylation´´. In der Arbeit von Dorling et al. (BRIDGES/BCAC) wurde die Variante 60X in 60.000 BC cases und 30X in 53.000 Kontrollen gefunden. Vgl. c.1100delC 868X in 60.000 cases und 254X in 53.000 Kontrollen.Evtl. handelt es sich um eine hypomorphe Variante

Cited literature: PMID 25741868