Cyanobacteria (ID 598298) - BioProject

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Accession: PRJNA598298 ID: 598298

Cyanobacteria

Genome sequencing and assembly of 163 cyanobacterial strains

Genome sequences of 163 cyanobacterial strains mainly isolated from freshwater and terrestrial habitats. More...

Accession	PRJNA598298
Data Type	Genome sequencing and assembly
Scope	Multispecies
Publications	Chen MY et al., "Comparative genomics reveals insights into cyanobacterial evolution and habitat adaptation.", ISME J, 2021 Jan;15(1):211-227
Submission	Registration date: 31-Dec-2019 South China Normal University
Relevance	Evolution

Project Data:

Resource Name	Number of Links
Sequence data
Nucleotide (WGS master)	163
SRA Experiments	12
Publications
PubMed	1
PMC	1
Other datasets
BioSample	163
Assembly	163

Assembly details:

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Assembly level

Number of Assemblies

Contig

Total

163
163

Assembly	WGS	BioSample	Strain	Taxonomy
GCA_014696265.1	JACJPW000000000	SAMN13702754	FACHB-1375	Aerosakkonema funiforme FACHB-1375
GCA_014697025.1	JACJRC000000000	SAMN13702721	FACHB-956	Alkalinema sp. FACHB-956
GCA_014697625.1	JACJSG000000000	SAMN13702691	FACHB-119	Anabaena azotica FACHB-119
GCA_014698735.1	JACJTQ000000000	SAMN13702655	FACHB-362	Anabaena catenula FACHB-362
GCA_014696775.1	JACJQR000000000	SAMN13702733	FACHB-170	Anabaena cylindrica FACHB-170
GCA_014697335.1	JACJRP000000000	SAMN13702708	FACHB-243	Anabaena cylindrica FACHB-243
GCA_014696465.1	JACJQC000000000	SAMN13702748	FACHB-318	Anabaena cylindrica FACHB-318
GCA_014698305.1	JACJST000000000	SAMN13702678	FACHB-196	Anabaena lutea FACHB-196
GCA_014697125.1	JACJRG000000000	SAMN13702717	FACHB-250	Anabaena minutissima FACHB-250
GCA_014696225.1	JACJPV000000000	SAMN13702755	FACHB-1237	Anabaena sp. FACHB-1237
GCA_014696335.1	JACJPZ000000000	SAMN13702751	FACHB-1250	Anabaena sp. FACHB-1250
GCA_014696755.1	JACJQS000000000	SAMN13702732	FACHB-1391	Anabaena sp. FACHB-1391
GCA_014696765.1	JACJQP000000000	SAMN13702735	FACHB-709	Anabaena sp. FACHB-709
GCA_014697485.1	JACJRY000000000	SAMN13702699	FACHB-83	Anabaena sp. FACHB-83
GCA_014696825.1	JACJQU000000000	SAMN13702730	FACHB-251	Anabaena sphaerica FACHB-251
GCA_014697105.1	JACJRF000000000	SAMN13702718	FACHB-260	Anabaena subtropica FACHB-260
GCA_014697315.1	JACJRO000000000	SAMN13702709	FACHB-1171	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1171
GCA_014696815.1	JACJQT000000000	SAMN13702731	FACHB-1040	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1040
GCA_014698295.1	JACJSR000000000	SAMN13702680	FACHB-1290	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1290
GCA_014698705.1	JACJTN000000000	SAMN13702658	FACHB-1265	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1265
GCA_014698695.1	JACJTP000000000	SAMN13702656	FACHB-1416	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1416
GCA_014698755.1	JACJTO000000000	SAMN13702657	FACHB-1287	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1287
GCA_014698725.1	JACJTM000000000	SAMN13702659	FACHB-1249	Aphanizomenon flos-aquae FACHB-1249
GCA_014698245.1	JACJSQ000000000	SAMN13702681	FACHB-1399	Aphanizomenon sp. FACHB-1399
GCA_014698265.1	JACJSS000000000	SAMN13702679	FACHB-1401	Aphanizomenon sp. FACHB-1401
GCA_014698815.1	JACJTS000000000	SAMN13702653	FACHB-835	Arthrospira platensis FACHB-835
GCA_014698675.1	JACJTL000000000	SAMN13702660	FACHB-439	Arthrospira platensis FACHB-439
GCA_014698385.1	JACJSX000000000	SAMN13702674	FACHB-971	Arthrospira platensis FACHB-971
GCA_014696595.1	JACJQI000000000	SAMN13702742	FACHB-113	Aulosira sp. FACHB-113
GCA_014698045.1	JACJSE000000000	SAMN13702693	FACHB-615	Aulosira sp. FACHB-615
GCA_014696435.1	JACJQG000000000	SAMN13702744	FACHB-343	Calothrix anomala FACHB-343
GCA_014696315.1	JACJPX000000000	SAMN13702753	FACHB-236	Calothrix membranacea FACHB-236
GCA_014696555.1	JACJQH000000000	SAMN13702743	FACHB-288	Calothrix parietina FACHB-288
GCA_014696565.1	JACJQK000000000	SAMN13702740	FACHB-1219	Calothrix sp. FACHB-1219
GCA_014697055.1	JACJRD000000000	SAMN13702720	FACHB-156	Calothrix sp. FACHB-156
GCA_014696495.1	JACJQF000000000	SAMN13702745	FACHB-168	Calothrix sp. FACHB-168
GCA_014696895.1	JACJQX000000000	SAMN13702727	FACHB-1243	Chroococcidiopsis sp. [FACHB-1243]
GCA_014698845.1	JACJTV000000000	SAMN13702650	FACHB-1120	Coleofasciculus sp. FACHB-1120
GCA_014695485.1	JACJOI000000000	SAMN13702795	FACHB-125	Coleofasciculus sp. FACHB-125
GCA_014695435.1	JACJOH000000000	SAMN13702796	FACHB-129	Coleofasciculus sp. FACHB-129
GCA_014695285.1	JACJOA000000000	SAMN13702803	FACHB-501	Coleofasciculus sp. FACHB-501
GCA_014695825.1	JACJPB000000000	SAMN13702776	FACHB-542	Coleofasciculus sp. FACHB-542
GCA_014695685.1	JACJOW000000000	SAMN13702781	FACHB-64	Coleofasciculus sp. FACHB-64
GCA_014695635.1	JACJOQ000000000	SAMN13702787	FACHB-712	Coleofasciculus sp. FACHB-712
GCA_014698185.1	JACJSL000000000	SAMN13702686	FACHB-SPT36	Coleofasciculus sp. FACHB-SPT36
GCA_014695475.1	JACJOJ000000000	SAMN13702794	FACHB-SPT9	Coleofasciculus sp. FACHB-SPT9
GCA_014695375.1	JACJOG000000000	SAMN13702797	FACHB-T130	Coleofasciculus sp. FACHB-T130
GCA_014695345.1	JACJOC000000000	SAMN13702801	FACHB-471	Cyanobacteria bacterium FACHB-471
GCA_014695275.1	JACJOB000000000	SAMN13702802	FACHB-472	Cyanobacteria bacterium FACHB-472
GCA_014695325.1	JACJNZ000000000	SAMN13702804	FACHB-502	Cyanobacteria bacterium FACHB-502
GCA_014695255.1	JACJNX000000000	SAMN13702806	FACHB-63	Cyanobacteria bacterium FACHB-63
GCA_014695195.1	JACJNW000000000	SAMN13702807	FACHB-DQ100	Cyanobacteria bacterium FACHB-DQ100
GCA_014697365.1	JACJRR000000000	SAMN13702706	FACHB-4101	Cyanobacterium aponinum FACHB-4101
GCA_014697415.1	JACJRT000000000	SAMN13702704	FACHB-13342	Cyanobium sp. FACHB-13342
GCA_014697195.1	JACJRJ000000000	SAMN13702714	FACHB-282	Cylindrospermum sp. FACHB-282
GCA_014696935.1	JACJQZ000000000	SAMN13702725	FACHB-1129	Desertifilum sp. FACHB-1129
GCA_014696985.1	JACJRA000000000	SAMN13702724	FACHB-866	Desertifilum sp. FACHB-866
GCA_014697015.1	JACJRB000000000	SAMN13702723	FACHB-868	Desertifilum sp. FACHB-868
GCA_014698035.1	JACJSF000000000	SAMN13702692	FACHB-395	Desmonostoc muscorum FACHB-395
GCA_014697585.1	JACJSB000000000	SAMN13702696	FACHB-1091	Dolichospermum sp. FACHB-1091
GCA_014697535.1	JACJRZ000000000	SAMN13702698	FACHB-380	Fischerella sp. FACHB-380
GCA_014696095.1	JACJPN000000000	SAMN13702764	FACHB-16	Leptolyngbya sp. FACHB-16
GCA_014697225.1	JACJRK000000000	SAMN13702713	FACHB-161	Leptolyngbya sp. FACHB-161
GCA_014695405.1	JACJOE000000000	SAMN13702799	FACHB-1624	Leptolyngbya sp. FACHB-1624
GCA_014696055.1	JACJPM000000000	SAMN13702765	FACHB-17	Leptolyngbya sp. FACHB-17
GCA_014697285.1	JACJRN000000000	SAMN13702710	FACHB-238	Leptolyngbya sp. FACHB-238
GCA_014697265.1	JACJRM000000000	SAMN13702711	FACHB-239	Leptolyngbya sp. FACHB-239
GCA_014696065.1	JACJPL000000000	SAMN13702766	FACHB-261	Leptolyngbya sp. FACHB-261
GCA_014695975.1	JACJPI000000000	SAMN13702769	FACHB-321	Leptolyngbya sp. FACHB-321
GCA_014695955.1	JACJPG000000000	SAMN13702771	FACHB-36	Leptolyngbya sp. FACHB-36
GCA_014697245.1	JACJRL000000000	SAMN13702712	FACHB-402	Leptolyngbya sp. FACHB-402
GCA_014695875.1	JACJPC000000000	SAMN13702775	FACHB-541	Leptolyngbya sp. FACHB-541
GCA_014695775.1	JACJOX000000000	SAMN13702780	FACHB-60	Leptolyngbya sp. FACHB-60
GCA_014695745.1	JACJOV000000000	SAMN13702782	FACHB-671	Leptolyngbya sp. FACHB-671
GCA_014695615.1	JACJOR000000000	SAMN13702786	FACHB-711	Leptolyngbya sp. FACHB-711
GCA_014695575.1	JACJOO000000000	SAMN13702789	FACHB-8	Leptolyngbya sp. FACHB-8
GCA_014696485.1	JACJQD000000000	SAMN13702747	FACHB-1083	Limnothrix sp. FACHB-1083
GCA_014696455.1	JACJQE000000000	SAMN13702746	FACHB-1088	Limnothrix sp. FACHB-1088
GCA_014698235.1	JACJSP000000000	SAMN13702682	FACHB-406	Limnothrix sp. FACHB-406
GCA_014698215.1	JACJSO000000000	SAMN13702683	FACHB-708	Limnothrix sp. FACHB-708
GCA_014698135.1	JACJSN000000000	SAMN13702684	FACHB-881	Limnothrix sp. FACHB-881
GCA_014696155.1	JACJPR000000000	SAMN13702760	FACHB-1	Microcoleus sp. FACHB-1
GCA_014696105.1	JACJPO000000000	SAMN13702763	FACHB-1515	Microcoleus sp. FACHB-1515
GCA_014695925.1	JACJPE000000000	SAMN13702773	FACHB-45	Microcoleus sp. FACHB-45
GCA_014695895.1	JACJPD000000000	SAMN13702774	FACHB-53	Microcoleus sp. FACHB-53
GCA_014695295.1	JACJNY000000000	SAMN13702805	FACHB-61	Microcoleus sp. FACHB-61
GCA_014695725.1	JACJOU000000000	SAMN13702783	FACHB-672	Microcoleus sp. FACHB-672
GCA_014695715.1	JACJOT000000000	SAMN13702784	FACHB-68	Microcoleus sp. FACHB-68
GCA_014695585.1	JACJON000000000	SAMN13702790	FACHB-831	Microcoleus sp. FACHB-831
GCA_014695525.1	JACJOL000000000	SAMN13702792	FACHB-84	Microcoleus sp. FACHB-84
GCA_014695175.1	JACJNV000000000	SAMN13702808	FACHB-DQ6	Microcoleus sp. FACHB-DQ6
GCA_014849525.1	JACJNU000000000	SAMN13702809	FACHB-SPT15	Microcoleus sp. FACHB-SPT15
GCA_014698445.1	JACJSZ000000000	SAMN13702672	FACHB-917	Microcystis elabens FACHB-917
GCA_014698375.1	JACJSW000000000	SAMN13702675	FACHB-1344	Microcystis flos-aquae FACHB-1344
GCA_014698335.1	JACJSV000000000	SAMN13702676	FACHB-1342	Microcystis viridis FACHB-1342
GCA_014696875.1	JACJQV000000000	SAMN13702729	FACHB-1317	Microcystis wesenbergii FACHB-1317
GCA_014696215.1	JACJPS000000000	SAMN13702758	FACHB-1339	Microcystis wesenbergii FACHB-1339
GCA_014696165.1	JACJPQ000000000	SAMN13702761	FACHB-13	Nodosilinea sp. FACHB-13
GCA_014695395.1	JACJOF000000000	SAMN13702798	FACHB-131	Nodosilinea sp. FACHB-131
GCA_014696135.1	JACJPP000000000	SAMN13702762	FACHB-141	Nodosilinea sp. FACHB-141
GCA_014697355.1	JACJRQ000000000	SAMN13702707	FACHB-3891	Nostoc calcicola FACHB-3891
GCA_014698065.1	JACJSI000000000	SAMN13702689	FACHB-838	Nostoc flagelliforme FACHB-838
GCA_014698505.1	JACJTD000000000	SAMN13702668	FACHB-393	Nostoc foliaceum FACHB-393
GCA_014698525.1	JACJTE000000000	SAMN13702667	FACHB-391	Nostoc linckia FACHB-391
GCA_014696615.1	JACJQJ000000000	SAMN13702741	FACHB-104	Nostoc linckia FACHB-104
GCA_014698835.1	JACJTU000000000	SAMN13702651	FACHB-159	Nostoc paludosum FACHB-159
GCA_014696625.1	JACJQL000000000	SAMN13702739	FACHB-3921	Nostoc parmelioides FACHB-3921
GCA_014698495.1	JACJTC000000000	SAMN13702669	FACHB-252	Nostoc punctiforme FACHB-252
GCA_014697425.1	JACJRU000000000	SAMN13702703	FACHB-110	Nostoc sp. FACHB-110
GCA_014698055.1	JACJSH000000000	SAMN13702690	FACHB-133	Nostoc sp. FACHB-133
GCA_014697455.1	JACJRW000000000	SAMN13702701	FACHB-145	Nostoc sp. FACHB-145
GCA_014697475.1	JACJRV000000000	SAMN13702702	FACHB-152	Nostoc sp. FACHB-152
GCA_014696905.1	JACJQW000000000	SAMN13702728	FACHB-190	Nostoc sp. FACHB-190
GCA_014697615.1	JACJSD000000000	SAMN13702694	FACHB-280	Nostoc sp. FACHB-280
GCA_014698635.1	JACJTK000000000	SAMN13702661	FACHB-857	Nostoc sp. FACHB-857
GCA_014697495.1	JACJRX000000000	SAMN13702700	FACHB-87	Nostoc sp. FACHB-87
GCA_014696655.1	JACJQM000000000	SAMN13702738	FACHB-888	Nostoc sp. FACHB-888
GCA_014698795.1	JACJTR000000000	SAMN13702654	FACHB-892	Nostoc sp. FACHB-892
GCA_014698115.1	JACJSJ000000000	SAMN13702688	FACHB-973	Nostoc sp. FACHB-973
GCA_014696735.1	JACJQQ000000000	SAMN13702734	FACHB-418	Nostoc sp. PCC 7120 = FACHB-418
GCA_014698475.1	JACJTB000000000	SAMN13702670	FACHB-130	Nostoc spongiaeforme FACHB-130
GCA_014696015.1	JACJPJ000000000	SAMN13702768	FACHB-28	Oculatella sp. FACHB-28
GCA_014698145.1	JACJSM000000000	SAMN13702685	FACHB-1406	Oscillatoria sp. FACHB-1406
GCA_014697545.1	JACJSA000000000	SAMN13702697	FACHB-1407	Oscillatoria sp. FACHB-1407
GCA_014697375.1	JACJRS000000000	SAMN13702705	FACHB-1136	Phormidium sp. FACHB-1136
GCA_014695965.1	JACJPH000000000	SAMN13702770	FACHB-322	Phormidium sp. FACHB-322
GCA_014695795.1	JACJOZ000000000	SAMN13702778	FACHB-592	Phormidium sp. FACHB-592
GCA_014695595.1	JACJOP000000000	SAMN13702788	FACHB-77	Phormidium sp. FACHB-77
GCA_014696675.1	JACJQN000000000	SAMN13702737	FACHB-1052	Phormidium tenue FACHB-1052
GCA_014696925.1	JACJQY000000000	SAMN13702726	FACHB-1050	Phormidium tenue FACHB-1050
GCA_014764505.1	JACXWX000000000	SAMN13702722	FACHB-886	Phormidium tenue FACHB-886
GCA_014698535.1	JACJTF000000000	SAMN13702666	FACHB-1261	Planktothricoides raciborskii FACHB-1261
GCA_014698175.1	JACJSK000000000	SAMN13702687	FACHB-1370	Planktothricoides raciborskii FACHB-1370
GCA_014748295.1	JACJUP000000000	SAMN13702759	FACHB-1355	Planktothrix sp. FACHB-1355
GCA_014697575.1	JACJSC000000000	SAMN13702695	FACHB-1365	Planktothrix sp. FACHB-1365
GCA_014696345.1	JACJPY000000000	SAMN13702752	FACHB-1277	Pseudanabaena cinerea FACHB-1277
GCA_014696385.1	JACJQB000000000	SAMN13702749	FACHB-723	Pseudanabaena mucicola FACHB-723
GCA_014696355.1	JACJQA000000000	SAMN13702750	FACHB-1998	Pseudanabaena sp. FACHB-1998
GCA_014696715.1	JACJQO000000000	SAMN13702736	FACHB-2040	Pseudanabaena sp. FACHB-2040
GCA_014698825.1	JACJTT000000000	SAMN13702652	FACHB-800	Richelia sinica FACHB-800
GCA_014698435.1	JACJTA000000000	SAMN13702671	FACHB-248	Scytonema hofmannii FACHB-248
GCA_014696195.1	JACJPT000000000	SAMN13702757	FACHB-1094	Sphaerospermopsis sp. FACHB-1094
GCA_014696235.1	JACJPU000000000	SAMN13702756	FACHB-1194	Sphaerospermopsis sp. FACHB-1194
GCA_014698905.1	JACJTX000000000	SAMN13702648	FACHB-805	Synechococcus elongatus PCC 7942 = FACHB-805
GCA_014698895.1	JACJTW000000000	SAMN13702649	FACHB-1061	Synechococcus elongatus FACHB-1061
GCA_014698415.1	JACJSY000000000	SAMN13702673	FACHB-242	Synechococcus elongatus FACHB-242
GCA_014698945.1	JACJTY000000000	SAMN13702647	FACHB-909	Synechococcus sp. FACHB-909
GCA_014698605.1	JACJTJ000000000	SAMN13702662	FACHB-383	Synechocystis sp. FACHB-383
GCA_014698575.1	JACJTG000000000	SAMN13702665	FACHB-898	Synechocystis sp. FACHB-898
GCA_014698595.1	JACJTH000000000	SAMN13702664	FACHB-908	Synechocystis sp. FACHB-908
GCA_014698625.1	JACJTI000000000	SAMN13702663	FACHB-929	Synechocystis sp. FACHB-929
GCA_014697075.1	JACJRE000000000	SAMN13702719	FACHB-123	Tolypothrix sp. FACHB-123
GCA_014696035.1	JACJPK000000000	SAMN13702767	FACHB-262	Trichocoleus sp. FACHB-262
GCA_014695915.1	JACJPF000000000	SAMN13702772	FACHB-40	Trichocoleus sp. FACHB-40
GCA_014695385.1	JACJOD000000000	SAMN13702800	FACHB-46	Trichocoleus sp. FACHB-46
GCA_014695845.1	JACJPA000000000	SAMN13702777	FACHB-591	Trichocoleus sp. FACHB-591
GCA_014695815.1	JACJOY000000000	SAMN13702779	FACHB-6	Trichocoleus sp. FACHB-6
GCA_014695675.1	JACJOS000000000	SAMN13702785	FACHB-69	Trichocoleus sp. FACHB-69
GCA_014695535.1	JACJOM000000000	SAMN13702791	FACHB-832	Trichocoleus sp. FACHB-832
GCA_014695505.1	JACJOK000000000	SAMN13702793	FACHB-90	Trichocoleus sp. FACHB-90
GCA_014697155.1	JACJRH000000000	SAMN13702716	FACHB-171	Trichormus variabilis FACHB-171
GCA_014697165.1	JACJRI000000000	SAMN13702715	FACHB-319	Trichormus variabilis FACHB-319
GCA_014698355.1	JACJSU000000000	SAMN13702677	FACHB-164	Trichormus variabilis FACHB-164

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Genome sequencing and assembly of 163 cyanobacterial strains

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