Conserved Protein Domain Family
PRK12540

?
PRK12540: PRK12540 
RNA polymerase sigma factor; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 183579
Aligned: 12 rows
Threshold Bit Score: 327.307
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
146338150   1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNSDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
27382908    1 MPLTDSLRNDILAAVPSLRAFAISLSGNADRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
92119032    1 MPLTDSLREDILASVPNLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
75676957    1 MPLTDSLRDEILASVPNLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
39937285    1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNADRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
115523766   1 MPLTDSLRDDLLAAVPSLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
90425505    1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
91975846    1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
86748511    1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNGDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
192293067   1 MPLTDSLRDDILAAVPSLRAFAISLSGNADRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
209886518   1 MPLTNALRDEILAAVPSLRAFAISLSGKSDRADDLVQETLLRALANIDSFQPGSNLPAWLFTILRNLFRSDYRKRRREVE 80 
298290070   2 SQFDPALRDEIIAAIPNLRAFAISLSGSVDRADDLVQETLLRAFANISSFRPGTNLPAWLFTILRNLFRSEYRKRRREVP 81 
146338150  81 DAEGNYAKTLKTHPSQGAHLEFEEFRAALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLAALLY 160
27382908   81 DAEGNYAKTLKTQPSQNAHLEFEEFRTALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAASICGCAVGTIKSRVNRARSKLAALLY 160
92119032   81 DSDGNYAKTLKSQPNQNAHLEFEEFRAALDKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAKICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
75676957   81 DSDGNYAKTLKSQPSQNAHLEFEEFRAALDKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAKICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
39937285   81 DADGSYAKTLKSQPGQTAHLEFEEFRAALDKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
115523766  81 DAEGSYAKTLKSQPGQDAHLEFEEFRTALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSAMLY 160
90425505   81 DAEGSYAKTLKSQPGQNAHLEFEEFRAALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSAMLY 160
91975846   81 DADGSYAKTLKSQPGQNAHLEFEEFRVALDKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
86748511   81 DADGSYAKTLKSQPGQNAHLEFEEFRAALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
192293067  81 DADGSYAKTLKSQPGQTAHLEFEEFRAALDKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSALLY 160
209886518  81 DAEGSYSKTLKSQPTQSSHLEFEEFRAALEKLPQDQREALILVGASGFSYEDAAAICGCAVGTIKSRVNRARSKLSAMLY 160
298290070  82 DSDGAFAATLTTNPDQATHLDFEDFRTALDKLPPDQREALVLVGASGFSYEEAADICQCAVGTIKSRVNRARKRLGELLA 161
146338150 161 VEGAEDFGPDETVRAVIGGSGG 182
27382908  161 VDGAEDFGPDETVRAVIGGSGG 182
92119032  161 VEGTEDFGPDDTVRAVIGSGR- 181
75676957  161 VEGTEDFGPDDTVRAVIGNR-- 180
39937285  161 VDGAEDFGPDDTVRAVIGGNG- 181
115523766 161 VDGAEDFGPDNTVRAVIGSSSG 182
90425505  161 VDGAEDFGPDDTVRAVIGGSGG 182
91975846  161 VDGAEDFGPDNTVRAVIGGNG- 181
86748511  161 VDGAEDFGPDDTVRAVIGSNG- 181
192293067 161 VDGAEDFGPDDTVRAVIGGNG- 181
209886518 161 VDGTEDFGPDSTVRAVIGGSGN 182
298290070 162 IEDVEDFGPDKTTRAVLAAERA 183
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap