Conserved Protein Domain Family
PHA03089

?
PHA03089: PHA03089 
late transcription factor VLTF-4; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 222977
Aligned: 20 rows
Threshold Bit Score: 131.47
Created: 9-Dec-2010
Updated: 16-Jan-2013
Structure
?
Aligned Rows:
PubMed ReferencesClick to see Conserved Features Help

Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
148912953   1 MSWSINLGNNGDNFKTLEEIRAHVRST-----TENMDKVTDEIFPSDVKIPTTSSSSRQKKPVVRKKAVTATKKSKKIKE 75 
113195282   1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NDDIFPEDVIIPSTKPKTKRATTPRKPAATKISTKKDKEKE 74 
17975008    1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NEDIFPEDVIIPSTKPKTKRTTTPRKPAATKRSTKKDKEKE 74 
22164692    1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NEDIFPEDVIIPSTKPKTKRTITPRKPAATKRSTKKDKEKE 74 
18640335    1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NDDIFPEDVIIPSTKPKTKRAIT-RKPAATKRSTKKDKEKE 73 
20178478    1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NEDIFPEDVIIPSTKPKTKRAAAPRKPAATKRSTKKEEVEE 74 
9634812     1 MSWTNSE---DKSFKTIDELKAKVKADsshhvSNSASDTEPEMIPEVVKKPTKKTAKKTKKQ------------------ 59 
9627609     1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLRNS-----AENKDK-NDDIFPEDVIIPSTKPKTKRATTPRKPAATKRSTKKDKEKE 74 
66275900    1 MAWSITNKADTSSFTKMAEIRAHLKNS-----AENKDK-NEDIFPEDVIIPSTKPKTKRATTPRKPAATKRSTKKEEVEE 74 
38229238    1 MSWSINLGNGGDNFKTLDEIRAHVKST-----TESVDEVTEEIFPSDIEIPSQKTPIKKRAVTRKKQTTVSKPKCSGK-- 73 
148912953  76 KTPiedhddendnddndndndndndndndndndndndndndddinnievndKNNNINNSDTEENENDDKKEDNKKSkKST 155
113195282  75 EVEeevvieeyhqtteen------------------spppssspgvgdiveSVAAVELDDSDGDDEP----------MVQ 126
17975008   75 EVEeveevvieeyhqttee----------------nspppssspgvgdiveSVAAVELDDSDGDDEP----------MVQ 128
22164692   75 EVEeevvieeyrqtteen------------------spppsssprvgdiveSVAAVELDDSDGGDDEP---------MVQ 127
18640335   74 EVEeevvieeyhqttedn------------------spppssspgvgdiveSVAAVELDDSDGDDEP----------MVQ 125
20178478   75 EVVveeyhqtteensp----------------------ppssspgvgdiveSVAAVELDDSDGDDE-----------PMA 121
9634812    60 ---------------------------------------------------ELASCNSSNPNTDPFTKDLDLYDLDvLSD 88 
9627609    75 EVEeeevvieeyhqtteen-----------------spppssspgvgniveSVTAVELDDSNGDDDNDNDNDDNEP-MVQ 136
66275900   75 EVVieeyhqttekn--------------------------spspgvsdiveSVAAVELDDSDGDDEP----------MVQ 118
38229238   74 ---------------------------------------------------EKLIKPESDNEKTEENEK--------SKE 94 
148912953 156 NNYNNQHEDGVINNSDLKIATESIIKGLKILNNKVSSVSTVLEDVQAASINRQYSSLIKNIDLLKS-LAECGKSQVIRKK 234
113195282 127 VEAGKVNHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIITRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 205
17975008  129 VEAGKVNHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIITRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 207
22164692  128 VEAGKVNHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIITRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 206
18640335  126 VESGKANHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIIIRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 204
20178478  122 QAGAKVNHSARSDVSDLKVATDNIVKDLKKIITRIAAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 200
9634812    89 GKCAEENKPSSIDLVETRLVIKTISKSIKDIAHRIAALRSVIHDLDLTDIPKNTGQAIKEVDKLKEaLCNLGVSVPPPKQ 168
9627609   137 VEAGKVNHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIITRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKSITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 215
66275900  119 VEAGKVNHSARSDLSDLKVATDNIVKDLKKIITRISAVSTVLEDVQAAGISRQFTSMTKAITTLSD-LVTEGKSKVVRKK 197
38229238   95 NLSKNTNSDEDINDSDLKIATDKIIKDLKVLNSRISAISTVLEDVQASSVSRQFTSLGKSVDVLKA-TIESGKTKVTRKK 173
148912953 235 VKNTKK 240
113195282 206 VKTCKK 211
17975008  208 VKTCKK 213
22164692  207 VKTCKK 212
18640335  205 VKTCKK 210
20178478  201 VKTCKK 206
9634812   169 QRKKAK 174
9627609   216 VKTCKK 221
66275900  198 VKTCKK 203
38229238  174 PRHDLK 179
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap