Conserved Protein Domain Family
PHA01075

?
PHA01075: PHA01075 
major capsid protein
Statistics
?
PSSM-Id: 222818
Aligned: 5 rows
Threshold Bit Score: 715.247
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
157738605   1 MAPASTKNETALLVAksaksaLQDFNHDYSKSWTFGDKWDNNNTMFETFVNKYLFPKINETLLIDIALGNRFNWLAKEQD 80 
31072024    1 MADETTNVAGAIVAS------LNDFNADNGKSWTFGTNWNAVGTDFETYTNQYLFPKLNETLIVETAAGNRLDWLAKEID 74 
29565763    1 MAQQSTKNETALLVAksaksaLQDFNHDYSKSWTFGDKWDNSNTMFETFVNKYLFPKINETLLIDIALGNRFNWLAKEQD 80 
66395193    1 MAQQSTKNETALLVAksaksaLQDFNHDYSKSWTFGDKWDNSNTMFETFVNKYLFPKINETLLIDIALGNRFNWLAKEQD 80 
29565740    1 MAQQSTKNETALLVAksaksaLQDFNHDYSKSWTFGDKWDNSNTMFETFVNKYLFPKINETLLIDIALGNRFNWLAKEQD 80 
157738605  81 FIGQYSEEYVIMDTVPINMDLSKNEELMLKRNYPRMATKLYGSGIVKKQKFTLNNNDTRFNFQTLADATNYALGVYKKKI 160
31072024   75 FIGQYSEEYVILDTVPVELDLSKSAQLMLERNYPKIASKLYGAGILKKLKFTLNDNIQRQQFATLGDATKFAVQVYKKKI 154
29565763   81 FIGQYSEEYVIMDTVPINMDLSKNEELMLKRNYPRMATKLYGNGIVKKQKFTLNNNDTRFNFQTLADATNYALGVYKKKI 160
66395193   81 FIGQYSEEYVIMDTVPINMDLSKNEELMLKRNYPRMATKLYGNGIVKKQKFTLNNNDTRFNFQTLADATNYALGVYKKKI 160
29565740   81 FIGQYSEEYVIMDTVPINMDLSKNEELMLKRNYPRMATKLYGNGIVKKQKFTLNNNDTRFNFQTLADATNYALGVYKKKI 160
157738605 161 SDINVLEEKEMRAMLVDYSLNQLSESNVRKTTSKEDLASKVFEAILNLQNNSAKYNEVHRASGGAIGQYTTVSKLKDIVI 240
31072024  155 ADINISEEQELKAIIMDYTSHIADVREVESGATMQQFINKVYTAILNLQNNSAKHNEAAQASGGAVGRFTTNTKLKDMLI 234
29565763  161 SDINVLEEKEMRAMLVDYSLNQLSETNVRKATSKEDLASKVFEAILNLQNNSAKYNEVHRASGGAIGQYTTVSKLKDIVI 240
66395193  161 SDINVLEEKEMRAMLVDYSLNQLSETNVRKATSKEDLASKVFEAILNLQNNSAKYNEVHRASGGAIGQYTTVSKLKDIVI 240
29565740  161 SDINVLEEKEMRAMLVDYSLNQLSETNVRKATSKEDLASKVFEAILNLQNNSAKYNEVHRASGGAIGQYTTVSKLKDIVI 240
157738605 241 LTTDSLKSYLLDTKIANTFQIAGIDFTDHVISFDDLGGVFKVTKEFKLqNQETIDFLRAYGDYQSQIGDTIPVGAVFTYD 320
31072024  235 VTTDEMKVEILNSFLANTFHAEGLDITSQIISFEDLGGVYKAAEDITV-DATIQGVMAAMGDYQVKAGDVIPAGTVFTYE 313
29565763  241 LTTDSLKSYLLDTKIANTFQIAGIDFTDHVISFDDLGGVFKVTKEFKLqNQDSIDFLRAYGDYQSQLGDTIPVGAVFTYD 320
66395193  241 LTTDSLKSYLLDTKIANTFQIAGIDFTDHVISFDDLGGVFKVTKEFKLqNQDSIDFLRAYGDYQSQLGDTIPVGAVFTYD 320
29565740  241 LTTDSLKSYLLDTKIANTFQIAGIDFTDHVISFDDLGGVFKVTKEFKLqNQDSIDFLRAYGDYQSQLGDTIPVGAVFTYD 320
157738605 321 VS--KLKEFTGNIEEIKPKSDLYAFILDINAIKYKRYTKGMLKQPFYNGEFDEVTHWIHYYSFKAISPFFNKILITDQD 397
31072024  314 IPaeALGDQADALVEVKPDSDEFVAIFDVRSIRYKRYTRNMLKAPFYNGEFDEVTHWIHYYSMKAISPFYNKVVIKRAN 392
29565763  321 VS--KLKEFTGNVEEIKPKSDLYAFILDINSIKYKRYTKGMLKPPFHNPEFDEVTHWIHYYSFKAISPFFNKILITDQD 397
66395193  321 VS--KLKEFTTNVEEIKPKSDLYAFILDINSIKYKRYTKGMLKQPFHNPEFDEVTHWIHYYSFKAISPFFNKILITDQD 397
29565740  321 VS--KLKEFTGNVEEIKPKSDLYAFILDINSIKYKRYTKGMLKPPFHNPEFDEVTHWIHYYSFKAISPFFNKILITDQD 397
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap