Conserved Protein Domain Family
infB

?
CHL00189: infB 
translation initiation factor 2; Provisional
Statistics
?
PSSM-Id: 177089
Aligned: 6 rows
Threshold Bit Score: 888.796
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
90994448    6 QNFENRSSrsssniNSSETIVDLKNPQII-----------YKIRLESVNNDNLLNLDLDKSESHtggeqhl-elssppKL 73 
11465723    6 QNFEKKTSsystnnNSSEKIVDLKNPQFI-----------YKIRLESTSTDNLLHLDIDKSETDgpnteqhlelssppRI 74 
11467694    6 HTYIQNYT------SSDDETIVLINPLILnlfn----ktnYDISQSNKQKDSIYHLDINIKTNS--------------KL 61 
51209974    1 MRYSNVIDfsicmsIKSENTFLLENPKFIknlkffnihssQEPKSPTDIRNSVENSDFNVQLEN---------------- 64 
149072054   1 --MNNNIA------ISKENTIKLSFPLVFdtkttntstkeYVETIKEDEKVDLFDPTIDTKLFV--------------KP 58 
283794887   1 ------------------------------------------------------MVNKNKASHE--------------EM 12 
90994448   74 DKKSKNFNKI---HDLVDSKKNKNRQRKKIKTKIHIDDDDDNFRDSNSNVSQ-------TAGDLAISLMRPPKPKVEVVK 143
11465723   75 DKKNKNFNKA---HDLLDNKKNKNRQRKKIKNKIHIDDDDDNFSDSTSNSAQ-------TAGDLAISLMRPPKPRSQSIK 144
11467694   62 DKKSKKIDRNq--DEVDELAKSKTKSKKKVQVEFETDDEYLNV----------------FNKPKHFDIVEKNIRKTEILN 123
51209974   65 --------------KLKNSFKQDGKQKSKKKKILSVDLDQEHIFKKKNKSKViisapddLTNNSEGSFKSGKQKKKEKGK 130
149072054  59 DRKTKKNDKSdqrDSDIDIIKTKLKSKKKEKSKFRKDEDYDSLKREDNQSPQgamsslpFARPEV--PAKKMVSNTNTLN 136
283794887  13 PETNRHSNKT-------ESNQTELIQKKLAEKTL---------------------------------------NQATKEK 46 
90994448  144 KLTSNKKSIRQKKVAVTPSQNSASIQSNSPPESISITNPLTIQELSKLICVQETDIIKYLFLKRISVTMNQTIDASIISS 223
11465723  145 KVIGNNKIPQQKKQQVASSIDQSITLPNSPPESISLINPLTIQELSRLICIPETDIIKYLFLKGISVTINQTVDNTIISS 224
11467694  124 EIKTINSATGKKNKKLLSRKKEEIVEDNQIPKELRINSSLTVQEFAELTCISDIEIIRTLFLKGQAVTVNQILDINTIIE 203
51209974  131 HKQNVNKDIHHTKNNRLSNLDP--LDDINKDKSVIIDSSLSIEELSIKLKIPPAEIITGLFLKGISVTVNQIIDIAIATQ 208
149072054 137 KKNVVKSSTKKSKKQTSAKNRELEQNLLVKPENVVIAGPLSVQELAVLLTVSETEIIRSLFLKGIGVTINQILDVSTAKT 216
283794887  47 STITKDKKKNKTSKKKLEEKAELKKYAPNTSKEISIHRTTCIEELSTLLLTPKNEIIKSLLLKGISVTPNQLINEDIIQQ 126
90994448  224 VADNFGIAVESNVKENNNGLSSNLDNSNAFyeTGNYIKRPPIVTVMGHVDHGKTTLLDYIRKSNNANKEIGGITQAIAAY 303
11465723  225 VAKNFGIAVDSQEQNNKKKKLTNLDIPVIVd-NHHCVNRPPVVTILGHVDHGKTSLLDYIHKSNNANKEVGGITQNIVAY 303
11467694  204 LGKDFHINIQIEEKNGLNEVNIEKNNFIKF--SENTIRRAPIVTILGHVDHGKTTLLDKIRQTQIAQKEAGGITQKIAAY 281
51209974  209 VAQKYNFTVINQNQNNQSELDQSDKLQQVS--TITSINRAPIVTILGHVDHGKTTLLDAIRNTNAAGKEIGGITQSIKAY 286
149072054 217 VGEDLGINIDHVKDSDEESKKLQIHEID----NESLEKRPPVIAIMGHVDHGKTTLLDKIRKTQIAQKEAGGITQKIGAY 292
283794887 127 IADEYETKIITEPKPIITTKTSKPISTSAQ------TQRPPIVTIIGHVNHGKTTLLHKIRNSQTNQKEAGGITQKIGAY 200
90994448  304 EVEYIKkdnkQKIVFLDTPGHEAFTSMRSRGANLTDVAIIIIAADDGVKPQTIEAINHIQKANVPFVIAISKIDKAG--- 380
11465723  304 EVEFKH----QQIVFLDTPGHEAFTSMRSRGANLTDIAIIIIAADDGIKPQTIEAIQHLQKANVPFIVAISKIDKNL--- 376
11467694  282 KVNVQYknenRNIVFLDTPGHEAFSNMRSRGINVTDIVILLVAADDGVKPQTIEAINAIKAAKLPIIVAINKIDKDQ--- 358
51209974  287 EVNWPYnssnQKLIFIDTPGHEAFSSMRLRCAQITDIVILIIAADDGLKPQTIEAINYISSKKTPFIVAINKIDKAN--- 363
149072054 293 EVEIDYkdqtKKLTFLDTPGHEAFSGMRSRGVQVTDIAILVVAADDGVKPQTVEAIKYIQAANVPIIVAINKIDKEN--- 369
283794887 201 ETIFEHkgenRKIVFLDTPGHETFSSTRSKSLSNSDLAILVIAIDDGIKAQTIESIKQAKDANIPIVVAINKVDKTDsik 280
90994448  381 SNTDIIEQDLLKYNVMSEKLGGQVPIIPISSLTGQNVDKLLETITLLAELEDLKADPTQPAQGIIIEAHLDKSHGPVATL 460
11465723  377 DSVDKIQHDLVAQNVISEKLGGSVPIIPISSVTGENIDKLLETILLLAELENLQADPTQLAQGVIIEAHLDKFHGPAATL 456
11467694  359 ANIEKVQQELSKYELIPESWGGQTPMIPISASQGTNIDSLLELILLMADIENYQAIEEDLASGTILESHIDRTRGPIASI 438
51209974  364 LNLIRVREELATYNIISTDWGGEIQFIEISALQKRNISQLLTAICSLAEFINLKADPTELVQGSILEAYLDKTKGIVVNI 443
149072054 370 ADIENIKQQLTQYNLIPENWGGDTLMVPISAMKGTNMENLLEMIILVSEIEDLKANTKVKAQGTVLEAHLDRTKGAVATL 449
283794887 281 ANTERLKTQLAEYNLIPEEWGGDTSMVAVSASQEYGIKELIDNIFLRTDMLDLRANPTCEAKGIVLETNINKTKGITTLI 360
90994448  461 LIQNGTLNISDNLVIGSAYAKIRVIINNAKEKINLAIPSSVVEIWGLSSVPATGEIALAVKSDKEAKLKAIENTSKDssi 540
11465723  457 LIQNGTLHIGDNMVIGMTHAKIRAIINNAKQKINLAAPSSVVEIWGLSSVPATGEVALVVNSDKEAKLKAIENESTNsii 536
11467694  439 LVQNGTLKLGDIIVTGTSLGKIRGMLDSEGNKINTLTPSSPGIIWGLNKSLNSGDKFQTFSNEKDAKTYFSKESENN--- 515
51209974  444 IVLSGTLHIGDIIVSGHSYGRVKKIINSLGNELIQAGPSSILEVLGFYSIPQTGRYFQVVNSEKEAKKMIAQIPLSG--- 520
149072054 450 LVQNGTLRIGDILTAGTSMAKIRGMINSLGEKIEECLPSSPVLIWGLSKLPASGEHFEIFDDEKQAKIAVQKAQEAN--- 526
283794887 361 LVQEGTLHIGETIVIGDTWSKIKNMVDASGKTTLVATASSVITIQGLLTTPHTETHFSCFRKVKDAIEFIKMKKTNT--- 437
90994448  541 iqkQRALNSRITLDTLKNTNSKDISKQISLIIKTDNQGSTEAILDSLSQFPQSKVQLNVVSIMPGEITATDVELASTTNS 620
11465723  537 vqkQKSLNSRITLDTISTINAKDENKQVTLIIKTDNQGSTEAILDSLSQFPQSKVQLNVLSIFPGEITATDVELASTTNS 616
11467694  516 ---KKITYNYISENPSNQILEESSKKILNFILKTDTQGSIEAIVNAISRIKTKQLQIKILYSNLGEVTETDVEFASTTNA 592
51209974  521 ---ITQTTKNILNLNPKVYNHNLNTRSLNLIIKADTQGTIDAIINSFIQISQKKIKLNILTASLGVVSNTDLDLAFSTQA 597
149072054 527 ---KENQTIANTISENYTLSNSNTKGVINLIIKTDIQGSAEAIIGSINKIPQDKVQVRVLYASAGEITETDIDFADTSGA 603
283794887 438 -----DFPKTPLVSATHSFIKQENKTEINVIIKAESQGLLEAVALNIPTQKHPNVNVRITKASVGYVTETDVEFAITSKS 512
90994448  621 TLIGFNTNFAPGTKQASAKSNILIENYQIIYALIEDIKRRMEDLLDPEYSEVPVGEAEVSTVFSLANRKIAGCRVINNKL 700
11465723  617 SLIGFNTNFAPGSRQAAAKLNVIIENYQIIYALIEGVREKMETLLDPEYSEVPVGEAEVGTVFSLANRKIAGCRVTNNKL 696
11467694  593 FVLAFNTRLAPGAKKTARQLNIDIREYNVVYDLVEDIESLIAQHSEPEYKKLKIGAATVKAVFPLGKNFVAGIIINEGKI 672
51209974  598 LIIAFNINISTNILNAAEKLNLSLRKFVLIYDLVDYVTYSMLDLVDPEYDKILIGQAEVQTTFTINKGTVAGCIVKSGKL 677
149072054 604 IVLAFNTSLATGASKAARHLNVKVKEYDVIYDLLDYIELTIEEITGPEYDKKSLGKAIVQGVFPLAKSFVAGLRVTEGKI 683
283794887 513 EILAFNTTYAPEAKKLANKKNIIIKDFKVIYDILNYISALENGNKSRNEKTDPTGIGIVKAIFPTSKTFVAGVLVTKGTI 592
90994448  701 LKNSWIKVIREEKVIYQGKIESLKRVREDVEEIQAGNECGIFISEFQLWQSGDKIHSFDLIPKQKSL 767
11465723  697 LKNSWIKVLRENEIVYQGKIESLKRIREDVEEIQAGNECGIFISEFQLWQTGDKIQSFDLVPKKRSL 763
11467694  673 VRSAHIQVQRKSGLVFEGDITTIKIVKKDVEEVSEGNECGLFIEEFSEWKVGDSIEIFELIQI---- 735
51209974  678 KKDALIGVYRKNKLIYEGVINSLKRMKNDVNEVVIGNECGILSKDYHFWQSEDLIKAYELHEKAKTL 744
149072054 684 TKNAHIEVIRQDLVVFDGSITSLKKVKEDIGEAIEDSECGLFVEEFDTWQENDIVQAFELIPKKRKE 750
283794887 593 TKKSLIHIIQELKTIYTGEIKSLKRGKEDISEAHYGSECGICLPNFAAWKIGDFIHAFDHPL----- 654
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap