BLAST
PubMed
Nucleotide
Protein
Genome
Structure
Taxonomy
Protein homologs in Complete Microbial /
Eukaryotic
genomes
To compare the similarity of the query genome proteins to different species choose two organisms by Taxonomy id or select them from the menu
Select your query genome
---Acaryochloris---
A. marina MBIC11017
---Acetobacter---
A. pasteurianus IFO 3283-01
---Acholeplasma---
A. laidlawii PG-8A
---Acidimicrobium---
A. ferrooxidans DSM 10331
---Acidiphilium---
A. cryptum JF-5
---Acidithiobacillus---
A. ferrooxidans ATCC 23270
A. ferrooxidans ATCC 53993
---Acidobacterium---
A. capsulatum ATCC 51196
---Acidothermus---
A. cellulolyticus 11B
---Acidovorax---
A. citrulli AAC00-1
A. sp. JS42
---Acinetobacter---
A. baumannii AB0057
A. baumannii AB307-0294
A. baumannii ACICU
A. baumannii ATCC 17978
A. baumannii AYE
A. baumannii SDF
A. sp. ADP1
---Actinobacillus---
A. pleuropneumoniae L20
A. pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03
A. pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76
A. succinogenes 130Z
---Actinosynnema---
A. mirum DSM 43827
---Aeromonas---
A. hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
A. salmonicida subsp. salmonicida A449
---Aeropyrum---
A. pernix K1
---Aggregatibacter---
A. aphrophilus NJ8700
---Agrobacterium---
A. radiobacter K84
A. tumefaciens str. C58
A. vitis S4
---Akkermansia---
A. muciniphila ATCC BAA-835
---Alcanivorax---
A. borkumensis SK2
---Alicyclobacillus---
A. acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446
---Aliivibrio---
A. salmonicida LFI1238
V. fischeri ES114
V. fischeri MJ11
---Alkalilimnicola---
A. ehrlichii MLHE-1
---Alkaliphilus---
A. metalliredigens QYMF
A. oremlandii OhILAs
---Alteromonas---
A. macleodii 'Deep ecotype'
---Anabaena---
A. variabilis ATCC 29413
---Anaerocellum---
A. thermophilum DSM 6725
---Anaerococcus---
A. prevotii DSM 20548
---Anaeromyxobacter---
A. dehalogenans 2CP-1
A. dehalogenans 2CP-C
A. sp. Fw109-5
A. sp. K
---Anaplasma---
A. marginale str. Florida
A. marginale str. St. Maries
A. phagocytophilum HZ
---Anoxybacillus---
A. flavithermus WK1
---Aquifex---
A. aeolicus VF5
---Archaeoglobus---
A. fulgidus DSM 4304
---Arcobacter---
A. butzleri RM4018
---Aromatoleum---
A. aromaticum EbN1
---Arthrobacter---
A. aurescens TC1
A. chlorophenolicus A6
A. sp. FB24
---Atopobium---
A. parvulum DSM 20469
---Azoarcus---
A. sp. BH72
---Azorhizobium---
A. caulinodans ORS 571
---Azotobacter---
A. vinelandii DJ
---Bacillus---
B. amyloliquefaciens FZB42
B. anthracis str. 'Ames Ancestor'
B. anthracis str. A0248
B. anthracis str. A2012
B. anthracis str. Ames
B. anthracis str. CDC 684
B. anthracis str. Sterne
B. cereus 03BB102
B. cereus AH187
B. cereus AH820
B. cereus ATCC 10987
B. cereus ATCC 14579
B. cereus B4264
B. cereus E33L
B. cereus G9842
B. cereus H3081.97
B. cereus Q1
B. clausii KSM-K16
B. cytotoxicus NVH 391-98
B. halodurans C-125
B. licheniformis ATCC 14580
B. pumilus SAFR-032
B. subtilis subsp. subtilis str. 168
B. thuringiensis serovar konkukian str. 97-27
B. thuringiensis str. Al Hakam
B. weihenstephanensis KBAB4
---Bacteroides---
B. fragilis NCTC 9343
B. fragilis YCH46
B. thetaiotaomicron VPI-5482
B. vulgatus ATCC 8482
---Bartonella---
B. bacilliformis KC583
B. grahamii as4aup
B. henselae str. Houston-1
B. quintana str. Toulouse
B. tribocorum CIP 105476
---Bdellovibrio---
B. bacteriovorus HD100
---Beijerinckia---
B. indica subsp. indica ATCC 9039
---Beutenbergia---
B. cavernae DSM 12333
---Bifidobacterium---
B. adolescentis ATCC 15703
B. animalis subsp. lactis AD011
B. animalis subsp. lactis Bl-04
B. animalis subsp. lactis DSM 10140
B. longum DJO10A
B. longum NCC2705
B. longum subsp. infantis ATCC 15697
---Bordetella---
B. avium 197N
B. bronchiseptica RB50
B. parapertussis 12822
B. pertussis Tohama I
B. petrii DSM 12804
---Borrelia---
B. afzelii ACA-1
B. afzelii PKo
B. burgdorferi 118a
B. burgdorferi 156a
B. burgdorferi 29805
B. burgdorferi 64b
B. burgdorferi 72a
B. burgdorferi 94a
B. burgdorferi B31
B. burgdorferi Bol26
B. burgdorferi CA-11.2a
B. burgdorferi WI91-23
B. burgdorferi ZS7
B. duttonii Ly
B. garinii Far04
B. garinii PBi
B. garinii PBr
B. hermsii DAH
B. recurrentis A1
B. sp. SV1
B. spielmanii A14S
B. turicatae 91E135
B. valaisiana VS116
---Brachybacterium---
B. faecium DSM 4810
---Brachyspira---
B. hyodysenteriae WA1
---Bradyrhizobium---
B. japonicum USDA 110
B. sp. BTAi1
B. sp. ORS278
---Brevibacillus---
B. brevis NBRC 100599
---Brucella---
B. abortus S19
B. abortus bv. 1 str. 9-941
B. canis ATCC 23365
B. melitensis ATCC 23457
B. melitensis biovar Abortus 2308
B. melitensis bv. 1 str. 16M
B. microti CCM 4915
B. ovis ATCC 25840
B. suis 1330
B. suis ATCC 23445
---Buchnera---
B. aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
B. aphidicola str. Cc (Cinara cedri)
B. aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
B. aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum)
---Burkholderia---
B. ambifaria AMMD
B. ambifaria MC40-6
B. cenocepacia AU 1054
B. cenocepacia HI2424
B. cenocepacia J2315
B. cenocepacia MC0-3
B. glumae BGR1
B. mallei ATCC 23344
B. mallei NCTC 10229
B. mallei NCTC 10247
B. mallei SAVP1
B. multivorans ATCC 17616
B. phymatum STM815
B. phytofirmans PsJN
B. pseudomallei 1106a
B. pseudomallei 1710b
B. pseudomallei 668
B. pseudomallei K96243
B. pseudomallei MSHR346
B. sp. 383
B. thailandensis E264
B. vietnamiensis G4
B. xenovorans LB400
---Caldicellulosiruptor---
C. saccharolyticus DSM 8903
---Caldivirga---
C. maquilingensis IC-167
---Calyptogena okutanii thioautotrophic gill symbiont---
C. Vesicomyosocius okutanii HA
---Campylobacter---
C. concisus 13826
C. curvus 525.92
C. fetus subsp. fetus 82-40
C. hominis ATCC BAA-381
C. jejuni RM1221
C. jejuni subsp. doylei 269.97
C. jejuni subsp. jejuni 81-176
C. jejuni subsp. jejuni 81116
C. jejuni subsp. jejuni NCTC 11168
C. lari RM2100
---Candidatus Accumulibacter---
C. Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1
---Candidatus Amoebophilus---
C. Amoebophilus asiaticus 5a2
---Candidatus Azobacteroides---
C. Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2
---Candidatus Baumannia cicadellinicola---
B. cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)
---Candidatus Blochmannia---
C. Blochmannia floridanus
C. Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
---Candidatus Carsonella---
C. Carsonella ruddii PV
---Candidatus Desulforudis---
C. Desulforudis audaxviator MP104C
---Candidatus Hamiltonella---
C. Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum)
---Candidatus Hodgkinia---
C. Hodgkinia cicadicola Dsem
---Candidatus Korarchaeum---
C. Korarchaeum cryptofilum OPF8
---Candidatus Koribacter---
C. Koribacter versatilis Ellin345
---Candidatus Liberibacter---
C. Liberibacter asiaticus str. psy62
---Candidatus Methanoregula---
C. Methanoregula boonei 6A8
---Candidatus Pelagibacter---
C. Pelagibacter ubique HTCC1062
---Candidatus Phytoplasma---
A. yellows witches'-broom phytoplasma AYWB
C. Phytoplasma australiense
C. Phytoplasma mali
O. yellows phytoplasma OY-M
---Candidatus Protochlamydia---
C. Protochlamydia amoebophila UWE25
---Candidatus Ruthia magnifica---
C. Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)
---Candidatus Solibacter---
C. Solibacter usitatus Ellin6076
---Candidatus Sulcia---
C. Sulcia muelleri GWSS
C. Sulcia muelleri SMDSEM
---Capnocytophaga---
C. ochracea DSM 7271
---Carboxydothermus---
C. hydrogenoformans Z-2901
---Catenulispora---
C. acidiphila DSM 44928
---Caulobacter---
C. crescentus CB15
C. crescentus NA1000
C. sp. K31
---Cellvibrio---
C. japonicus Ueda107
---Chelativorans---
C. sp. BNC1
---Chitinophaga---
C. pinensis DSM 2588
---Chlamydia---
C. muridarum Nigg
C. trachomatis
C. trachomatis 434/Bu
C. trachomatis A/HAR-13
C. trachomatis B/Jali20/OT
C. trachomatis D/UW-3/CX
C. trachomatis L2b/UCH-1/proctitis
---Chlamydophila---
C. abortus S26/3
C. caviae GPIC
C. felis Fe/C-56
C. pneumoniae AR39
C. pneumoniae CWL029
C. pneumoniae J138
C. pneumoniae TW-183
---Chlorobaculum---
C. parvum NCIB 8327
C. tepidum TLS
---Chlorobium---
C. chlorochromatii CaD3
C. limicola DSM 245
C. phaeobacteroides BS1
C. phaeobacteroides DSM 266
C. phaeovibrioides DSM 265
---Chloroflexus---
C. aggregans DSM 9485
C. aurantiacus J-10-fl
C. sp. Y-400-fl
---Chloroherpeton---
C. thalassium ATCC 35110
---Chromobacterium---
C. violaceum ATCC 12472
---Chromohalobacter---
C. salexigens DSM 3043
---Citrobacter---
C. koseri ATCC BAA-895
---Clavibacter---
C. michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382
C. michiganensis subsp. sepedonicus
---Clostridium---
C. acetobutylicum ATCC 824
C. beijerinckii NCIMB 8052
C. botulinum A str. ATCC 19397
C. botulinum A str. ATCC 3502
C. botulinum A str. Hall
C. botulinum A2 str. Kyoto
C. botulinum A3 str. Loch Maree
C. botulinum B str. Eklund 17B
C. botulinum B1 str. Okra
C. botulinum Ba4 str. 657
C. botulinum D str. 1873
C. botulinum E3 str. Alaska E43
C. botulinum F str. Langeland
C. cellulolyticum H10
C. difficile 630
C. kluyveri DSM 555
C. kluyveri NBRC 12016
C. novyi NT
C. perfringens ATCC 13124
C. perfringens SM101
C. perfringens str. 13
C. phytofermentans ISDg
C. tetani E88
C. thermocellum ATCC 27405
---Colwellia---
C. psychrerythraea 34H
---Coprothermobacter---
C. proteolyticus DSM 5265
---Corynebacterium---
C. aurimucosum ATCC 700975
C. diphtheriae NCTC 13129
C. efficiens YS-314
C. glutamicum ATCC 13032
C. glutamicum R
C. jeikeium K411
C. kroppenstedtii DSM 44385
C. urealyticum DSM 7109
---Coxiella---
C. burnetii 'MSU Goat Q177'
C. burnetii CbuG_Q212
C. burnetii CbuK_Q154
C. burnetii Dugway 5J108-111
C. burnetii RSA 331
C. burnetii RSA 493
---Cronobacter---
C. sakazakii ATCC BAA-894
---Cryptobacterium---
C. curtum DSM 15641
---Cupriavidus---
C. taiwanensis
R. eutropha H16
R. eutropha JMP134
R. metallidurans CH34
---Cyanothece---
C. sp. ATCC 51142
C. sp. PCC 7424
C. sp. PCC 7425
C. sp. PCC 8801
C. sp. PCC 8802
---Cytophaga---
C. hutchinsonii ATCC 33406
---Dechloromonas---
D. aromatica RCB
---Dehalococcoides---
D. ethenogenes 195
D. sp. BAV1
D. sp. CBDB1
---Deinococcus---
D. deserti VCD115
D. geothermalis DSM 11300
D. radiodurans R1
---Delftia---
D. acidovorans SPH-1
---Desulfatibacillum---
D. alkenivorans AK-01
---Desulfitobacterium---
D. hafniense DCB-2
D. hafniense Y51
---Desulfobacterium---
D. autotrophicum HRM2
---Desulfococcus---
D. oleovorans Hxd3
---Desulfohalobium---
D. retbaense DSM 5692
---Desulfomicrobium---
D. baculatum DSM 4028
---Desulfotalea---
D. psychrophila LSv54
---Desulfotomaculum---
D. acetoxidans DSM 771
D. reducens MI-1
---Desulfovibrio---
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20
D. magneticus RS-1
D. salexigens DSM 2638
D. vulgaris DP4
D. vulgaris str. 'Miyazaki F'
D. vulgaris str. Hildenborough
---Desulfurococcus---
D. kamchatkensis 1221n
---Diaphorobacter---
D. sp. TPSY
---Dichelobacter---
D. nodosus VCS1703A
---Dickeya---
D. dadantii Ech703
D. zeae Ech1591
---Dictyoglomus---
D. thermophilum H-6-12
D. turgidum DSM 6724
---Dinoroseobacter---
D. shibae DFL 12
---Dyadobacter---
D. fermentans DSM 18053
---Edwardsiella---
E. ictaluri 93-146
---Eggerthella---
E. lenta DSM 2243
---Ehrlichia---
E. canis str. Jake
E. chaffeensis str. Arkansas
E. ruminantium str. Gardel
E. ruminantium str. Welgevonden
---Elusimicrobium---
E. minutum Pei191
---Enterobacter---
E. sp. 638
---Enterococcus---
E. faecalis V583
---Erwinia---
E. tasmaniensis Et1/99
---Erythrobacter---
E. litoralis HTCC2594
---Escherichia---
E. coli 536
E. coli 53638
E. coli 55989
E. coli APEC O1
E. coli ATCC 8739
E. coli B str. REL606
E. coli B171
E. coli BL21
E. coli BL21(DE3)
E. coli BW2952
E. coli CFT073
E. coli E24377A
E. coli ED1a
E. coli HS
E. coli IAI1
E. coli IAI39
E. coli O127:H6 str. E2348/69
E. coli O157:H7 EDL933
E. coli O157:H7 str. EC4115
E. coli O157:H7 str. Sakai
E. coli O157:H7 str. TW14359
E. coli S88
E. coli SE11
E. coli SMS-3-5
E. coli UMN026
E. coli UTI89
E. coli str. K-12 substr. DH10B
E. coli str. K-12 substr. MG1655
E. coli str. K-12 substr. W3110
E. fergusonii ATCC 35469
---Eubacterium---
E. eligens ATCC 27750
E. rectale ATCC 33656
---Exiguobacterium---
E. sibiricum 255-15
E. sp. AT1b
---Fervidobacterium---
F. nodosum Rt17-B1
---Finegoldia---
F. magna ATCC 29328
---Flavobacterium---
F. johnsoniae UW101
F. psychrophilum JIP02/86
---Francisella---
F. novicida U112
F. philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017
F. tularensis subsp. holarctica
F. tularensis subsp. holarctica FTNF002-00
F. tularensis subsp. holarctica OSU18
F. tularensis subsp. mediasiatica FSC147
F. tularensis subsp. tularensis FSC198
F. tularensis subsp. tularensis SCHU S4
F. tularensis subsp. tularensis WY96-3418
---Frankia---
F. alni ACN14a
F. sp. CcI3
F. sp. EAN1pec
---Fusobacterium---
F. nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586
F. nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953
---Gemmatimonas---
G. aurantiaca T-27
---Geobacillus---
G. kaustophilus HTA426
G. sp. WCH70
G. thermodenitrificans NG80-2
---Geobacter---
G. bemidjiensis Bem
G. lovleyi SZ
G. metallireducens GS-15
G. sp. FRC-32
G. sp. M21
G. sulfurreducens PCA
G. uraniireducens Rf4
---Gloeobacter---
G. violaceus PCC 7421
---Gluconacetobacter---
G. diazotrophicus PAl 5
---Gluconobacter---
G. oxydans 621H
---Gramella---
G. forsetii KT0803
---Granulibacter---
G. bethesdensis CGDNIH1
---Haemophilus---
H. ducreyi 35000HP
H. influenzae 86-028NP
H. influenzae PittEE
H. influenzae PittGG
H. influenzae Rd KW20
H. parasuis SH0165
---Hahella---
H. chejuensis KCTC 2396
---Haloarcula---
H. marismortui ATCC 43049
---Halobacterium---
H. salinarum R1
H. sp. NRC-1
---Halomicrobium---
H. mukohataei DSM 12286
---Haloquadratum---
H. walsbyi DSM 16790
---Halorhabdus---
H. utahensis DSM 12940
---Halorhodospira---
H. halophila SL1
---Halorubrum---
H. lacusprofundi ATCC 49239
---Halothermothrix---
H. orenii H 168
---Helicobacter---
H. acinonychis str. Sheeba
H. hepaticus ATCC 51449
H. pylori 26695
H. pylori B38
H. pylori G27
H. pylori HPAG1
H. pylori J99
H. pylori P12
H. pylori Shi470
---Heliobacterium---
H. modesticaldum Ice1
---Herminiimonas---
H. arsenicoxydans
---Herpetosiphon---
H. aurantiacus ATCC 23779
---Hirschia---
H. baltica ATCC 49814
---Histophilus---
H. somnus 129PT
H. somnus 2336
---Hydrogenobaculum---
H. sp. Y04AAS1
---Hyperthermus---
H. butylicus DSM 5456
---Hyphomonas---
H. neptunium ATCC 15444
---Idiomarina---
I. loihiensis L2TR
---Ignicoccus---
I. hospitalis KIN4/I
---Jannaschia---
J. sp. CCS1
---Janthinobacterium---
J. sp. Marseille
---Jonesia---
J. denitrificans DSM 20603
---Kangiella---
K. koreensis DSM 16069
---Kineococcus---
K. radiotolerans SRS30216
---Klebsiella---
K. pneumoniae 342
K. pneumoniae NTUH-K2044
K. pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578
---Kocuria---
K. rhizophila DC2201
---Kosmotoga---
K. olearia TBF 19.5.1
---Kytococcus---
K. sedentarius DSM 20547
---Lactobacillus---
L. acidophilus NCFM
L. brevis ATCC 367
L. casei ATCC 334
L. casei BL23
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365
L. fermentum IFO 3956
L. gasseri ATCC 33323
L. helveticus DPC 4571
L. johnsonii NCC 533
L. plantarum JDM1
L. plantarum WCFS1
L. reuteri DSM 20016
L. reuteri JCM 1112
L. rhamnosus GG
L. rhamnosus HN001
L. rhamnosus Lc 705
L. sakei subsp. sakei 23K
L. salivarius UCC118
---Lactococcus---
L. lactis subsp. cremoris MG1363
L. lactis subsp. cremoris SK11
L. lactis subsp. lactis Il1403
---Laribacter---
L. hongkongensis HLHK9
---Lawsonia---
L. intracellularis PHE/MN1-00
---Legionella---
L. pneumophila str. Corby
L. pneumophila str. Lens
L. pneumophila str. Paris
L. pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1
---Leifsonia---
L. xyli subsp. xyli str. CTCB07
---Leptospira---
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Ames)'
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)'
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
L. interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130
L. interrogans serovar Lai str. 56601
---Leptothrix---
L. cholodnii SP-6
---Leptotrichia---
L. buccalis DSM 1135
---Leuconostoc---
L. citreum KM20
L. mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293
---Listeria---
L. innocua Clip11262
L. monocytogenes Clip80459
L. monocytogenes EGD-e
L. monocytogenes HCC23
L. monocytogenes str. 4b F2365
L. welshimeri serovar 6b str. SLCC5334
---Lysinibacillus---
L. sphaericus C3-41
---Macrococcus---
M. caseolyticus JCSC5402
---Magnetococcus---
M. sp. MC-1
---Magnetospirillum---
M. magneticum AMB-1
---Mannheimia---
M. succiniciproducens MBEL55E
---Maricaulis---
M. maris MCS10
---Marinobacter---
M. aquaeolei VT8
---Marinomonas---
M. sp. MWYL1
---Mesoplasma---
M. florum L1
---Mesorhizobium---
M. loti MAFF303099
---Metallosphaera---
M. sedula DSM 5348
---Methanobrevibacter---
M. smithii ATCC 35061
---Methanocaldococcus---
M. fervens AG86
M. jannaschii DSM 2661
---Methanococcoides---
M. burtonii DSM 6242
---Methanococcus---
M. aeolicus Nankai-3
M. maripaludis C5
M. maripaludis C6
M. maripaludis C7
M. maripaludis S2
M. vannielii SB
---Methanocorpusculum---
M. labreanum Z
---Methanoculleus---
M. marisnigri JR1
---Methanopyrus---
M. kandleri AV19
---Methanosaeta---
M. thermophila PT
---Methanosarcina---
M. acetivorans C2A
M. barkeri str. Fusaro
M. mazei Go1
---Methanosphaera---
M. stadtmanae DSM 3091
---Methanosphaerula---
M. palustris E1-9c
---Methanospirillum---
M. hungatei JF-1
---Methanothermobacter---
M. thermautotrophicus str. Delta H
---Methylacidiphilum---
M. infernorum V4
---Methylibium---
M. petroleiphilum PM1
---Methylobacillus---
M. flagellatus KT
---Methylobacterium---
M. chloromethanicum CM4
M. extorquens AM1
M. extorquens DM4
M. extorquens PA1
M. nodulans ORS 2060
M. populi BJ001
M. radiotolerans JCM 2831
M. sp. 4-46
---Methylocella---
M. silvestris BL2
---Methylococcus---
M. capsulatus str. Bath
---Methylotenera---
M. mobilis JLW8
---Methylovorus---
M. sp. SIP3-4
---Micrococcus---
M. luteus NCTC 2665
---Microcystis---
M. aeruginosa NIES-843
---Moorella---
M. thermoacetica ATCC 39073
---Mycobacterium---
M. abscessus
M. avium 104
M. avium subsp. paratuberculosis K-10
M. bovis AF2122/97
M. bovis BCG str. Pasteur 1173P2
M. bovis BCG str. Tokyo 172
M. gilvum PYR-GCK
M. leprae Br4923
M. leprae TN
M. marinum M
M. smegmatis str. MC2 155
M. sp. JLS
M. sp. KMS
M. sp. MCS
M. tuberculosis CDC1551
M. tuberculosis F11
M. tuberculosis H37Ra
M. tuberculosis H37Rv
M. tuberculosis KZN 1435
M. ulcerans Agy99
M. vanbaalenii PYR-1
---Mycoplasma---
M. agalactiae PG2
M. arthritidis 158L3-1
M. capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
M. conjunctivae
M. gallisepticum R
M. genitalium G37
M. hyopneumoniae 232
M. hyopneumoniae 7448
M. hyopneumoniae J
M. mobile 163K
M. mycoides subsp. mycoides SC str. PG1
M. penetrans HF-2
M. pneumoniae M129
M. pulmonis UAB CTIP
M. synoviae 53
---Myxococcus---
M. xanthus DK 1622
---Nanoarchaeum---
N. equitans Kin4-M
---Natranaerobius---
N. thermophilus JW/NM-WN-LF
---Natronomonas---
N. pharaonis DSM 2160
---Nautilia---
N. profundicola AmH
---Neisseria---
N. gonorrhoeae FA 1090
N. gonorrhoeae NCCP11945
N. meningitidis 053442
N. meningitidis FAM18
N. meningitidis MC58
N. meningitidis Z2491
N. meningitidis alpha14
---Neorickettsia---
N. risticii str. Illinois
N. sennetsu str. Miyayama
---Nitratiruptor---
N. sp. SB155-2
---Nitrobacter---
N. hamburgensis X14
N. winogradskyi Nb-255
---Nitrosococcus---
N. oceani ATCC 19707
---Nitrosomonas---
N. europaea ATCC 19718
N. eutropha C91
---Nitrosopumilus---
N. maritimus SCM1
---Nitrosospira---
N. multiformis ATCC 25196
---Nocardia---
N. farcinica IFM 10152
---Nocardioides---
N. sp. JS614
---Nostoc---
N. punctiforme PCC 73102
N. sp. PCC 7120
---Novosphingobium---
N. aromaticivorans DSM 12444
---Oceanobacillus---
O. iheyensis HTE831
---Ochrobactrum---
O. anthropi ATCC 49188
---Oenococcus---
O. oeni PSU-1
---Oligotropha---
O. carboxidovorans OM5
---Opitutus---
O. terrae PB90-1
---Orientia---
O. tsutsugamushi str. Boryong
O. tsutsugamushi str. Ikeda
---Paenibacillus---
P. sp. JDR-2
---Parabacteroides---
P. distasonis ATCC 8503
---Paracoccus---
P. denitrificans PD1222
---Parvibaculum---
P. lavamentivorans DS-1
---Pasteurella---
P. multocida subsp. multocida str. Pm70
---Pectobacterium---
P. atrosepticum SCRI1043
P. carotovorum subsp. carotovorum PC1
---Pediococcus---
P. pentosaceus ATCC 25745
---Pedobacter---
P. heparinus DSM 2366
---Pelobacter---
P. carbinolicus DSM 2380
P. propionicus DSM 2379
---Pelodictyon---
P. luteolum DSM 273
P. phaeoclathratiforme BU-1
---Pelotomaculum---
P. thermopropionicum SI
---Persephonella---
P. marina EX-H1
---Petrotoga---
P. mobilis SJ95
---Phenylobacterium---
P. zucineum HLK1
---Photobacterium---
P. profundum SS9
---Photorhabdus---
P. asymbiotica
P. luminescens subsp. laumondii TTO1
---Picrophilus---
P. torridus DSM 9790
---Polaromonas---
P. naphthalenivorans CJ2
P. sp. JS666
---Polynucleobacter---
P. necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1
P. necessarius subsp. necessarius STIR1
---Porphyromonas---
P. gingivalis ATCC 33277
P. gingivalis W83
---Prochlorococcus---
P. marinus str. AS9601
P. marinus str. MIT 9211
P. marinus str. MIT 9215
P. marinus str. MIT 9301
P. marinus str. MIT 9303
P. marinus str. MIT 9312
P. marinus str. MIT 9313
P. marinus str. MIT 9515
P. marinus str. NATL1A
P. marinus str. NATL2A
P. marinus subsp. marinus str. CCMP1375
P. marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
---Propionibacterium---
P. acnes KPA171202
---Prosthecochloris---
P. aestuarii DSM 271
---Proteus---
P. mirabilis HI4320
---Pseudoalteromonas---
P. atlantica T6c
P. haloplanktis TAC125
---Pseudomonas---
P. aeruginosa LESB58
P. aeruginosa PA7
P. aeruginosa PAO1
P. aeruginosa UCBPP-PA14
P. entomophila L48
P. fluorescens Pf-5
P. fluorescens Pf0-1
P. fluorescens SBW25
P. mendocina ymp
P. putida F1
P. putida GB-1
P. putida KT2440
P. putida W619
P. stutzeri A1501
P. syringae pv. phaseolicola 1448A
P. syringae pv. syringae B728a
P. syringae pv. tomato str. DC3000
---Psychrobacter---
P. arcticus 273-4
P. cryohalolentis K5
P. sp. PRwf-1
---Psychromonas---
P. ingrahamii 37
---Pyrobaculum---
P. aerophilum str. IM2
P. arsenaticum DSM 13514
P. calidifontis JCM 11548
P. islandicum DSM 4184
---Pyrococcus---
P. abyssi GE5
P. furiosus DSM 3638
P. horikoshii OT3
---Ralstonia---
R. pickettii 12D
R. pickettii 12J
R. solanacearum GMI1000
---Renibacterium---
R. salmoninarum ATCC 33209
---Rhizobium---
R. etli CFN 42
R. etli CIAT 652
R. leguminosarum bv. trifolii WSM1325
R. leguminosarum bv. trifolii WSM2304
R. leguminosarum bv. viciae 3841
R. sp. NGR234
---Rhodobacter---
R. sphaeroides 2.4.1
R. sphaeroides ATCC 17025
R. sphaeroides ATCC 17029
R. sphaeroides KD131
---Rhodococcus---
R. erythropolis PR4
R. jostii RHA1
R. opacus B4
---Rhodoferax---
R. ferrireducens T118
---Rhodopirellula---
R. baltica SH 1
---Rhodopseudomonas---
R. palustris BisA53
R. palustris BisB18
R. palustris BisB5
R. palustris CGA009
R. palustris HaA2
R. palustris TIE-1
---Rhodospirillum---
R. centenum SW
R. rubrum ATCC 11170
---Rickettsia---
R. africae ESF-5
R. akari str. Hartford
R. bellii OSU 85-389
R. bellii RML369-C
R. canadensis str. McKiel
R. conorii str. Malish 7
R. felis URRWXCal2
R. massiliae MTU5
R. peacockii str. Rustic
R. prowazekii str. Madrid E
R. rickettsii str. 'Sheila Smith'
R. rickettsii str. Iowa
R. typhi str. Wilmington
---Roseiflexus---
R. castenholzii DSM 13941
R. sp. RS-1
---Roseobacter---
R. denitrificans OCh 114
---Rubrobacter---
R. xylanophilus DSM 9941
---Ruegeria---
R. pomeroyi DSS-3
R. sp. TM1040
---Saccharomonospora---
S. viridis DSM 43017
---Saccharophagus---
S. degradans 2-40
---Saccharopolyspora---
S. erythraea NRRL 2338
---Salinibacter---
S. ruber DSM 13855
---Salinispora---
S. arenicola CNS-205
S. tropica CNB-440
---Salmonella---
S. enterica subsp. arizonae serovar 62:z4,z23:--
S. enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483
S. enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67
S. enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853
S. enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109
S. enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91
S. enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476
S. enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. CVM29188
S. enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594
S. enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. 404ty
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2
S. enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
S. enterica subsp. enterica serovar Virchow str. SL491
---Serratia---
S. proteamaculans 568
---Shewanella---
S. amazonensis SB2B
S. baltica OS155
S. baltica OS185
S. baltica OS195
S. baltica OS223
S. denitrificans OS217
S. frigidimarina NCIMB 400
S. halifaxensis HAW-EB4
S. loihica PV-4
S. oneidensis MR-1
S. pealeana ATCC 700345
S. piezotolerans WP3
S. putrefaciens CN-32
S. sediminis HAW-EB3
S. sp. ANA-3
S. sp. MR-4
S. sp. MR-7
S. sp. W3-18-1
S. woodyi ATCC 51908
---Shigella---
S. boydii CDC 3083-94
S. boydii Sb227
S. dysenteriae Sd197
S. flexneri 2a str. 2457T
S. flexneri 2a str. 301
S. flexneri 5 str. 8401
S. sonnei Ss046
---Sinorhizobium---
S. medicae WSM419
S. meliloti 1021
---Slackia---
S. heliotrinireducens DSM 20476
---Sodalis---
S. glossinidius str. 'morsitans'
---Sorangium---
S. cellulosum 'So ce 56'
---Sphingomonas---
S. wittichii RW1
---Sphingopyxis---
S. alaskensis RB2256
---Staphylococcus---
S. aureus RF122
S. aureus subsp. aureus COL
S. aureus subsp. aureus JH1
S. aureus subsp. aureus JH9
S. aureus subsp. aureus MRSA252
S. aureus subsp. aureus MSSA476
S. aureus subsp. aureus MW2
S. aureus subsp. aureus Mu3
S. aureus subsp. aureus Mu50
S. aureus subsp. aureus N315
S. aureus subsp. aureus NCTC 8325
S. aureus subsp. aureus USA300_FPR3757
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH1516
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH959
S. aureus subsp. aureus str. Newman
S. carnosus subsp. carnosus TM300
S. epidermidis ATCC 12228
S. epidermidis RP62A
S. haemolyticus JCSC1435
S. saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
---Staphylothermus---
S. marinus F1
---Stenotrophomonas---
S. maltophilia K279a
S. maltophilia R551-3
---Streptococcus---
S. agalactiae 2603V/R
S. agalactiae A909
S. agalactiae NEM316
S. dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124
S. equi subsp. equi 4047
S. equi subsp. zooepidemicus
S. equi subsp. zooepidemicus MGCS10565
S. gordonii str. Challis substr. CH1
S. mutans UA159
S. pneumoniae 70585
S. pneumoniae ATCC 700669
S. pneumoniae CGSP14
S. pneumoniae D39
S. pneumoniae G54
S. pneumoniae Hungary19A-6
S. pneumoniae JJA
S. pneumoniae P1031
S. pneumoniae R6
S. pneumoniae TIGR4
S. pneumoniae Taiwan19F-14
S. pyogenes M1 GAS
S. pyogenes MGAS10270
S. pyogenes MGAS10394
S. pyogenes MGAS10750
S. pyogenes MGAS2096
S. pyogenes MGAS315
S. pyogenes MGAS5005
S. pyogenes MGAS6180
S. pyogenes MGAS8232
S. pyogenes MGAS9429
S. pyogenes NZ131
S. pyogenes SSI-1
S. pyogenes str. Manfredo
S. sanguinis SK36
S. suis 05ZYH33
S. suis 98HAH33
S. suis BM407
S. suis P1/7
S. suis SC84
S. thermophilus CNRZ1066
S. thermophilus LMD-9
S. thermophilus LMG 18311
S. uberis 0140J
---Streptomyces---
S. avermitilis MA-4680
S. coelicolor A3(2)
S. griseus subsp. griseus NBRC 13350
---Sulfolobus---
S. acidocaldarius DSM 639
S. islandicus L.S.2.15
S. islandicus M.14.25
S. islandicus M.16.27
S. islandicus M.16.4
S. islandicus Y.G.57.14
S. islandicus Y.N.15.51
S. solfataricus P2
S. tokodaii str. 7
---Sulfurihydrogenibium---
S. azorense Az-Fu1
S. sp. YO3AOP1
---Sulfurimonas---
S. denitrificans DSM 1251
---Sulfurovum---
S. sp. NBC37-1
---Symbiobacterium---
S. thermophilum IAM 14863
---Synechococcus---
S. elongatus PCC 6301
S. elongatus PCC 7942
S. sp. CC9311
S. sp. CC9605
S. sp. CC9902
S. sp. JA-2-3B'a(2-13)
S. sp. JA-3-3Ab
S. sp. PCC 7002
S. sp. RCC307
S. sp. WH 7803
S. sp. WH 8102
---Synechocystis---
S. sp. PCC 6803
---Syntrophobacter---
S. fumaroxidans MPOB
---Syntrophomonas---
S. wolfei subsp. wolfei str. Goettingen
---Syntrophus---
S. aciditrophicus SB
---Teredinibacter---
T. turnerae T7901
---Thauera---
T. sp. MZ1T
---Thermoanaerobacter---
T. pseudethanolicus ATCC 33223
T. sp. X514
T. tengcongensis MB4
---Thermobifida---
T. fusca YX
---Thermococcus---
T. gammatolerans EJ3
T. kodakarensis KOD1
T. onnurineus NA1
T. sibiricus MM 739
---Thermodesulfovibrio---
T. yellowstonii DSM 11347
---Thermofilum---
T. pendens Hrk 5
---Thermomicrobium---
T. roseum DSM 5159
---Thermoplasma---
T. acidophilum DSM 1728
T. volcanium GSS1
---Thermoproteus---
T. neutrophilus V24Sta
---Thermosipho---
T. africanus TCF52B
T. melanesiensis BI429
---Thermosynechococcus---
T. elongatus BP-1
---Thermotoga---
T. lettingae TMO
T. maritima MSB8
T. neapolitana DSM 4359
T. petrophila RKU-1
T. sp. RQ2
---Thermus---
T. thermophilus HB27
T. thermophilus HB8
---Thioalkalivibrio---
T. sp. HL-EbGR7
---Thiobacillus---
T. denitrificans ATCC 25259
---Thiomicrospira---
T. crunogena XCL-2
---Tolumonas---
T. auensis DSM 9187
---Treponema---
T. denticola ATCC 35405
T. pallidum subsp. pallidum SS14
T. pallidum subsp. pallidum str. Nichols
---Trichodesmium---
T. erythraeum IMS101
---Tropheryma---
T. whipplei TW08/27
T. whipplei str. Twist
---Ureaplasma---
U. parvum serovar 3 str. ATCC 27815
U. parvum serovar 3 str. ATCC 700970
U. urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699
---Variovorax---
V. paradoxus S110
---Verminephrobacter---
V. eiseniae EF01-2
---Vibrio---
V. cholerae M66-2
V. cholerae MJ-1236
V. cholerae O1 biovar El Tor str. N16961
V. cholerae O395
V. harveyi ATCC BAA-1116
V. parahaemolyticus RIMD 2210633
V. splendidus LGP32
V. vulnificus CMCP6
V. vulnificus YJ016
---Wigglesworthia---
W. glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis
---Wolbachia---
W. endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel
W. endosymbiont of Drosophila melanogaster
W. endosymbiont strain TRS of Brugia malayi
W. sp. wRi
---Wolinella---
W. succinogenes DSM 1740
---Xanthobacter---
X. autotrophicus Py2
---Xanthomonas---
X. axonopodis pv. citri str. 306
X. campestris pv. campestris str. 8004
X. campestris pv. campestris str. ATCC 33913
X. campestris pv. campestris str. B100
X. campestris pv. vesicatoria str. 85-10
X. oryzae pv. oryzae KACC10331
X. oryzae pv. oryzae MAFF 311018
X. oryzae pv. oryzae PXO99A
---Xylella---
X. fastidiosa 9a5c
X. fastidiosa M12
X. fastidiosa M23
X. fastidiosa Temecula1
---Yersinia---
Y. enterocolitica subsp. enterocolitica 8081
Y. pestis Angola
Y. pestis Antiqua
Y. pestis CA88-4125
Y. pestis CO92
Y. pestis KIM
Y. pestis Nepal516
Y. pestis Pestoides F
Y. pestis biovar Microtus str. 91001
Y. pestis biovar Orientalis str. IP275
Y. pseudotuberculosis IP 31758
Y. pseudotuberculosis IP 32953
Y. pseudotuberculosis PB1/+
Y. pseudotuberculosis YPIII
---Zymomonas---
Z. mobilis subsp. mobilis ZM4
---environmental samples---
u. methanogenic archaeon RC-I
---unclassified Flavobacteriaceae---
F. bacterium 3519-10
---uncultured Termite group 1 bacterium---
u. Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17
Choose two species for comparison
---Acaryochloris---
A. marina MBIC11017
---Acetobacter---
A. pasteurianus IFO 3283-01
---Acholeplasma---
A. laidlawii PG-8A
---Acidimicrobium---
A. ferrooxidans DSM 10331
---Acidiphilium---
A. cryptum JF-5
---Acidithiobacillus---
A. ferrooxidans ATCC 23270
A. ferrooxidans ATCC 53993
---Acidobacterium---
A. capsulatum ATCC 51196
---Acidothermus---
A. cellulolyticus 11B
---Acidovorax---
A. citrulli AAC00-1
A. sp. JS42
---Acinetobacter---
A. baumannii AB0057
A. baumannii AB307-0294
A. baumannii ACICU
A. baumannii ATCC 17978
A. baumannii AYE
A. baumannii SDF
A. sp. ADP1
---Actinobacillus---
A. pleuropneumoniae L20
A. pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03
A. pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76
A. succinogenes 130Z
---Actinosynnema---
A. mirum DSM 43827
---Aeromonas---
A. hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
A. salmonicida subsp. salmonicida A449
---Aeropyrum---
A. pernix K1
---Aggregatibacter---
A. aphrophilus NJ8700
---Agrobacterium---
A. radiobacter K84
A. tumefaciens str. C58
A. vitis S4
---Akkermansia---
A. muciniphila ATCC BAA-835
---Alcanivorax---
A. borkumensis SK2
---Alicyclobacillus---
A. acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446
---Aliivibrio---
A. salmonicida LFI1238
V. fischeri ES114
V. fischeri MJ11
---Alkalilimnicola---
A. ehrlichii MLHE-1
---Alkaliphilus---
A. metalliredigens QYMF
A. oremlandii OhILAs
---Alteromonas---
A. macleodii 'Deep ecotype'
---Anabaena---
A. variabilis ATCC 29413
---Anaerocellum---
A. thermophilum DSM 6725
---Anaerococcus---
A. prevotii DSM 20548
---Anaeromyxobacter---
A. dehalogenans 2CP-1
A. dehalogenans 2CP-C
A. sp. Fw109-5
A. sp. K
---Anaplasma---
A. marginale str. Florida
A. marginale str. St. Maries
A. phagocytophilum HZ
---Anoxybacillus---
A. flavithermus WK1
---Aquifex---
A. aeolicus VF5
---Archaeoglobus---
A. fulgidus DSM 4304
---Arcobacter---
A. butzleri RM4018
---Aromatoleum---
A. aromaticum EbN1
---Arthrobacter---
A. aurescens TC1
A. chlorophenolicus A6
A. sp. FB24
---Atopobium---
A. parvulum DSM 20469
---Azoarcus---
A. sp. BH72
---Azorhizobium---
A. caulinodans ORS 571
---Azotobacter---
A. vinelandii DJ
---Bacillus---
B. amyloliquefaciens FZB42
B. anthracis str. 'Ames Ancestor'
B. anthracis str. A0248
B. anthracis str. A2012
B. anthracis str. Ames
B. anthracis str. CDC 684
B. anthracis str. Sterne
B. cereus 03BB102
B. cereus AH187
B. cereus AH820
B. cereus ATCC 10987
B. cereus ATCC 14579
B. cereus B4264
B. cereus E33L
B. cereus G9842
B. cereus H3081.97
B. cereus Q1
B. clausii KSM-K16
B. cytotoxicus NVH 391-98
B. halodurans C-125
B. licheniformis ATCC 14580
B. pumilus SAFR-032
B. subtilis subsp. subtilis str. 168
B. thuringiensis serovar konkukian str. 97-27
B. thuringiensis str. Al Hakam
B. weihenstephanensis KBAB4
---Bacteroides---
B. fragilis NCTC 9343
B. fragilis YCH46
B. thetaiotaomicron VPI-5482
B. vulgatus ATCC 8482
---Bartonella---
B. bacilliformis KC583
B. grahamii as4aup
B. henselae str. Houston-1
B. quintana str. Toulouse
B. tribocorum CIP 105476
---Bdellovibrio---
B. bacteriovorus HD100
---Beijerinckia---
B. indica subsp. indica ATCC 9039
---Beutenbergia---
B. cavernae DSM 12333
---Bifidobacterium---
B. adolescentis ATCC 15703
B. animalis subsp. lactis AD011
B. animalis subsp. lactis Bl-04
B. animalis subsp. lactis DSM 10140
B. longum DJO10A
B. longum NCC2705
B. longum subsp. infantis ATCC 15697
---Bordetella---
B. avium 197N
B. bronchiseptica RB50
B. parapertussis 12822
B. pertussis Tohama I
B. petrii DSM 12804
---Borrelia---
B. afzelii ACA-1
B. afzelii PKo
B. burgdorferi 118a
B. burgdorferi 156a
B. burgdorferi 29805
B. burgdorferi 64b
B. burgdorferi 72a
B. burgdorferi 94a
B. burgdorferi B31
B. burgdorferi Bol26
B. burgdorferi CA-11.2a
B. burgdorferi WI91-23
B. burgdorferi ZS7
B. duttonii Ly
B. garinii Far04
B. garinii PBi
B. garinii PBr
B. hermsii DAH
B. recurrentis A1
B. sp. SV1
B. spielmanii A14S
B. turicatae 91E135
B. valaisiana VS116
---Brachybacterium---
B. faecium DSM 4810
---Brachyspira---
B. hyodysenteriae WA1
---Bradyrhizobium---
B. japonicum USDA 110
B. sp. BTAi1
B. sp. ORS278
---Brevibacillus---
B. brevis NBRC 100599
---Brucella---
B. abortus S19
B. abortus bv. 1 str. 9-941
B. canis ATCC 23365
B. melitensis ATCC 23457
B. melitensis biovar Abortus 2308
B. melitensis bv. 1 str. 16M
B. microti CCM 4915
B. ovis ATCC 25840
B. suis 1330
B. suis ATCC 23445
---Buchnera---
B. aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
B. aphidicola str. Cc (Cinara cedri)
B. aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
B. aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum)
---Burkholderia---
B. ambifaria AMMD
B. ambifaria MC40-6
B. cenocepacia AU 1054
B. cenocepacia HI2424
B. cenocepacia J2315
B. cenocepacia MC0-3
B. glumae BGR1
B. mallei ATCC 23344
B. mallei NCTC 10229
B. mallei NCTC 10247
B. mallei SAVP1
B. multivorans ATCC 17616
B. phymatum STM815
B. phytofirmans PsJN
B. pseudomallei 1106a
B. pseudomallei 1710b
B. pseudomallei 668
B. pseudomallei K96243
B. pseudomallei MSHR346
B. sp. 383
B. thailandensis E264
B. vietnamiensis G4
B. xenovorans LB400
---Caldicellulosiruptor---
C. saccharolyticus DSM 8903
---Caldivirga---
C. maquilingensis IC-167
---Calyptogena okutanii thioautotrophic gill symbiont---
C. Vesicomyosocius okutanii HA
---Campylobacter---
C. concisus 13826
C. curvus 525.92
C. fetus subsp. fetus 82-40
C. hominis ATCC BAA-381
C. jejuni RM1221
C. jejuni subsp. doylei 269.97
C. jejuni subsp. jejuni 81-176
C. jejuni subsp. jejuni 81116
C. jejuni subsp. jejuni NCTC 11168
C. lari RM2100
---Candidatus Accumulibacter---
C. Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1
---Candidatus Amoebophilus---
C. Amoebophilus asiaticus 5a2
---Candidatus Azobacteroides---
C. Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2
---Candidatus Baumannia cicadellinicola---
B. cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)
---Candidatus Blochmannia---
C. Blochmannia floridanus
C. Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
---Candidatus Carsonella---
C. Carsonella ruddii PV
---Candidatus Desulforudis---
C. Desulforudis audaxviator MP104C
---Candidatus Hamiltonella---
C. Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum)
---Candidatus Hodgkinia---
C. Hodgkinia cicadicola Dsem
---Candidatus Korarchaeum---
C. Korarchaeum cryptofilum OPF8
---Candidatus Koribacter---
C. Koribacter versatilis Ellin345
---Candidatus Liberibacter---
C. Liberibacter asiaticus str. psy62
---Candidatus Methanoregula---
C. Methanoregula boonei 6A8
---Candidatus Pelagibacter---
C. Pelagibacter ubique HTCC1062
---Candidatus Phytoplasma---
A. yellows witches'-broom phytoplasma AYWB
C. Phytoplasma australiense
C. Phytoplasma mali
O. yellows phytoplasma OY-M
---Candidatus Protochlamydia---
C. Protochlamydia amoebophila UWE25
---Candidatus Ruthia magnifica---
C. Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)
---Candidatus Solibacter---
C. Solibacter usitatus Ellin6076
---Candidatus Sulcia---
C. Sulcia muelleri GWSS
C. Sulcia muelleri SMDSEM
---Capnocytophaga---
C. ochracea DSM 7271
---Carboxydothermus---
C. hydrogenoformans Z-2901
---Catenulispora---
C. acidiphila DSM 44928
---Caulobacter---
C. crescentus CB15
C. crescentus NA1000
C. sp. K31
---Cellvibrio---
C. japonicus Ueda107
---Chelativorans---
C. sp. BNC1
---Chitinophaga---
C. pinensis DSM 2588
---Chlamydia---
C. muridarum Nigg
C. trachomatis
C. trachomatis 434/Bu
C. trachomatis A/HAR-13
C. trachomatis B/Jali20/OT
C. trachomatis D/UW-3/CX
C. trachomatis L2b/UCH-1/proctitis
---Chlamydophila---
C. abortus S26/3
C. caviae GPIC
C. felis Fe/C-56
C. pneumoniae AR39
C. pneumoniae CWL029
C. pneumoniae J138
C. pneumoniae TW-183
---Chlorobaculum---
C. parvum NCIB 8327
C. tepidum TLS
---Chlorobium---
C. chlorochromatii CaD3
C. limicola DSM 245
C. phaeobacteroides BS1
C. phaeobacteroides DSM 266
C. phaeovibrioides DSM 265
---Chloroflexus---
C. aggregans DSM 9485
C. aurantiacus J-10-fl
C. sp. Y-400-fl
---Chloroherpeton---
C. thalassium ATCC 35110
---Chromobacterium---
C. violaceum ATCC 12472
---Chromohalobacter---
C. salexigens DSM 3043
---Citrobacter---
C. koseri ATCC BAA-895
---Clavibacter---
C. michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382
C. michiganensis subsp. sepedonicus
---Clostridium---
C. acetobutylicum ATCC 824
C. beijerinckii NCIMB 8052
C. botulinum A str. ATCC 19397
C. botulinum A str. ATCC 3502
C. botulinum A str. Hall
C. botulinum A2 str. Kyoto
C. botulinum A3 str. Loch Maree
C. botulinum B str. Eklund 17B
C. botulinum B1 str. Okra
C. botulinum Ba4 str. 657
C. botulinum D str. 1873
C. botulinum E3 str. Alaska E43
C. botulinum F str. Langeland
C. cellulolyticum H10
C. difficile 630
C. kluyveri DSM 555
C. kluyveri NBRC 12016
C. novyi NT
C. perfringens ATCC 13124
C. perfringens SM101
C. perfringens str. 13
C. phytofermentans ISDg
C. tetani E88
C. thermocellum ATCC 27405
---Colwellia---
C. psychrerythraea 34H
---Coprothermobacter---
C. proteolyticus DSM 5265
---Corynebacterium---
C. aurimucosum ATCC 700975
C. diphtheriae NCTC 13129
C. efficiens YS-314
C. glutamicum ATCC 13032
C. glutamicum R
C. jeikeium K411
C. kroppenstedtii DSM 44385
C. urealyticum DSM 7109
---Coxiella---
C. burnetii 'MSU Goat Q177'
C. burnetii CbuG_Q212
C. burnetii CbuK_Q154
C. burnetii Dugway 5J108-111
C. burnetii RSA 331
C. burnetii RSA 493
---Cronobacter---
C. sakazakii ATCC BAA-894
---Cryptobacterium---
C. curtum DSM 15641
---Cupriavidus---
C. taiwanensis
R. eutropha H16
R. eutropha JMP134
R. metallidurans CH34
---Cyanothece---
C. sp. ATCC 51142
C. sp. PCC 7424
C. sp. PCC 7425
C. sp. PCC 8801
C. sp. PCC 8802
---Cytophaga---
C. hutchinsonii ATCC 33406
---Dechloromonas---
D. aromatica RCB
---Dehalococcoides---
D. ethenogenes 195
D. sp. BAV1
D. sp. CBDB1
---Deinococcus---
D. deserti VCD115
D. geothermalis DSM 11300
D. radiodurans R1
---Delftia---
D. acidovorans SPH-1
---Desulfatibacillum---
D. alkenivorans AK-01
---Desulfitobacterium---
D. hafniense DCB-2
D. hafniense Y51
---Desulfobacterium---
D. autotrophicum HRM2
---Desulfococcus---
D. oleovorans Hxd3
---Desulfohalobium---
D. retbaense DSM 5692
---Desulfomicrobium---
D. baculatum DSM 4028
---Desulfotalea---
D. psychrophila LSv54
---Desulfotomaculum---
D. acetoxidans DSM 771
D. reducens MI-1
---Desulfovibrio---
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20
D. magneticus RS-1
D. salexigens DSM 2638
D. vulgaris DP4
D. vulgaris str. 'Miyazaki F'
D. vulgaris str. Hildenborough
---Desulfurococcus---
D. kamchatkensis 1221n
---Diaphorobacter---
D. sp. TPSY
---Dichelobacter---
D. nodosus VCS1703A
---Dickeya---
D. dadantii Ech703
D. zeae Ech1591
---Dictyoglomus---
D. thermophilum H-6-12
D. turgidum DSM 6724
---Dinoroseobacter---
D. shibae DFL 12
---Dyadobacter---
D. fermentans DSM 18053
---Edwardsiella---
E. ictaluri 93-146
---Eggerthella---
E. lenta DSM 2243
---Ehrlichia---
E. canis str. Jake
E. chaffeensis str. Arkansas
E. ruminantium str. Gardel
E. ruminantium str. Welgevonden
---Elusimicrobium---
E. minutum Pei191
---Enterobacter---
E. sp. 638
---Enterococcus---
E. faecalis V583
---Erwinia---
E. tasmaniensis Et1/99
---Erythrobacter---
E. litoralis HTCC2594
---Escherichia---
E. coli 536
E. coli 53638
E. coli 55989
E. coli APEC O1
E. coli ATCC 8739
E. coli B str. REL606
E. coli B171
E. coli BL21
E. coli BL21(DE3)
E. coli BW2952
E. coli CFT073
E. coli E24377A
E. coli ED1a
E. coli HS
E. coli IAI1
E. coli IAI39
E. coli O127:H6 str. E2348/69
E. coli O157:H7 EDL933
E. coli O157:H7 str. EC4115
E. coli O157:H7 str. Sakai
E. coli O157:H7 str. TW14359
E. coli S88
E. coli SE11
E. coli SMS-3-5
E. coli UMN026
E. coli UTI89
E. coli str. K-12 substr. DH10B
E. coli str. K-12 substr. MG1655
E. coli str. K-12 substr. W3110
E. fergusonii ATCC 35469
---Eubacterium---
E. eligens ATCC 27750
E. rectale ATCC 33656
---Exiguobacterium---
E. sibiricum 255-15
E. sp. AT1b
---Fervidobacterium---
F. nodosum Rt17-B1
---Finegoldia---
F. magna ATCC 29328
---Flavobacterium---
F. johnsoniae UW101
F. psychrophilum JIP02/86
---Francisella---
F. novicida U112
F. philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017
F. tularensis subsp. holarctica
F. tularensis subsp. holarctica FTNF002-00
F. tularensis subsp. holarctica OSU18
F. tularensis subsp. mediasiatica FSC147
F. tularensis subsp. tularensis FSC198
F. tularensis subsp. tularensis SCHU S4
F. tularensis subsp. tularensis WY96-3418
---Frankia---
F. alni ACN14a
F. sp. CcI3
F. sp. EAN1pec
---Fusobacterium---
F. nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586
F. nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953
---Gemmatimonas---
G. aurantiaca T-27
---Geobacillus---
G. kaustophilus HTA426
G. sp. WCH70
G. thermodenitrificans NG80-2
---Geobacter---
G. bemidjiensis Bem
G. lovleyi SZ
G. metallireducens GS-15
G. sp. FRC-32
G. sp. M21
G. sulfurreducens PCA
G. uraniireducens Rf4
---Gloeobacter---
G. violaceus PCC 7421
---Gluconacetobacter---
G. diazotrophicus PAl 5
---Gluconobacter---
G. oxydans 621H
---Gramella---
G. forsetii KT0803
---Granulibacter---
G. bethesdensis CGDNIH1
---Haemophilus---
H. ducreyi 35000HP
H. influenzae 86-028NP
H. influenzae PittEE
H. influenzae PittGG
H. influenzae Rd KW20
H. parasuis SH0165
---Hahella---
H. chejuensis KCTC 2396
---Haloarcula---
H. marismortui ATCC 43049
---Halobacterium---
H. salinarum R1
H. sp. NRC-1
---Halomicrobium---
H. mukohataei DSM 12286
---Haloquadratum---
H. walsbyi DSM 16790
---Halorhabdus---
H. utahensis DSM 12940
---Halorhodospira---
H. halophila SL1
---Halorubrum---
H. lacusprofundi ATCC 49239
---Halothermothrix---
H. orenii H 168
---Helicobacter---
H. acinonychis str. Sheeba
H. hepaticus ATCC 51449
H. pylori 26695
H. pylori B38
H. pylori G27
H. pylori HPAG1
H. pylori J99
H. pylori P12
H. pylori Shi470
---Heliobacterium---
H. modesticaldum Ice1
---Herminiimonas---
H. arsenicoxydans
---Herpetosiphon---
H. aurantiacus ATCC 23779
---Hirschia---
H. baltica ATCC 49814
---Histophilus---
H. somnus 129PT
H. somnus 2336
---Hydrogenobaculum---
H. sp. Y04AAS1
---Hyperthermus---
H. butylicus DSM 5456
---Hyphomonas---
H. neptunium ATCC 15444
---Idiomarina---
I. loihiensis L2TR
---Ignicoccus---
I. hospitalis KIN4/I
---Jannaschia---
J. sp. CCS1
---Janthinobacterium---
J. sp. Marseille
---Jonesia---
J. denitrificans DSM 20603
---Kangiella---
K. koreensis DSM 16069
---Kineococcus---
K. radiotolerans SRS30216
---Klebsiella---
K. pneumoniae 342
K. pneumoniae NTUH-K2044
K. pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578
---Kocuria---
K. rhizophila DC2201
---Kosmotoga---
K. olearia TBF 19.5.1
---Kytococcus---
K. sedentarius DSM 20547
---Lactobacillus---
L. acidophilus NCFM
L. brevis ATCC 367
L. casei ATCC 334
L. casei BL23
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365
L. fermentum IFO 3956
L. gasseri ATCC 33323
L. helveticus DPC 4571
L. johnsonii NCC 533
L. plantarum JDM1
L. plantarum WCFS1
L. reuteri DSM 20016
L. reuteri JCM 1112
L. rhamnosus GG
L. rhamnosus HN001
L. rhamnosus Lc 705
L. sakei subsp. sakei 23K
L. salivarius UCC118
---Lactococcus---
L. lactis subsp. cremoris MG1363
L. lactis subsp. cremoris SK11
L. lactis subsp. lactis Il1403
---Laribacter---
L. hongkongensis HLHK9
---Lawsonia---
L. intracellularis PHE/MN1-00
---Legionella---
L. pneumophila str. Corby
L. pneumophila str. Lens
L. pneumophila str. Paris
L. pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1
---Leifsonia---
L. xyli subsp. xyli str. CTCB07
---Leptospira---
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Ames)'
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)'
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
L. interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130
L. interrogans serovar Lai str. 56601
---Leptothrix---
L. cholodnii SP-6
---Leptotrichia---
L. buccalis DSM 1135
---Leuconostoc---
L. citreum KM20
L. mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293
---Listeria---
L. innocua Clip11262
L. monocytogenes Clip80459
L. monocytogenes EGD-e
L. monocytogenes HCC23
L. monocytogenes str. 4b F2365
L. welshimeri serovar 6b str. SLCC5334
---Lysinibacillus---
L. sphaericus C3-41
---Macrococcus---
M. caseolyticus JCSC5402
---Magnetococcus---
M. sp. MC-1
---Magnetospirillum---
M. magneticum AMB-1
---Mannheimia---
M. succiniciproducens MBEL55E
---Maricaulis---
M. maris MCS10
---Marinobacter---
M. aquaeolei VT8
---Marinomonas---
M. sp. MWYL1
---Mesoplasma---
M. florum L1
---Mesorhizobium---
M. loti MAFF303099
---Metallosphaera---
M. sedula DSM 5348
---Methanobrevibacter---
M. smithii ATCC 35061
---Methanocaldococcus---
M. fervens AG86
M. jannaschii DSM 2661
---Methanococcoides---
M. burtonii DSM 6242
---Methanococcus---
M. aeolicus Nankai-3
M. maripaludis C5
M. maripaludis C6
M. maripaludis C7
M. maripaludis S2
M. vannielii SB
---Methanocorpusculum---
M. labreanum Z
---Methanoculleus---
M. marisnigri JR1
---Methanopyrus---
M. kandleri AV19
---Methanosaeta---
M. thermophila PT
---Methanosarcina---
M. acetivorans C2A
M. barkeri str. Fusaro
M. mazei Go1
---Methanosphaera---
M. stadtmanae DSM 3091
---Methanosphaerula---
M. palustris E1-9c
---Methanospirillum---
M. hungatei JF-1
---Methanothermobacter---
M. thermautotrophicus str. Delta H
---Methylacidiphilum---
M. infernorum V4
---Methylibium---
M. petroleiphilum PM1
---Methylobacillus---
M. flagellatus KT
---Methylobacterium---
M. chloromethanicum CM4
M. extorquens AM1
M. extorquens DM4
M. extorquens PA1
M. nodulans ORS 2060
M. populi BJ001
M. radiotolerans JCM 2831
M. sp. 4-46
---Methylocella---
M. silvestris BL2
---Methylococcus---
M. capsulatus str. Bath
---Methylotenera---
M. mobilis JLW8
---Methylovorus---
M. sp. SIP3-4
---Micrococcus---
M. luteus NCTC 2665
---Microcystis---
M. aeruginosa NIES-843
---Moorella---
M. thermoacetica ATCC 39073
---Mycobacterium---
M. abscessus
M. avium 104
M. avium subsp. paratuberculosis K-10
M. bovis AF2122/97
M. bovis BCG str. Pasteur 1173P2
M. bovis BCG str. Tokyo 172
M. gilvum PYR-GCK
M. leprae Br4923
M. leprae TN
M. marinum M
M. smegmatis str. MC2 155
M. sp. JLS
M. sp. KMS
M. sp. MCS
M. tuberculosis CDC1551
M. tuberculosis F11
M. tuberculosis H37Ra
M. tuberculosis H37Rv
M. tuberculosis KZN 1435
M. ulcerans Agy99
M. vanbaalenii PYR-1
---Mycoplasma---
M. agalactiae PG2
M. arthritidis 158L3-1
M. capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
M. conjunctivae
M. gallisepticum R
M. genitalium G37
M. hyopneumoniae 232
M. hyopneumoniae 7448
M. hyopneumoniae J
M. mobile 163K
M. mycoides subsp. mycoides SC str. PG1
M. penetrans HF-2
M. pneumoniae M129
M. pulmonis UAB CTIP
M. synoviae 53
---Myxococcus---
M. xanthus DK 1622
---Nanoarchaeum---
N. equitans Kin4-M
---Natranaerobius---
N. thermophilus JW/NM-WN-LF
---Natronomonas---
N. pharaonis DSM 2160
---Nautilia---
N. profundicola AmH
---Neisseria---
N. gonorrhoeae FA 1090
N. gonorrhoeae NCCP11945
N. meningitidis 053442
N. meningitidis FAM18
N. meningitidis MC58
N. meningitidis Z2491
N. meningitidis alpha14
---Neorickettsia---
N. risticii str. Illinois
N. sennetsu str. Miyayama
---Nitratiruptor---
N. sp. SB155-2
---Nitrobacter---
N. hamburgensis X14
N. winogradskyi Nb-255
---Nitrosococcus---
N. oceani ATCC 19707
---Nitrosomonas---
N. europaea ATCC 19718
N. eutropha C91
---Nitrosopumilus---
N. maritimus SCM1
---Nitrosospira---
N. multiformis ATCC 25196
---Nocardia---
N. farcinica IFM 10152
---Nocardioides---
N. sp. JS614
---Nostoc---
N. punctiforme PCC 73102
N. sp. PCC 7120
---Novosphingobium---
N. aromaticivorans DSM 12444
---Oceanobacillus---
O. iheyensis HTE831
---Ochrobactrum---
O. anthropi ATCC 49188
---Oenococcus---
O. oeni PSU-1
---Oligotropha---
O. carboxidovorans OM5
---Opitutus---
O. terrae PB90-1
---Orientia---
O. tsutsugamushi str. Boryong
O. tsutsugamushi str. Ikeda
---Paenibacillus---
P. sp. JDR-2
---Parabacteroides---
P. distasonis ATCC 8503
---Paracoccus---
P. denitrificans PD1222
---Parvibaculum---
P. lavamentivorans DS-1
---Pasteurella---
P. multocida subsp. multocida str. Pm70
---Pectobacterium---
P. atrosepticum SCRI1043
P. carotovorum subsp. carotovorum PC1
---Pediococcus---
P. pentosaceus ATCC 25745
---Pedobacter---
P. heparinus DSM 2366
---Pelobacter---
P. carbinolicus DSM 2380
P. propionicus DSM 2379
---Pelodictyon---
P. luteolum DSM 273
P. phaeoclathratiforme BU-1
---Pelotomaculum---
P. thermopropionicum SI
---Persephonella---
P. marina EX-H1
---Petrotoga---
P. mobilis SJ95
---Phenylobacterium---
P. zucineum HLK1
---Photobacterium---
P. profundum SS9
---Photorhabdus---
P. asymbiotica
P. luminescens subsp. laumondii TTO1
---Picrophilus---
P. torridus DSM 9790
---Polaromonas---
P. naphthalenivorans CJ2
P. sp. JS666
---Polynucleobacter---
P. necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1
P. necessarius subsp. necessarius STIR1
---Porphyromonas---
P. gingivalis ATCC 33277
P. gingivalis W83
---Prochlorococcus---
P. marinus str. AS9601
P. marinus str. MIT 9211
P. marinus str. MIT 9215
P. marinus str. MIT 9301
P. marinus str. MIT 9303
P. marinus str. MIT 9312
P. marinus str. MIT 9313
P. marinus str. MIT 9515
P. marinus str. NATL1A
P. marinus str. NATL2A
P. marinus subsp. marinus str. CCMP1375
P. marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
---Propionibacterium---
P. acnes KPA171202
---Prosthecochloris---
P. aestuarii DSM 271
---Proteus---
P. mirabilis HI4320
---Pseudoalteromonas---
P. atlantica T6c
P. haloplanktis TAC125
---Pseudomonas---
P. aeruginosa LESB58
P. aeruginosa PA7
P. aeruginosa PAO1
P. aeruginosa UCBPP-PA14
P. entomophila L48
P. fluorescens Pf-5
P. fluorescens Pf0-1
P. fluorescens SBW25
P. mendocina ymp
P. putida F1
P. putida GB-1
P. putida KT2440
P. putida W619
P. stutzeri A1501
P. syringae pv. phaseolicola 1448A
P. syringae pv. syringae B728a
P. syringae pv. tomato str. DC3000
---Psychrobacter---
P. arcticus 273-4
P. cryohalolentis K5
P. sp. PRwf-1
---Psychromonas---
P. ingrahamii 37
---Pyrobaculum---
P. aerophilum str. IM2
P. arsenaticum DSM 13514
P. calidifontis JCM 11548
P. islandicum DSM 4184
---Pyrococcus---
P. abyssi GE5
P. furiosus DSM 3638
P. horikoshii OT3
---Ralstonia---
R. pickettii 12D
R. pickettii 12J
R. solanacearum GMI1000
---Renibacterium---
R. salmoninarum ATCC 33209
---Rhizobium---
R. etli CFN 42
R. etli CIAT 652
R. leguminosarum bv. trifolii WSM1325
R. leguminosarum bv. trifolii WSM2304
R. leguminosarum bv. viciae 3841
R. sp. NGR234
---Rhodobacter---
R. sphaeroides 2.4.1
R. sphaeroides ATCC 17025
R. sphaeroides ATCC 17029
R. sphaeroides KD131
---Rhodococcus---
R. erythropolis PR4
R. jostii RHA1
R. opacus B4
---Rhodoferax---
R. ferrireducens T118
---Rhodopirellula---
R. baltica SH 1
---Rhodopseudomonas---
R. palustris BisA53
R. palustris BisB18
R. palustris BisB5
R. palustris CGA009
R. palustris HaA2
R. palustris TIE-1
---Rhodospirillum---
R. centenum SW
R. rubrum ATCC 11170
---Rickettsia---
R. africae ESF-5
R. akari str. Hartford
R. bellii OSU 85-389
R. bellii RML369-C
R. canadensis str. McKiel
R. conorii str. Malish 7
R. felis URRWXCal2
R. massiliae MTU5
R. peacockii str. Rustic
R. prowazekii str. Madrid E
R. rickettsii str. 'Sheila Smith'
R. rickettsii str. Iowa
R. typhi str. Wilmington
---Roseiflexus---
R. castenholzii DSM 13941
R. sp. RS-1
---Roseobacter---
R. denitrificans OCh 114
---Rubrobacter---
R. xylanophilus DSM 9941
---Ruegeria---
R. pomeroyi DSS-3
R. sp. TM1040
---Saccharomonospora---
S. viridis DSM 43017
---Saccharophagus---
S. degradans 2-40
---Saccharopolyspora---
S. erythraea NRRL 2338
---Salinibacter---
S. ruber DSM 13855
---Salinispora---
S. arenicola CNS-205
S. tropica CNB-440
---Salmonella---
S. enterica subsp. arizonae serovar 62:z4,z23:--
S. enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483
S. enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67
S. enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853
S. enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109
S. enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91
S. enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476
S. enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. CVM29188
S. enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594
S. enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. 404ty
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2
S. enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
S. enterica subsp. enterica serovar Virchow str. SL491
---Serratia---
S. proteamaculans 568
---Shewanella---
S. amazonensis SB2B
S. baltica OS155
S. baltica OS185
S. baltica OS195
S. baltica OS223
S. denitrificans OS217
S. frigidimarina NCIMB 400
S. halifaxensis HAW-EB4
S. loihica PV-4
S. oneidensis MR-1
S. pealeana ATCC 700345
S. piezotolerans WP3
S. putrefaciens CN-32
S. sediminis HAW-EB3
S. sp. ANA-3
S. sp. MR-4
S. sp. MR-7
S. sp. W3-18-1
S. woodyi ATCC 51908
---Shigella---
S. boydii CDC 3083-94
S. boydii Sb227
S. dysenteriae Sd197
S. flexneri 2a str. 2457T
S. flexneri 2a str. 301
S. flexneri 5 str. 8401
S. sonnei Ss046
---Sinorhizobium---
S. medicae WSM419
S. meliloti 1021
---Slackia---
S. heliotrinireducens DSM 20476
---Sodalis---
S. glossinidius str. 'morsitans'
---Sorangium---
S. cellulosum 'So ce 56'
---Sphingomonas---
S. wittichii RW1
---Sphingopyxis---
S. alaskensis RB2256
---Staphylococcus---
S. aureus RF122
S. aureus subsp. aureus COL
S. aureus subsp. aureus JH1
S. aureus subsp. aureus JH9
S. aureus subsp. aureus MRSA252
S. aureus subsp. aureus MSSA476
S. aureus subsp. aureus MW2
S. aureus subsp. aureus Mu3
S. aureus subsp. aureus Mu50
S. aureus subsp. aureus N315
S. aureus subsp. aureus NCTC 8325
S. aureus subsp. aureus USA300_FPR3757
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH1516
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH959
S. aureus subsp. aureus str. Newman
S. carnosus subsp. carnosus TM300
S. epidermidis ATCC 12228
S. epidermidis RP62A
S. haemolyticus JCSC1435
S. saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
---Staphylothermus---
S. marinus F1
---Stenotrophomonas---
S. maltophilia K279a
S. maltophilia R551-3
---Streptococcus---
S. agalactiae 2603V/R
S. agalactiae A909
S. agalactiae NEM316
S. dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124
S. equi subsp. equi 4047
S. equi subsp. zooepidemicus
S. equi subsp. zooepidemicus MGCS10565
S. gordonii str. Challis substr. CH1
S. mutans UA159
S. pneumoniae 70585
S. pneumoniae ATCC 700669
S. pneumoniae CGSP14
S. pneumoniae D39
S. pneumoniae G54
S. pneumoniae Hungary19A-6
S. pneumoniae JJA
S. pneumoniae P1031
S. pneumoniae R6
S. pneumoniae TIGR4
S. pneumoniae Taiwan19F-14
S. pyogenes M1 GAS
S. pyogenes MGAS10270
S. pyogenes MGAS10394
S. pyogenes MGAS10750
S. pyogenes MGAS2096
S. pyogenes MGAS315
S. pyogenes MGAS5005
S. pyogenes MGAS6180
S. pyogenes MGAS8232
S. pyogenes MGAS9429
S. pyogenes NZ131
S. pyogenes SSI-1
S. pyogenes str. Manfredo
S. sanguinis SK36
S. suis 05ZYH33
S. suis 98HAH33
S. suis BM407
S. suis P1/7
S. suis SC84
S. thermophilus CNRZ1066
S. thermophilus LMD-9
S. thermophilus LMG 18311
S. uberis 0140J
---Streptomyces---
S. avermitilis MA-4680
S. coelicolor A3(2)
S. griseus subsp. griseus NBRC 13350
---Sulfolobus---
S. acidocaldarius DSM 639
S. islandicus L.S.2.15
S. islandicus M.14.25
S. islandicus M.16.27
S. islandicus M.16.4
S. islandicus Y.G.57.14
S. islandicus Y.N.15.51
S. solfataricus P2
S. tokodaii str. 7
---Sulfurihydrogenibium---
S. azorense Az-Fu1
S. sp. YO3AOP1
---Sulfurimonas---
S. denitrificans DSM 1251
---Sulfurovum---
S. sp. NBC37-1
---Symbiobacterium---
S. thermophilum IAM 14863
---Synechococcus---
S. elongatus PCC 6301
S. elongatus PCC 7942
S. sp. CC9311
S. sp. CC9605
S. sp. CC9902
S. sp. JA-2-3B'a(2-13)
S. sp. JA-3-3Ab
S. sp. PCC 7002
S. sp. RCC307
S. sp. WH 7803
S. sp. WH 8102
---Synechocystis---
S. sp. PCC 6803
---Syntrophobacter---
S. fumaroxidans MPOB
---Syntrophomonas---
S. wolfei subsp. wolfei str. Goettingen
---Syntrophus---
S. aciditrophicus SB
---Teredinibacter---
T. turnerae T7901
---Thauera---
T. sp. MZ1T
---Thermoanaerobacter---
T. pseudethanolicus ATCC 33223
T. sp. X514
T. tengcongensis MB4
---Thermobifida---
T. fusca YX
---Thermococcus---
T. gammatolerans EJ3
T. kodakarensis KOD1
T. onnurineus NA1
T. sibiricus MM 739
---Thermodesulfovibrio---
T. yellowstonii DSM 11347
---Thermofilum---
T. pendens Hrk 5
---Thermomicrobium---
T. roseum DSM 5159
---Thermoplasma---
T. acidophilum DSM 1728
T. volcanium GSS1
---Thermoproteus---
T. neutrophilus V24Sta
---Thermosipho---
T. africanus TCF52B
T. melanesiensis BI429
---Thermosynechococcus---
T. elongatus BP-1
---Thermotoga---
T. lettingae TMO
T. maritima MSB8
T. neapolitana DSM 4359
T. petrophila RKU-1
T. sp. RQ2
---Thermus---
T. thermophilus HB27
T. thermophilus HB8
---Thioalkalivibrio---
T. sp. HL-EbGR7
---Thiobacillus---
T. denitrificans ATCC 25259
---Thiomicrospira---
T. crunogena XCL-2
---Tolumonas---
T. auensis DSM 9187
---Treponema---
T. denticola ATCC 35405
T. pallidum subsp. pallidum SS14
T. pallidum subsp. pallidum str. Nichols
---Trichodesmium---
T. erythraeum IMS101
---Tropheryma---
T. whipplei TW08/27
T. whipplei str. Twist
---Ureaplasma---
U. parvum serovar 3 str. ATCC 27815
U. parvum serovar 3 str. ATCC 700970
U. urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699
---Variovorax---
V. paradoxus S110
---Verminephrobacter---
V. eiseniae EF01-2
---Vibrio---
V. cholerae M66-2
V. cholerae MJ-1236
V. cholerae O1 biovar El Tor str. N16961
V. cholerae O395
V. harveyi ATCC BAA-1116
V. parahaemolyticus RIMD 2210633
V. splendidus LGP32
V. vulnificus CMCP6
V. vulnificus YJ016
---Wigglesworthia---
W. glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis
---Wolbachia---
W. endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel
W. endosymbiont of Drosophila melanogaster
W. endosymbiont strain TRS of Brugia malayi
W. sp. wRi
---Wolinella---
W. succinogenes DSM 1740
---Xanthobacter---
X. autotrophicus Py2
---Xanthomonas---
X. axonopodis pv. citri str. 306
X. campestris pv. campestris str. 8004
X. campestris pv. campestris str. ATCC 33913
X. campestris pv. campestris str. B100
X. campestris pv. vesicatoria str. 85-10
X. oryzae pv. oryzae KACC10331
X. oryzae pv. oryzae MAFF 311018
X. oryzae pv. oryzae PXO99A
---Xylella---
X. fastidiosa 9a5c
X. fastidiosa M12
X. fastidiosa M23
X. fastidiosa Temecula1
---Yersinia---
Y. enterocolitica subsp. enterocolitica 8081
Y. pestis Angola
Y. pestis Antiqua
Y. pestis CA88-4125
Y. pestis CO92
Y. pestis KIM
Y. pestis Nepal516
Y. pestis Pestoides F
Y. pestis biovar Microtus str. 91001
Y. pestis biovar Orientalis str. IP275
Y. pseudotuberculosis IP 31758
Y. pseudotuberculosis IP 32953
Y. pseudotuberculosis PB1/+
Y. pseudotuberculosis YPIII
---Zymomonas---
Z. mobilis subsp. mobilis ZM4
---environmental samples---
u. methanogenic archaeon RC-I
---unclassified Flavobacteriaceae---
F. bacterium 3519-10
---uncultured Termite group 1 bacterium---
u. Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17
---Acaryochloris---
A. marina MBIC11017
---Acetobacter---
A. pasteurianus IFO 3283-01
---Acholeplasma---
A. laidlawii PG-8A
---Acidimicrobium---
A. ferrooxidans DSM 10331
---Acidiphilium---
A. cryptum JF-5
---Acidithiobacillus---
A. ferrooxidans ATCC 23270
A. ferrooxidans ATCC 53993
---Acidobacterium---
A. capsulatum ATCC 51196
---Acidothermus---
A. cellulolyticus 11B
---Acidovorax---
A. citrulli AAC00-1
A. sp. JS42
---Acinetobacter---
A. baumannii AB0057
A. baumannii AB307-0294
A. baumannii ACICU
A. baumannii ATCC 17978
A. baumannii AYE
A. baumannii SDF
A. sp. ADP1
---Actinobacillus---
A. pleuropneumoniae L20
A. pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03
A. pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76
A. succinogenes 130Z
---Actinosynnema---
A. mirum DSM 43827
---Aeromonas---
A. hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966
A. salmonicida subsp. salmonicida A449
---Aeropyrum---
A. pernix K1
---Aggregatibacter---
A. aphrophilus NJ8700
---Agrobacterium---
A. radiobacter K84
A. tumefaciens str. C58
A. vitis S4
---Akkermansia---
A. muciniphila ATCC BAA-835
---Alcanivorax---
A. borkumensis SK2
---Alicyclobacillus---
A. acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446
---Aliivibrio---
A. salmonicida LFI1238
V. fischeri ES114
V. fischeri MJ11
---Alkalilimnicola---
A. ehrlichii MLHE-1
---Alkaliphilus---
A. metalliredigens QYMF
A. oremlandii OhILAs
---Alteromonas---
A. macleodii 'Deep ecotype'
---Anabaena---
A. variabilis ATCC 29413
---Anaerocellum---
A. thermophilum DSM 6725
---Anaerococcus---
A. prevotii DSM 20548
---Anaeromyxobacter---
A. dehalogenans 2CP-1
A. dehalogenans 2CP-C
A. sp. Fw109-5
A. sp. K
---Anaplasma---
A. marginale str. Florida
A. marginale str. St. Maries
A. phagocytophilum HZ
---Anoxybacillus---
A. flavithermus WK1
---Aquifex---
A. aeolicus VF5
---Archaeoglobus---
A. fulgidus DSM 4304
---Arcobacter---
A. butzleri RM4018
---Aromatoleum---
A. aromaticum EbN1
---Arthrobacter---
A. aurescens TC1
A. chlorophenolicus A6
A. sp. FB24
---Atopobium---
A. parvulum DSM 20469
---Azoarcus---
A. sp. BH72
---Azorhizobium---
A. caulinodans ORS 571
---Azotobacter---
A. vinelandii DJ
---Bacillus---
B. amyloliquefaciens FZB42
B. anthracis str. 'Ames Ancestor'
B. anthracis str. A0248
B. anthracis str. A2012
B. anthracis str. Ames
B. anthracis str. CDC 684
B. anthracis str. Sterne
B. cereus 03BB102
B. cereus AH187
B. cereus AH820
B. cereus ATCC 10987
B. cereus ATCC 14579
B. cereus B4264
B. cereus E33L
B. cereus G9842
B. cereus H3081.97
B. cereus Q1
B. clausii KSM-K16
B. cytotoxicus NVH 391-98
B. halodurans C-125
B. licheniformis ATCC 14580
B. pumilus SAFR-032
B. subtilis subsp. subtilis str. 168
B. thuringiensis serovar konkukian str. 97-27
B. thuringiensis str. Al Hakam
B. weihenstephanensis KBAB4
---Bacteroides---
B. fragilis NCTC 9343
B. fragilis YCH46
B. thetaiotaomicron VPI-5482
B. vulgatus ATCC 8482
---Bartonella---
B. bacilliformis KC583
B. grahamii as4aup
B. henselae str. Houston-1
B. quintana str. Toulouse
B. tribocorum CIP 105476
---Bdellovibrio---
B. bacteriovorus HD100
---Beijerinckia---
B. indica subsp. indica ATCC 9039
---Beutenbergia---
B. cavernae DSM 12333
---Bifidobacterium---
B. adolescentis ATCC 15703
B. animalis subsp. lactis AD011
B. animalis subsp. lactis Bl-04
B. animalis subsp. lactis DSM 10140
B. longum DJO10A
B. longum NCC2705
B. longum subsp. infantis ATCC 15697
---Bordetella---
B. avium 197N
B. bronchiseptica RB50
B. parapertussis 12822
B. pertussis Tohama I
B. petrii DSM 12804
---Borrelia---
B. afzelii ACA-1
B. afzelii PKo
B. burgdorferi 118a
B. burgdorferi 156a
B. burgdorferi 29805
B. burgdorferi 64b
B. burgdorferi 72a
B. burgdorferi 94a
B. burgdorferi B31
B. burgdorferi Bol26
B. burgdorferi CA-11.2a
B. burgdorferi WI91-23
B. burgdorferi ZS7
B. duttonii Ly
B. garinii Far04
B. garinii PBi
B. garinii PBr
B. hermsii DAH
B. recurrentis A1
B. sp. SV1
B. spielmanii A14S
B. turicatae 91E135
B. valaisiana VS116
---Brachybacterium---
B. faecium DSM 4810
---Brachyspira---
B. hyodysenteriae WA1
---Bradyrhizobium---
B. japonicum USDA 110
B. sp. BTAi1
B. sp. ORS278
---Brevibacillus---
B. brevis NBRC 100599
---Brucella---
B. abortus S19
B. abortus bv. 1 str. 9-941
B. canis ATCC 23365
B. melitensis ATCC 23457
B. melitensis biovar Abortus 2308
B. melitensis bv. 1 str. 16M
B. microti CCM 4915
B. ovis ATCC 25840
B. suis 1330
B. suis ATCC 23445
---Buchnera---
B. aphidicola str. 5A (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum)
B. aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae)
B. aphidicola str. Cc (Cinara cedri)
B. aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum)
B. aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum)
---Burkholderia---
B. ambifaria AMMD
B. ambifaria MC40-6
B. cenocepacia AU 1054
B. cenocepacia HI2424
B. cenocepacia J2315
B. cenocepacia MC0-3
B. glumae BGR1
B. mallei ATCC 23344
B. mallei NCTC 10229
B. mallei NCTC 10247
B. mallei SAVP1
B. multivorans ATCC 17616
B. phymatum STM815
B. phytofirmans PsJN
B. pseudomallei 1106a
B. pseudomallei 1710b
B. pseudomallei 668
B. pseudomallei K96243
B. pseudomallei MSHR346
B. sp. 383
B. thailandensis E264
B. vietnamiensis G4
B. xenovorans LB400
---Caldicellulosiruptor---
C. saccharolyticus DSM 8903
---Caldivirga---
C. maquilingensis IC-167
---Calyptogena okutanii thioautotrophic gill symbiont---
C. Vesicomyosocius okutanii HA
---Campylobacter---
C. concisus 13826
C. curvus 525.92
C. fetus subsp. fetus 82-40
C. hominis ATCC BAA-381
C. jejuni RM1221
C. jejuni subsp. doylei 269.97
C. jejuni subsp. jejuni 81-176
C. jejuni subsp. jejuni 81116
C. jejuni subsp. jejuni NCTC 11168
C. lari RM2100
---Candidatus Accumulibacter---
C. Accumulibacter phosphatis clade IIA str. UW-1
---Candidatus Amoebophilus---
C. Amoebophilus asiaticus 5a2
---Candidatus Azobacteroides---
C. Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2
---Candidatus Baumannia cicadellinicola---
B. cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)
---Candidatus Blochmannia---
C. Blochmannia floridanus
C. Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN
---Candidatus Carsonella---
C. Carsonella ruddii PV
---Candidatus Desulforudis---
C. Desulforudis audaxviator MP104C
---Candidatus Hamiltonella---
C. Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum)
---Candidatus Hodgkinia---
C. Hodgkinia cicadicola Dsem
---Candidatus Korarchaeum---
C. Korarchaeum cryptofilum OPF8
---Candidatus Koribacter---
C. Koribacter versatilis Ellin345
---Candidatus Liberibacter---
C. Liberibacter asiaticus str. psy62
---Candidatus Methanoregula---
C. Methanoregula boonei 6A8
---Candidatus Pelagibacter---
C. Pelagibacter ubique HTCC1062
---Candidatus Phytoplasma---
A. yellows witches'-broom phytoplasma AYWB
C. Phytoplasma australiense
C. Phytoplasma mali
O. yellows phytoplasma OY-M
---Candidatus Protochlamydia---
C. Protochlamydia amoebophila UWE25
---Candidatus Ruthia magnifica---
C. Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)
---Candidatus Solibacter---
C. Solibacter usitatus Ellin6076
---Candidatus Sulcia---
C. Sulcia muelleri GWSS
C. Sulcia muelleri SMDSEM
---Capnocytophaga---
C. ochracea DSM 7271
---Carboxydothermus---
C. hydrogenoformans Z-2901
---Catenulispora---
C. acidiphila DSM 44928
---Caulobacter---
C. crescentus CB15
C. crescentus NA1000
C. sp. K31
---Cellvibrio---
C. japonicus Ueda107
---Chelativorans---
C. sp. BNC1
---Chitinophaga---
C. pinensis DSM 2588
---Chlamydia---
C. muridarum Nigg
C. trachomatis
C. trachomatis 434/Bu
C. trachomatis A/HAR-13
C. trachomatis B/Jali20/OT
C. trachomatis D/UW-3/CX
C. trachomatis L2b/UCH-1/proctitis
---Chlamydophila---
C. abortus S26/3
C. caviae GPIC
C. felis Fe/C-56
C. pneumoniae AR39
C. pneumoniae CWL029
C. pneumoniae J138
C. pneumoniae TW-183
---Chlorobaculum---
C. parvum NCIB 8327
C. tepidum TLS
---Chlorobium---
C. chlorochromatii CaD3
C. limicola DSM 245
C. phaeobacteroides BS1
C. phaeobacteroides DSM 266
C. phaeovibrioides DSM 265
---Chloroflexus---
C. aggregans DSM 9485
C. aurantiacus J-10-fl
C. sp. Y-400-fl
---Chloroherpeton---
C. thalassium ATCC 35110
---Chromobacterium---
C. violaceum ATCC 12472
---Chromohalobacter---
C. salexigens DSM 3043
---Citrobacter---
C. koseri ATCC BAA-895
---Clavibacter---
C. michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382
C. michiganensis subsp. sepedonicus
---Clostridium---
C. acetobutylicum ATCC 824
C. beijerinckii NCIMB 8052
C. botulinum A str. ATCC 19397
C. botulinum A str. ATCC 3502
C. botulinum A str. Hall
C. botulinum A2 str. Kyoto
C. botulinum A3 str. Loch Maree
C. botulinum B str. Eklund 17B
C. botulinum B1 str. Okra
C. botulinum Ba4 str. 657
C. botulinum D str. 1873
C. botulinum E3 str. Alaska E43
C. botulinum F str. Langeland
C. cellulolyticum H10
C. difficile 630
C. kluyveri DSM 555
C. kluyveri NBRC 12016
C. novyi NT
C. perfringens ATCC 13124
C. perfringens SM101
C. perfringens str. 13
C. phytofermentans ISDg
C. tetani E88
C. thermocellum ATCC 27405
---Colwellia---
C. psychrerythraea 34H
---Coprothermobacter---
C. proteolyticus DSM 5265
---Corynebacterium---
C. aurimucosum ATCC 700975
C. diphtheriae NCTC 13129
C. efficiens YS-314
C. glutamicum ATCC 13032
C. glutamicum R
C. jeikeium K411
C. kroppenstedtii DSM 44385
C. urealyticum DSM 7109
---Coxiella---
C. burnetii 'MSU Goat Q177'
C. burnetii CbuG_Q212
C. burnetii CbuK_Q154
C. burnetii Dugway 5J108-111
C. burnetii RSA 331
C. burnetii RSA 493
---Cronobacter---
C. sakazakii ATCC BAA-894
---Cryptobacterium---
C. curtum DSM 15641
---Cupriavidus---
C. taiwanensis
R. eutropha H16
R. eutropha JMP134
R. metallidurans CH34
---Cyanothece---
C. sp. ATCC 51142
C. sp. PCC 7424
C. sp. PCC 7425
C. sp. PCC 8801
C. sp. PCC 8802
---Cytophaga---
C. hutchinsonii ATCC 33406
---Dechloromonas---
D. aromatica RCB
---Dehalococcoides---
D. ethenogenes 195
D. sp. BAV1
D. sp. CBDB1
---Deinococcus---
D. deserti VCD115
D. geothermalis DSM 11300
D. radiodurans R1
---Delftia---
D. acidovorans SPH-1
---Desulfatibacillum---
D. alkenivorans AK-01
---Desulfitobacterium---
D. hafniense DCB-2
D. hafniense Y51
---Desulfobacterium---
D. autotrophicum HRM2
---Desulfococcus---
D. oleovorans Hxd3
---Desulfohalobium---
D. retbaense DSM 5692
---Desulfomicrobium---
D. baculatum DSM 4028
---Desulfotalea---
D. psychrophila LSv54
---Desulfotomaculum---
D. acetoxidans DSM 771
D. reducens MI-1
---Desulfovibrio---
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774
D. desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20
D. magneticus RS-1
D. salexigens DSM 2638
D. vulgaris DP4
D. vulgaris str. 'Miyazaki F'
D. vulgaris str. Hildenborough
---Desulfurococcus---
D. kamchatkensis 1221n
---Diaphorobacter---
D. sp. TPSY
---Dichelobacter---
D. nodosus VCS1703A
---Dickeya---
D. dadantii Ech703
D. zeae Ech1591
---Dictyoglomus---
D. thermophilum H-6-12
D. turgidum DSM 6724
---Dinoroseobacter---
D. shibae DFL 12
---Dyadobacter---
D. fermentans DSM 18053
---Edwardsiella---
E. ictaluri 93-146
---Eggerthella---
E. lenta DSM 2243
---Ehrlichia---
E. canis str. Jake
E. chaffeensis str. Arkansas
E. ruminantium str. Gardel
E. ruminantium str. Welgevonden
---Elusimicrobium---
E. minutum Pei191
---Enterobacter---
E. sp. 638
---Enterococcus---
E. faecalis V583
---Erwinia---
E. tasmaniensis Et1/99
---Erythrobacter---
E. litoralis HTCC2594
---Escherichia---
E. coli 536
E. coli 53638
E. coli 55989
E. coli APEC O1
E. coli ATCC 8739
E. coli B str. REL606
E. coli B171
E. coli BL21
E. coli BL21(DE3)
E. coli BW2952
E. coli CFT073
E. coli E24377A
E. coli ED1a
E. coli HS
E. coli IAI1
E. coli IAI39
E. coli O127:H6 str. E2348/69
E. coli O157:H7 EDL933
E. coli O157:H7 str. EC4115
E. coli O157:H7 str. Sakai
E. coli O157:H7 str. TW14359
E. coli S88
E. coli SE11
E. coli SMS-3-5
E. coli UMN026
E. coli UTI89
E. coli str. K-12 substr. DH10B
E. coli str. K-12 substr. MG1655
E. coli str. K-12 substr. W3110
E. fergusonii ATCC 35469
---Eubacterium---
E. eligens ATCC 27750
E. rectale ATCC 33656
---Exiguobacterium---
E. sibiricum 255-15
E. sp. AT1b
---Fervidobacterium---
F. nodosum Rt17-B1
---Finegoldia---
F. magna ATCC 29328
---Flavobacterium---
F. johnsoniae UW101
F. psychrophilum JIP02/86
---Francisella---
F. novicida U112
F. philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017
F. tularensis subsp. holarctica
F. tularensis subsp. holarctica FTNF002-00
F. tularensis subsp. holarctica OSU18
F. tularensis subsp. mediasiatica FSC147
F. tularensis subsp. tularensis FSC198
F. tularensis subsp. tularensis SCHU S4
F. tularensis subsp. tularensis WY96-3418
---Frankia---
F. alni ACN14a
F. sp. CcI3
F. sp. EAN1pec
---Fusobacterium---
F. nucleatum subsp. nucleatum ATCC 25586
F. nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953
---Gemmatimonas---
G. aurantiaca T-27
---Geobacillus---
G. kaustophilus HTA426
G. sp. WCH70
G. thermodenitrificans NG80-2
---Geobacter---
G. bemidjiensis Bem
G. lovleyi SZ
G. metallireducens GS-15
G. sp. FRC-32
G. sp. M21
G. sulfurreducens PCA
G. uraniireducens Rf4
---Gloeobacter---
G. violaceus PCC 7421
---Gluconacetobacter---
G. diazotrophicus PAl 5
---Gluconobacter---
G. oxydans 621H
---Gramella---
G. forsetii KT0803
---Granulibacter---
G. bethesdensis CGDNIH1
---Haemophilus---
H. ducreyi 35000HP
H. influenzae 86-028NP
H. influenzae PittEE
H. influenzae PittGG
H. influenzae Rd KW20
H. parasuis SH0165
---Hahella---
H. chejuensis KCTC 2396
---Haloarcula---
H. marismortui ATCC 43049
---Halobacterium---
H. salinarum R1
H. sp. NRC-1
---Halomicrobium---
H. mukohataei DSM 12286
---Haloquadratum---
H. walsbyi DSM 16790
---Halorhabdus---
H. utahensis DSM 12940
---Halorhodospira---
H. halophila SL1
---Halorubrum---
H. lacusprofundi ATCC 49239
---Halothermothrix---
H. orenii H 168
---Helicobacter---
H. acinonychis str. Sheeba
H. hepaticus ATCC 51449
H. pylori 26695
H. pylori B38
H. pylori G27
H. pylori HPAG1
H. pylori J99
H. pylori P12
H. pylori Shi470
---Heliobacterium---
H. modesticaldum Ice1
---Herminiimonas---
H. arsenicoxydans
---Herpetosiphon---
H. aurantiacus ATCC 23779
---Hirschia---
H. baltica ATCC 49814
---Histophilus---
H. somnus 129PT
H. somnus 2336
---Hydrogenobaculum---
H. sp. Y04AAS1
---Hyperthermus---
H. butylicus DSM 5456
---Hyphomonas---
H. neptunium ATCC 15444
---Idiomarina---
I. loihiensis L2TR
---Ignicoccus---
I. hospitalis KIN4/I
---Jannaschia---
J. sp. CCS1
---Janthinobacterium---
J. sp. Marseille
---Jonesia---
J. denitrificans DSM 20603
---Kangiella---
K. koreensis DSM 16069
---Kineococcus---
K. radiotolerans SRS30216
---Klebsiella---
K. pneumoniae 342
K. pneumoniae NTUH-K2044
K. pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578
---Kocuria---
K. rhizophila DC2201
---Kosmotoga---
K. olearia TBF 19.5.1
---Kytococcus---
K. sedentarius DSM 20547
---Lactobacillus---
L. acidophilus NCFM
L. brevis ATCC 367
L. casei ATCC 334
L. casei BL23
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC 11842
L. delbrueckii subsp. bulgaricus ATCC BAA-365
L. fermentum IFO 3956
L. gasseri ATCC 33323
L. helveticus DPC 4571
L. johnsonii NCC 533
L. plantarum JDM1
L. plantarum WCFS1
L. reuteri DSM 20016
L. reuteri JCM 1112
L. rhamnosus GG
L. rhamnosus HN001
L. rhamnosus Lc 705
L. sakei subsp. sakei 23K
L. salivarius UCC118
---Lactococcus---
L. lactis subsp. cremoris MG1363
L. lactis subsp. cremoris SK11
L. lactis subsp. lactis Il1403
---Laribacter---
L. hongkongensis HLHK9
---Lawsonia---
L. intracellularis PHE/MN1-00
---Legionella---
L. pneumophila str. Corby
L. pneumophila str. Lens
L. pneumophila str. Paris
L. pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1
---Leifsonia---
L. xyli subsp. xyli str. CTCB07
---Leptospira---
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Ames)'
L. biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)'
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197
L. borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550
L. interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130
L. interrogans serovar Lai str. 56601
---Leptothrix---
L. cholodnii SP-6
---Leptotrichia---
L. buccalis DSM 1135
---Leuconostoc---
L. citreum KM20
L. mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293
---Listeria---
L. innocua Clip11262
L. monocytogenes Clip80459
L. monocytogenes EGD-e
L. monocytogenes HCC23
L. monocytogenes str. 4b F2365
L. welshimeri serovar 6b str. SLCC5334
---Lysinibacillus---
L. sphaericus C3-41
---Macrococcus---
M. caseolyticus JCSC5402
---Magnetococcus---
M. sp. MC-1
---Magnetospirillum---
M. magneticum AMB-1
---Mannheimia---
M. succiniciproducens MBEL55E
---Maricaulis---
M. maris MCS10
---Marinobacter---
M. aquaeolei VT8
---Marinomonas---
M. sp. MWYL1
---Mesoplasma---
M. florum L1
---Mesorhizobium---
M. loti MAFF303099
---Metallosphaera---
M. sedula DSM 5348
---Methanobrevibacter---
M. smithii ATCC 35061
---Methanocaldococcus---
M. fervens AG86
M. jannaschii DSM 2661
---Methanococcoides---
M. burtonii DSM 6242
---Methanococcus---
M. aeolicus Nankai-3
M. maripaludis C5
M. maripaludis C6
M. maripaludis C7
M. maripaludis S2
M. vannielii SB
---Methanocorpusculum---
M. labreanum Z
---Methanoculleus---
M. marisnigri JR1
---Methanopyrus---
M. kandleri AV19
---Methanosaeta---
M. thermophila PT
---Methanosarcina---
M. acetivorans C2A
M. barkeri str. Fusaro
M. mazei Go1
---Methanosphaera---
M. stadtmanae DSM 3091
---Methanosphaerula---
M. palustris E1-9c
---Methanospirillum---
M. hungatei JF-1
---Methanothermobacter---
M. thermautotrophicus str. Delta H
---Methylacidiphilum---
M. infernorum V4
---Methylibium---
M. petroleiphilum PM1
---Methylobacillus---
M. flagellatus KT
---Methylobacterium---
M. chloromethanicum CM4
M. extorquens AM1
M. extorquens DM4
M. extorquens PA1
M. nodulans ORS 2060
M. populi BJ001
M. radiotolerans JCM 2831
M. sp. 4-46
---Methylocella---
M. silvestris BL2
---Methylococcus---
M. capsulatus str. Bath
---Methylotenera---
M. mobilis JLW8
---Methylovorus---
M. sp. SIP3-4
---Micrococcus---
M. luteus NCTC 2665
---Microcystis---
M. aeruginosa NIES-843
---Moorella---
M. thermoacetica ATCC 39073
---Mycobacterium---
M. abscessus
M. avium 104
M. avium subsp. paratuberculosis K-10
M. bovis AF2122/97
M. bovis BCG str. Pasteur 1173P2
M. bovis BCG str. Tokyo 172
M. gilvum PYR-GCK
M. leprae Br4923
M. leprae TN
M. marinum M
M. smegmatis str. MC2 155
M. sp. JLS
M. sp. KMS
M. sp. MCS
M. tuberculosis CDC1551
M. tuberculosis F11
M. tuberculosis H37Ra
M. tuberculosis H37Rv
M. tuberculosis KZN 1435
M. ulcerans Agy99
M. vanbaalenii PYR-1
---Mycoplasma---
M. agalactiae PG2
M. arthritidis 158L3-1
M. capricolum subsp. capricolum ATCC 27343
M. conjunctivae
M. gallisepticum R
M. genitalium G37
M. hyopneumoniae 232
M. hyopneumoniae 7448
M. hyopneumoniae J
M. mobile 163K
M. mycoides subsp. mycoides SC str. PG1
M. penetrans HF-2
M. pneumoniae M129
M. pulmonis UAB CTIP
M. synoviae 53
---Myxococcus---
M. xanthus DK 1622
---Nanoarchaeum---
N. equitans Kin4-M
---Natranaerobius---
N. thermophilus JW/NM-WN-LF
---Natronomonas---
N. pharaonis DSM 2160
---Nautilia---
N. profundicola AmH
---Neisseria---
N. gonorrhoeae FA 1090
N. gonorrhoeae NCCP11945
N. meningitidis 053442
N. meningitidis FAM18
N. meningitidis MC58
N. meningitidis Z2491
N. meningitidis alpha14
---Neorickettsia---
N. risticii str. Illinois
N. sennetsu str. Miyayama
---Nitratiruptor---
N. sp. SB155-2
---Nitrobacter---
N. hamburgensis X14
N. winogradskyi Nb-255
---Nitrosococcus---
N. oceani ATCC 19707
---Nitrosomonas---
N. europaea ATCC 19718
N. eutropha C91
---Nitrosopumilus---
N. maritimus SCM1
---Nitrosospira---
N. multiformis ATCC 25196
---Nocardia---
N. farcinica IFM 10152
---Nocardioides---
N. sp. JS614
---Nostoc---
N. punctiforme PCC 73102
N. sp. PCC 7120
---Novosphingobium---
N. aromaticivorans DSM 12444
---Oceanobacillus---
O. iheyensis HTE831
---Ochrobactrum---
O. anthropi ATCC 49188
---Oenococcus---
O. oeni PSU-1
---Oligotropha---
O. carboxidovorans OM5
---Opitutus---
O. terrae PB90-1
---Orientia---
O. tsutsugamushi str. Boryong
O. tsutsugamushi str. Ikeda
---Paenibacillus---
P. sp. JDR-2
---Parabacteroides---
P. distasonis ATCC 8503
---Paracoccus---
P. denitrificans PD1222
---Parvibaculum---
P. lavamentivorans DS-1
---Pasteurella---
P. multocida subsp. multocida str. Pm70
---Pectobacterium---
P. atrosepticum SCRI1043
P. carotovorum subsp. carotovorum PC1
---Pediococcus---
P. pentosaceus ATCC 25745
---Pedobacter---
P. heparinus DSM 2366
---Pelobacter---
P. carbinolicus DSM 2380
P. propionicus DSM 2379
---Pelodictyon---
P. luteolum DSM 273
P. phaeoclathratiforme BU-1
---Pelotomaculum---
P. thermopropionicum SI
---Persephonella---
P. marina EX-H1
---Petrotoga---
P. mobilis SJ95
---Phenylobacterium---
P. zucineum HLK1
---Photobacterium---
P. profundum SS9
---Photorhabdus---
P. asymbiotica
P. luminescens subsp. laumondii TTO1
---Picrophilus---
P. torridus DSM 9790
---Polaromonas---
P. naphthalenivorans CJ2
P. sp. JS666
---Polynucleobacter---
P. necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1
P. necessarius subsp. necessarius STIR1
---Porphyromonas---
P. gingivalis ATCC 33277
P. gingivalis W83
---Prochlorococcus---
P. marinus str. AS9601
P. marinus str. MIT 9211
P. marinus str. MIT 9215
P. marinus str. MIT 9301
P. marinus str. MIT 9303
P. marinus str. MIT 9312
P. marinus str. MIT 9313
P. marinus str. MIT 9515
P. marinus str. NATL1A
P. marinus str. NATL2A
P. marinus subsp. marinus str. CCMP1375
P. marinus subsp. pastoris str. CCMP1986
---Propionibacterium---
P. acnes KPA171202
---Prosthecochloris---
P. aestuarii DSM 271
---Proteus---
P. mirabilis HI4320
---Pseudoalteromonas---
P. atlantica T6c
P. haloplanktis TAC125
---Pseudomonas---
P. aeruginosa LESB58
P. aeruginosa PA7
P. aeruginosa PAO1
P. aeruginosa UCBPP-PA14
P. entomophila L48
P. fluorescens Pf-5
P. fluorescens Pf0-1
P. fluorescens SBW25
P. mendocina ymp
P. putida F1
P. putida GB-1
P. putida KT2440
P. putida W619
P. stutzeri A1501
P. syringae pv. phaseolicola 1448A
P. syringae pv. syringae B728a
P. syringae pv. tomato str. DC3000
---Psychrobacter---
P. arcticus 273-4
P. cryohalolentis K5
P. sp. PRwf-1
---Psychromonas---
P. ingrahamii 37
---Pyrobaculum---
P. aerophilum str. IM2
P. arsenaticum DSM 13514
P. calidifontis JCM 11548
P. islandicum DSM 4184
---Pyrococcus---
P. abyssi GE5
P. furiosus DSM 3638
P. horikoshii OT3
---Ralstonia---
R. pickettii 12D
R. pickettii 12J
R. solanacearum GMI1000
---Renibacterium---
R. salmoninarum ATCC 33209
---Rhizobium---
R. etli CFN 42
R. etli CIAT 652
R. leguminosarum bv. trifolii WSM1325
R. leguminosarum bv. trifolii WSM2304
R. leguminosarum bv. viciae 3841
R. sp. NGR234
---Rhodobacter---
R. sphaeroides 2.4.1
R. sphaeroides ATCC 17025
R. sphaeroides ATCC 17029
R. sphaeroides KD131
---Rhodococcus---
R. erythropolis PR4
R. jostii RHA1
R. opacus B4
---Rhodoferax---
R. ferrireducens T118
---Rhodopirellula---
R. baltica SH 1
---Rhodopseudomonas---
R. palustris BisA53
R. palustris BisB18
R. palustris BisB5
R. palustris CGA009
R. palustris HaA2
R. palustris TIE-1
---Rhodospirillum---
R. centenum SW
R. rubrum ATCC 11170
---Rickettsia---
R. africae ESF-5
R. akari str. Hartford
R. bellii OSU 85-389
R. bellii RML369-C
R. canadensis str. McKiel
R. conorii str. Malish 7
R. felis URRWXCal2
R. massiliae MTU5
R. peacockii str. Rustic
R. prowazekii str. Madrid E
R. rickettsii str. 'Sheila Smith'
R. rickettsii str. Iowa
R. typhi str. Wilmington
---Roseiflexus---
R. castenholzii DSM 13941
R. sp. RS-1
---Roseobacter---
R. denitrificans OCh 114
---Rubrobacter---
R. xylanophilus DSM 9941
---Ruegeria---
R. pomeroyi DSS-3
R. sp. TM1040
---Saccharomonospora---
S. viridis DSM 43017
---Saccharophagus---
S. degradans 2-40
---Saccharopolyspora---
S. erythraea NRRL 2338
---Salinibacter---
S. ruber DSM 13855
---Salinispora---
S. arenicola CNS-205
S. tropica CNB-440
---Salmonella---
S. enterica subsp. arizonae serovar 62:z4,z23:--
S. enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483
S. enterica subsp. enterica serovar Choleraesuis str. SC-B67
S. enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853
S. enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109
S. enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91
S. enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476
S. enterica subsp. enterica serovar Kentucky str. CVM29188
S. enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. ATCC 9150
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi B str. SPB7
S. enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594
S. enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. 404ty
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18
S. enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2
S. enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
S. enterica subsp. enterica serovar Virchow str. SL491
---Serratia---
S. proteamaculans 568
---Shewanella---
S. amazonensis SB2B
S. baltica OS155
S. baltica OS185
S. baltica OS195
S. baltica OS223
S. denitrificans OS217
S. frigidimarina NCIMB 400
S. halifaxensis HAW-EB4
S. loihica PV-4
S. oneidensis MR-1
S. pealeana ATCC 700345
S. piezotolerans WP3
S. putrefaciens CN-32
S. sediminis HAW-EB3
S. sp. ANA-3
S. sp. MR-4
S. sp. MR-7
S. sp. W3-18-1
S. woodyi ATCC 51908
---Shigella---
S. boydii CDC 3083-94
S. boydii Sb227
S. dysenteriae Sd197
S. flexneri 2a str. 2457T
S. flexneri 2a str. 301
S. flexneri 5 str. 8401
S. sonnei Ss046
---Sinorhizobium---
S. medicae WSM419
S. meliloti 1021
---Slackia---
S. heliotrinireducens DSM 20476
---Sodalis---
S. glossinidius str. 'morsitans'
---Sorangium---
S. cellulosum 'So ce 56'
---Sphingomonas---
S. wittichii RW1
---Sphingopyxis---
S. alaskensis RB2256
---Staphylococcus---
S. aureus RF122
S. aureus subsp. aureus COL
S. aureus subsp. aureus JH1
S. aureus subsp. aureus JH9
S. aureus subsp. aureus MRSA252
S. aureus subsp. aureus MSSA476
S. aureus subsp. aureus MW2
S. aureus subsp. aureus Mu3
S. aureus subsp. aureus Mu50
S. aureus subsp. aureus N315
S. aureus subsp. aureus NCTC 8325
S. aureus subsp. aureus USA300_FPR3757
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH1516
S. aureus subsp. aureus USA300_TCH959
S. aureus subsp. aureus str. Newman
S. carnosus subsp. carnosus TM300
S. epidermidis ATCC 12228
S. epidermidis RP62A
S. haemolyticus JCSC1435
S. saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305
---Staphylothermus---
S. marinus F1
---Stenotrophomonas---
S. maltophilia K279a
S. maltophilia R551-3
---Streptococcus---
S. agalactiae 2603V/R
S. agalactiae A909
S. agalactiae NEM316
S. dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124
S. equi subsp. equi 4047
S. equi subsp. zooepidemicus
S. equi subsp. zooepidemicus MGCS10565
S. gordonii str. Challis substr. CH1
S. mutans UA159
S. pneumoniae 70585
S. pneumoniae ATCC 700669
S. pneumoniae CGSP14
S. pneumoniae D39
S. pneumoniae G54
S. pneumoniae Hungary19A-6
S. pneumoniae JJA
S. pneumoniae P1031
S. pneumoniae R6
S. pneumoniae TIGR4
S. pneumoniae Taiwan19F-14
S. pyogenes M1 GAS
S. pyogenes MGAS10270
S. pyogenes MGAS10394
S. pyogenes MGAS10750
S. pyogenes MGAS2096
S. pyogenes MGAS315
S. pyogenes MGAS5005
S. pyogenes MGAS6180
S. pyogenes MGAS8232
S. pyogenes MGAS9429
S. pyogenes NZ131
S. pyogenes SSI-1
S. pyogenes str. Manfredo
S. sanguinis SK36
S. suis 05ZYH33
S. suis 98HAH33
S. suis BM407
S. suis P1/7
S. suis SC84
S. thermophilus CNRZ1066
S. thermophilus LMD-9
S. thermophilus LMG 18311
S. uberis 0140J
---Streptomyces---
S. avermitilis MA-4680
S. coelicolor A3(2)
S. griseus subsp. griseus NBRC 13350
---Sulfolobus---
S. acidocaldarius DSM 639
S. islandicus L.S.2.15
S. islandicus M.14.25
S. islandicus M.16.27
S. islandicus M.16.4
S. islandicus Y.G.57.14
S. islandicus Y.N.15.51
S. solfataricus P2
S. tokodaii str. 7
---Sulfurihydrogenibium---
S. azorense Az-Fu1
S. sp. YO3AOP1
---Sulfurimonas---
S. denitrificans DSM 1251
---Sulfurovum---
S. sp. NBC37-1
---Symbiobacterium---
S. thermophilum IAM 14863
---Synechococcus---
S. elongatus PCC 6301
S. elongatus PCC 7942
S. sp. CC9311
S. sp. CC9605
S. sp. CC9902
S. sp. JA-2-3B'a(2-13)
S. sp. JA-3-3Ab
S. sp. PCC 7002
S. sp. RCC307
S. sp. WH 7803
S. sp. WH 8102
---Synechocystis---
S. sp. PCC 6803
---Syntrophobacter---
S. fumaroxidans MPOB
---Syntrophomonas---
S. wolfei subsp. wolfei str. Goettingen
---Syntrophus---
S. aciditrophicus SB
---Teredinibacter---
T. turnerae T7901
---Thauera---
T. sp. MZ1T
---Thermoanaerobacter---
T. pseudethanolicus ATCC 33223
T. sp. X514
T. tengcongensis MB4
---Thermobifida---
T. fusca YX
---Thermococcus---
T. gammatolerans EJ3
T. kodakarensis KOD1
T. onnurineus NA1
T. sibiricus MM 739
---Thermodesulfovibrio---
T. yellowstonii DSM 11347
---Thermofilum---
T. pendens Hrk 5
---Thermomicrobium---
T. roseum DSM 5159
---Thermoplasma---
T. acidophilum DSM 1728
T. volcanium GSS1
---Thermoproteus---
T. neutrophilus V24Sta
---Thermosipho---
T. africanus TCF52B
T. melanesiensis BI429
---Thermosynechococcus---
T. elongatus BP-1
---Thermotoga---
T. lettingae TMO
T. maritima MSB8
T. neapolitana DSM 4359
T. petrophila RKU-1
T. sp. RQ2
---Thermus---
T. thermophilus HB27
T. thermophilus HB8
---Thioalkalivibrio---
T. sp. HL-EbGR7
---Thiobacillus---
T. denitrificans ATCC 25259
---Thiomicrospira---
T. crunogena XCL-2
---Tolumonas---
T. auensis DSM 9187
---Treponema---
T. denticola ATCC 35405
T. pallidum subsp. pallidum SS14
T. pallidum subsp. pallidum str. Nichols
---Trichodesmium---
T. erythraeum IMS101
---Tropheryma---
T. whipplei TW08/27
T. whipplei str. Twist
---Ureaplasma---
U. parvum serovar 3 str. ATCC 27815
U. parvum serovar 3 str. ATCC 700970
U. urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699
---Variovorax---
V. paradoxus S110
---Verminephrobacter---
V. eiseniae EF01-2
---Vibrio---
V. cholerae M66-2
V. cholerae MJ-1236
V. cholerae O1 biovar El Tor str. N16961
V. cholerae O395
V. harveyi ATCC BAA-1116
V. parahaemolyticus RIMD 2210633
V. splendidus LGP32
V. vulnificus CMCP6
V. vulnificus YJ016
---Wigglesworthia---
W. glossinidia endosymbiont of Glossina brevipalpis
---Wolbachia---
W. endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel
W. endosymbiont of Drosophila melanogaster
W. endosymbiont strain TRS of Brugia malayi
W. sp. wRi
---Wolinella---
W. succinogenes DSM 1740
---Xanthobacter---
X. autotrophicus Py2
---Xanthomonas---
X. axonopodis pv. citri str. 306
X. campestris pv. campestris str. 8004
X. campestris pv. campestris str. ATCC 33913
X. campestris pv. campestris str. B100
X. campestris pv. vesicatoria str. 85-10
X. oryzae pv. oryzae KACC10331
X. oryzae pv. oryzae MAFF 311018
X. oryzae pv. oryzae PXO99A
---Xylella---
X. fastidiosa 9a5c
X. fastidiosa M12
X. fastidiosa M23
X. fastidiosa Temecula1
---Yersinia---
Y. enterocolitica subsp. enterocolitica 8081
Y. pestis Angola
Y. pestis Antiqua
Y. pestis CA88-4125
Y. pestis CO92
Y. pestis KIM
Y. pestis Nepal516
Y. pestis Pestoides F
Y. pestis biovar Microtus str. 91001
Y. pestis biovar Orientalis str. IP275
Y. pseudotuberculosis IP 31758
Y. pseudotuberculosis IP 32953
Y. pseudotuberculosis PB1/+
Y. pseudotuberculosis YPIII
---Zymomonas---
Z. mobilis subsp. mobilis ZM4
---environmental samples---
u. methanogenic archaeon RC-I
---unclassified Flavobacteriaceae---
F. bacterium 3519-10
---uncultured Termite group 1 bacterium---
u. Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17
Distribution of
B. pertussis Tohama I
homologs
146 hits
4 equal hits
Zoom
x20
x10
x5
1013 hits
3436 query proteins produced
1163 hits
.
Each circle represents a single query genome protein, plotted by its BLAST scores to the highest scoring protein from each of the selected organisms. Symmetrical hits are shown as diamonds. Click on the protein(s) of interest or enter a query string to see the homologs in two chosen organisms.
Cutoff:
Linear scale
Logarithmic scale
1/X
Query: