MYBPC3 gene variations in hypertrophic cardiomyopathy patients in India

Can J Cardiol. 2008 Feb;24(2):127-30. doi: 10.1016/s0828-282x(08)70568-3.

Abstract

Background: Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is a complex cardiac muscular disorder, inherited as an autosomal dominant disease with variable penetrance. Cardiac myosin-binding protein C (MyBPC) is the predominant myosin-binding protein isoform in the heart muscle. One hundred forty-seven mutations have been detected in MYBPC3, accounting for 15% of all HCM cases.

Objective: To screen exons 16, 18, 19, 22, 24, 28, 30, 31 and 34 in the MYBPC3 gene in Indian HCM patients.

Methods: Sixty control and 95 HCM samples were collected from cardiology units of the CARE Hospital (Nampally, Banjara Hills, Secunderabad, India) for genomic DNA isolation followed by polymerase chain reaction and single-stranded conformational polymorphism analysis.

Results: Screening of the exons revealed two variations - one novel frame shift mutation in exon 19 at the nucleotide position 11577-11578 and one novel single nucleotide polymorphism (SNP) in codon 1093 of exon 31, coding for glycine with a C>T transition (GGC/GGT), in addition to the seven known SNPs mainly in the intronic region and one known missense mutation D770N in this population.

Conclusion: The novel frame shift mutation identified in exon 19, D570fs, with the insertion of an adenine residue in codon 570 coding for aspartate, results in a premature termination codon that produces a truncated protein lacking myosin- and titin-binding sites, explaining the role of the nonsense-mediated decay pathway. A novel SNP identified in codon 1093 of exon 31 was found to be a synonymous codon, which may have a regulatory effect at the translational level, attributing to affinity differences between codon-anticodon interactions. The screening of this gene may be relevant in the Indian context.

HISTORIQUE: La myocardiopahie hypertrophique (MCH) est un trouble complexe du muscle cardiaque, hérité sous forme de maladie autosomique dominante à pénétration variable. La protéine C cardiaque de liaison à la myosine (MyBPC) est le principal isoforme de la protéine de liaison à la myosine du muscle cardiaque. On a décelé 147 mutations dans le gène MYBPC3 ce qui représente 15 % de tous les cas de MCH.

OBJECTIF: Dépister les exons 16, 18, 19, 22, 24, 28, 30, 31 et 34 dans le gène MYBPC3 de patients indiens atteints de MCH.

MÉTHODOLOGIE: Les auteurs ont colligé 60 sujets témoins et 95 échantillons de MCH dans des unités de cardiologie de l’Hôpital CARE (de Nampally dans les montagnes de Banjara à Secunderabad, en Inde) afin d’isoler l’ADN génomique et de procéder à une réaction en chaîne de la polymérase et à une analyse polymorphique conformationnelle monocaténaire.

RÉSULTATS: Le dépistage des exons a révélé deux variations – une nouvelle mutation à trame décalée dans l’exon 19 à la position 11577^11578 du nucléotide et un nouveau polymorphisme d’un nucléotide simple (PNS) dans le codon 1093 de l’exon 31, qui code la glycine avec une transition C>T (GGC/GGT), en plus des sept PNS connus surtout situés dans la région intronique et d’une mutation faux-sens D770N connue au sein de notre population.

CONCLUSION: La nouvelle mutation à trame décalée repérée dans l’exon 19, D570fs, avec l’insertion d’un résidu d’adénine dans le codon 570 codant pour l’Asp, provoque un codon de terminaison prématuré qui produit une protéine tronquée, sans liaison à la myosine et à la titine, ce qui explique le rôle de voie de désintégration à médiation de terminaison. Un nouveau PNS repéré dans le codon 1093 de l’exon 31 était un codon synonyme, qui pourrait avoir un effet régulateur au niveau traductionnel causé par les différences d’affinité entre interactions codon-anticodon. Le dépistage de ce gène peut être pertinent en Inde.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Adult
  • Cardiomyopathy, Hypertrophic, Familial / genetics*
  • Carrier Proteins / genetics*
  • Case-Control Studies
  • Child
  • Codon, Nonsense
  • Exons
  • Female
  • Frameshift Mutation
  • Genetic Testing
  • Humans
  • India
  • Male
  • Middle Aged
  • Pedigree
  • Polymorphism, Single Nucleotide

Substances

  • Carrier Proteins
  • Codon, Nonsense
  • myosin-binding protein C