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Join view for chr X (reference)
acc1 clone1 clone1 status clone1 center acc2 clone2 clone2 status clone2 center align len perc. id gaps join status comments
BX649234.1 RP24-281J6 fin SC BX322590.10 RP23-14B5 fin SC 2000 100 0 green  
BX322590.10 RP23-14B5 fin SC CU468274.10 RP23-197C11 fin SC 2000 100 0 green  
CT868691.5 RP23-22L6 fin SC CR936417.6 RP23-365N15 fin SC 2000 100 0 green  
CT025758.11 RP23-385I6 fin SC AC125200.4 RP23-261P9 fin WUGSC 0 0 0 red more than one overlap present
AC125200.4 RP23-261P9 fin WUGSC CT868693.9 RP23-293H11 fin SC 2000 100 0 green  
CT868693.9 RP23-293H11 fin SC CU914482.3 RP23-333J17 pre SC 24458 100 5 white alignment exists; one or more unfinished sequences; contained sequence
CU914482.3 RP23-333J17 pre SC CT868692.7 RP23-243G7 fin SC 0 0 0 white one or more unfinished sequences; no overlap present
CU633443.2 RP23-462H19 fin SC BX901965.5 RP23-152A17 fin SC 2000 100 0 green  
BX901965.5 RP23-152A17 fin SC BX546505.9 RP23-220E8 fin SC 2000 100 0 green  
BX546505.9 RP23-220E8 fin SC BX465847.15 RP23-102L14 fin SC 2000 100 0 green  
BX465847.15 RP23-102L14 fin SC BX571834.6 RP24-573J17 fin SC 2000 100 0 green  
BX571834.6 RP24-573J17 fin SC BX324122.17 RP23-317B9 fin SC 2000 100 0 green  
BX324122.17 RP23-317B9 fin SC BX548065.6 RP23-163B21 fin SC 2000 100 0 green  
BX548065.6 RP23-163B21 fin SC BX465866.13 RP23-128L16 fin SC 2000 100 0 green  
BX465866.13 RP23-128L16 fin SC BX649475.8 RP23-161F5 fin SC 2000 100 0 green  
BX649475.8 RP23-161F5 fin SC AC125035.3 RP23-328F24 fin WUGSC 2000 100 0 green  
AC125035.3 RP23-328F24 fin WUGSC BX511313.20 RP24-391O14 fin SC 1821 100 0 yellow alignment length < 2000
BX511313.20 RP24-391O14 fin SC AL671501.8 RP23-313P3 fin SC 2000 100 0 green  
AL671501.8 RP23-313P3 fin SC CR524824.5 WI1-1975M18 fin SC 2000 100 0 green  
CR524824.5 WI1-1975M18 fin SC CR954966.2 WI1-2342H11 fin SC 2000 100 0 green  
CR954966.2 WI1-2342H11 fin SC CR955033.1 WI1-1965B19 fin SC 2000 100 0 green  
AL671962.5 RP23-163A2 fin SC AL808124.12 RP23-146I4 fin SC 2000 100 0 green  
AL808124.12 RP23-146I4 fin SC AL954858.10 RP23-257H8 fin SC 2000 100 0 green  
AL954858.10 RP23-257H8 fin SC AL663104.17 RP23-207H18 fin SC 2000 100 0 green  
AL663104.17 RP23-207H18 fin SC AL731793.18 RP23-135F22 fin SC 2000 100 0 green  
AL731793.18 RP23-135F22 fin SC AL672231.7 RP23-54C14 fin SC 2000 100 0 green  
AL672231.7 RP23-54C14 fin SC AL671995.4 RP23-109E24 fin SC 2000 100 0 green  
AL671995.4 RP23-109E24 fin SC AL671978.2 RP23-443E19 fin SC 2000 100 0 green  
AL671978.2 RP23-443E19 fin SC AL670169.9 RP23-198C2 fin SC 2000 100 0 green  
AL670169.9 RP23-198C2 fin SC AL663032.9 RP23-27I6 fin SC 1995 100 1 yellow alignment length < 2000
AL663032.9 RP23-27I6 fin SC AL805902.5 RP23-224M4 fin SC 2000 99.950 0 green  
AL805902.5 RP23-224M4 fin SC AL662917.12 RP23-194N7 fin SC 2000 100 0 green  
AL662917.12 RP23-194N7 fin SC BX890632.7 RP23-93E11 fin SC 2000 100 0 green  
BX890632.7 RP23-93E11 fin SC BX890578.6 RP23-72P20 fin SC 2000 100 0 green  
BX890578.6 RP23-72P20 fin SC AL844482.6 RP23-81A18 fin SC 2000 100 0 green  
AL844482.6 RP23-81A18 fin SC BX000455.7 RP24-66J3 fin SC 2000 100 0 green  
BX000455.7 RP24-66J3 fin SC AL731692.8 RP23-245M18 fin SC 2000 100 0 green  
AL731692.8 RP23-245M18 fin SC AL806531.12 RP23-188K22 fin SC 2000 100 0 green  
AL806531.12 RP23-188K22 fin SC AL731832.13 RP23-180N10 fin SC 2000 100 0 green  
AL731832.13 RP23-180N10 fin SC AL672060.9 RP23-423L11 fin SC 2000 100 0 green  
AL672060.9 RP23-423L11 fin SC AL671864.6 RP23-243O4 fin SC 2000 100 0 green  
AL671864.6 RP23-243O4 fin SC AL671118.30 RP23-256J17 fin SC 2000 100 0 green  
AL671118.30 RP23-256J17 fin SC AL672144.8 RP23-40H13 fin SC 2000 100 0 green  
AL672144.8 RP23-40H13 fin SC AL672031.10 RP23-433D6 fin SC 2000 100 0 green  
AL672031.10 RP23-433D6 fin SC BX547929.3 RP24-186K6 fin SC 2000 100 0 green  
BX547929.3 RP24-186K6 fin SC BX005236.16 RP23-254A23 fin SC 2000 100 0 green  
BX005236.16 RP23-254A23 fin SC AL671042.10 RP23-382O24 fin SC 1990 100 0 yellow alignment length < 2000
AL671042.10 RP23-382O24 fin SC AL670360.8 RP23-3A4 fin SC 2000 100 0 green  
AL670360.8 RP23-3A4 fin SC AL845272.2 RP23-169D18 fin SC 2000 100 0 green  
AL845272.2 RP23-169D18 fin SC BX001027.8 RP23-265I10 fin SC 2000 100 0 green  
BX001027.8 RP23-265I10 fin SC AL671335.12 RP23-130J1 fin SC 2000 100 0 green  
AL671335.12 RP23-130J1 fin SC AL671185.8 RP23-192N1 fin SC 2000 100 0 green  
AL671185.8 RP23-192N1 fin SC AL671275.11 RP23-344J21 fin SC 2000 100 0 green  
AL671275.11 RP23-344J21 fin SC BX571767.3 RP23-156F8 fin SC 2000 100 0 green  
BX571767.3 RP23-156F8 fin SC BX294183.17 RP24-388B10 fin SC 2000 100 0 green  
BX294183.17 RP24-388B10 fin SC BX571734.7 RP23-334P23 fin SC 2000 100 0 green  
BX571734.7 RP23-334P23 fin SC AL845431.7 RP23-263K14 fin SC 2000 100 0 green  
AL845431.7 RP23-263K14 fin SC AL669975.9 RP23-218H24 fin SC 2000 100 0 green  
AL669975.9 RP23-218H24 fin SC AL671492.12 RP23-286H11 fin SC 2000 100 0 green  
AL671492.12 RP23-286H11 fin SC AL808012.13 RP23-451N14 fin SC 2000 100 0 green  
AL808012.13 RP23-451N14 fin SC AL683852.17 RP23-72B15 fin SC 2000 100 0 green  
AL683852.17 RP23-72B15 fin SC AL672055.8 RP23-339K2 fin SC 2000 100 0 green  
AL672055.8 RP23-339K2 fin SC BX000537.11 RP24-392J24 fin SC 2000 100 0 green  
BX000537.11 RP24-392J24 fin SC AL662925.12 RP23-226M12 fin SC 2000 100 0 green  
AL662925.12 RP23-226M12 fin SC AL808107.19 RP23-354L12 fin SC 2000 100 0 green  
AL808107.19 RP23-354L12 fin SC AL669967.12 RP23-216M21 fin SC 2000 100 0 green  
AL669967.12 RP23-216M21 fin SC AL833805.11 RP23-158L19 fin SC 2000 100 0 green  
AL833805.11 RP23-158L19 fin SC AL671988.15 RP23-165J1 fin SC 6 N/A 0 black initial certificate; no overlap present
AL671988.15 RP23-165J1 fin SC AL671117.6 RP23-278L4 fin SC 2000 100 0 green  
AL671117.6 RP23-278L4 fin SC AL672204.7 RP23-325N6 fin SC 2000 100 0 green  
AL672204.7 RP23-325N6 fin SC BX005215.13 RP23-280F9 fin SC 2000 100 0 green  
BX005215.13 RP23-280F9 fin SC AL844904.4 RP23-315J3 fin SC 2000 100 0 green  
AL844904.4 RP23-315J3 fin SC AL833795.7 RP23-81B16 fin SC 2000 100 0 green  
AL833795.7 RP23-81B16 fin SC AL731833.7 RP23-72P19 fin SC 2000 100 0 green  
AL731833.7 RP23-72P19 fin SC AL672170.11 RP23-435C17 fin SC 2000 100 0 green  
AL672170.11 RP23-435C17 fin SC AL670670.7 RP23-234O7 fin SC 2000 100 0 green  
AL670670.7 RP23-234O7 fin SC AL671919.9 RP23-400A17 fin SC 2000 100 0 green  
AL671919.9 RP23-400A17 fin SC AL808113.7 RP23-464N8 fin SC 2000 100 0 green  
AL808113.7 RP23-464N8 fin SC BX000428.10 RP23-474G7 fin SC 2000 100 0 green  
BX000428.10 RP23-474G7 fin SC AL669973.10 RP23-256C17 fin SC 2000 100 0 green  
AL669973.10 RP23-256C17 fin SC AL669848.12 RP23-209F17 fin SC 2000 100 0 green  
AL669848.12 RP23-209F17 fin SC AL845268.2 RP23-69A6 fin SC 2000 100 0 green  
AL845268.2 RP23-69A6 fin SC AL732400.9 RP23-92K6 fin SC 2000 100 0 green  
AL732400.9 RP23-92K6 fin SC AL845505.3 RP23-115D12 fin SC 2000 100 0 green  
AL845505.3 RP23-115D12 fin SC BX072553.7 RP23-66P7 fin SC 2000 100 0 green  
BX072553.7 RP23-66P7 fin SC AL672105.16 RP23-326D14 fin SC 2000 100 0 green  
AL672105.16 RP23-326D14 fin SC AL671875.12 RP23-296M12 fin SC 2000 100 0 green  
AL671875.12 RP23-296M12 fin SC BX284676.8 RP23-258L18 fin SC 2000 100 1 green simple sequence in gap
BX284676.8 RP23-258L18 fin SC AL805907.5 RP23-262M20 fin SC 2000 100 0 green  
AL805907.5 RP23-262M20 fin SC AL831729.6 RP23-68J21 fin SC 2000 100 0 green  
AL831729.6 RP23-68J21 fin SC AL732321.18 RP23-167N17 fin SC 2000 100 0 green  
AL732321.18 RP23-167N17 fin SC AL773583.9 RP23-384O2 fin SC 2000 100 0 green  
AL773583.9 RP23-384O2 fin SC AL807734.7 RP23-303N21 fin SC 2000 100 0 green  
AL807734.7 RP23-303N21 fin SC BX004977.8 RP23-278J5 fin SC 2000 100 0 green  
BX004977.8 RP23-278J5 fin SC BX005345.12 RP23-344C21 fin SC 2000 100 0 green  
BX005345.12 RP23-344C21 fin SC BX890633.3 RP23-391L13 fin SC 2000 100 0 green  
BX890633.3 RP23-391L13 fin SC AL844221.6 RP23-445C3 fin SC 2000 100 0 green  
AL844221.6 RP23-445C3 fin SC AL831724.7 RP23-405G17 fin SC 2000 100 0 green  
AL831724.7 RP23-405G17 fin SC AL824714.17 RP23-116G14 fin SC 2000 100 0 green  
AL824714.17 RP23-116G14 fin SC AL773547.6 RP23-243E14 fin SC 6 N/A 0 black initial certificate; no overlap present
AL773547.6 RP23-243E14 fin SC AL732451.8 RP23-85G19 fin SC 2000 100 0 green  
AL732451.8 RP23-85G19 fin SC BX004855.10 RP23-216P21 fin SC 2000 100 0 green  
BX004855.10 RP23-216P21 fin SC AL833782.13 RP23-83L24 fin SC 2000 100 0 green  
AL833782.13 RP23-83L24 fin SC AL732469.8 RP23-434B15 fin SC 2000 100 0 green  
AL732469.8 RP23-434B15 fin SC AL732368.12 RP23-417N12 fin SC 2000 100 0 green  
AL732368.12 RP23-417N12 fin SC AL831718.6 RP23-146O20 fin SC 2000 100 0 green  
AL831718.6 RP23-146O20 fin SC AL807375.14 RP23-247H23 fin SC 2000 100 0 green  
AL807375.14 RP23-247H23 fin SC AL845316.3 RP23-348I7 fin SC 2000 100 0 green  
AL845316.3 RP23-348I7 fin SC AL731679.9 RP23-33J13 fin SC 344 100 0 yellow alignment length < 2000
AL731679.9 RP23-33J13 fin SC AL806519.12 RP23-172A2 fin SC 2000 100 0 green  
AL806519.12 RP23-172A2 fin SC AL714007.10 RP23-295M3 fin SC 2000 100 0 green  
AL714007.10 RP23-295M3 fin SC AL807765.6 RP23-478J19 fin SC 2000 100 0 green  
AL807765.6 RP23-478J19 fin SC AL663098.8 RP23-24L23 fin SC 2000 100 0 green  
AL663098.8 RP23-24L23 fin SC BX545916.4 RP23-227O4 fin SC 2000 100 0 green  
BX545916.4 RP23-227O4 fin SC BX294384.19 RP24-230A23 fin SC 2000 100 0 green  
BX294384.19 RP24-230A23 fin SC AL672073.8 RP23-333P16 fin SC 2000 100 0 green  
AL672073.8 RP23-333P16 fin SC AL807240.12 RP23-394F6 fin SC 2000 100 0 green  
AL807240.12 RP23-394F6 fin SC AL671885.13 RP23-132C19 fin SC 2000 100 0 green  
AL671885.13 RP23-132C19 fin SC AL671853.7 RP23-275N2 fin SC 2000 100 0 green  
AL671853.7 RP23-275N2 fin SC AL671922.16 RP23-295K1 fin SC 2000 100 0 green  
AL671922.16 RP23-295K1 fin SC AL672268.18 RP23-171J18 fin SC 2000 100 0 green  
AL672268.18 RP23-171J18 fin SC AL929226.7 RP23-368N20 fin SC 2000 100 0 green  
AL929226.7 RP23-368N20 fin SC AL805967.7 RP23-450K9 fin SC 2000 100 0 green  
AL805967.7 RP23-450K9 fin SC AL807250.9 RP23-99K18 fin SC 2000 100 0 green  
AL807250.9 RP23-99K18 fin SC BX284930.5 RP23-166M2 fin SC 2000 100 0 green  
BX284930.5 RP23-166M2 fin SC AL671902.6 RP23-358K4 fin SC 2000 100 0 green  
AL671902.6 RP23-358K4 fin SC BX678769.5 RP23-435C20 fin SC 2000 100 0 green  
BX678769.5 RP23-435C20 fin SC BX679666.13 RP23-239G22 fin SC 2000 100 0 green  
BX679666.13 RP23-239G22 fin SC AL732295.24 RP23-77F19 fin SC 2000 100 0 green  
AL732295.24 RP23-77F19 fin SC BX548010.5 RP23-22P24 fin SC 2000 100 0 green  
BX548010.5 RP23-22P24 fin SC AL928570.14 RP23-183A10 fin SC 2000 100 0 green  
AL928570.14 RP23-183A10 fin SC BX284651.5 RP23-308C21 fin SC 2000 100 0 green  
BX284651.5 RP23-308C21 fin SC AL844487.3 RP23-162L23 fin SC 2000 100 0 green  
AL844487.3 RP23-162L23 fin SC AL953840.8 RP23-152F6 fin SC 2000 100 0 green  
AL953840.8 RP23-152F6 fin SC AL929382.9 RP23-136C24 fin SC 2000 100 0 green  
AL929382.9 RP23-136C24 fin SC AL773552.6 RP23-103H15 fin SC 2000 100 0 green  
AL773552.6 RP23-103H15 fin SC AL808116.6 RP23-97H1 fin SC 2000 100 0 green  
AL808116.6 RP23-97H1 fin SC BX547936.5 RP23-109A11 fin SC 2000 100 0 green  
BX547936.5 RP23-109A11 fin SC BX005191.10 RP23-433C8 fin SC 2000 100 0 green  
BX005191.10 RP23-433C8 fin SC AL807248.7 RP23-400M20 fin SC 2000 100 0 green  
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AL672247.8 RP23-95I19 fin SC AL669891.12 RP23-271F3 fin SC 2000 100 1 green simple sequence in gap
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AL672051.14 RP23-332O3 fin SC AL669895.9 RP23-31N7 fin SC 2000 100 0 green  
AL669895.9 RP23-31N7 fin SC AL831775.6 RP23-146M22 fin SC 6 N/A 0 black initial certificate; no overlap present
AL831775.6 RP23-146M22 fin SC AL731732.15 RP23-100F3 fin SC 2000 100 0 green  
AL731732.15 RP23-100F3 fin SC AL844483.5 RP23-245N10 fin SC 2000 100 0 green  
AL844483.5 RP23-245N10 fin SC AL671861.13 RP23-160B4 fin SC 2000 100 0 green  
AL671861.13 RP23-160B4 fin SC AL808016.23 RP23-443A2 fin SC 2000 100 0 green  
AL808016.23 RP23-443A2 fin SC AL731647.13 RP23-226L1 fin SC 2000 100 0 green  
AL731647.13 RP23-226L1 fin SC AL671896.4 RP23-354F16 fin SC 2000 100 0 green  
AL671896.4 RP23-354F16 fin SC AL670689.7 RP23-269N5 fin SC 2000 100 0 green  
AL670689.7 RP23-269N5 fin SC AL672188.6 RP23-53B2 fin SC 2000 100 0 green  
AL672188.6 RP23-53B2 fin SC AL805971.6 RP23-143H1 fin SC 2000 100 0 green  
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AL672249.6 RP23-92P11 fin SC AL807797.10 RP23-417D2 fin SC 2000 100 0 green  
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BX000527.12 RP23-67M6 fin SC AL807768.5 RP23-302D20 fin SC 2000 100 0 green  
AL807768.5 RP23-302D20 fin SC AL731839.13 RP23-76O22 fin SC 2000 100 0 green  
AL731839.13 RP23-76O22 fin SC AL670024.7 RP23-254F7 fin SC 2000 100 0 green  
AL670024.7 RP23-254F7 fin SC AL807738.8 RP23-300P23 fin SC 2000 100 0 green  
AL807738.8 RP23-300P23 fin SC AL672110.10 RP23-338D24 fin SC 2000 100 0 green  
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AL669974.6 RP23-229E11 fin SC AL672156.9 RP23-43L23 fin SC 2000 100 0 green  
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AL831757.5 RP23-279A21 fin SC AL731773.20 RP23-152G20 fin SC 2000 100 0 green  
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AL671976.6 RP23-320H14 fin SC AL928539.4 RP23-152D24 fin SC 2000 100 0 green  
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BX539327.3 RP23-145F2 fin SC AL805978.10 RP23-344I3 fin SC 2000 100 0 green  
AL805978.10 RP23-344I3 fin SC BX323445.4 RP23-468B9 fin SC 2000 100 0 green  
BX323445.4 RP23-468B9 fin SC AC055766.31 RP23-149C7 fin BCM 1999 100 0 yellow alignment length < 2000
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AL670882.5 RP23-286G19 fin SC BX000994.9 RP23-158A5 fin SC 2000 100 0 green  
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BX649615.6 RP23-273I8 fin SC BX572618.5 RP23-224A7 fin SC 2000 100 0 green  
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BX649617.4 RP23-344M13 fin SC BX005219.12 RP23-343B19 fin SC 2000 100 1 green simple sequence in gap
BX005219.12 RP23-343B19 fin SC AL808014.8 RP23-142A6 fin SC 2000 100 0 green  
AL808014.8 RP23-142A6 fin SC AL662932.10 RP23-15B7 fin SC 2000 100 0 green  
AL662932.10 RP23-15B7 fin SC BX005200.8 RP23-321L9 fin SC 2000 100 0 green  
BX005200.8 RP23-321L9 fin SC AL807780.7 RP23-456P12 fin SC 2000 100 0 green  
AL807780.7 RP23-456P12 fin SC AL671981.12 RP23-358P8 fin SC 2000 100 0 green  
AL671981.12 RP23-358P8 fin SC AL671630.10 RP23-327E13 fin SC 2000 100 0 green  
AL671630.10 RP23-327E13 fin SC BX004809.15 RP23-284G7 fin SC 2000 100 0 green  
BX004809.15 RP23-284G7 fin SC BX936321.7 RP24-74M16 fin SC 2000 100 0 green  
BX936321.7 RP24-74M16 fin SC BX682540.5 RP23-383O14 fin SC 2000 100 0 green  
BX682540.5 RP23-383O14 fin SC BX927381.5 RP23-14I19 fin SC 2000 100 0 green  
BX927381.5 RP23-14I19 fin SC BX649624.8 RP23-263M8 fin SC 2000 100 0 green  
BX649624.8 RP23-263M8 fin SC CR751562.5 RP23-240H13 fin SC 2000 100 0 green  
CR751562.5 RP23-240H13 fin SC BX678770.5 RP23-430N5 fin SC 2000 100 0 green  
BX678770.5 RP23-430N5 fin SC BX664732.7 RP23-452F17 fin SC 2000 100 0 green  
BX664732.7 RP23-452F17 fin SC AL731774.11 RP23-61E13 fin SC 2000 100 0 green  
AL731774.11 RP23-61E13 fin SC AL672021.11 RP23-463M4 fin SC 2000 100 0 green  
AL672021.11 RP23-463M4 fin SC AL731791.16 RP23-199A12 fin SC 2000 100 0 green  
AL731791.16 RP23-199A12 fin SC BX679667.8 RP24-424A15 fin SC 2000 100 0 green  
BX679667.8 RP24-424A15 fin SC BX571759.9 RP23-256J1 fin SC 2000 100 0 green  
BX571759.9 RP23-256J1 fin SC BX890554.6 RP23-291C10 fin SC 2000 100 0 green  
BX890554.6 RP23-291C10 fin SC BX664734.28 RP23-140E23 fin SC 2000 100 0 green  
BX664734.28 RP23-140E23 fin SC CT573011.11 RP23-330P11 fin SC 2000 100 0 green  
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