NC_001944 AY450442 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCCAGTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||*||||||||||||||||||**|||||||||||||||||||**||* 43 GGTGCCGAGGTGCCCGCCCCTAGGC-GGAGTAAATGGCGCCGTTATACGG 91 101 C-CGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 |*|**|||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||| 92 CGCCGTAATCTCCGGAGGATCACACTCGCCCGGGAACCATGCCGTCCAAG 141 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 |||||||||||*|||||||||||||||||*||*||||||||||||||||| 142 GAGGGCTCTGGTTGTCGCCGTTGGTGTTTTACCCTTAACAACCCTACAGA 191 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 192 CGGCGAGATCGAATTCGTCCGTTCTCTGGGGCCTGACGAATTCTACTATG 241 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 ||||||||||||||||||||||*||||||||*||*|||||**|||||||| 242 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCACCTGCAAGGC 291 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 292 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGTGCGCTTAAGAAAATGCT 341 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 ||||||||**||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||| 342 GCCGCGAGCGCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGATGCGGATAATGAGA 391 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 |||*|||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 392 AGTGTTGCAGTAAAGAGGGGGACGTTATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 441 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||| 442 AGAGACGGTCACCGCGCGTTCGACGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 491 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 492 ACGTAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 541 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||*||| 542 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTTTCGCTATTGGTCGGTTCCCGCCCACGT 591 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 ||*||*|||||*|||||*||||||||*||*||*||*|||||||||||||| 592 GACTTCAAGACAGAGGTCGACGTCATCTATGGACCGCCGGGGTGTGGCAA 641 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||*||||||||||||||||||||||||**||||||||||||||||||| 642 GAGTAGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGAGTAAATATTATAAAATGCGCG 691 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|*|||||| 692 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGAAGTCGTCATCATTGACGAC 741 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 |||||||||||||||||*||||||||||*||||||||||||||||||||| 742 TTTTATGGGTGGCTACCCTATTGCGAGACGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 791 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 792 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 841 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 |||||||||||||||||||||||*||||*|||||*||||||||||||||| 842 GGATCATTATCACGAGCAATAAGCCCCCCGAGACTTGGTACAAGGAGGAC 891 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||* 892 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACCCGTGTATGGTGGTACAC 941 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 ***||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 942 ---TGACAAGTTGGAACAAGTCCGGTCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 988 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAAGTTAGG-CGTCGGGCCGAA 1048 |||*|||||*||||||||||||*||||*|||*|**||*||||*||||||| 989 ATTATTGATCGTCTCGGTGATGATTAAAAAAATCCGGGCGTCAGGCCGAA 1038 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 ||||*||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||||||||||| 1039 GGCCTGATGCCGCAGGGCGGGACGCCCTGCCGGAGGGGTCGCAGGGCCGT 1088 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGGGG 1148 |||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||||*||||||||| 1089 CAGGCCCGAGAGCCCGACCAGCCCGGAGGGCCTCGTCTGTGTCGGGGGGG 1138 1149 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGGC 1197 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||*||||||| 1139 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACCAACACGGTCAGCGCCGAAGGC 1188 1198 GCCAATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGTAC 1247 ||||||||||||||*|||||||||||||*|*||||||||||||||||||| 1189 GCCAATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCAGTTTGAGTCTTTATTAAGTAC 1238 1248 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTG 1297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||||*| 1239 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATACAAAGTGAGCTGG 1288 1298 GTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATGCC 1347 **|||||||||||||*||***||||||||||||||||||||**|||*||| 1289 CATACATAAGTGATCTTTACGTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAAGCAAGGCC 1338 1348 GTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1397 |||||||*|||||||||*||||||*||||*|||||||||||||||||||| 1339 GTAGTGCTTGACTTTCGTTCCTGCCGCGTCGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1388 1398 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCT 1447 |||||||||||||*||||||||||||||||||||**||||||||||||** 1389 TCCAGCCGGTTCTTGCGCTGTTTAGCCACAATGCCACAGACTGGTTCGTA 1438 1448 GTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGTTT 1497 |*||**|||||*|*|||*||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1439 GCGGCCAGGTCTTCTATTGTTATTTGTGGTTTCGGTCTGAGGAGGCGTTT 1488 1498 GAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTG 1547 ||||||||||**|||||||||*|||*|*|||||||||||||||||||||| 1489 GAATCCCCTGGCAACATACCACTTTTTCGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTG 1538 1548 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCT 1597 |*|||||**||||||||******||||||||||||*||||*|||||*||| 1539 GATCTTGATTTTGGTCTTTTTTTGTTTTAAATTTAGTTATTCTGGAATCT 1588 1598 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCC 1647 ||||||||||||||||||||||||||*|||*|****||*||||||||*|| 1589 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCTTCTGCACTAATTGTGTAGTGGCC 1638 1648 CCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTCGA 1697 |*||||||||||*|*|||||||||*|||||||||||*|||||||*||||| 1639 CGATGTGGGCCTAAGTTCCATTTTGGCTAACTTAATGCGGTAGTCTTCGA 1688 1698 AATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATGCA 1747 ||||||||||*||||||||||||||||||**||*|||||||||||||*|| 1689 AATTCAGTGTATGTGGGTTTGGTGTGTTTTCTAGGAAGTCTGACAATACA 1738 1748 AAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTTTG 1797 |||||||***||||*||**|**||||*|*||||||||*|||||||||||| 1739 AAGGTTATGTAGTCAGAATTCCAAATGATGTTGCCAGGACTGGTGGTTTG 1788 1798 TTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCC 1847 |||||||||*|*||||||||||||||||*|||*|||||*||||||||**| 1789 TTTTTGAATGTCGAATTTGAATTGGCGTTTGAATCTGATAGTGTAAATTC 1838 1848 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTAT 1897 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||||| 1839 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTATCTACGTCGCCGGTGGTAT 1888 1898 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACC---GTCGTCT 1944 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|***||||||| 1889 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATATCTACGTCGTCT 1938 1945 AACCTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCAT-AGGCGGCGG 1993 ||*|||||||*|||||||||||*||||||||||||||||**||||||||| 1939 AATCTGAAATTTAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCAGCAGGCGGCGG 1988 -------- ******** 1989 TTAGTATT 1996