NC_001944 AY450440 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCCAGTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||********||*|||||||||*|||||||||||||||||||**||* 43 GGTGCCCCAACCGCCTCCCCTAGGGCGGAGTAAATGGCGCCGTTATACGG 92 101 ---CCGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCA 147 ***||||||||||||||||||||*||||||*||*||||||||*||||||| 93 GCGCCGTTAATCTCCGGAGGATCGCACTCGGCCCGGAACCATGCCGTCCA 142 148 AGGAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACA 197 |||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||*|||* 143 AGGAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTTACCCTTAACAACCTTACG 192 198 GACGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTA 247 ||||||||*||||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||| 193 GACGGCGAGATCGAATTCGTCCGTTCTCTGGGGCTTGACGAATTCTACTA 242 248 TGCCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAG 297 ||||||||||||||||||||||||*||||||||*||*||||||*|||||| 243 TGCCATCGTTGGACGGGAAAAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCATCTGCAAG 292 298 GCTACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATG 347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 293 GCTACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATG 342 348 CTGCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGA 397 ||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|| 343 CTGCCGCGAGCTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGATGCGGATAATGA 392 398 GAAGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGG 447 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 393 GAAGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTTATACTTACCCTGGGCATTGTGG 442 448 CGAGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCC 497 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 443 CGAGAGACGGTCACCGCGCTTTCGACGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCC 492 498 GGACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAG 547 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 493 GGACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAG 542 548 GCATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGC 597 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*| 543 GCATGGGCGGGGCTTGCATAGTCTCTCGCTATTGGTGGGTTCCCGCCCAC 592 598 GTGATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGC 647 ||||*||*||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||| 593 GTGACTTCAAGACTGAGGTTGACGTCATCTACGGACCACCGGGGTGTGGC 642 648 AAGAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCG 697 |||||**|||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||| 643 AAGAGCAGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACTAAATTTTATAAAATGCG 692 698 CGGTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACG 747 |||*||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||| 693 CGGGGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAGGAAGTCGTCATCTTGGACG 742 748 ACTTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGT 797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 743 ACTTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGGCTCTGCGACCGT 792 798 TACCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAA 847 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 793 TACCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACAAGCAA 842 848 GAGGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGG 897 |||||||||||||||||||||||||*||||*|****|||||||||||||| 843 GAGGATCATTATCACGAGCAATAAGCCCCCCGCAGACTGGTACAAGGAGG 892 898 ACTGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTAC 947 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||** 893 ACTGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACCCGTGTATGGTGGTGG 942 948 AACATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCAT 997 *||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 943 GACATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGTCTGATTTCCTCGCCCACCCCAT 992 998 CAATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAA-GTTAGGCGTCGGGCCG 1046 |||||*|||||*||||||||||||*||||*|||*|***||||||*||||| 993 CAATTATTGATCGTCTCGGTGATGATTAAAAAAAGCCGGGCGTCAGGCCG 1042 1047 AAGGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCC 1096 ||||||*||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||||||||| 1043 AAGGCCTGATGCCGCAGGGCGGGACGCCCTGCCGGAGGGGTCGCAGGGCC 1092 1097 GTCAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGG 1146 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||||*||||||| 1093 GTCAGGCCCGAGACCCCGACCAGCCCGGAGGGCCTCGTCTGTGTCGGGGG 1142 1147 GGGGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAG 1195 |||||||||||||*||||||||||||||||*||||||||*||||*||||| 1143 GGGGGCCCCGGGGAGTCCCCCCGACACGACCAACACGGTCAGCGCCGAAG 1192 1196 GCGCCAATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGT 1245 ||||||||||||||||*|||||||||||||*|*||||||||||||||||| 1193 GCGCCAATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCAGTTTGAGTCTTTATTAAGT 1242 1246 ACTGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCT 1295 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||| 1243 ACTGGGATTGTTGGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATACAGAGTGAGCT 1292 1296 TGGTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATG 1345 *|**||||||||||||*||***|||||||||||||||||||||**|||*| 1293 CGCATACATAAGTGATTGTCACTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAATGCAAGG 1342 1346 CCGTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGG 1395 |||||||||*||||*|||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 1343 CCGTAGTGCTTGACGTTCGCTCCTGCCGCATTGGGTCCTCCTTGTAGTGG 1392 1396 GATCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCG 1445 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1393 GATCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCCGCAGACTGGTTCG 1442 1446 CTGTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGT 1495 |*|||||*|||||*|*|||*||||||||*|||||*|||||||||||*||| 1443 CAGTGGTCAGGTCATCTATAGTTATTTGAGGTTTCGGTCTGAGGAGGCGT 1492 1496 TTGAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAG 1545 ||||||||||||**|||||||||*|||*|*|||||||||||||**||||* 1493 TTGAATCCCCTGGCAACATACCACTTTTTTGCACCGTCGAAAGAAGCCAC 1542 1546 TGGGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGT 1595 |||||||||*||||||||||*|**|||*|||||||||**|||*|||||*| 1543 TGGGTCTTGAGTTTGGTCTGAAGTAGTCTTAAATTTAGCTATTCTGGAAT 1592 1596 CTTGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGT 1645 |||||||||*||||||||||||||||||||||*|****||*||||||||* 1593 CTTGGATTATGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTGCACTAATTGTGTAGTGG 1642 1646 CCCCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTC 1695 ||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||| 1643 CCCCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAATTTAATCCGGTAGTCTTC 1692 1696 GAAATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATG 1745 ||||||*|||||*|||||||||||*|***|||*||*|||||||||||||| 1693 GAAATTTAGTGTATGTGGGTTTGGCGCTGTTGCTAGGAAGTCTGACAATG 1742 1746 CAAAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTT 1795 |||||||||***||||*||**|**||||*|**|*|||||||||||||||| 1743 CAAAGGTTATGTAGTCAGAATTCCAAATCACTTGGCCAGTACTGGTGGTT 1792 1796 TGTTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAAC 1845 ||*|||*||||*|*||||||||||||||||*|||*|||||*||||||||* 1793 TGCTTTCGAATGTCGAATTTGAATTGGCGTTTGAATCTGATAGTGTAAAT 1842 1846 CCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGT 1895 *|||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||**||||||| 1843 TCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTATCTACGTCTTCGGCGGT 1892 1896 ATCGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACC---GTCGT 1942 ||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||*|***||||| 1893 ATCGCCTGTTGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGTATATCTACGTCGT 1942 1943 CTAACCTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCAT-AGGCGGC 1991 ||||*|||||||||||||||||||*||||||||||||||||**||||||| 1943 CTAATCTGAAATATAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCAGCAGGCGGC 1992 1992 GG-------- 1993 ||******** 1993 GGTTAGTATT 2002