NC_001944 AY450436 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACTGCAGCCATTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 ****|****|||||||||*|||||||||||*||*|||||||||||||||| 43 AGGCCCCCCGTGCCCGCCTCTAGGGAGGAGCAACTGGCGCCGTTAGGCGC 92 101 CCGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAGG 150 |***|||*|||||||||||||||||||*||||*|||*||*|||||||||| 93 CG--TAAGCTCCGGAGGATCACACTCGCCCGG-AACTATGCCGTCCAAGG 139 151 AGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGAC 200 |||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||| 140 AGGGCTCCGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACCGAC 189 201 GGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATGC 250 |||||*|||||||*|||||||*|||||*||*|||||||||||*||||||| 190 GGCGAGATCGAATACGTCCGTGCTCTCCGGTCTGACGAATTCCACTATGC 239 251 CATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGCT 300 ||||||||||||||||*||||*||||||||*||*|||||||||||||||| 240 CATCGTTGGACGGGAACAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCATTTGCAAGGCT 289 301 ACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCTG 350 ||*|*||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||*|* 290 ACCTCCATTTTAAAACTAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGTTT 339 351 CCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGAA 400 |||||||**||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||| 340 CCGCGAGCGCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGATGCGGATAATGAGAA 389 401 GTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCGA 450 ||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 390 GTATTGTAGTAAAGAGGGGGACGTGATACTTACCCTGGGCATTGTGGCGA 439 451 GAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGGA 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 440 GAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGGA 489 501 CCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGCA 550 |*||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 490 CGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCGGAGATCTACGTCAGGCA 539 551 TGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGTG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 540 TGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGTG 589 601 ATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAAG 650 ||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||| 590 ATTTCAAGACTGAGGTCGACGTCATTTACGGGCCTCCGGGGTGTGGCAAG 639 651 AGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCGG 700 |||**||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||| 640 AGTAAATGGGCCAATGAGCAGCCGGGGACTAAATATTATAAAATGCGCGG 689 701 TGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGACT 750 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 690 GGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATTTTGGACGACT 739 751 TTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTAC 800 |||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 740 TTTATGGGTGGTTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGTGACCGTTAC 789 801 CCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGAG 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 790 CCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACCAGCAAGAG 839 851 GATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGACT 900 |||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||| 840 GATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCCGAGACTTGGTACAAGGAGGACT 889 901 GTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAAC 950 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||| 890 GTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTTACTCGTGTATGGTGGTACAAC 939 951 ATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCAA 1000 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 940 ATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTTCTCGCCCACCCCATCAA 989 1001 TTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAAGTTAGGCGTCGGGCCGAAGG 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 990 TTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAAGTTAGGCGTCGGGCCGAAGG 1039 1051 CCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGTCA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1040 CCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGCTCGCAGGGCCGTCA 1089 1101 GGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGGGGGG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||**|||||||||| 1090 GGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGC-TAGTCTGTGCCGGGGGGGGG 1138 1151 GCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGTAGCGACGAAGGCGCC 1200 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1139 -CCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGTAGCGCCGAAGGCGCC 1187 1201 AATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGTACTGG 1250 |||||||||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1188 AATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCTGTTTGAGTCTTTATTAAGTACTGG 1237 1251 GATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTGGTT 1300 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1238 GATTGTTGGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTGGTT 1287 1301 ACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATGCCGTA 1350 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1288 ACATAAGTGATTGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGGCAATGCCGTA 1337 1351 GTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGATCC 1400 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1338 GTGCCTGACTTTTGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGATCC 1387 1401 AGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCTGTG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1388 AGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCTGTG 1437 1451 GTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGTTTGAA 1500 ||||||||||||||*|||||*||||||||*||*||||||||*|||||||| 1438 GTGAGGTCGTTTATTGTTATCTGTGGTTTCGGCCTGAGGAGGCGTTTGAA 1487 1501 TCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTGGGT 1550 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||||||||||||| 1488 TCCCCTGCTAACATACCATTTTTTGGCACCGTCGAAGGGTGCCAGTGGGT 1537 1551 CTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCTTGG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1538 CTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCTTGG 1587 1601 ATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCCCCA 1650 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1588 ATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCATCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCCCCA 1637 1651 TGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTCGAAAT 1700 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1638 TGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCCAACTTAATCCGGTAGTTTTCGAAAT 1687 1701 TCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATGCAAAG 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1688 TCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCCGACAATGCAAAG 1737 1751 GTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTTTGTTT 1800 ||||||||||||||**|||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1738 GTTACAAAGTCGGAATTAAAAATTAAGTTGCCAGTACTGGTGGTTTGTTT 1787 1801 TTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCCTAT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1788 TTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCCTAT 1837 1851 TGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTATCGC 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1838 TGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTATCGC 1887 1901 CTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACCGTCGTCTAACCTG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||*||||| 1888 CTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGTATATCGTCGTCTGACCTG 1937 1951 AAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCATAGGCGGCGG------- 1993 |*||||||||||||||*||||||||||||||||*|||||||||******* 1938 AGATATAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCACAGGCGGCGGTTAGTAT 1987 - * 1988 T 1988