NC_001944 AF080560 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**||| 43 TCTGCCGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGGCGTTATACGC 92 101 C-CGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 |*|**||||||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||||||| 93 CGCCGTAATCTCCGGAGGATCACACCCGCCCGGGAACCATGCCGTCCAAG 142 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 ||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 143 GAGGGCTCCGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACAGA 192 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 193 CGGCGAGATCGAATTCGTCCGTTCTCTGGGGCCTGACGAATTCTACTATG 242 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 |||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 243 CCATCGTTGGACGCGAAAAGGGTGAGCAAGGCACCCCCCATTTGCAAGGC 292 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 293 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAACTGCT 342 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 ||||||||**||||||||||||||||||||*|||||*||*|||||*|||| 343 GCCGCGAGCCCATTTTGAGCGCGCTAAAGGTAGCGATGCTGATAATGAGA 392 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 |||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||| 393 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTTATACTCACCCTGGGCATTGTGGCG 442 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||| 443 AGAGACGGTCACCGCGCGTTCGACGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 492 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||*|||| 493 ACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGAAGTCTACGTAAGGC 542 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 |||||||||||||*||||*||||||||||||||||||||||*||||*||| 543 ATGGGCGGGGCTTACATAACCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCAGCCCACGT 592 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 ||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 593 GACTTCAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 642 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||*|||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 643 GAGTAGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACTAAATATTATAAAATGCGCG 692 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||*||||||||||* 693 GTGAATGGTGGGATGGATATGACGGGGAAGATGTCGTCGTCTTGGACGAT 742 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 743 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 792 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 *|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||| 793 TCCACATAAAGTGCCAGTCAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACCAGCAAGA 842 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 ||||*||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||||||||| 843 GGATAATTATCACGAGCAATAAGCCCCCCGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 892 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 ||||||||*|||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 893 TGTGACCCTAAGCCACTGTTCCGGAGGTTCACACGTGTTTGGTGGTACAA 942 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 |*|*||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 943 CGTGGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGACTTCCTCGCCCACCCCATCA 992 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTA-ATAAAGTTAGGCGTCGGGCCGAA 1048 |||**||||||||||||||||||||**||||||*|||||||||||||||| 993 ATTACTGATAGTCTCGGTGATGTTTTCATAAAGCTAGGCGTCGGGCCGAA 1042 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1043 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGCTCGCAGGGCCGT 1092 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGGGG 1148 |||||||||*|**||||||||||||||||||*||*|||||*||||||||| 1093 CAGGCCCGAAAGACCGACCAGCCCGGAGGGCGTATTCTGTGTCGGGGGGG 1142 1149 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGGC 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||||||| 1143 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGTCAGCGCCGAAGGC 1192 1198 GCCAATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGTAC 1247 ||||||||||||||*|||||||||||||||**||||||||||||||||*| 1193 GCCAATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCTGTCTGAGTCTTTATTAAGTGC 1242 1248 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTG 1297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 1243 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATACAAAGTGAGCTTG 1292 1298 GTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATGCC 1347 ||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||**||||||| 1293 GTCACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGGGGGAAGCTGAATGCAATGCC 1342 1348 GTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1397 ||||||||*||||||||*|||*||||*||||||||||||||||||||||| 1343 GTAGTGCCGGACTTTCGTTCCCGCTGAGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1392 1398 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCT 1447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1393 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCCGCAGACTGGTTCGCT 1442 1448 GTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGTTT 1497 |||||*|||||*|*||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1443 GTGGTCAGGTCCTCTATCGTTATTTGTGGTTTGGGTCTGAGGAGGCGTTT 1492 1498 GAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTG 1547 ||||||||||||||||*|||||||**||||||||||||||||||||||*| 1493 GAATCCCCTGCTAACAAACCATTTCTTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGAG 1542 1548 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCT 1597 ||||||||||||||||||||**|||||||||||||*||||*||||||||| 1543 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAGTAGTTTTAAATTTAGTTATTCTGGAGTCT 1592 1598 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCC 1647 ||||||||||||||||||||||||||||*|**|||||*||||||*||||| 1593 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTTTGATTGTACGGTGTAATGTCC 1642 1648 CCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTCGA 1697 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||| 1643 CCCTGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATACGGTAGTCTTCGA 1692 1698 AATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATGCA 1747 |||||||||**|||||||||||***|**|**||*||||||***|||*||| 1693 AATTCAGTGCGTGTGGGTTTGGGACGGCTTGTAGGAAGTCGTCCAACGCA 1742 1748 AAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTTTG 1797 ||*||||***||||*|***||||||||||||||||***|||||||||||| 1743 AATGTTATGTAGTCAGCATTAAAAATTAGGTTGCCGACACTGGTGGTTTG 1792 1798 TTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCC 1847 |||||||||||*|||||*|||||||||||||||||*|||||||||*|||| 1793 TTTTTGAATTTTGAATTGGAATTGGCGTGTGAGTCGGAGAGTGTAGACCC 1842 1848 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTAT 1897 |||||||||*|||||||||*|||||||||||*||||||||||*||||||| 1843 TATTGGTTGTGAAACGGCGCCTGCGGAAGTGCCTACGTCGCCTGCGGTAT 1892 1898 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACCGTCGTCTAAC 1947 |||||||||||||||||||||||***||||||||||||*|*||||||||* 1893 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTA---TGGGCGGGCATATCTTCGTCTAAT 1939 1948 CTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCATAGGCGGCGG---- 1993 |||||||*|||||||||||*||||||||||||||||*|||||||||**** 1940 CTGAAATTTAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCACAGGCGGCGGTTAG 1989 ---- **** 1990 TATT 1993