NC_001944 AF311298 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**||| 43 TCTGCCGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGGCGTTATACGC 92 101 C-CGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 |*|**||||||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||||||| 93 CGCCGTAATCTCCGGAGGATCACACCCGCCCGGGAACCATGCCGTCCAAG 142 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 ||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 143 GAGGGCTCCGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACAGA 192 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*|||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 193 CGGCGAGATCGAATTCGTCCGTACTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 242 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 ||||||||||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||*|||| 243 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCATTTGCGAGGC 292 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 293 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCTCTTAAGAAAATGCT 342 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 ||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||*||||||||*|||| 343 GCCGCGAGCTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGTAGCGATGCGGATAATGAGA 392 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 ||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 393 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGATGTTATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 442 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 443 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGACGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 492 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 493 ACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 542 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 |||||||*||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*||| 543 ATGGGCGTGGCTTGCATAACCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCACGT 592 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 |||||*|||||*||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||| 593 GATTTCAAGACGGAGGTTGACGTCATCTACGGGCCCCCGGGGTGTGGCAA 642 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||**||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||| 643 GAGTAAATGGGCCAATGAGCAGCCGGGGACTAAATATTATAAAATGCGCG 692 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||||| 693 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATATCGTCATCCTGGACGAC 742 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 743 TTCTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 792 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||| 793 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCATTTGTGGAGTTTACCAGCAAGA 842 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 ||||*|||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 843 GGATAATTATTACGAGCAATAAGGCCCCCGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 892 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 ||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 893 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGGTTCACACGTGTTTGGTGGTACAA 942 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 |*|*||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 943 CGTGGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGACTTCCTCGCCCACCCCATCA 992 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTA-ATAAAGTTAGGCGTCGGGCCGAA 1048 |||**|||||||*||||||||||||**||||||*|||||||||||||||| 993 ATTACTGATAGTTTCGGTGATGTTTTCATAAAGGTAGGCGTCGGGCCGAA 1042 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 1043 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGCTTGCAGGGCCGT 1092 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGGGG 1148 |||||||||||**||||||||||||||||||*||||||||*||||||||| 1093 CAGGCCCGAGAGACCGACCAGCCCGGAGGGCGTAGTCTGTGTCGGGGGGG 1142 1149 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGGC 1197 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||||||| 1143 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGTCAGCGCCGAAGGC 1192 1198 GCCAATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGTAC 1247 ||||||||||||||*|||||||||||||||**||||||*||||||||||| 1193 GCCAATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCTGTCTGAGTCCTTATTAAGTAC 1242 1248 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTG 1297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 1243 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATACAAAGTGAGCTTG 1292 1298 GTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATGCC 1347 ||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||**||||||| 1293 GTCACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGGGGGAAGCTGAATGCAATGCC 1342 1348 GTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1397 ||||||||*||||||||||||*||||*||||||||||||||||||||||| 1343 GTAGTGCCGGACTTTCGCTCCCGCTGAGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1392 1398 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCT 1447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||| 1393 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCCGCAGACTGGTTTGCT 1442 1448 GTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGTTT 1497 |||||*|||||*|*||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1443 GTGGTCAGGTCCTCTATCGTTATTTGTGGTTTGGGTCTGAGGAGGCGTTT 1492 1498 GAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTG 1547 ||||||||||||||||*|||||||**|||||||||||||||||||*||*| 1493 GAATCCCCTGCTAACAAACCATTTCTTGGCACCGTCGAAAGGTGCTAGAG 1542 1548 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCT 1597 |||||||||||||||||||||*||||||||||*||*||||*||||||||| 1543 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAATAGTTTTAAATCTAGTTATTCTGGAGTCT 1592 1598 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCC 1647 ||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*||||||*||||| 1593 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTGATTGTACGGTGTAATGTCC 1642 1648 CCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTCGA 1697 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|*|||*| 1643 CCCTGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATTCGGTAATCTTCAA 1692 1698 AATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATGCA 1747 ||||*|||||*|||||||||||***|**|**||*||||||***|||*||| 1693 AATTGAGTGTGTGTGGGTTTGGGACGGCTTGTAGGAAGTCGTCCAACGCA 1742 1748 AAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTTTG 1797 |||||*|***||||*|***||||*||||||||||||**|||||||||||| 1743 AAGGTAATGTAGTCAGCATTAAAGATTAGGTTGCCAACACTGGTGGTTTG 1792 1798 TTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCC 1847 |||*|*|||||*|||||*|||||||||*|||||||||||||||||||**| 1793 TTTGTTAATTTTGAATTGGAATTGGCGCGTGAGTCTGAGAGTGTAAATTC 1842 1848 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTAT 1897 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1843 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGCCTACGTCGCCGGCGGTAT 1892 1898 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACCGTCGTCTAAC 1947 ||||||||||||||||*||||||***||||||||||||*|*||||||||* 1893 CGCCTGATGTGACGTCCGCGGTA---TGGGCGGGCATATCTTCGTCTAAT 1939 1948 CTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCATAGGCGGCGG---- 1993 |||||||*|||||||||||*||||||||||||||||*|||||||||**** 1940 CTGAAATGTAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCACAGGCGGCGGTTAG 1989 ---- **** 1990 TATT 1993