NC_001944 AF311297 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||**||| 43 TCTGCCGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGGCGTTATACGC 92 101 C-CGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 |*|**||||||||||||||||||||*||*|||||||||||*||||||||| 93 CGCCGTAATCTCCGGAGGATCACACCCGCCCGGGAACCATGCCGTCCAAG 142 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 ||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 143 GAGGGCTCCGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACAGA 192 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||||||| 193 CGGCGAGATCGAATTCGTCCGTTCTCTGGGGTCTGACGAATTCTACTATG 242 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 |||||||||||||*|||*||||*||||*||||||*||||||||||*|||| 243 CCATCGTTGGACGCGAAGAGGGCGAGCGAGGCACCCCCCATTTGCGAGGC 292 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 293 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 342 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 |||*||||*|||||||||||||||||*|||||||||**|||||||*|||| 343 GCCCCGAGCTCATTTTGAGCGCGCTAGAGGGAGCGATTCGGATAATGAGA 392 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 393 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTGATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 442 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 443 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGACGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 492 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||*||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 493 ACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCGGATATCTACGTCAGGC 542 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*||||||||*||| 543 ATGGGCGGGGCTTGCATAACCTCTCGCTATTGGTTGGATCCCGCCCACGT 592 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 |||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||| 593 GATTTCAAGACTGAGGTTGACGTCATCTACGGGCCACCCGGGTGTGGCAA 642 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||*|||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||| 643 GAGTAGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACTGAATATTATAAAATGCGCG 692 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 693 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 742 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 743 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 792 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 793 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACCAGCAAGA 842 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 ||||*||||||||||||||||||*||||*||||||||||*|||||||||| 843 GGATAATTATCACGAGCAATAAGCCCCCCGAGACCTGGTGCAAGGAGGAC 892 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 ||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 893 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGGTTCACACGTGTTTGGTGGTACAA 942 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 |*|*|||*||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 943 CGTGGACGAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGACTTCCTCGCCCACCCCATCA 992 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTA-ATAAAGTTAGGCGTCGGGCCGAA 1048 |||**||||||||||||||||||||**||||||*|||||||||||||||| 993 ATTACTGATAGTCTCGGTGATGTTTTCATAAAGCTAGGCGTCGGGCCGAA 1042 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*|||||||||||| 1043 GGCCCGATGCCGCAGGGGGG-ACCCCCTGCCGGAGGGCTCGCAGGGCCGT 1091 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTAGTCTGTATCGGGGGGG 1148 |||||||||*|*|||||||||||||||||||*||*|||||*||||||||| 1092 CAGGCCCGAAAGCCCGACCAGCCCGGAGGGCGTATTCTGTGTCGGGGGGG 1141 1149 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGGC 1197 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*||||*||||||| 1142 GGGCCCCGGGGGGTCCCCCCCACACGACGAACACGGTCAGCGCCGAAGGC 1191 1198 GCCAATAAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCTTGAGTCTTTATTAAGTAC 1247 ||||||||||||||*|||||||||||||||**|||||||||||||||||| 1192 GCCAATAAACACTCGAAAAGGTATTTGCTGTCTGAGTCTTTATTAAGTAC 1241 1248 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATATATAGTGAGCTTG 1297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 1242 TGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGAACATACAAAGTGAGCTTG 1291 1298 GTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGGGAAGCTGAAGCCAATGCC 1347 ||*||||||*|||||||||||*|||||||*|||||||||||**||||||| 1292 GTCACATAATTGATCGTTTGTCCTGGCTGGGGGAAGCTGAATGCAATGCC 1341 1348 GTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGGGTCCTCCTTGTAGTGGGA 1397 ||||||||*||||||||||||*||||*||||||||*|||||||||||||| 1342 GTAGTGCCGGACTTTCGCTCCCGCTGAGTTGGGTCTTCCTTGTAGTGGGA 1391 1398 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCTGCAGACTGGTTCGCT 1447 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1392 TCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAATGCCGCAGACTGGTTCGCT 1441 1448 GTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTTTGGTCTGAGGAGACGTTT 1497 |||||*|||||*|*||||||||||||||||||*|||||||||||*||||| 1442 GTGGTCAGGTCCTCTATCGTTATTTGTGGTTTGGGTCTGAGGAGGCGTTT 1491 1498 GAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGTG 1547 ||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||*| 1492 GAATCCCCTGCTAACAAACCATTTCCTGGCACCGTCGAAAGGTGCCAGAG 1541 1548 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAATTTACTTATCCTGGAGTCT 1597 ||||||||||||||||||||**||||||||||*||*||||*||||||||| 1542 GGTCTTGTGTTTGGTCTGCAGTAGTTTTAAATCTAGTTATTCTGGAGTCT 1591 1598 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCCTTGTATGGTGTAGTGTCC 1647 ||||||||||||||||||||||||||||||**|||||*||*|||*||||| 1592 TGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTGATTGTACGGCGTAATGTCC 1641 1648 CCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATCCGGTAGTTTTCGA 1697 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|*|||*| 1642 CCCTGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACTTAATTCGGTAATCTTCAA 1691 1698 AATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTTATGAAGTCTGACAATGCA 1747 ||||*||||**|||||||||||***|**|**|||||||||***|||*||| 1692 AATTGAGTGCGTGTGGGTTTGGGACGGCTTGTATGAAGTCCTCCAACGCA 1741 1748 AAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTTGCCAGTACTGGTGGTTTG 1797 |||||*|***||||*|***|||||||||||||||||**|||||||||||| 1742 AAGGTAATGTAGTCAGCATTAAAAATTAGGTTGCCAACACTGGTGGTTTG 1791 1798 TTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGAGTCTGAGAGTGTAAACCC 1847 |||*|*|||||*|||||*|||||||||*|||||||||||||||||||*|| 1792 TTTGTTAATTTTGAATTGGAATTGGCGCGTGAGTCTGAGAGTGTAAATCC 1841 1848 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGTCTACGTCGCCGGCGGTAT 1897 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1842 TATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGCCTACGTCGCCGGCGGTAT 1891 1898 CGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCGGGCATACCGTCGTCTAAC 1947 ||||||||||||||||*||||||***||||||||||||*|*||||||||* 1892 CGCCTGATGTGACGTCGGCGGTA---TGGGCGGGCATATCTTCGTCTAAT 1938 1948 CTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGGTGCCCCATAGGCGGCGG---- 1993 |||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||**** 1939 CTGAAATGTAGCGCATGCGCAGTTAGAGGTGCCCCATAGGCGGCGGTTAG 1988 ---- **** 1989 TATT 1992