NC_001944 AF311296 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********||||||||||||||||||||||||||||||***|*|||*||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAAACAGTGGATGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||******|*|********|||**||**|||*|||*||||*|*||** 43 GGTGCACCAAAGACTCGAAGAGGGGCAGATGAAAGGGCACCGTAATGCAG 92 101 CCGT-TAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 *||**|*|||*|*|||*|||*||**|****|||*||||||**|*|*|*|* 93 ACGCCTGATCACGGGAAGATGACGGTGACGCGGAAACCATGGCATACGAC 142 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 ||*||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 143 GATGGCTCTGGGTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACAGA 192 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*|||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||||| 193 CGGCGAGATCGAATACGTCCGTACTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 242 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 ||||||||||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||||||| 243 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCATTTGCAAGGC 292 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|||| 293 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGGCTGAGCGCGCTTAAGAAATTGCT 342 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 ||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||*||*|||| 343 GCCGCGAGCTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGATGCGGACAATGAGA 392 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 393 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTGATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 442 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||*||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||||||| 443 AGAGATGGTCACCGCGCTTTCGGCGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 492 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 493 ACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 542 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||| 543 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGCTCCCGCCCACGT 592 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 ||*||*|||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||||||| 593 GACTTCAAGACTGAGGTCGACGTCATCTACGGACCACCGGGGTGTGGCAA 642 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||*|||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||||||| 643 GAGTAGATGGGCCAATGAGCAGTCTGGGACTAAATATTATAAAATGCGCG 692 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 ||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||**|*||||*|||| 693 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAGGAAGTCGTTGTATTGGGCGAC 742 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 743 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGGCTCTGCGACCGTTA 792 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 793 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 842 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 ||||||||||*||||||||||||*||||*||||*|||||||||||||||| 843 GGATCATTATTACGAGCAATAAGCCCCCCGAGAGCTGGTACAAGGAGGAC 892 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|| 893 TGTGACCCGAAGCCACTCTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTATAA 942 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 **|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 943 TGTGGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 992 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAAGTTAGG-CGTCGGGCCGAA 1048 |||*|||||*|||||||||||**||||*|||*|**||*||||*||||||| 993 ATTATTGATCGTCTCGGTGATTATTAAAAAAATCCGGGCGTCAGGCCGAA 1042 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 ||||*||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||||||||||| 1043 GGCCTGATGCCGCAGGGCGGGACGCCCTGCCGGAGGGCTCGCAGGGCCGT 1092 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTA-GTCTGTATCGGGGGG 1147 |||||||||||*|||||||||||||||||||****||||||*|||||||| 1093 CAGGCCCGAGAGCCCGACCAGCCCGGAGGGCTACTGTCTGTGTCGGGGGG 1142 1148 GGGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGG 1196 ||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||*||||*|||||| 1143 GGGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACGCGACGAGCACGGTCAGCGCCGAAGG 1192 1197 CGCCAAT-----------------AAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCT 1229 |||||||*****************||||||||*|||*|||||||||||** 1193 CGCCAATGACCAATTGAAAACAATAAACACTCGAAACGGTATTTGCTGTC 1242 1230 TGAGTCTTTATTAAGTACTGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGA 1279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||| 1243 TGAGTCTTTATTAAGTACTGGGATTGTTAGGGGCAAATTGGCGGAACTGA 1292 1280 ACATATATAGTGAGCTTGGTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGG 1329 |||||*|*|||*||||*|**|||||||||||||*||**|||||||||||| 1293 ACATACAAAGTTAGCTCGCATACATAAGTGATCTTTACTTCTGGCTGAGG 1342 1330 GAAGCTGAAGCCAATGCCGTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGG 1379 ||||||||||*|||*||||||||||*||||||||||||||||*||||||| 1343 GAAGCTGAAGGCAAGGCCGTAGTGCTTGACTTTCGCTCCTGCCGCGTTGG 1392 1380 GTCCTCCTTGTAGTGGGATCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAAT 1429 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1393 GTCCTCCTTGTAGTGGGATCCAGCCGGTTCTGGCACTGTTTAGCCACAAT 1442 1430 GCTGCAGACTGGTTCGCTGTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTT 1479 ||*|||||||||||||**|*||**|||||||*|||*|||||||||||||| 1443 GCCGCAGACTGGTTCGAAGCGGCCAGGTCGTCTATTGTTATTTGTGGTTT 1492 1480 TGGTCTGAGGAGACGTTTGAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCAC 1529 *|||||||||||*|||||||||||||||||||*||||||||||*|||||| 1493 CGGTCTGAGGAGGCGTTTGAATCCCCTGCTAAGATACCATTTTTTGGCAC 1542 1530 CGTCGAAAGGTGCCAGTGGGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAAT 1579 ||||||||||||||||*||||||||**|||||||||||*||||||||||| 1543 CGTCGAAAGGTGCCAGGGGGTCTTGGTTTTGGTCTGCAGCAGTTTTAAAT 1592 1580 TTACTTATCCTGGAGTCTTGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCC 1629 |||*||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1593 TTAGTTATTCTGGAATCTTGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTGC 1642 1630 TTGTATGGTGTAGTGTCCCCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACT 1679 ****||*||||||||*|||||*||*|||||*||||||||||||||||||| 1643 ACTAATTGTGTAGTGGCCCCACGTTGGCCTTATTTCCATTTTAGCTAACT 1692 1680 TAATCCGGTAGTTTTCGAAATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTT 1729 ||||*|||||||*|||||||||||||||*||||||||*|||||**||**| 1693 TAATGCGGTAGTCTTCGAAATTCAGTGTATGTGGGTTCGGTGTCGTTTCT 1742 1730 ATGAAGTCTGACAATGCAAAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTT 1779 |*||||||||||||||*||||||||***||||*||**|**||||||**|* 1743 AGGAAGTCTGACAATGTAAAGGTTATGTAGTCAGAATTCCAAATTACTTG 1792 1780 GCCAGTACTGGTGGTTTGTTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGA 1829 |**||*||||||||||||||||*||||*|*||||||||||||||||*||| 1793 GTTAGGACTGGTGGTTTGTTTTAGAATATCGAATTTGAATTGGCGTTTGA 1842 1830 GTCTGAGAGTGTAAACCCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGT 1879 *||||||*|||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||| 1843 ATCTGAGTGTGTAAATTCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGT 1892 1880 CTACGTCGCCGGCGGTATCGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCG 1929 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1893 CTACGTCGCCGGCGGTATCGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGAATGGGCG 1942 1930 GGCATACCG---TCGTCTAACCTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGG 1976 ||||||*|****||||||||*|||||||*|||||||||||*|||||||*| 1943 GGCATATCTACCTCGTCTAATCTGAAATGTAGCGCATGCGCAGTTAGAAG 1992 1977 TGCCCCAT-AGGCGGCGG-------- 1993 |||||||**|||||||||******** 1993 TGCCCCAGCAGGCGGCGGTTAGTATT 2018