NC_001944 AF311295 1 TTAGTATTACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCGCAGCTATTGGCTGC 50 ********|||||||||||||||||||||||||||*||***|*|||*||| 1 --------ACCCGCCGCCTGGGGCACCGGGGCACCCCAAACAGTGGATGC 42 51 CTTGCGGAGGTGCCCGCCCCTAGGGAGGAGTAAATGGCGCCGTTAGGCGC 100 **|||*******||**|*|||||||*|||||||||||||||||||**||* 43 GGTGCCCCAACCCCTCCTCCTAGGGCGGAGTAAATGGCGCCGTTATACGG 92 101 C-CGTTAATCTCCGGAGGATCACACTCGTCCGGGAACCATCCCGTCCAAG 149 |*|**|*|||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||| 93 CGCCGTGATCTCCGGAGGATCACACTCGCCCGGGAACCATGCCGTCCAAG 142 150 GAGGGCTCTGGCTGTCGCCGTTGGTGTTTCACTCTTAACAACCCTACAGA 199 |||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 143 GAGGGCTCTGGTTGTCGCCGTTGGTGTTTCACCCTTAACAACCCTACAGA 192 200 CGGCGAAATCGAATTCGTCCGTTCTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 249 ||||||*|||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||||| 193 CGGCGAGATCGAATACGTCCGTACTCTCGGGCCTGACGAATTCTACTATG 242 250 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGTGAGCAAGGCACTCCCCATTTGCAAGGC 299 ||||||||||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||||||| 243 CCATCGTTGGACGGGAAAAGGGCGAGCAAGGTACCCCCCATTTGCAAGGC 292 300 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGACTGAGCGCGCTTAAGAAAATGCT 349 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|||| 293 TACTTTCATTTTAAAAATAAGAAGCGGCTGAGCGCGCTTAAGAAATTGCT 342 350 GCCGCGAGGTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGACGCGGATAACGAGA 399 ||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||*||*|||| 343 GCCGCGAGCTCATTTTGAGCGCGCTAAAGGGAGCGATGCGGACAATGAGA 392 400 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTCATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 449 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 393 AGTATTGCAGTAAAGAGGGGGACGTGATACTTACCCTGGGCATTGTGGCG 442 450 AGAGACGGTCACCGCGCTTTCGATGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 499 |||||*||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||||||| 443 AGAGATGGTCACCGCGCTTTCGGCGGAGCTGTTGCTGCCGTGATGTCCGG 492 500 ACCCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 549 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 493 ACGCAAAATGAAGGAAGTCGCGCGAGAGTTCCCAGATATCTACGTCAGGC 542 550 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGTTCCCGCCCGCGT 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||| 543 ATGGGCGGGGCTTGCATAGCCTCTCGCTATTGGTTGGCTCCCGCCCACGT 592 600 GATTTTAAGACTGAGGTTGACGTCATTTACGGGCCACCGGGGTGTGGCAA 649 ||*||*|||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||||||| 593 GACTTCAAGACTGAGGTCGACGTCATCTACGGACCACCGGGGTGTGGCAA 642 650 GAGTCGATGGGCCAATGAGCAGCCTGGGACCAAATATTATAAAATGCGCG 699 ||||*|||||||||||||||||*|||||||*||||||||||||||||||| 643 GAGTAGATGGGCCAATGAGCAGTCTGGGACTAAATATTATAAAATGCGCG 692 700 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAAGATGTCGTCATCTTGGACGAC 749 ||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||**|*||||*|||| 693 GTGAATGGTGGGATGGATATGATGGGGAGGAAGTCGTTGTATTGGGCGAC 742 750 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGCCTCTGCGACCGTTA 799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 743 TTTTATGGGTGGCTACCTTATTGCGAGATGCTCCGGCTCTGCGACCGTTA 792 800 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 793 CCCACATAAAGTGCCAGTTAAGGGCGCTTTTGTGGAGTTTACGAGCAAGA 842 850 GGATCATTATCACGAGCAATAAGGCCCCGGAGACCTGGTACAAGGAGGAC 899 ||||||||||*||||||||||||*||||*||||*|||||||||||||||| 843 GGATCATTATTACGAGCAATAAGCCCCCCGAGAGCTGGTACAAGGAGGAC 892 900 TGTGACCCGAAGCCACTGTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTACAA 949 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|| 893 TGTGACCCGAAGCCACTCTTCCGGAGATTCACTCGTGTTTGGTGGTATAA 942 950 CATTGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 999 **|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 943 TGTGGACAAGTTGGAACAAGTCCGGCCTGATTTCCTCGCCCACCCCATCA 992 1000 ATTTTTGATAGTCTCGGTGATGTTTAATAAAGTTAGG-CGTCGGGCCGAA 1048 |||*|||||*|||||||||||**||||*|||*|**||*||||*||||||| 993 ATTATTGATCGTCTCGGTGATTATTAAAAAAATCCGGGCGTCAGGCCGAA 1042 1049 GGCCCGATGCCGCAGGGGGGGACCCCCTGCCGGAGGGTTCGCAGGGCCGT 1098 ||||*||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||*|||||||| 1043 GGCCTGATGCCGCAGGGCGGGACGCCCTGCCGGAGGGCTCGGAGGGCCGT 1092 1099 CAGGCCCGAGAACCCGACCAGCCCGGAGGGCCTA-GTCTGTATCGGGGGG 1147 |||||||||||*|||||||||||||||||||****||||||*|||||||| 1093 CAGGCCCGAGAGCCCGACCAGCCCGGAGGGCTACTGTCTGTGTCGGGGGG 1142 1148 GGGGCCCCGGGGGGTCCCCCCGACACGACGAACACGGT-AGCGACGAAGG 1196 ||||||||*||||||||||||||||||||||*||||||*||||*|*|||| 1143 GGGGCCCCAGGGGGTCCCCCCGACACGACGAGCACGGTCAGCGCCAAAGG 1192 1197 CGCCAAT-----------------AAACACTCAAAAAGGTATTTGCTGCT 1229 |||||||*****************||||||||*|||*|||||||||||** 1193 CGCCAATGACCACTTGAAAACAATAAACACTCGAAACGGTATTTGCTGTC 1242 1230 TGAGTCTTTATTAAGTACTGGGATTGTTAGGGGCAAACTGACGGAATTGA 1279 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||| 1243 TGAGTCTTTATTAAGTACTGGGATTGTTAGGGGCAAATTGGCGGAACTGA 1292 1280 ACATATATAGTGAGCTTGGTTACATAAGTGATCGTTTGTTCTGGCTGAGG 1329 |||||*|*|||*||||*|**|||||||||||||*||**|||||||||||| 1293 ACATACAAAGTTAGCTCGCATACATAAGTGATCTTTACTTCTGGCTGAGG 1342 1330 GAAGCTGAAGCCAATGCCGTAGTGCCTGACTTTCGCTCCTGCTGCGTTGG 1379 ||||||||||*|||*||||||||||*||||||||||||||||*||||||| 1343 GAAGCTGAAGGCAAGGCCGTAGTGCTTGACTTTCGCTCCTGCCGCGTTGG 1392 1380 GTCCTCCTTGTAGTGGGATCCAGCCGGTTCTGGCGCTGTTTAGCCACAAT 1429 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1393 GTCCTCCTTGTAGTGGGATCCAGCCGGTTCTGGCACTGTTTAGCCACAAT 1442 1430 GCTGCAGACTGGTTCGCTGTGGTGAGGTCGTTTATCGTTATTTGTGGTTT 1479 ||*|||||||||||||**|||||*|||||*|*|||*|||||||||||||| 1443 GCCGCAGACTGGTTCGAAGTGGTCAGGTCTTCTATTGTTATTTGTGGTTT 1492 1480 TGGTCTGAGGAGACGTTTGAATCCCCTGCTAACATACCATTTTCTGGCAC 1529 *|||||||||||*|||||||||||||||||||*||||||||||*|||||| 1493 CGGTCTGAGGAGGCGTTTGAATCCCCTGCTAAGATACCATTTTTTGGCAC 1542 1530 CGTCGAAAGGTGCCAGTGGGTCTTGTGTTTGGTCTGCAACAGTTTTAAAT 1579 |||||||||||||||**||||||||**|||||||||||**|||||||||| 1543 CGTCGAAAGGTGCCACGGGGTCTTGGTTTTGGTCTGCAGTAGTTTTAAAT 1592 1580 TTACTTATCCTGGAGTCTTGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTCC 1629 |||*||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1593 TTAGTTATTCTGGAATCTTGGATTACGGCCGTGTGGCCGAATCCGTCTGC 1642 1630 TTGTATGGTGTAGTGTCCCCATGTGGGCCTCATTTCCATTTTAGCTAACT 1679 ****||*||||||||*|||||*||*|||||*|*||||||||||||||||| 1643 ACTAATTGTGTAGTGGCCCCACGTTGGCCTTAATTCCATTTTAGCTAACT 1692 1680 TAATCCGGTAGTTTTCGAAATTCAGTGTTTGTGGGTTTGGTGTGTTTGTT 1729 ||||*|||||||*|||||||||||||||*||||||||*|||||**||**| 1693 TAATGCGGTAGTCTTCGAAATTCAGTGTATGTGGGTTCGGTGTCGTTTCT 1742 1730 ATGAAGTCTGACAATGCAAAGGTTACAAAGTCGGAGCTAAAAATTAGGTT 1779 |*||||||||||||||*||||||||***||||*||**|**||||||**|* 1743 AGGAAGTCTGACAATGTAAAGGTTATGTAGTCAGAATTCCAAATTACTTG 1792 1780 GCCAGTACTGGTGGTTTGTTTTTGAATTTGGAATTTGAATTGGCGTGTGA 1829 |**||*||||||||||||||||*|||*||*||||||||||||||||*||| 1793 GTTAGGACTGGTGGTTTGTTTTAGAAGTTCGAATTTGAATTGGCGTTTGA 1842 1830 GTCTGAGAGTGTAAACCCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGT 1879 |||||||*|||||||**||||||||||||||||||||||||||||||||| 1843 GTCTGAGTGTGTAAATTCTATTGGTTGAGAAACGGCGTCTGCGGAAGTGT 1892 1880 CTACGTCGCCGGCGGTATCGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGTATGGGCG 1929 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1893 CTACGTCGCCGGCGGTATCGCCTGATGTGACGTCTGCGGTAGAATGGGCG 1942 1930 GGCATACC---GTCGTCTAACCTGAAATATAGCGCATGCGTAGTTAGAGG 1976 ||||||*|***|||||||||*|||||||*|||||||||||*||||||||| 1943 GGCATATCTACGTCGTCTAATCTGAAATGTAGCGCATGCGCAGTTAGAGG 1992 1977 TGCCCCAT-AGGCGGCGG-------- 1993 |||||||**|||||||||******** 1993 TGCCCCAGCAGGCGGCGGTTAGTATT 2018