NC_004581 AY742221 1 ACTGATGGCCGCGCGAAGTCCCGGTATGCCTTTTCAGCCGTTGGATCTGG 50 *|||||||||||||||||*||*|||*||||||||||||||||*|||*||| 1 -CTGATGGCCGCGCGAAGGCCTGGTGTGCCTTTTCAGCCGTTAGATTTGG 49 51 AGCCGTACCTTTTTCGCGTTCCCATTTTGCCCCTGGAGTCCCGAGCTATT 100 *||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 50 TGCCGTACCTTTT-CGCGTTCCCATCTTGCCCCTGGAGTCCCGAGCTATT 98 101 TACGACCCCCTGCCACCGAGTCCCCTTCGTGGAGCGCTCTTCGTCCAACA 150 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 99 TACGACCCCCTGCCACCGAGTCCCTTTCGTGGAGCGCTCTTCGTCCAACA 148 151 CGTGTCCCAACTTTTGCGCATTTTTGACTACCTGTCGCGCACTTGAATTA 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149 CGTGTCCCAACTTTTGCGCATTTTTGACTACCTGTCGCGCACTTGAATTA 198 201 AAGTTGCCCTTTTATTTTCTTCCAATTATTTTGCGGCTGAGTAGTCTAGA 250 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 199 AAGTTGCCCTTTTATTTCCTTCCAATTATTTTGCGGCTGAGTAGTCTAGA 248 251 TAATTGTGACAACTTAGTGAGCAAGTTGTAG-GAGGACCCTATCCGTCTG 299 |||||||||||||||||||*|||||||||*|*|||||||||||||||||| 249 TAATTGTGACAACTTAGTGGGCAAGTTGTTGTGAGGACCCTATCCGTCTG 298 300 GGAAAATAATTGGGTTTTCACGTGTACCAATGGGAAATAATATGTATAGC 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 299 GGAAAATAATTGGGTTTTCACGTGTACCAATGGGAAATAATATGTATAGC 348 350 CTATTTAATTTAGAAAATTAAATAGTTTTAGTAATTCCTATATAATAGCG 399 |||||||||||***|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 349 CTATTTAATTTTCTAAATTAAATAGTTTTAGTAATTCCTATATAATAGCG 398 400 TTTACTAGTCTGGGTAAAATTCGTATAGGAAAAAATATTTATTATTTTTT 449 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 399 TCTACTAGTCTGGGTAAAATTCGTATAGGAAAAAATATTTATTATTTTTT 448 450 AAATTTAACCTATTGAAAATGTACAGTTTAAAGAGTAGACGTGGATCGAA 499 ||*||||||||*|||||*|||||||||||*|||||||||||||||||*|| 449 AA-TTTAACCTGTTGAATATGTACAGTTTCAAGAGTAGACGTGGATCAAA 497 500 TTACATTCAAGCACGTGGAAACTCACGGACCCCATTATTCAAACGACATT 549 |||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||| 498 TTACATTCAAGCACGTGTAAACTCACGCACCCCATTATTCAAACGACATT 547 550 CCACTGGTAAGCGTTATGGAGGAAGACGACTACAGCCACTGAATGTGAAA 599 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 548 CCACTGGTAAGCGTTATGGAGGTAGACGACTACAGCCACTGAATGTGAAA 597 600 AGAGAAGATGAACCCAGAATGTCGACCCAACGCATCCACGAGAATCAATA 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 598 AGAGAAGATGAACCCAGAATGTCGACCCAACGCATACACGAGAATCAATA 647 650 TGGGTCGGAATTTACAATGGCCCACAACACAGCCATTTCGACCTATATCT 699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 648 TGGGTCGGAATTTACAATGGCCCACAACACAGCCATTTCGACCTATATCT 697 700 CCTATCCTAATCTGGGCAAGACTGAACCCAATCGAACCAGGTCGTACATC 749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 698 CCTATCCTAATCTGGGCAAGACTGAACCCAATCGAACCAGGTCGTACATC 747 750 AAGCTGAAACGATTGCGTTTCAAGGGCACGGTGAAGATCGAACGAGTTCC 799 |||*||||||||*|||||||||||||||||||*|||||*||||||||||| 748 AAGTTGAAACGACTGCGTTTCAAGGGCACGGTCAAGATTGAACGAGTTCC 797 800 TACTGACGTGGCTATGGATGGTTCGATTCCCAACACGGAAGGGGTGTTCT 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 798 TACTGACGTGGCTATGGATGGTTCGATTCCCAACACGGAGGGAGTGTTCT 847 850 CATTGGTCATAGTCGTTGACCGAAAACCTCATTTGACTGCATCTGGATGC 899 |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 848 CATTGATCATAGTCGTTGACCGAAAACCTCATTTGACTGCATCTGGTTGC 897 900 CTACATACGTTTGACGAACTATTTGGTGCGATAATCCACAGCCATGGAAC 949 ||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||| 898 CTACATACGTTTGATGAACTATTTGGTGCGATTATCCACAGCCATGGAAC 947 950 CCTGTCTATAGTTCCCGCGTTGAAGGATCGTTACTACATACGGCATGTAA 999 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 948 CCTGTCTATAGTTCCCGCGTTGAAGGATCGTTACTACATAAGGCATGTAA 997 1000 TTAAACGGGTACTGTCCGTCGAGAAAGATAACGTCATGGTGGATATTGAA 1049 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 998 CTAAACGGGTACTGTCCGTCGAGAAAGATAACGTCATGGTGGATATTGAA 1047 1050 GGATCCACTGCTCTGTCTAATAGGCGTTTTAATTGTTGGGCCAGTTTTAA 1099 |||||||*||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1048 GGATCCATTGCTCTCTCTAATAGGCGTTTTAATTGTTGGGCCAGTTTTAA 1097 1100 AGATCTTGATTTGGATTCATGTAAGGGTGTTTATGACAACATAAACAAGA 1149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1098 AGATCTTGATTTGGATTCATGTAAGGGTGTTTATGATAACATAAACAAGA 1147 1150 ATGCCCTGTTAGTTTATTACTCATGGGTATCGGATACTGTGTCTAAAGCA 1199 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1148 ATGCCCTGTTAGTATATTACTCATGGGTATCGGATACTGTGTCTAAAGCA 1197 1200 TCCACTTATGTATCGTATGACCTTGATTATATTGGATAATCAATAATAAC 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1198 TCCACTTATGTATCGTATGACCTTGATTATATTGGATAATCAATAATAAC 1247 1250 AGGAAAATTTGAATAAGAAAAAATATTATTTAAATATTTTTGGTTGAGGA 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1248 AGGAAAATTTGAATAAGAAAAAATATTATTTAAATATTTTTGGTTGAGGA 1297 1300 CCATTACAACTACTCTTGATACATTCTTGGACCGTTGTCCTAACCAGTTC 1349 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1298 GCATTACAACTACTCTTGATACATTCTTGGACCGTTGTCCTAACCAGTTC 1347 1350 GTTTAATTGGGCCATAGACATGGTAATGTTGGACTCAGCCCTATGGGCCC 1399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1348 GTTTAATTGGGCCATAGACATGGTAATGTTGGACTCAGCCCTATGTGCCC 1397 1400 CTACTATTGATGCCGAGTCACCTGGATCCAGTACAGTGGACCCTAACCTG 1449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1398 CTACTATTGATGCCGAGTCACCTGGATCCAGTACAGTGGACCCTAACCTG 1447 1450 TGCAGCTCTCTGTAAGGTGTCTGTTCGTTATTGGACTGTGAGTCCGCATC 1499 ||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||| 1448 TGCAACTCTCTGTAAGGTGTCTCTTCGTTATTGGACTGTGCGTCCGCATC 1497 1500 TTCGTTAACGGGCCCTATGGTACTCCTGGTCGCCCACGACTCCCCTGGCC 1549 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||| 1498 TTCGTTAACGGGCCCGATGGTACTCCTGGTCGCCCACGACTCCCCAGGCC 1547 1550 TTATTTCTATTGGGCCTGGAAGCCCAAATCTGTTCATGGATGCGGACCTA 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1548 TTATTTCTATTGGGCCTGGAAGCCCAAATCTGTTCATGGATGCGGACCTA 1597 1600 ATTAGTTTCCTTTCCCATTTACCATAGTCTACATGTGAGAAATCAACGTC 1649 ||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||| 1598 ATTAGTTTCCTTTCCCATTTACCATAATCTACGTGTGAGAAATCAACGTC 1647 1650 TTTAGCGGAGAACTGTTTGGAAAGGATCTTTACCGTTGGCGCCTTGAACG 1699 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1648 TTTAGCAGAGAACTGTTTGGAAAGGATCTTTACCGTTGGCGCCTTGAACG 1697 1700 GAATATCGACGGAATGTTTGGCGGTCGATAATTTCAGCTTCCCTTTGAAT 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1698 GAATATCGACGGAATGTTTGGCGGTCGATAATTTCAGCTTCCCTTTGAAT 1747 1750 TTTGCGAAGTGGGTACGCTGTTGAACATTCGTATCAGAAACTCTGTAATA 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1748 TTTGCGAAGTGGGTACGCTGTTGAACATTCGTATCAGAAACTCTGTAATA 1797 1800 GAGTTTCCAAGGGATTGGGTCTTTGAGAGAGAAGAAGGAAGCTGAAAAAT 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1798 GAGTTTCCAAGGGATTGGGTCTTTGAGAGAGAAGAAGGAAGCTGAAAAAT 1847 1850 AGTGGAGATCTATGTTACACCTGATCGGAAAAGTCCACGACGATTGTAAT 1899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1848 AGTGGAGATCTATGTTACACCTGATCGGAAAAGTCCACGACGATTGTAAT 1897 1900 GATTCATTATCAGTCATCCTCTTGTCGTGAATCTCCACTATCACTGTACC 1949 ||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||**|| 1898 GATTCATTATCAGTCATCCTCTTGTCATGAATCTCCACTATCACTGATCC 1947 1950 AGTCGCGTTAATTGGCACCTGCTGCCTGTACTCGATAACGCAATGATCGA 1999 *|||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||| 1948 GGTCGCGTTAATTGGCACCTGCTGCCTGTATTCGATGACGCAATGATCGA 1997 2000 TCTTCATGCAACTGCGACTGAGTCTCGCCGTTAATTGTGCCGCCGTTGAC 2049 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||| 1998 TCTTCATGCAACTGCGACTGAGCCTCGCCGTTAATTGAGCCGCCGTTGAC 2047 2050 GGAAACTGCAGAACGATCTCAGTTAGGTCATGGGAAAGCTGATATTCATC 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2048 GGAAACTGCAGAACGATCTCAGTTAGGTCATGGGAAAGCTGATATTCATC 2097 2100 CCTCTGAGACTCTATATAATTAAATGCGTTTGGGGGATTAGCTAATTGAG 2149 |||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 2098 CCTTTGAGACTCTATATAATTAAAAGCGTTTGGGGGATTAGCTAATTGAG 2147 2150 AATCCATATAGAGAAATATGGCCGCGCAGCGACGCCGGTTGAAGAATATG 2199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2148 AATCCATATAGAGAAATATGGCCGCGCAGCGACGCCGGCTGAAGAATATG 2197 2200 AACAAGGAATAAGATGAACAAGGAAGAAGATGAACAAGCAATAATTTAAT 2249 |||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2198 AACAAGGAACAAGATGAACAAGGAAGAAGATGAACAGGCAATAATTTAAT 2247 2250 TAATTATTGTTAATAAGCATAAATTATGAAAATAATTTTGATGGTAATGA 2299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2248 TAATTATTGTTAATAAGCATAAATTATGAAAATAATTTTGATGGTAATGA 2297 2300 AAGTATTATAAATAATATTTAGGAGAAAATATTGTTAAGGAAATATCTGG 2349 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||| 2298 AAGTATTATAAATAATATTTAAGAGAAAATATTGTTAAGGAAAAATCTGG 2347 2350 TTATGTTTATTTGTTAAGGTATATGGGTTTTTATAGAAACCCAGGAGCAG 2399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2348 TTATGTTTATTTGTTAAGGTATATGGGTTTTTATAGAAACCCAGGAGCAT 2397 2400 CTATGGTAAGAAACCCAGGACTCAAAAAATGCCTCTCAACTTCTCTCATA 2449 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2398 CTATAGTAAGAAACCCAGGACTCAAAAAATGCCTCTCAACTTCTCTCATA 2447 2450 TGTTGCGGAGTCTGGAGTCCCATTTATACCATAGAAAGCATTGGGGGTAT 2499 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2448 TGTTGTGGAGTCTGGAGTCCCATTTATACCATAGAAAGCATTGGGGGTAT 2497 2500 AGCATGGTAATTTCACATCGGACTCCATACCGCGGCCATCTATATAATAT 2549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2498 AGCATGGTAATTTCACATCGGACTCCATACCGCGGCCATCTATATAATAT 2547 2550 T- 2550 |* 2548 TA 2549