NC_004580 AY742220 1 ACTGATGGCCGCGCGGATTTTGGAGCCCCCTTTTGTCGTTAGCGCGACCT 50 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 -CTGATGGCCGCGCGGATTTTGGAGCCCCCTTTTGTCGTTAGCGCGACCT 49 51 TTAATTCAAATTAAAGGTTGCTTTTTTCTATCGTCCAATCATTTTGCGCC 100 ||||||**|||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||||| 50 TTAATTTGAATTAAAGGTTGCTTTTTTCTGTTGTCCAATCATTTTGCGCC 99 101 TGACTAGCCTAGATATTAGCAACAACTTCGCGACTAAGTTGTTGACCGTC 150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 100 TGACTAGCCTAGATATTAGCAACAACTTCGCGACTAAGTTGTTGACCGGC 149 151 AAGTATAAATTAATGGGCTTATGGCCCAATGGGTATAGAGCAAAATGCCC 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150 AAGTATAAATTAATGGGCTTATGGCCCAATGGGTATAGAGCAAAATGCCC 199 201 AAGCGTGATGCCCCGTGGCGCTTATTAGCGGGTACGTCTAAGGTAAGTCG 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 200 AAGCGTGATGCCCCGTGGCGCTTATTAGCGGGTACGTCTAAGGTAAGTCG 249 251 AAATGCCAACTACTCTCCCTTGAGAGTATTGGGCCCTAAAGTTAATAAGG 300 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||| 250 AAATGCCAACTACTCTCCCCTGAGAGTATTGGGCCCTAAGGTTAATAAGG 299 301 CCTCTGAATGGGTTTACAGGCCTATGTACAGGAAGCCCAGAATCTATCGC 350 ||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||*||| 300 CCTCTGAATGGGTTAACAGGCCTATGTATAGGAAGCCCAGAATCTACCGC 349 351 ACGTTAAGGACGCCTGACATTCCGAGAGGCTGTGAAGGGCCATGTAAAGT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 350 ACGTTAAGGACGCCTGACATTCCGAGAGGCTGTGAAGGGCCATGTAAAGT 399 401 CCAGTCATATGAACAGCGCCACGATGTCTCACACGTGGGTAAGGTAATGT 450 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 400 CCAGTCGTATGAACAGCGCCACGATGTCTCACACGTGGGTAAGGTAATGT 449 451 GTATATCTGATGTCACACGTGGTAATGGTATCACCCACCGTGTTGGTAAG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 450 GTATATCTGATGTCACACGTGGTAATGGTATCACCCACCGTGTTGGTAAG 499 501 CGTTTCTGTGTTAAGTCTGTATATATTTTAGGGAAAATATGGATGGATGA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 500 CGTTTCTGTGTTAAGTCTGTATATATTTTAGGGAAAATATGGATGGATGA 549 551 GAATATTAAGCTGAAGAACCACACGAACAGCGTCATTTTTTGGCTGGTTA 600 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 550 GAATATTAAGCTGAAGAACCACACGAACAGTGTCATTTTTTGGCTGGTTA 599 601 GAGATCGTAGACCATATGGCACGCCTATGGACTTTGGTCAAGTGTTTAAT 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 600 GAGATCGTAGACCATATGGCACGCCTATGGACTTTGGTCAAGTGTTTAAT 649 651 ATGTTTGACAACGAGCCAAGTACTGCCACTGTCAAGAACGATCTCAGAGA 700 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 650 ATGTTTGACAACGAGCCCAGTACTGCCACTGTCAAGAACGATCTCAGAGA 699 701 TAGGTTGCAGGTCATGCACAAGTTTTATGCTAAGGTAACTGGAGGACAAT 750 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 700 TAGGTTGCAGGTCATGCACAAGTTTTATGCTAAGGTAACTGGTGGACAAT 749 751 ACGCGAGCAACGAGCAAGCCTTGGTCAAGAGATTCTGGAAGGTCAACAAT 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 750 ACGCGAGCAACGAGCAAGCCTTGGTCAAGAGATTCTGGAAGGTCAACAAT 799 801 CATGTGGTGTACAACCACCAAGAAGCAGGGAAATATGAGAATCACACGGA 850 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|| 800 CATGTGGTGTACAACCACCAGGAAGCAGGGAAATATGAGAATCACACTGA 849 851 GAATGCGTTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAATCCTGTGT 900 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 850 GAATGCGCTATTATTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAATCCTGTGT 899 901 ATGCAACGTTGAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATCATGAATTAA 950 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 900 ATGCAACATTGAAAATTCGGATCTATTTTTACGATTCGATCATGAATTAA 949 951 TAAAATTTAAATTTTATTGAATGATTTTCTAGTACATAACTGACATACGA 1000 |||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||| 950 TAAAATTTAAATTTTATTGCATGATATTCTAGTACATAACTGACATACGA 999 1001 CTTATCAGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATTACATTGTTAAGTGAAATTA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1000 CTTATCAGTTGCGAAACGAACAGCTCTAATTACATTGTTAAGTGAAATTA 1049 1051 CGCCTAATTCGTCTAAGTACAACATAACCAACTGTTTAAACCTAATTAAA 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1050 CGCCTAATTCGTCTAAGTACAACATAACCAACTGTCTAAACCTAATTAAA 1099 1101 TAAGTCGACCCAGAAGCTGTCAGAGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1100 TAAGTCGACCCAGAAGCTGTCAGAGATGTCGTCCAGACTTGGAAGTTCAG 1149 1151 GTAAGCTTTGTGGAGATGCAACGCTCTCCGTAAGTTGTGGTTGAATCGGA 1200 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 1150 GTAAGCTTTGTGGAGATGCAACGCTTTCCGTAAGTTGTGGTTGAATCGGA 1199 1201 TCTGGACGTGGTATATACGCGTCCTGGTGTATAGCAGATCCTCTACTCCG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1200 TCTGGACGTGGTATATACGCGTCCTGGTGTATAGCAGATCCTCTACTCCG 1249 1251 TATATCTTGAAATATAGGGGATTTATTATCTCCCAGATATACACGCCATT 1300 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1250 TATATCTTGAAATAGAGGGGATTTATTATCTCCCAGATATACACGCCATT 1299 1301 CTCTGCCTGACGTGCAGTGATGATTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGACCG 1350 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1300 CTCTGCCTGACGTGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGACCG 1349 1351 GTGCAGCCTATGTGGAAGTATATGGTGCACCCACAGTTTAGATCAATGCG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1350 GTGCAGCCTATGTGGAAGTATATGGTGCACCCACAGTTTAGATCAATGCG 1399 1401 TCGTCGTCTAATCGCCCTCCTCTTGGCTTGCCTGTGTGCCTTCTTGATAG 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1400 TCGTCGTCTAATCGCCCTCCTCTTGGCTTGCCTGTGTGCCTTCTTGATAG 1449 1451 AGGGGGGCGTCGAGAGTGATGAAGATAACATTCTTGAGAGTCCAATGTTT 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1450 AGGGGGGCGTCGAGAGTGATGAAGATAACATTCTTGAGTGTCCAATGTTT 1499 1501 GAGCGACGCATTTTCCGCTTTATCCAGGAAATCTTTATAGCTGGATCCCT 1550 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1500 GAGCGACGCATTTTCCGCCTTATCCAGGAAATCTTTATAGCTGGATCCCT 1549 1551 CGCCTGGATTGCAAAGCACGATTGAAGGGATCCCTCCTTTAATTTGAACT 1600 ||||||||||||||||||||||||||*|*||**||||||||||||||||| 1550 CGCCTGGATTGCAAAGCACGATTGAAKGKATYYCTCCTTTAATTTGAACT 1599 1601 GGTTTCCCGTACTTGCAATTTGACTGCCAGTCTTTTTGGGCCCCAAGAAG 1650 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1600 GGTTTCCCGTATTTGCAATTTGACTGCCAGTCTTTTTGGGCCCCAAGAAG 1649 1651 CTCTTTCCAATGCTTTAGCTTTAGGTATTGCGGTGCTACGTCATCAATGA 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1650 CTCTTTCCAATGCTTTAGCTTTAGGTATTGCGGTGATACGTCATCAATGA 1699 1701 CGTTATAGGCAACATTATTCGAGTACACTCGATTATTGAAGTCCAGGTGT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1700 CGTTATAGGCAACATTATTCGAGTACACTCGATTATTGAAGTCCAGGTGT 1749 1751 CCACTGAGGTAATTATGTGGGCCTAAAGCACGAGCCCACATCGTCTTGCC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1750 CCACTGAGGTAATTATGTGGGCCTAAAGCACGAGCCCACATCGTCTTGCC 1799 1801 CGTTCTAGAATCACCTTCCACTATGAGACTAACTGGTCTTACAGGCCGCG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1800 CGTTCTAGAATCACCTTCCACTATGAGACTAACTGGTCTCACAGGCCGCG 1849 1851 CAGCGGGACCCATTCCAAAATAATCATCCGCCCATTCTTGCATCTGTTCA 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1850 CAGCGGGACCCATTCCAAAATAATCATCCGCCCATTCTTGCATCTGTTCA 1899 1901 GGAACGTTAGTGAAAGAGGAAAGTGGAAATGGAGGGACCCATTGTTCAGG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1900 GGAACGTTAGTGAAAGAGGAAAGTGGAAATGGAGGGACCCATTGTTCAGG 1949 1951 CGCCTTTTTGAAAAGGCGTTCCAAGTTCGCTGTAATGTTATGGTAACTCA 2000 |||||||||||||||||||||||||||*|||*|*|||||||||||*|||| 1950 CGCCTTTTTGAAAAGGCGTTCCAAGTTTGCTTTGATGTTATGGTAGCTCA 1999 2001 CGATGAACGCCCTTGGATCTCCGGCCCGGATAATTGCAAGAGCTTCCGCC 2050 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2000 CGATGAACGCTCTTGGATCTCCGGCCCGGATAATTGCAAGAGCTTCCGCC 2049 2051 AAACTAGGTGCATTGATGGCGTTATAATAGACGTCGTCTTTATTCTTCTT 2100 |*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||*|| 2050 AGACTAGGTGCATTGATGGCGTTATAAAAGACGTCGTCTTTATTCTTTTT 2099 2101 TGTACCCCCAGGCACTTTGAACTGTCCGGATTCACAACAATCGCCGTCTT 2150 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2100 TGTACCCCCAGGCACTGTGAACTGTCCGGATTCACAACAATCGCCGTCTT 2149 2151 TGGTGATGTAATTCTTGACGGCGTTGGCGTCTTTGGCTGCTTGTATGTTT 2200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2150 TGGTGATGTAATTCTTGACGGCGTTGGCGTCTTTGGCTGCTTGTATGTTT 2199 2201 GGGTGAAAATTGGTCGACCTTCTGGGGTGAGTAAGGTCGAAAAATCTCTT 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2200 GGGTGAAAATTGGTCGACCTTCTGGGGTGAGTAAGGTCGAAAAATCTCTC 2249 2251 ATTCTTGATGTTGGACTTTCCAGAGAGTTGGATGAGACAGTGAAGGTGTG 2300 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||| 2250 ATTCTTGATGTTGGACTTTCCGGAGAGTTGGATGAGACAGTGAAGATGTG 2299 2301 GGAATCCGTCCGAGTGCTCCTCTCTGGCAACTCGAATATATGTTGGTTTG 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2300 GGAATCCGTCCGAGTGCTCCTCTCTGGCAACTCGAATATATGTTGGTTTG 2349 2351 ACGACTGACCATGATAAGGTTTGAAGCATTTGAAGAGCTTCATTTTTTGG 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 2350 ACGACTGACCATGATAAGGTTTGAAGCATTTGAAGAGCTTCATTTTTAGG 2399 2401 GATATCGCACTTGGGATAGGTTAAGAAAATATGTCTGGCTTGTAAACGAA 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2400 GATATCGCACTTGGGATAGGTTAAGAAAATATGTCTGGCTTGTAAACGAA 2449 2451 AAGAATCGGGGTTTCTAGGCATTTTTTAAATAGTGACCCAGGACTCAAAA 2500 ||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2450 AAGAATCGGGTTTTCTAGGCATATTTTAAATAGTGACCCAGGACTCAAAA 2499 2501 ACTAGCTCTCAACTTCTCTCATATGTTGTGGAGTCTGGAGTCCTTTATAT 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2500 ACTAGCTCTCAACTTCTCTCATATGTTGTGGAGTCTGGAGTCCTTTATAT 2549 2551 ATGTTTACGCTATAGAAGGCATTTGGGGACTCTCCCGGGCCCACCATAGG 2600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2550 ATGTTTACGCTATAGAAGGCATTTGGGGACTCTCCCGGGCCCACCATAGG 2599 2601 ACTCCATACCGCGGCCATCTATATAATATT- 2630 ||||||||||||||||||||||||||||||* 2600 ACTCCATACCGCGGCCATCTATATAATATTA 2630