NC_003540 AJ878089
  1 GGCACCTGACGTCGGTGTCCTGATGAAGATCCATGACAGGATCGAAACCT 50
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  1 GGCACCTGACGTCGGTGTCCTGATGAAGATCCATGACAGGATCGAAACCT 50

 51 CTTCCAGTTTCGGCTTGTGTGGGAGTAAAGCTTTCGCTCTCTCCACAGCC 100
    |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||
 51 CTTCCAGTTTCGGCTTGTGCGGGAGTAAAGCTTTCGCTCTCTCCACAGCC 100

101 TCATCAGGAAACCCACTTCAGGTCTCGACTGGAAGGTCGTTAAACTTCCC 150
    |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||
101 TCATCAGGAAACCCACTTCAGGTCTCGACTGGAGGGTCGTTAAACTTCCC 150

151 CTCTAAGCGGAGTAGAGGTAAATACCTCCGTCCAACCCCGGGAGGAAAGG 200
    |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||
151 CTCTAAGCGGAGTAGAGGTAAATACCTCCGTCCCACCCCGGGAGGAAAGG 200

201 GGTTGGGACCCGGAACAGATCCAGTTCCGGTCCTTTGGAGTCCATTTCTC 250
    |||*||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||*|||||*
201 GGTGGGGACCCGGAACAGCTCTAGTTCCGGTCCTTTGGAGTCCGTTTCTA 250

251 TCGTTGGATATTCTCCTCGGAGAAGGGAGATGGGGCCAGTCCCAGTCGGT 300
    *|||||||*|||**|**|||**||||||||*|||||||||||||||||||
251 CCGTTGGAGATTACCTCCGGGTAAGGGAGACGGGGCCAGTCCCAGTCGGT 300

301 TCGCTCTCGTAGTCACAGCCACTGGGGAACCTAGGCAGATGGCTGGACGG 350
    ||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||
301 TCGCTCTCGTAGTCACAGCCGCTGGGGAACCTAGGCAGATGGCTGGACGG 350

351 AGTCTTAGTCCACTCCAGAGGACCTTGGGTTTGAAACCCCCAAGAGGTC 399
    |||||||||||||||||*||||||*|||||||*|||||||||*||||||
351 AGTCTTAGTCCACTCCAAAGGACCATGGGTTTTAAACCCCCATGAGGTC 399