NC_003540 AJ878086
  1 GGCACCTGACGTCGGTGTCCTGATGAAGATCCATGACAGGATCGAAACCT 50
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  1 GGCACTTGACGTCGGTGTCCTGATGAAGATCCAAGACAGGATCGAAACCT 50

 51 CTTCCAGTTTCGGCTTGTGTGGGAGTAAAGCTTTCGCTCTCTCCACAGCC 100
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 51 CTTCCAGTTTCGGCTTGTGTGGGAGTAAAGCTTTCGCTCTCTCCACAGCC 100

101 TCATCAGGAAACCCACTTCAGGTCTCGACTGGAAGGTCGTTAAACTTCCC 150
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101 TCATCAGGAAACCCACTTCAGGTCTCGACTGGAAGGTCGT-AAACTTCCC 149

151 CTCTAAGCGGAGTAGAGGTAAATACCTCCGTCCAACCCCGGGAGGAAAGG 200
    |||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||
150 CTCTAAGCGGAGTAGAGGTAAATACCTCCGTCCCACCCCGGGAGGAAAGG 199

201 GGTTGGGACCCGGAACAGATCCAGTTCCGGTCCTTTGGAGTCCATTTCTC 250
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200 GGTGGGGACCCGGAATAGATCCAATTCCGGTCCTTTGGAGTCCATTTCTC 249

251 TCGTTGGATATTCTCCTCGGAGAAGGGAGATGGGGCCAGTCCCAGTCGGT 300
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250 TCGTTGGATTTTCTCCTCGGAGAAGGGAGATGGGGCCAGTCCCAGTCGGT 299

301 TCGCTCTCGTAGTCACAGCCACTGGGGAACCTAGGCAGATGGCTGGACGG 350
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300 TCGCTCTCGTAGTCACAGCCACTGGGGAACCTAGGCAGATGGCTGGACGG 349

351 AGTCTTAGTCCACTCCAGAGGACCTTGGGTTTGAAACCCCCAAGAGGTC 399
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350 AGTCTTAGTCCACTCCAGAGGACCTTGGGTTTATAACCCCCAAGAGGTC 398