NC_004107 AY628100 1 AATTCGGGACATACCACGTGGTTTAGTTCCGCCTCAAACTCCAACAAATC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 AATTCGGGACATACCACGTGGTTTAGTTCCGCCTCAAACTCCAACAAATC 50 51 GAGATCAAGGGAGAAAGCCTACTCCTCCAACTCCACCTCTAAGAGATACT 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 GAGATCAAGGGAGAAAGCCTACTCCTCCAACTCCACCTCTAAGAGATACT 100 101 CACCCCCACTTAACTATGAAAAATCAGACTTTTCATCTCCAGGGGTTCGT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 CACCCCCACTTAACTATGAAAAATCAGACTTTTCATCTCCAGGGGTTCGT 150 151 AGACGGATTACGAGACTTGACAACAACGGAACGCCAACACAATGCCTATG 200 *|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GGACGGATTAAGAGACTTGACAACAACGGAACGCCAACACAATGCCTATG 200 201 GAGATCCTTTTACAACACTAAGCCCTGCGGTTCCTACTGTATCCACCATA 250 |||||||||||||*|||*|||||||||*|||||||||||||||||||||| 201 GAGATCCTTTTACGACAGTAAGCCCTGTGGTTCCTACTGTATCCACCATA 250 251 TTGTCTCCTCCCTCGACGACTGGGGACCCTGCACTGTCACCGGAGATGTC 300 |||||||||||*||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 251 TTGTCTCCTCCATCGACGACTGGGGACCCTGCACAGTCACCGGAGATGTC 300 301 ACCATCAAGTCTCCTAGGACTCCTCGCAGGATTACAGGTGGTGTATTTCT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 301 ACCATCAAGTCTCCTAGGACTCCTCGCAGGATTACAGGTGGTGTATTTCT 350 351 TGTGGACAAAAATCCTAACAATAGCTCAGAATCTAGATTGGTGGTGGACT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 TGTGGACAAAAATCCTAACAATAGCTCAGAATCTAGATTGGTGGTGGACT 400 401 TCTCTCAGTTTTCCAGGGGGCATACCAGAGTGCACTGGCCAAAATTCGCA 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 TCTCTCAGTTTTCCAGGGGGCATACCAGAGTGCACTGGCCAAAATTCGCA 450 451 GTTCCAAACTTGCAAACACTTGCCAACCTCCTGTCCACCAACTTGCAATG 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 451 GTTCCAAACTTGCAAACACTTGCCAACCTCCTGTCCACCGACTTGCAATG 500 501 GCTTTCGTTGGATGTATCTGCGGCGTTTTATCATATACCTATTAGTCCTG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 501 GCTTTCGTTGGATGTATCTGCGGCGTTTTATCATATACCTATTAGTCCTG 550 551 CTGCTGTGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTCCTGGACTGGAAAGGTTTAAT 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 551 CTGCTGTGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTCCTGGACTGGAAAGGTTTAAT 600 601 ACCTGTCTGTCCTCTTCAACCCACAACAGAAACAACAGTCAATTGCAGAC 650 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 601 ACCTGTCTGTCCTATTCAACCCACAACAGAAACAACAGTCAATTGCAGAC 650 651 AATGCACAATCTCTGCACAAGACATGTATACTCCTCCTTACTGTTGTTGT 700 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 651 AATGCACAATCTCTGTACAAGACATGTATACTCCTCCTTACTGTTGTTGT 700 701 TTAAAACCTACGGCAGGAAATTGCACTTGTTGGCCCATCCCTTCATCATG 750 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 701 TTAAAACCTACGGCAGGAAATTGCACTTGCTGGCCCATCCCTTCATCATG 750 751 GGCTTTAGGAAATTACCTATGGGAGTGGGCCTTAGCCCGTTTCTCTTGGC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 GGCTTTAGGAAATTACCTATGGGAGTGGGCCTTAGCCCGTTTCTCTTGGC 800 801 TCAATTTACTAGTGCCCTTGCTTCAATGGTTAGGAGGAATTTCCCTCATT 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 801 TCAATTTACTAGTGCCCTTGCTTCAATGGTTAGGAGGAATTTCCCTCATT 850 851 GCGTGGTTTTTGCTTATATGGATGATTTGGTTTTGGGGGCCCGCACTTCT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 851 GCGTGGTTTTTGCTTATATGGATGATTTGGTTTTGGGGGCCCGCACTTCT 900 901 GAGCATCTTACCGCCATTTATTCCCATATTTGTTCTGTTTTTCTTGATTT 950 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 901 GAGCATCTTACCGCCATTTATACCCATATTTGTTCTGTTTTTCTTGATTT 950 951 GGGTATACATTTGAATGTCAATAAAACAAAATGGTGGGGCAATCATCTAC 1000 ||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||*||| 951 GGGTATACATTTAAATGTTAATAAAACAAAATGGTGGGGCAATCATTTAC 1000 1001 ATTTCATGGGATATGTGATTACTAGTTCAGGTGTATTGCCACAAGACAAA 1050 ||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||| 1001 ATTTTATGGGATATGTAATTACTAGTTCAGGTGTATTGCCACAAGATAAA 1050 1051 CATGTTAAGAAAATTTCCCGTTATTTGCGCTCTGTTCCTGTTAATCAACC 1100 ||||||||||||*|||||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 1051 CATGTTAAGAAACTTTCCCGTTATTTACGATCTGTTCCTGTTAATCAACC 1100 1101 TCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTG 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1101 TCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTG 1150 1151 CTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCT 1200 |||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||*||||||||||| 1151 CTCCTTTTACGCTGTGTGGATATGCTGCTTTAATGCCTCTGTATCATGCT 1200 1201 ATTACTTCCCGTACGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTT 1250 |||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1201 ATTGCTTCCCGTACGGCTTTCGTTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTT 1250 1251 GCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGG 1300 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||||||||| 1251 GCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCCGCCAACGTGGCGTGG 1300 1301 TGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACC 1350 |||||*||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1301 TGTGCTCTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGCTGGGGCATTGCCACC 1350 1351 ACCTATCAACTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCAC 1400 ||||*||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||*||||| 1351 ACCTGTCAACTCCTTTCTGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCGATCGCCAC 1400 1401 GGCGGAACTCATTGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGC 1450 |||*||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||*||* 1401 GGCAGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACGGGGGCTAGGT 1450 1451 TGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTT 1500 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1451 TGTTGGGCACTGATAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTT 1500 1501 CCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCAACTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTT 1550 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 1501 CCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCAACTGGATCCTACGCGGGACGTCCTT 1550 1551 CTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCC 1600 |||||||||||||||*||*|||||||||||||||||*||||||||*|||| 1551 CTGCTACGTCCCTTCAGCTCTCAATCCAGCGGACCTCCCTTCCCGAGGCC 1600 1601 TGCTGCCGGTTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACG 1650 |*||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||*||||*|||| 1601 TTCTGCCGGTTCTGCGGCCTCTCCCGCGTCTTCGCTTTCGGCCTCCGACG 1650 1651 AGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTGTTTCGCCTCGGCGTCC 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1651 AGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTGTTTCGCCTCGGCGTCC 1700 1701 GGTCCGTGTTGCTTGGTCTTCACCTGTGCAGAATTGCGAACCATGGATTC 1750 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1701 GGTCCGTGTTGCTTGGTCGTCACCTGTGCAGAATTGCGAACCATGGATTC 1750 1751 CACCGTGAACTTTGTCTCCTGGCATGCAAATCGTCAACTTGGCATGCCAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1751 CACCGTGAACTTTGTCTCCTGGCATGCAAATCGTCAACTTGGCATGCCAA 1800 1801 GTAAGGACCTTTGGACTCCTTATATAAAAGATCAATTATTAACTAAATGG 1850 |*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1801 GCAAGGACCTTTGGACTCCTTATATAAGAGATCAATTATTAACTAAATGG 1850 1851 GAGGAGGGCAGCATTGATCCTAGATTATCAATATTTGTATTAGGAGGCTG 1900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1851 GAGGAGGGCAGCATTGATCCTAGATTATCAATATTTGTATTAGGAGGCTG 1900 1901 TAGGCATAAATGCATGCGACTTCTGTAACCATGTATCTTTTTCACCTGTG 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1901 TAGGCATAAATGCATGCGACTTCTGTAACCATGTATCTTTTTCACCTGTG 1950 1951 CCTTGTTTTTGCCTGTGTTCCATGTCCTACTTTTCAAGCCTCCAAGCTGT 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1951 CCTTGTTTTTGCCTGTGTTCCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGT 2000 2001 GCCTTGGATGGCTTTGGGGCATGGACATAGATCCCTATAAAGAATTTGGT 2050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 2001 GCCTTGGATGGCTTTGGGGCATGGACATAGATCCTTATAAAGAATTTGGT 2050 2051 TCATCTTATCAGTTGTTGAATTTTCTTCCTTTGGACTTCTTTCCTGACCT 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 2051 TCATCTTATCAGTTGTTGAATTTTCTTCCTTTGGACTTCTTTCCTGATCT 2100 2101 TAATGCTTTGGTGGACACTGCTACTGCCTTGTATGAAGAAGAGCTAACAG 2150 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||| 2101 TAATGCTTTGGTGGACACTGCTACTGCTTTGTATGAAGAAGAACTAACAG 2150 2151 GTAGGGAACATTGCTCTCCGCACCATACAGCTATTAGACAAGCTTTAGTA 2200 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2151 GTAGGGAACATTGCTCTCCGCATCATACAGCTATTAGACAAGCTTTAGTA 2200 2201 TGCTGGGATGAATTAACTAAATTGATAGCTTGGATGAGCTCTAACATAAC 2250 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||||*||||||||||| 2201 TGCTGGGATGAATTAACTAAACTGATAGCTTGGATGAGTTCTAACATAAC 2250 2251 TTCTGAACAAGTAAGAACAATCATAGTAAATCATGTCAATGATACCTGGG 2300 ||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||| 2251 TTCTGAACAAGTAAGAACAATCATTGTAAACCATGTCAATGATACCTGGG 2300 2301 GACTTAAGGTGAGACAAAGTTTATGGTTTCATTTGTCATGTCTCACTTTT 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2301 GACTTAAGGTGAGACAAAGTTTATGGTTTCATTTGTCATGTCTCACTTTC 2350 2351 GGACAACATACAGTTCAAGAATTTTTAGTAAGTTTTGGAGTATGGATCAG 2400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2351 GGACAACATACAGTTCAAGAATTTTTAGTAAGTTTTGGAGTATGGATCAG 2400 2401 AACTCCAGCTCCATATAGACCTCCTAATGCACCCATTCTCTCGACTCTTC 2450 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2401 GACTCCAGCTCCATATAGACCTCCTAATGCACCCATTCTCTCGACTCTTC 2450 2451 CGGAACATACAGTCATTAGGAGAAGAGGAGGTGCAAGAGCTTCTAGGTCC 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2451 CGGAACATACAGTCATTAGGAGAAGAGGAGGTGCAAGAGCTTCTAGGTCC 2500 2501 CCCAGAAGACGCACTCCCTCTCCTCGCAGGAGAAGATCTCAATCACCGCG 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2501 CCCAGAAGACGCACTCCCTCTCCTCGCAGGAGAAGATCTCAATCACCGCG 2550 2551 TCGCAGACGCTCTCAATCTCCATCTGCCAACTGCTGATCTTCAATGGGTA 2600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2551 TCGCAGACGCTCTCAATCTCCATCTGCCAACTGCTGATCTTCAATGGGTA 2600 2601 CATAAAACTAATGCTATTACAGGTCTTTACTCTAACCAAGCTGCTCAGTT 2650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2601 CATAAAACTAATGCTATTACAGGTCTTTACTCTAACCAAGCTGCTCAGTT 2650 2651 CAATCCGCATTGGATTCAACCTGAGTTTCCTGAACTTCATTTACATAATG 2700 *||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||| 2651 TAACCCGCATTGGATTCAACCTGAGTTTCCTGAGCTTCATTTACACAATG 2700 2701 ATTTAATTCAAAAATTGCAACAGTATTTTGGTCCTTTGACTATAAATGAA 2750 |*||||||*|||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||||| 2701 AATTAATTAAAAAATTGCAACAGTATTTTGGTCCCTTGACTATTAATGAA 2750 2751 AAGAGAAAATTGCAATTAAATTTTCCTGCCAGATTTTTCCCCAAAGCTAC 2800 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2751 AAGAGAAAATTGCAATTAAATTTTCCTGCAAGATTTTTCCCCAAAGCTAC 2800 2801 TAAATATTTCCCTTTAATTAAAGGCATAAAAAACAATTATCCTAATTTTG 2850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2801 TAAATATTTCCCTTTAATTAAAGGCATAAAAAACAATTATCCTAATTTTG 2850 2851 CTTTAGAACATTTCTTTGCTACCGCAAATTATTTGTGGACTTTATGGGAA 2900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2851 CTTTAGAACATTTCTTTGCTACCGCAAATTATTTGTGGACTTTATGGGAA 2900 2901 GCTGGAATTTTGTATTTAAGGAAGAATCAAACAACTTTGACTTTTAAAGG 2950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2901 GCTGGAATTTTGTATTTAAGGAAGAATCAAACAACTTTGACTTTTAAAGG 2950 2951 TAAACCATATTCTTGGGAACACAGACAGCTAGTGCAACATAATGGGCAAC 3000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2951 TAAACCATATTCTTGGGAACACAGACAGCTAGTGCAACATAATGGGCAAC 3000 3001 AACATAAAAGTCACCTTCAATCCAGACAAAATAGCAGCATGGTGGCCTGC 3050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 3001 AACATAAAAGTCACCTTCAATCCAGACAAAATAGCAGCGTGGTGGCCTGC 3050 3051 AGTGGGCACTTATTACACAACCACTTATCCTCAGAATCAGTCAGTGTTTC 3100 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||| 3051 AGTGGGCACTTATTACACAACCACTTACCCTCAGAACCAGTCAGTGTTTC 3100 3101 AACCAGGAATTTATCAAACAACATCTCTGATAAATCCCAAAAATCAACAA 3150 |||||||*|||||||||||||||||**|**||||||||||||*||||||| 3101 AACCAGGGATTTATCAAACAACATCCTTAGTAAATCCCAAAACTCAACAA 3150 3151 GAACTGGACTCTGTTCTTATAAACAGATACAAACAGATAGACTGGAACAC 3200 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||| 3151 GAACTGGACTCTGTTCTCATAAACAGATACAAACAGATAGATTGGAACAC 3200 3201 TTGGCAAGGATTTCCTGTGGATCAAAAATTACCATTGGTCAGCAGGGATC 3250 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||*|||||||| 3201 TTGGCAAGGATTTCCTGTGGATCAAAAACTACCATTGGTCAACAGGGATC 3250 3251 CTCCCCCAAAACCTTATATAAATCAATCAGCTCAAACTTTCGAAATCAAA 3300 |*|||||||||||***************|||||||||||||||||||||| 3251 CACCCCCAAAACC---------------AGCTCAAACTTTCGAAATCAAA 3285 3301 CCTGGGCCTATAATAGTTCCCGG 3323 ||||||||||||||||||||*|| 3286 CCTGGGCCTATAATAGTTCCTGG 3308