NC_001983 AY271892 1 ATCGGTGTCTCTCCATTTAACTCTATGTATCGGTGTATCGGTGTCTTATT 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TATATGTAGGAGAGTTACTAAAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ACCTGAGGACCCCGCGACCGGTGTACGCTTTTGCTTATGGACCCACCTTA 150 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 -CCTGAGGACCCCGCGACCGGTGTACGCTTTTGCTTATGGACCCACCTTA 50 151 TCTTTAGTCGTTCAATGACATGCGCTCCTCAGCGCTTACATAATTCAAAT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 TCTTTAGTCGTTCAATGACATGCGCTCCTCAGCGCTTACATAATTCAAAT 100 201 TTGAATTATAAAGAGAGCTGCTACTTTCTTTATTGGCAGCCATGTGGGAT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 TTGAATTATAAAGAGAGCTGCTACTTTCTTTATTGGCAGCCATGTGGGAT 150 251 CCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCGTTACATGGTTTCCGTTGTATGCT 300 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 151 CCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCGTTGCATGGTTTCCGTTGTATGCT 200 301 TGCCATTAAGTATTTACAATACATTCAGGCGAATTATCCCTCTAATTCTC 350 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||||*||||| 201 TGCCATTAAGTATTTACAATACATTCAGGAGAATTATCCTTCTA-TTCTC 249 351 TTGGTTACGTGTATTTAACAGAGTTAATACAGGTTTTACGTATACGGAAA 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 250 TTGGTTACGTGTATTTAACAGAGTTAATACAGGTTTTACGTGTACGGAAA 299 401 CATGCCAAAGCGGAATTACGATCACCGCCTTCTCTACCCCGATGTCGAAT 450 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 300 CATGCCAAAGCGGAATTACGAT-ACCGCCTTCTCTACCCCGATGTCGAAT 348 451 GTGCGGAGGAGGCTGATCTTCGACACCCCGCTTTCCTTACCTGCCACTGC 500 |||||**|||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 349 GTGCGTCGGAGGCTGACCTTCGACACCCCGCTTTCCTTACCTGCCACTGC 398 501 GGGAAGTGTCCCTGCCAGCGCGAAAAGGAGGAGGTGGACCAACCGACCCA 550 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 399 GGGGAGTGTCCCTGCCAGCGCGAAAAGGAGGAGGTGGACCAACCGACCCA 448 551 TGTGGAGGAAACCGAGATATTATCGGTTATACCGCTCTCCTGATGTCCCA 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 449 TGTGGAGGAAACCGAGATATTATCGGTTATACCGCTCTCCTGATGTCCCA 498 601 CGTGGTTGTGAAGGACCTTGTAAGGTCCAATCCTTCGAGGCGAAACATGA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 499 CGTGGTTGTGAAGGACCTTGTAAGGTCCAATCCTTTGAGGCGAAACATGA 548 651 TATTTCGCATCTCGGTAAGGTCATATGTGTCACTGATGTGACACGAGGCA 700 ||||||||||*||||*||||||*||||||||||||||||||||||||||| 549 TATTTCGCATGTCGGCAAGGTCTTATGTGTCACTGATGTGACACGAGGCA 598 701 ATGGCATCACTCACAGAGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCTATCTGG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 599 ATGGCATCACTCACAGAGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCTATCTGG 648 751 GTTACAGGCAAAATCTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAATCACAC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 649 GTTACAGGCAAAATCTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAATCACAC 698 801 TAATACTGTGATGTTCAAGTTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTGGCACGC 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 699 TAATACTGTGATGTTCAAGTTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTGGCACGC 748 851 CACAAGACTTTGGTCAAGTGTTCAACATGTATGACAATGAACCCAGTACT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 749 CACAAGACTTTGGTCAAGTGTTCAACATGTATGACAATGAACCCAGTACT 798 901 GCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCGTGCGTAAGTT 950 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 799 GCTACTGTAAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCGTGCGTAAGTT 848 951 TCAAGCCACAGTTACTGGTGGCCAGTATGCGAGCAAGGAGCAAGCCATAG 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 849 TCAAGCCACAGTTACTGGTGGCCAGTATGCGTGCAAGGAGCAAGCCATAG 898 1001 TTAGTAAATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCACCAAGAG 1050 |||**|*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 899 TTAACAGATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCACCAAGAG 948 1051 GCAGCGAAGTATGAAAATCATACTGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGC 1100 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 949 GCAGCGAAGTATGAAAACCATACTGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGC 998 1101 ATGTACTCATGCATCAAATCCTGTGTATGCAACACTAAAAATTCGGATCT 1150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 999 ATGTACTCATGCATCAAATCCTGTGTATGCAACACTAAAAATTCGGATCT 1048 1151 ATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAATTTTGTATTGAACATTATGC 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1049 ATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAAGTTTGTATTGAACATTATGC 1098 1201 GTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGATATGTGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1099 GTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGATATGTGA 1148 1251 GGCGCCTTGTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTATTTAAAT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1149 GGCGCCTTGTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTATTTAAAT 1198 1301 ATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATTGATAATATCATCCCAGAAGTCGCC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1199 ATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATTGATAATATCATCCCAGAAGTCGCC 1248 1351 GTCAAATAATGGTAGAGCTTCAGATCCAGGAAGCATTTGTGCATCAGCAG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1249 GTCAAATAATGGTAGAGCTTCAGATCCAGGAAGCATTTGTGCATCAGCAG 1298 1401 TGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATGATCCGTATTTGGGTCACATACA 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1299 TGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATGATCCGTATTTGGGTCACATACA 1348 1451 TCTGGGATTCTGGACGAATTAGACGGTGCTGCATGATCTTGAAAGAGAGG 1500 |||||||**|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1349 TCTGGGACCCTGGACGAATTTGACGGTGCTGCATGATCTTGAAAGAGAGG 1398 1501 GGATTTCGCACCTCCCAAGTAAAGACGCCATTCCTGAGTTGAGCTGCAGT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1399 GGATTTCGCACCTCCCAAGTAAAGACGCCATTCCTGAGTTGAGCTGCAGT 1448 1551 GATGTTGTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTACGGCAGTTGATATGGATG 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1449 GATGTTGTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTACGGCAGTTAATATGGATG 1498 1601 TAATAACTACACCC-----TTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAATTGCTCG 1645 ||||||||||||||*****||||||||||||||||||||||||||||||| 1499 TAATAACTACACCCACAGCTTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAATTGCTCG 1548 1646 CTTCTTGGCAACCTTGTGTTGCGCTTTGATCGACGGAGGAGAAAAGTGGT 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1549 CTTCTTGGCAACCTTGTGTTGCGCTTTGATCGACGGAGGAGAAAAGTGGT 1598 1696 TCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTTGAAGCCCACAATTTGAGTGC 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1599 TCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTTGAAGCCCACAATTTGAGTGC 1648 1746 TGTATTATCAGCCTCGTCCAAGTACTCTTTATAAGAGGATTTTGGTCCAG 1795 |||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1649 TGTGTTTTCAGCCTCGTCCAAGTACTCTTTATAAGAGGATTTTGGTCCAG 1698 1796 GATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATATGAGTGGGCTTC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1699 GATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATATGAGTGGGCTTC 1748 1846 CCGTACTTGACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTT 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1749 CCGTACTTGACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTT 1798 1896 GAAATGTTTCAAATAATGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAG 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1799 GAAATGTTTCAAATAATGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAG 1848 1946 CATCGTTGGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAAAGATAA 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1849 CATCGTTGGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAAAGATAA 1898 1996 TTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATTGTTTTACCCGTGCGACTATC 2045 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1899 TTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATTATTTTACCCGTGCGACTATC 1948 2046 GCCTTCAATCACAATGCTAATCGGTCTTTCCGGC---GCAGCGGGATGTC 2092 ||||||||||||||||||||||||||||||||||***||||||||||*|| 1949 GCCTTCAATCACAATGCTAATCGGTCTTTCCGGCCGCGCAGCGGGATCTC 1998 2093 TAACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTTGGGACTTTGTCAAAT 2142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1999 TAACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTTGGGACTTTGTCAAAT 2048 2143 GCTGATAAGCTATAAGGTGACACGTAAAGTGGAACTTCATCTGAAAAAAT 2192 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 2049 GCTGATAAGCTATAAGGTGACACGTAAAGTGGAACTTCATCTGCAAAAAT 2098 2193 CCGTGACAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGTAAAATATAATCTTTAG 2242 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2099 CCGTGACAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGTAAAATATAATCTTTAG 2148 2243 GAGCCTTCTCCCTCAGTATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCACTGTTG 2292 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2149 GAGCCTTCTCCCTCAGTATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCACTGTTG 2198 2293 AGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCTAGCTGA 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2199 AGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCTAGCTGA 2248 2343 TCTGCCATCGACTTGGAAACTTCCATGGTCAACGACGTCTCCGTCTTTGT 2392 ||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||| 2249 TCTGCCATCGACTTGGAAACGTCCATGGTCAAGGACGTCTCCGTCTTTGT 2298 2393 CCATGTATGACTTAACATCTGATGCGCTTTTAGCTGCCTGAACGTTCGGA 2442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2299 CCATGTATGACTTAACATCTGATGCGCTTTTAGCTGCCTGAACGTTCGGA 2348 2443 TGGTAATGTGCTGATCTGGTTGAGGAAACCAGGTCGAAGAACCTTTCGTT 2492 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2349 TGGTAATGTGCTGATCTGGTTGAGGAAACCAGGTCGAAGAACCTTTCGTT 2398 2493 CTTCGTTTGGAACTTCCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGATGAGGTT 2542 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2399 CTTCGTTTGGAACTTTCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGATGGGGTT 2448 2543 CTCCATCTTCATGAAGTTCACGACAGACTCGGATGAACTTCTTGTTGACA 2592 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2449 CGCCATCTTCATGAAGTTCACGACAGACTCGGATGAACTTCTTGTTGACA 2498 2593 GGCGTTGATAACGCTAAGAGTTCTTCAAGAGCGTCCTCCTTTCTAAGAGG 2642 ||||||||||||||||||||||**||||||||||||||||||*||||||| 2499 GGCGTTGATAACGCTAAGAGTTGCTCAAGAGCGTCCTCCTTTGTAAGAGG 2548 2643 ACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGCGTTTATAGCAAAACGAC 2692 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2549 ACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGCGTTTATAGCAAAACGAC 2598 2693 CGAGTCTAGGCATATTTTGGCGTCGTTTTGT------------------- 2723 |||||||||||||||||||||||||||||||******************* 2599 CGAGTCTAGGCATATTTTGGCGTCGTTTTGTATCGGTGTCTCTCCATTTA 2648 -------------------------------------------------- ************************************************** 2649 ACTCTATGTATCGGTGTATCGGTGTCTTATTTATATGTAGGAGAGTTACT 2698 ------------------------------- ******************************* 2699 AAAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 2729