NC_001983 AY269991 1 ATCGGTGTCTCTCCATTTAACTCTATGTATCGGTGTATCGGTGTCTTATT 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TATATGTAGGAGAGTTACTAAAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ACCTGAGGACCCCGCGACCGGTGTACGCTTTTGCTTATGGACCCACCTTA 150 *|||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||*|||||| 2 -CCTGAGGACCCCGCGACCGGTGTACGCTTTTACTTTTGGACCGACCTTA 50 151 TCTTTAGTCGTTCAATGACATGCGCTCCTCAGCGCTTACATAATTCAAAT 200 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 51 TCTTTAGTCGTTCAATGACAGGCGCTCCTCAGCGCTTACATAATTCAAAT 100 201 TTGAATTATAAAGAGAGCTGCTACTTTCTTTATTGGCAGCCATGTGGGAT 250 ||||||||||||||||||*||*||*|*|||||*||||||||||||||||| 101 TTGAATTATAAAGAGAGCGGCCACATGCTTTAGTGGCAGCCATGTGGGAT 150 251 CCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCGTTACATGGTTTCCGTTGTATGCT 300 ||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||| 151 CCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCCTTGCATGGTTTCCGTTGTATGCT 200 301 TGCCATTAAGTATTTACAATACATTCAGGCGAATTATCCCTCTAATTCTC 350 |||*||*||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||| 201 TGCAATAAAGTATTTACAATACATTCAGGAGAATTATCCGTCTAATTCTC 250 351 TTGGTTACGTGTATTTAACAGAGTTAATACAGGTTTTACGTATACGGAAA 400 |*|||||**|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 251 TCGGTTATTTGTATTTAACACAGTTAATACAGGTTTTACGTATACGGAAA 300 401 CATGCCAAAGCGGAATTACGATCACCGCCTTCTCTACCCCGATGTCGAAT 450 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 301 CATGCCAAAGCGGAATTACGAT-ACCGCCTTCTCTACCCCGATGTCGAAT 349 451 GTGCGGAGGAGGCTGATCTTCGACACCCCGCTTTCCTTACCTGCCACTGC 500 ||*||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||||**|||| 350 GTTCGGAGGAGACTGACCTTCGACACCCCGCTTTCCTTACCTGCACCTGC 399 501 GGGAAGTGTCCCTGCCAGCGCGAAAAGGAGGAGGTGGACCAACCGACCCA 550 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||||**|||||||||| 400 GGGAAGTGTCCCTGCCAGCGCCAAAAGGAGGAGGTGGATTAACCGACCCA 449 551 TGTGGAGGAAACCGAGATATTATCGGTTATACCGCTCTCCTGATGTCCCA 600 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 450 TGTGGAGGAAACCGAGGTATTATCGGTTATACCGCTCTCCTGATGTCCCA 499 601 CGTGGTTGTGAAGGACCTTGTAAGGTCCAATCCTTCGAGGCGAAACATGA 650 |||||||||||||||||*|||||||||||*|||||*||*||||||||||| 500 CGTGGTTGTGAAGGACCGTGTAAGGTCCAGTCCTTTGAAGCGAAACATGA 549 651 TATTTCGCATCTCGGTAAGGTCATATGTGTCACTGATGTGACACGAGGCA 700 ||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 550 TATTTCGCATGTCGGCAAGGTCATATGTGTCACTGATGTGACACGAGGCA 599 701 ATGGCATCACTCACAGAGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCTATCTGG 750 **|||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||||||||||| 600 TGGGCATCACTCATAGAGTTGGTAAACGGTTTTGTGTTAAGTCTATCTGG 649 751 GTTACAGGCAAAATCTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAATCACAC 800 |||||*||*||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 650 GTTACCGGTAAGATTTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAATCACAC 699 801 TAATACTGTGATGTTCAAGTTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTGGCACGC 850 *||||||||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 700 GAATACTGTAATGTTCAAGCTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTGGCACGC 749 851 CACAAGACTTTGGTCAAGTGTTCAACATGTATGACAATGAACCCAGTACT 900 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||* 750 CACAAGACTTTGGTCAAGTGTTTAACATGTATGACAATGAACCAAGTACC 799 901 GCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCGTGCGTAAGTT 950 ||*||*||*||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 800 GCAACAGTCAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCATGCGTAAGTT 849 951 TCAAGCCACAGTTACTGGTGGCCAGTATGCGAGCAAGGAGCAAGCCATAG 1000 |||*||||||||||||||||||||*||||||*|*||*||||||||||||| 850 TCAGGCCACAGTTACTGGTGGCCAATATGCGTGTAAAGAGCAAGCCATAG 899 1001 TTAGTAAATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCACCAAGAG 1050 |||**|*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 900 TTAACAGATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCACCAAGAA 949 1051 GCAGCGAAGTATGAAAATCATACTGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGC 1100 ||||*||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||| 950 GCAGGGAAGTATGAAAACCATACTGAAAATGCTTTGTTATTGTATATGGC 999 1101 ATGTACTCATGCATCAAATCCTGTGTATGCAACACTAAAAATTCGGATCT 1150 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||| 1000 ATGTACTCATGCATCAAATCCCGTGTATGCAACACTGAAAATTCGGATCT 1049 1151 ATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAATTTTGTATTGAACATTATGC 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1050 ATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAAGTTTGTATTGAACATTATGC 1099 1201 GTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGATATGTGA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1100 GTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGATATGCGA 1149 1251 GGCGCCTTGTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTATTTAAAT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1150 GGCGCCTTGTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTATTTAAAT 1199 1301 ATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATTGATAATATCATCCCAGAAGTCGCC 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1200 ATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATTGATAATATCATCCCAGAAGTCGCC 1249 1351 GTCAAATAATGGTAGAGCTTCAGATCCAGGAAGCATTTGTGCATCAGCAG 1400 *|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1250 TTCAAATAATGGTAGAGCGTCAGATCCAGGAAGCATTTGTGCATCAGCAG 1299 1401 TGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATGATCCGTATTTGGGTCACATACA 1450 |||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||| 1300 TGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATTATGCGTATTTGGGTCACATACA 1349 1451 TCTGGGATTCTGGACGAATTAGACGGTGCTGCATGATCTTGAAAGAGAGG 1500 |||||||**|||***||||**||||||||||||||||||||||||||||| 1350 TCTGGGACCCTGCTTGAATCTGACGGTGCTGCATGATCTTGAAAGAGAGG 1399 1501 GGATTTCGCACCTCCCAAGTAAAGACGCCATTCCTGAGTTGAGCTGCAGT 1550 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1400 GGATTTCGCACCTCCCAAATAAAGACGCCATTCCTGAGTTGAGCTGCAGT 1449 1551 GATGTTGTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTACGGCAGTTGATATGGATG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||||||||| 1450 GATGTTGTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTCCGACAGTTAATATGGATG 1499 1601 TAATAACTACACCC-----TTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAATTGCTCG 1645 |||||*||||||||*****||||||||||||||||||||||||||||||| 1500 TAATAGCTACACCCACAGCTTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAATTGCTCG 1549 1646 CTTCTTGGCAACCTTGTGTTGCGCTTTGATCGACGGAGGAGAAAAGTGGT 1695 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1550 CTTCTTGGCAACCCTGTGTTGCGCTTTGATCGACGGAGGAGAAAAGTGGC 1599 1696 TCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTTGAAGCCCACAATTTGAGTGC 1745 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||| 1600 TCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTCGAAGCCCACAATTTTAGTGC 1649 1746 TGTATTATCAGCCTCGTCCAAGTACTCTTTATAAGAGGATTTTGGTCCAG 1795 |||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||| 1650 TGTGTTATCAGCCTCGTCCAAGTAATCTTTATAAGAGGACTTTGGTCCAG 1699 1796 GATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATATGAGTGGGCTTC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1700 GATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATGTGAGTGGGCTTC 1749 1846 CCGTACTTGACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTT 1895 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1750 CCGTACTTCACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAATTCTTT 1799 1896 GAAATGTTTCAAATAATGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAG 1945 *|||||||||||||||||||||||*|*||||||||||*|||||||||||| 1800 AAAATGTTTCAAATAATGGGGATCAATGTCATCAATGGCGTTATACCAAG 1849 1946 CATCGTTGGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAAAGATAA 1995 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1850 CATCGTTTGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAAAGATAA 1899 1996 TTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATTGTTTTACCCGTGCGACTATC 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**||| 1900 TTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATTGTTTTACCCGTGCGAGAATC 1949 2046 GCCTTCAATCACAATGCTAATCGGTCTTTCCGGC---GCAGCGGGATGTC 2092 |||||||||*|||||*||||||||||||||||||***||||||||||*|| 1950 GCCTTCAATGACAATACTAATCGGTCTTTCCGGCCGCGCAGCGGGATCTC 1999 2093 TAACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTTGGGACTTTGTCAAAT 2142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2000 TAACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTTGGGACTTTGTCAAAT 2049 2143 GCTGATAAGCTATAAGGTGACACGTAAAGTGGAACTTCATCTGAAAAAAT 2192 |||**||||||||||||||||||*|||*|||||||*|*||||***||||| 2050 GCTTCTAAGCTATAAGGTGACACATAAGGTGGAACATAATCTTGGAAAAT 2099 2193 CCGTGACAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGTAAAATATAATCTTTAG 2242 *|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*| 2100 ACGTGATAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGTAAAATATAATCCTTTG 2149 2243 GAGCCTTCTCCCTCAGTATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCACTGTTG 2292 ||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||| 2150 GAGCTTTCTCCCTCAGTATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCAGAGTTG 2199 2293 AGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCTAGCTGA 2342 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2200 AGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCTAGCTGA 2249 2343 TCTGCCATCGACTTGGAAACTTCCATGGTCAACGACGTCTCCGTCTTTGT 2392 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2250 TCTGCCATCGACTTGGAAACTTCCATGGTCAAGGACGTCTCCGTCTTTGT 2299 2393 CCATGTATGACTTAACATCTGATGCGCTTTTAGCTGCCTGAACGTTCGGA 2442 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||| 2300 CCATGTATGACTTAACATCTGATGCGCTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGA 2349 2443 TGGTAATGTGCTGATCTGGTTGAGGAAACCAGGTCGAAGAACCTTTCGTT 2492 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2350 TGGTAATGTGCTGATCTGGTTGGGGAAACCAGGTCGAAGAACCTTTCGTT 2399 2493 CTTCGTTTGGAACTTCCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGATGAGGTT 2542 ||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2400 CTTCGTTTGGAATTTTCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGATGAGGTT 2449 2543 CTCCATCTTCATGAAGTTCACGACAGACTCGGATGAACTTCTTGTTGACA 2592 ||||||*||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||* 2450 CTCCATTTTCATGGAGTTCACGACAGACACGGATGAACTTCTTGTTGACC 2499 2593 GGCGTTGATAACGCTAAGAGTTCTTCAAGAGCGTCCTCCTTTCTAAGAGG 2642 ||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||*||||||| 2500 GGCGTTGATAACGCTAAGAGTTGTTCAAGTGCGTCCTCCTTTGTAAGAGG 2549 2643 ACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGCGTTTATAGCAAAACGAC 2692 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 2550 ACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTTTTTGCGTTTATAGCAAAACGAC 2599 2693 CGAGTCTAGGCATATTTTGGCGTCGTTTTGT------------------- 2723 |||*||||||||||*|||*||||||||||||******************* 2600 CGATTCTAGGCATAATTTCGCGTCGTTTTGTATCGGTGTCTCTCTAAAAG 2649 -------------------------------------------------- ************************************************** 2650 TACTAGCTATCGGTGTATCGGTGTCTTATTTATATGTAGGAGAGTTACTA 2699 ------------------------------ ****************************** 2700 AAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 2729