NC_001983 AY271896 1 ATCGGTGTCTCTCCATTTAACTCTATGTATCGGTGTATCGGTGTCTTATT 50 |************************************************* 1 A------------------------------------------------- 1 51 TATATGTAGGAGAGTTACTAAAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 ACCTGAGGACCCCGCGACCGGTGTACGCTTTTGCTTATG------GACCC 144 *|||||||||||||||||||||**||||||||||||*||******||||| 2 -CCTGAGGACCCCGCGACCGGTTCACGCTTTTGCTTTTGTAATTGGACCC 50 145 ACCTTATCTTTAGTCGTTCAATGACATGCGCTCCTCAGCGCTTACATAAT 194 ||||||||||*|||||||||||||*|*||||*|||||||||||**||||| 51 ACCTTATCTTGAGTCGTTCAATGAGAGGCGCCCCTCAGCGCTTCAATAAT 100 195 TCAAATTTGAATTATAAAGAGAGCTGCTACTTTCTTTATTGGCAGCCATG 244 ||*|*|||||||||||||||||||*||*||||||||||*||||||||||| 101 TCGAGTTTGAATTATAAAGAGAGCGGCCACTTTCTTTAGTGGCAGCCATG 150 245 TGGGATCCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCGTTACATGGTTTCCGTTG 294 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*|||||||| 151 TGGGATCCATTGGTGAACGACTTTCCCAAATCCTTGCATGGGTTCCGTTG 200 295 TATGCTTGCCATTAAGTATTTACAATACATTCAGGCGAATTATCCCTCTA 344 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||| 201 TATGCTTGCCATAAAGTATTTACAATACATTCAGGAGAATTATCCGTCTA 250 345 ATTCTCTTGGTTACGTGTATTTAACAGAGTTAATACAGGTTTTACGTATA 394 ||||||||||||***|*|||||||||*||||||||||||||||||||||| 251 ATTCTCTTGGTTTTTTTTATTTAACACAGTTAATACAGGTTTTACGTATA 300 395 CGGAAACATGCCAAAGCGGAATTACGATCACCGCCTTCTCTACCCCGATG 444 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 301 CGGAAACATGCCAAAGCGGAATTACGAT-ACCGCCTTCTCTACCCCGATG 349 445 TCGAATGTGCGGAGGAGGCTGATCTTCGACACCCCGCTTTCCTTACCTGC 494 |||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||*||||||||||| 350 TCGAATGTGCGGAGGAGACTGACCTTCGACACCCCGCTGTCCTTACCTGC 399 495 CACTGCGGGAAGTGTCCCTGCCAGCGCGAAAAGGAGGAGGTGGACCAACC 544 **||||||||||||*|||||||||*|**|||||||||||||||||||||| 400 ATCTGCGGGAAGTGCCCCTGCCAGTGGCAAAAGGAGGAGGTGGACCAACC 449 545 GACCCATGTGGAGGAAACCGAGATATTATCGGTTATACCGCTCTCCTGAT 594 ||||||||||||||||||||||****|||||*|||||||||||||||||| 450 GACCCATGTGGAGGAAACCGAGGCTGTATCGATTATACCGCTCTCCTGAT 499 595 GTCCCACGTGGTTGTGAAGGACCTTGTAAGGTCCAATCCTTCGAGGCGAA 644 |||||||||||||||||*|||||*|||||||||||*|||||*||*||||| 500 GTCCCACGTGGTTGTGAGGGACCGTGTAAGGTCCAGTCCTTTGAAGCGAA 549 645 ACATGATATTTCGCATCTCGGTAAGGTCATATGTGTCACTGATGTGACAC 694 ||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||||| 550 ACATGATATTTCGCATGTCGGCAAGGTCATATGTGTCACTGATGTGACAC 599 695 GAGGCAATGGCATCACTCACAGAGTTGGGAAACGATTTTGTGTTAAGTCT 744 ||||||**|||||||||||*||||||||||||||||||||||*||||||| 600 GAGGCATGGGCATCACTCATAGAGTTGGGAAACGATTTTGTGCTAAGTCT 649 745 ATCTGGGTTACAGGCAAAATCTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAA 794 |||||||||||*||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||| 650 ATCTGGGTTACTGGAAAAATTTGGATGGATGAGAACATCAAGACAAAGAA 699 795 TCACACTAATACTGTGATGTTCAAGTTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTG 844 ||||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 700 TCACACGAATACTGTGATGTTCAAGCTAGTGCGTGACAGACGTCCATTTG 749 845 GCACGCCACAAGACTTTGGTCAAGTGTTCAACATGTATGACAATGAACCC 894 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 750 GCACGCCACAAGACTTTGGTCAAGTGTTCAACATGTATGACAATGAACCA 799 895 AGTACTGCTACTGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCGTGCG 944 ||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 800 AGTACTGCAACAGTGAAGAACGATCTTCGTGATCGTTATCAGGTCATGCG 849 945 TAAGTTTCAAGCCACAGTTACTGGTGGCCAGTATGCGAGCAAGGAGCAAG 994 |||||||||*|||||||||||*||||||||*||||||*|*||*||||||| 850 TAAGTTTCAGGCCACAGTTACCGGTGGCCAATATGCGTGTAAAGAGCAAG 899 995 CCATAGTTAGTAAATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCAC 1044 ||||||||||*|*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 900 CCATAGTTAGCAGATTTTATCGTGTTAACAATTATGTTGTTTACAACCAC 949 1045 CAAGAGGCAGCGAAGTATGAAAATCATACTGAGAATGCTTTGTTATTGTA 1094 |||||*||||**||||||||*||*||||||||*||||||||||||||||| 950 CAAGAAGCAGGAAAGTATGAGAACCATACTGAAAATGCTTTGTTATTGTA 999 1095 TATGGCATGTACTCATGCATCAAATCCTGTGTATGCAACACTAAAAATTC 1144 ||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1000 TATGGCATGTACGCATGCATCAAATCCTGTGTATGCAACACTGAAAATTC 1049 1145 GGATCTATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAATTTTGTATTGAACA 1194 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1050 GGATCTATTTTTATGATTCGATTTCAAATTAATAAAGTTTGTATTGAACA 1099 1195 TTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGAT 1244 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1100 TTATGCGTAAAGCTTACATCCTCCACATGGTGGAGTTTTTCATACAGGAT 1149 1245 ATGTGAGGCGCCTTGTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTAT 1294 |||*||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1150 ATGCGAGGCGCCTTTTAATACATTGCCTATGCTAATGACGCCTAAATTAT 1199 1295 TTAAATATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATTGATAATATCATCCCAGAA 1344 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1200 TTAAATATCTAAATAATTGTCTACTAAAAATCGATAATATCATCCCAGAA 1249 1345 GTCGCCGTCAAATAATGGTAGAGCTTCAGATCCAGGAAGCATTTGTGCAT 1394 ||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||||||*|||||||| 1250 GTCGCCGTCAAATAGTGGTAGGGCTTCAGATCCAGGAAGCACTTGTGCAT 1299 1395 CAGCAGTGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATGATCCGTATTTGGGTCA 1444 |||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||||||| 1300 CAGCAGTGCTTTCTTCAACCCGTGGTTGAACATTATGCGTATTTGGGTCA 1349 1445 CATACATCTGGGATTCTGGACGAATTAGACGGTGCTGCATGATCTTGAAA 1494 |||||||||||||**|||***|||||*||||||||||||||||||||||| 1350 CATACATCTGGGACCCTGCTTGAATTTGACGGTGCTGCATGATCTTGAAA 1399 1495 GAGAGGGGATTTCGCACCTCCCAAGTAAAGACGCCATTCCTGAGTTGAGC 1544 |||||||||||||||||||||||**|||||||||||*||||||||||||| 1400 GAGAGGGGATTTCGCACCTCCCAGATAAAGACGCCACTCCTGAGTTGAGC 1449 1545 TGCAGTGATGTTGTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTACGGCAGTTGATA 1594 ||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 1450 TGCAGTGATGTTCTCCCCGGTGCGAAAATCCATAGTTACGACAGTTGATA 1499 1595 TGGATGTAATAACTACACCC-----TTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAAT 1639 |||||*||||||||||||||*****||||||||||||||||||||||||| 1500 TGGATATAATAACTACACCCACACTTTAAATCAATTCGAGAGCGTCGAAT 1549 1640 TGCTCGCTTCTTGGCAACCTTGTGTTGCGCTTTGATCGACGGAGGAGAAA 1689 |||||||||||||||||||*||||||||||*||||||||||||||||||| 1550 TGCTCGCTTCTTGGCAACCCTGTGTTGCGCCTTGATCGACGGAGGAGAAA 1599 1690 AGTGGTTCTTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTTGAAGCCCACAATTT 1739 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1600 AGTGGTTCCTTGAGGGTGTAGAATTCCGCATTCTTGGAAGCCCACAATTT 1649 1740 GAGTGCTGTATTATCAGCCTCGTCCAAGTACTCTTTATAAGAGGATTTTG 1789 |||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||*| 1650 GAGTGCTGTGTTATCAGCCTCGTCCAAGTATTCTTTATAAGAGGACTTGG 1699 1790 GTCCAGGATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATATGAGTG 1839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1700 GTCCAGGATTGCATAAAAAGATGGTGGGGATACCACCTTTAATGTGAGTG 1749 1840 GGCTTCCCGTACTTGACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAA 1889 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1750 GGCTTCCCGTACTTCACGTTAGATTGCCAGTCTCTTTGCGCGCCCATGAA 1799 1890 TTCTTTGAAATGTTTCAAATAATGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTAT 1939 ||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1800 TTCTTTAAAATGTTTCAAATAATGGGGATCAACGTCATCAATGACGTTAT 1849 1940 ACCAAGCATCGTTGGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAA 1989 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1850 ACCAAGCATCGTTTGAATAGATCTTACTGTTAAGATCCAAGTGGCCGCAA 1899 1990 AGATAATTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATTGTTTTACCCGTGCG 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1900 AGATAATTGTGAGGACCTAACGCACGTGCCCACATGGTTTTACCCGTGCG 1949 2040 ACTATCGCCTTCAATCACAATGCTAATCGGTCTTTCCGGC---GCAGCGG 2086 |**||||||||||||||||||||||||||||||*||||||***||||||| 1950 AGAATCGCCTTCAATCACAATGCTAATCGGTCTATCCGGCCGCGCAGCGG 1999 2087 GATGTCTAACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTTGGGACTTTG 2136 |||**||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2000 GATCCCTGACATTTTCTGAAGCCCATGAAGAAATGTAACTGGGGACTTTG 2049 2137 TCAAATGCTGATAAGCTATAAGGTGACACGTAAAGTGGAACTTCATCTGA 2186 ||||||||||||||||||||*||||||||*||**||||||||||||||** 2050 TCAAATGCTGATAAGCTATATGGTGACACATATTGTGGAACTTCATCTAC 2099 2187 AAAAATCCGTGACAAATTACAATTTAAATTATGAAATTGTAAAATATAAT 2236 *|||||***|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 2100 GAAAATTTTTGACAAATTACAATTTAGATTATGAAATTGTAAAATATAAT 2149 2237 CTTTAGGAGCCTTCTCCCTCAGTATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCA 2286 |*||*||||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2150 CCTTTGGAGCCTTTTCCCTCAATATATTGAGGGCCTGTAACTTGGATCCA 2199 2287 CTGTTGAGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCT 2336 **|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2200 GAGTTGAGTGCCTCGGCATAAGCGTCGTTGGCAGACTGTTTACCTCCTCT 2249 2337 AGCTGATCTGCCATCGACTTGGAAACTTCCATGGTCAACGACGTCTCCGT 2386 |||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||*||||||||||| 2250 AGCTGATCTGCCATCGACTTGGAAATTTCCATGATCAAGGACGTCTCCGT 2299 2387 CTTTGTCCATGTATGACTTAACATCTGATGCGCTTTTAGCTGCCTGAACG 2436 ||||||||||||||||*||||||||||*||||||*||||||||||||||| 2300 CTTTGTCCATGTATGATTTAACATCTGTTGCGCTCTTAGCTGCCTGAACG 2349 2437 TTCGGATGGTAATGTGCTGATCTGGTTGAGGAAACCAGGTCGAAGAACCT 2486 |||||||||*||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 2350 TTCGGATGGAAATGTGCTGATCTGGTTGGGGAAACCAGGTCGAAGAACCT 2399 2487 TTCGTTCTTCGTTTGGAACTTCCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGAT 2536 |||||||*||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2400 TTCGTTCCTCGTGTGGAACTTTCCTTCGAATTGAAGCAGAACATGGAGAT 2449 2537 GAGGTTCTCCATCTTCATGAAGTTCACGACAGACTCGGATGAACTTCTTG 2586 ||||||||||||*||||||*||||||||||||||*||||||||||||||| 2450 GAGGTTCTCCATTTTCATGGAGTTCACGACAGACACGGATGAACTTCTTG 2499 2587 TTGACAGGCGTTGATAACGCTAAGAGTTCTTCAAGAGCGTCCTCCTTTCT 2636 ||*|||||||||||||||||||||||||**|||||*||||||||*|||*| 2500 TTTACAGGCGTTGATAACGCTAAGAGTTGCTCAAGTGCGTCCTCTTTTGT 2549 2637 AAGAGGACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGCGTTTATAGCAA 2686 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2550 AAGAGGACAACGGGGATAAGTGAGGAAATAGTTCTTTGCGTTTATAGCAA 2599 2687 AACGACCGAGTCTAGGCATATTTTGGCGTCGTTTTG-------------- 2722 |||||||*||||||||||||||||||*||||||||*************** 2600 AACGACCTAGTCTAGGCATATTTTGGTGTCGTTTTTGTATCGGTGGACAG 2649 -------------------------------------------------- ************************************************** 2650 ACATATAACTCTATATATCGGTGAATCGGTGACCTATATATATGTATTAG 2699 2723 -------------------------------------T 2723 *************************************| 2700 AGTTACTAAAACCCTCAGGGGTCCTCAGCAATAATATT 2737