NC_001933 AJ575821 1 TTCTC-TCTCCGCAATCGGTACTCAGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTA 49 **|***|**||||***|****||***||*||****|||||****|*||*| 1 ACCGGATGGCCGCGCCCCCCTCTTT-ATGGTGGCCCCCCCCACGTTGGGA 49 50 ---CTCAATATATACATGAGTACCAAATGGCATAG-ATGTAAATAATGGG 95 ***|*|**|*|****|*|***||*|*|*|||**|**||||***|**|||* 50 TGTCCCCCTCTCACAACGCTCACTAGAAGGCTCAACATGT---TGGTGGC 96 96 AATATAATTTGAATTGAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTACCGGATGGC 145 ***|**||*|***||**||**||*|******|||||**||***|**|*|* 97 CCCACGATGTTGTTTATAA--CGTC------TATAACGTTTGAGACTCGA 138 146 CGCGCCCCCCTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCC 195 *||**********||*||*||*******||||||**|||*********|* 139 AGC----------TTGTGATG-------CCACGT--ATG---------CG 160 196 CTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCGCTTTATG 245 *|*|||*|**|**||**|*|*|*||**|||***|*|**|||*|**|***| 161 TTATTTGTACT--TCGTCTCGAAGTT-ATGAGTGAGGGCCCTGTATGTGG 207 246 GTGGCCCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAG 295 *|**|***||*||**|*|***|||**********|||*|***|*|*|||* 208 ATATCTAACCGCATATTG---TGT----------GAATG---GATTAAAC 241 296 CTTGTATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACAAGTCGTCGCC 345 *|*|*|******||****||*||||*****|||||*|**|**|******* 242 GTGGCAAGATCATG----CCGTTTA-----TTGGGAACTATAT------- 275 346 TGTACAATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTTCCTGAGTCTGTCCACGG 395 **||**|||**|****||*||*||*|*********|**||*||||***|* 276 --TATTATGCTGTTGTCTATA-TATA---------TAGGTATGTC---GT 310 396 TTTCCGGAGATCTTGCACATGGTGATTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTAT 445 *||*|||||||||*||||||||||*|*||||||||||||||||||||||| 311 GTTTCGGAGATCT-GCACATGGTGGTGTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTAT 359 446 ACCCCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGG 495 ||||||||||||||||||||**|||||||||||||||||||||||||||| 360 ACCCCCCGTTCTACTCCATTTTCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGG 409 496 TAAGGGTAGATCATTTCGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCAT 545 ||||||||*||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 410 TAAGGGTAAATCATTTCGTTCTTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCAT 459 546 TAGCTCGTCGGAATCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTAT 595 ||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 460 TAGCCCGTCGGAACCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTAT 509 596 AAGACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAA 645 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 510 AAGACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGATTTTACCATACATAATAA 559 646 TAATTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGTTAAAACACGTGCCCTTA 695 ||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||||| 560 TAATTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGCCAAAACACGTGCCCTTA 609 696 GCGATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACA 745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 610 GCGATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACA 659 746 GGTACAGTGTGTATAAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAAT 795 ||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||| 660 GGTACAGTGTGTATTAAAAACAGCCAGATGGAATCTGACGGAAGCCCAAT 709 796 GTTGGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCC 845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 710 GTTGGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCC 759 846 CCCGTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTT 895 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 760 CTCGTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTT 809 896 GGGTCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAA 945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 810 GGGTCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAA 859 946 GGATCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCATACCCAGTTAATACGGAGA 995 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 860 GGATCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCTTACCCAGTTAATACGGAGA 909 996 AGGGTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGGTGGTAGA 1045 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*||||||| 910 AGGGTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGACGTTTTGTTGGTAGA 959 1046 TACCCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATC 1095 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 960 TACCCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATC 1009 1096 GGGATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTAT 1145 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1010 GGGATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTAT 1059 1146 GGCTCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACT 1195 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1060 GGCTCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACT 1109 1196 CGATATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGATACATGGCTCTG 1245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1110 CGATATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGATACATGGCTCTG 1159 1246 CATACTCGTATTTAAACATATATTTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTA 1295 ||||||||||||||||||*||||*|||||||||||||||||||||||||| 1160 CATACTCGTATTTAAACACATATGTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTA 1209 1296 AGTCCTCTCGTGTGAATTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCT 1345 ||||||||||||||||*|*|||||||||||*||||||||||||||||||| 1210 AGTCCTCTCGTGTGAAGTTGTCCGATCCTATTTGTGATACTGACTTTCCT 1259 1346 GGGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGTTGTAAGGCCTTTC 1395 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|||| 1260 GGGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGCTGTAAGGCTTTTC 1309 1396 AATGGATG-CCCAGCCTCGCTCTTTAACGGCCCATGGCTCGTGAAGCCCA 1444 |||*||||*||||||*||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1310 AATTGATGGCCCAGCTTCGCTCTT-AACGGCCCATGGCTCGTGAAGCCCA 1358 1445 AGCTCGCTTCTAACGGCCCAGGATTCATTTGGGCCTATTGAACATGGAGC 1494 |*||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||| 1359 ACCTCGCTTCTAACGGCCCATGATTCATTGGGGCCTATTGAACATGGAGC 1408 1495 ATATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCC 1544 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1409 ATATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCC 1458 1545 TCTGCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTG 1594 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1459 TCTGCTGGGGTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTG 1508 1595 AAGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATT 1644 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1509 AAGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATT 1558 1645 AGGACTGCGTTTGCAGTTGACCAGCTTGAGTTTTCCTTGTATACGGCAGA 1694 ||*|||||*||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||| 1559 AG-ACTGC-TTTGCAGTTGAC-AGCTTGAGTTTTCCCTGTATACGGCAGA 1605 1695 AGTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTC 1744 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1606 AGTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTC 1655 1745 CATGGGTTTATGTCCTTCATGGTAGAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAG 1794 ||||||||||||||*|||||||***||||||||||||||||||||||||| 1656 CATGGGTTTATGTCTTTCATGGAGAAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAG 1705 1795 GTTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTC 1844 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1706 GTTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCTGCCTGTTTTGAGTCTC 1755 1845 CGTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGTCCAGTGGCG 1894 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||| 1756 CGTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGCCCTGTGGCG 1805 1895 TTAATGGGTACCTGGTTTCTATATTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCA 1944 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1806 TTAATGGGTACCTGGTTTCTATACTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCA 1855 1945 GCAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGC 1994 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1856 GCAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAAC 1905 1995 TCAACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCG 2044 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1906 TCAACTTGACGTCGGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCG 1955 2045 GAACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCA-- 2092 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||** 1956 GAACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCAGG 2005 2093 ---AATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCA 2139 ***||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2006 GGAAATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCA 2055 2140 TAAAGCAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATAT 2189 ||||||||||||||*|||*|||||||||||*||||||||||||||||||| 2056 TAAAGCAAAGCCCAGAGCTTAATAAATAGCGAAAGGCATATATATTATAT 2105 2190 TATTGATGAAAGGGTATAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACAT 2239 |||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2106 TATTGATGAAAGGTTACAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACAT 2155 2240 GAAA-GCTATACAATATATTTAAAAATAGTTGCTGACGACGTCATCCTTC 2288 ||||*|||||||||||||||||*|||*|||||*|||||||||||||*||| 2156 GAAAAGCTATACAATATATTTATAAAAAGTTG-TGACGACGTCATC-TTC 2203 2289 AACGAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACTCTGGTTAAGC 2338 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||||||||| 2204 AACGAATGGAACCGGAAACCCTAATGCATCTCTGATGACTCTGGTTAAGC 2253 2339 CCTCTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTG 2388 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2254 CCTCTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTG 2303 2389 AGTTTGTAACCCCAATCTTCTATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATC 2438 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 2304 AGTTTGTAACCCCAATCTTCCATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATC 2353 2439 TATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGG 2488 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*| 2354 TATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAAATGGAGGTAATATG 2403 2489 AATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCT------------- 2525 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||************* 2404 AATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGGTTGATGTCTGCTAGTAGTTTTGAAT 2453 2526 --------GATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCACGCACATTT 2567 ********||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||| 2454 TCGACCCAGATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCGCACACATTT 2503 2568 CTTGCTTTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAA 2617 ||||||*||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2504 CTTGCTGTGTTGCAAGAAGGAATAGGTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAA 2553 2618 TGAGAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGAT---------------------- 2645 ||||||||||||||||||||||||||||********************** 2554 TGAGAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGATTTCTCTCTCCTCAATTGGAGAC 2603 -------------------------------------------------- ************************************************** 2604 ACCCCTGAGCAAGTCTCTAGTGAATTGGAGACAATATATATGTGTCTCCA 2653 -------------------------------------------------- ************************************************** 2654 AATGGCATTCTCGTAATTCTCAAAAGTTACAGTCAAATTTCAAATTCGAA 2703 ----------------------------------- *********************************** 2704 TTTGAGATCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTA 2738