NC_001933 AJ575820 1 TTCTC-TCTCCGCAATCGGTACTCAGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTA 49 **|***|**||||***|**|**|*|****|*****||||||**||*||** 1 ACCGGATGGCCGCGCCCCCTCTTTATGGTGGCCC-CCCCCACGTTGGGAT 49 50 CTCAATATAT-ACAT-GAGTACCAAATGGCATAG-ATGTAAATAATGGGA 96 *||****|*|*|||**|*|*||*|***||***|**||||***|**|||** 50 GTCCCCCTCTCACAACGCGCACTAGGAGGTTCAACATGT---TGGTGGCC 96 97 ATATAATTTGAATTGAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTACCGGATGGCC 146 **|**||*|***||**||**||*|******|||||**||***|**|*|** 97 CCACGATGTTGTTTATAA--CGTC------TATAACGTTTGAGACTCGAA 138 147 GCGCCCCCCTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCC 196 ||***********|*||*||*******||||||**|||*********|** 139 GCA----------TGTGATG-------CCACGT--ATG---------CGT 160 197 TCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCGCTTTATGG 246 |*|||*|**|**||**|*|*|*||*********************||||* 161 TATTTGTACT--TCGTCTCGAAGT---------------------TATGA 187 247 TGGCCCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAGC 296 **|****|||*|*|||**|||*|||**|*|*||*|**|**||***||*|* 188 GTGAGGGCCCTATGTGTGGATATCCAAC-CGCATATGGTGCG---AATGG 233 297 TTGTATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACAAGTCGTCGCCT 346 *|*||*|*|||*******|*|*|***|**|||||****|**|******** 234 AT-TAAACGTGGCAAGATCATGTCGTTTATTGGGAGCTATAT-------- 274 347 GTACAATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTTCCTGAGTCTGTCCACGGT 396 *||**|||*||****||*||*||*|*********||*||*||||***|** 275 -TATTATGCGGTTGTCTATA-TATA---------TGGGTATGTC---GTG 310 397 TTCCGGAGATCTTGCACATGGTGATTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTATA 446 ||*|||||||||*||||||||||*|||*|||||||||||||||||||||| 311 TTTCGGAGATCT-GCACATGGTGGTTTAAGGATGAGAAGAGGTGCCTATA 359 447 CCCCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGT 496 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 360 CCCCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGT 409 497 AAGGGTAGATCATTTCGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCATT 546 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 410 AAGGGTAGATCATTTCGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCAGTTCGTCCATT 459 547 AGCTCGTCGGAATCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATA 596 ||||||||||||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 460 AGCTCGTCGGAACTTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATA 509 597 AGACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAAT 646 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 510 AGACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAAT 559 647 AATTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGTTAAAACACGTGCCCTTAG 696 |||||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||||||||| 560 AATTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGCCAAAACACGTGCCCTTAG 609 697 CGATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAG 746 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 610 CGATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAG 659 747 GTACAGTGTGTATAAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAATG 796 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 660 GTACAGTGTGTATAAAAAACAGTCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAATG 709 797 TTGGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCCC 846 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 710 TTGGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGGCCCC 759 847 CCGTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTTG 896 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 760 TCGTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTTG 809 897 GGTCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAG 946 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 810 GGTCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAG 859 947 GATCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCATACCCAGTTAATACGGAGAA 996 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 860 GATCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCTTACCCAGTTAATACGGAGAA 909 997 GGGTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGGTGGTAGAT 1046 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||| 910 GGGTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGTTGGAAGAT 959 1047 ACCCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCG 1096 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 960 ACCCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCG 1009 1097 GGATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATG 1146 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1010 GGATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATG 1059 1147 GCTCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTC 1196 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1060 GCTCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTC 1109 1197 GATATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGATACATGGCTCTGC 1246 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1110 GATATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGATACATGGCTCTGC 1159 1247 ATACTCGTATTTAAACATATATTTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTAA 1296 |||||||||||||||||*||||*||||||||||||||||||||*||*||| 1160 ATACTCGTATTTAAACACATATCTACTGTCTTGCTGATGATGTTGTGTAA 1209 1297 GTCCTCTCGTGTGAATTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCTG 1346 |||||||||||||||*||||||*|||||||*||||||||||||||||||| 1210 GTCCTCTCGTGTGAAGTGGTCCAATCCTACCTGTGATACTGACTTTCCTG 1259 1347 GGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGTTGTAAGGCCTTTCA 1396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1260 GGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGCTGTAAGGCCTTTCA 1309 1397 ATGGATG-CCCAGCCTCGCTCTTTAACGGCCCATGGCTCGTGAAGCCCAA 1445 ||*||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||| 1310 ATTGATGGCCCAGCCTCGCTCTT-AACGGCCCATGGCTCGTTAAGCCCAA 1358 1446 GCTCGCTTCTAACGGCCCAGGATTCATTTGGGCCTATTGAACATGGAGCA 1495 *||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||| 1359 CCTCGCTTCTAACGGCCCATGATTCATTTGGTCCTATTGAACATGGAGCA 1408 1496 TATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCCT 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1409 TATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCCTGGACCAGTTTCCT 1458 1546 CTGCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTGA 1595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**||||||||| 1459 CTGCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCTTTCTCAGTGA 1508 1596 AGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATTA 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1509 AGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCAGTA 1558 1646 GGACTGCGTTTGCAGTTGACCAGCTTGAGTTTTCCTTGTATACGGCAGAA 1695 |*|||||*||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||| 1559 G-ACTGC-TTTGCAGTTGAC-AGCTTGAGTTTTCCCTGTATACGGCAGAA 1605 1696 GTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTCC 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1606 GTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACTCTGTACATAACCCTCC 1655 1746 ATGGGTTTATGTCCTTCATGGTAGAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGG 1795 |||||||||||||||||||||***|||||||||||||||||||||||||| 1656 ATGGGTTTATGTCCTTCATGGAGAAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGG 1705 1796 TTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTCC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1706 TTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTCC 1755 1846 GTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGTCCAGTGGCGT 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 1756 GTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGCCCTGTGGCGT 1805 1896 TAATGGGTACCTGGTTTCTATATTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAG 1945 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1806 TAATGGGTACCTGGTTTCTATACTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAG 1855 1946 CAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGCT 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1856 CAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGCT 1905 1996 CAACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGG 2045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1906 CAACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGG 1955 2046 AACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCA--- 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*** 1956 AACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCAGGG 2005 2093 --AATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCAT 2140 **|||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2006 GAAATGCTTAATAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCAT 2055 2141 AAAGCAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATT 2190 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2056 AAAACAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATT 2105 2191 ATTGATGAAAGGGTATAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACATG 2240 ||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2106 ATTGATGAAAGGTTACAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACATG 2155 2241 AAA-GCTATACAATATATTTAAAAATAGTTGCTGACGACGTCATCCTTCA 2289 |||*|||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||| 2156 AAAAGCTATACAATATATTTAAAAAAAGTTG-TGACGACGTCATC-TTCA 2203 2290 ACGAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACTCTGGTTAAGCC 2339 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2204 ACGAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACGCTGGTTAAGCC 2253 2340 CTCTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTGA 2389 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2254 CTCTAGTAGTATGTTACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTGTTGA 2303 2390 GTTTGTAACCCCAATCTTCTATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATCT 2439 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2304 GTTTGTAACCCCAATCTTCCATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATCT 2353 2440 ATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGGA 2489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2354 ATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGGA 2403 2490 ATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCT-------------- 2525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||************** 2404 ATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCTAGTAGTTTTGAATT 2453 2526 -------GATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCACGCACATTTC 2568 *******||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||*||||| 2454 CGACCCAGATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCGCACATATTTC 2503 2569 TTGCTTTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAAT 2618 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2504 TTGCTGTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAAT 2553 2619 GAGAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGAT----------------------- 2645 ||||||||||||||||||||*||||||*********************** 2554 GAGAATGATGTTGGGTTTAAATGGGATTTCTCTCTCCGCAATCGGTACTC 2603 -------------------------------------------------- ************************************************** 2604 AGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTACTCAATATATACATGAGTACCAAA 2653 -------------------------------------------------- ************************************************** 2654 TGGCATAGATGTAAATAATGGGAATATAATTTGAATTCAAAAGCGGCCAT 2703 ------------ ************ 2704 CCGTATAATATT 2715