NC_001933 AJ512823 1 TTCTC-TCTCCGCAATCGGTACTCAGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTA 49 **|***|**||||***|****||****||***|*||||||********** 1 ACCGGATGGCCGCGCCCCCCTCTT---TATGGTGGCCCCC---------- 37 50 CTCAATATATACATGAGTACCAAATGGCATAGATGTAAATAATGGGAATA 99 |*||****||****|*|**||*******||*|**|**********|**** 38 CCCACCGGATGGCCGCGCCCCTCTCTTTATGGTGGCCCCCCCCACGTTGG 87 100 TAATTTGAATTGAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTACCGGATGGCCGCG 149 *|**|*****|***|****||**||**||**|**||*|***|||***|*| 88 GATGTCCCCCTCTCACAACGC--TCACTAGGAGGTT-CAACATGTTGGTG 134 150 CCCCCCTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCTCT 199 *||||****|**||*|**|**|**|*|****|*|*|***|*|****|*** 135 GCCCCACGATGTTGTTTATAACGTCTATAACGTTTGAGACTCGAAGCATG 184 200 TTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCGCT-TTATGGTG 248 |*|||*****|*|*****|||***|*|*****|**|*||***|||||*** 185 TGATGC----CACGTATGCGTTATTAGTACTTCGTCTCGAAGTTATGAGT 230 249 GCCCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAGCTT 298 |****|||*|*|||**|||*||***|*|*||*|**|**||***||*|**| 231 GAGGGCCCTATGTGTGGATATCTAAC-CGCATATTGTGCG---AATGGAT 276 299 GTATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACAAGTCGTCGCCTGT 348 *||*|*|||*******|*|*****|**|||||*|**|**|*********| 277 -TAAACGTGGCAAGATCATGCCGTTTATTGGGAACTATAT---------T 316 349 ACAATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTTCCTGAGTCTGTCCACGGTTT 398 |**|||**|****||*||*||*|*********||*||*||||***|**|| 317 ATTATGCTGTTGTCTATA-TATA---------TGGGTATGTC---GTGTT 353 399 CCGGAGATCTTGCACATGGTGATTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTATACC 448 *|||||||||*||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 354 TCGGAGATCT-GCACATGGTGGTTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTATACC 402 449 CCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGTAA 498 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 403 CCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGTAA 452 499 GGGTAGATCATTTCGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCATTAG 548 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 453 GGGTAGATCATTACGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCATTAG 502 549 CTCGTCGGAATCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATAAG 598 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 503 CTCGTCGGAACCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATAAG 552 599 ACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAATAA 648 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 553 ACCTTGTCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAATAA 602 649 TTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGTTAAAACACGTGCCCTTAGCG 698 |||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||||||||||| 603 TTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGCCAAAACACGTGCCCTTAGCG 652 699 ATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAGGT 748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 653 ATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAGGT 702 749 ACAGTGTGTATAAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAATGTT 798 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 703 ACAGTGTGTATAAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAATGTT 752 799 GGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCCCCC 848 |||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 753 GGGCCCGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCCCTC 802 849 GTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTTGGG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 803 GTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCGTTCCCACAGTTGTTTGGG 852 899 TCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAGGA 948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 853 TCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAGGA 902 949 TCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCATACCCAGTTAATACGGAGAAGG 998 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 903 TCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCTTACCCAGTTAATACGGAGAAGG 952 999 GTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGGTGGTAGATAC 1048 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 953 GTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGTTGGTAGATAC 1002 1049 CCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCGGG 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1003 CCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCGGG 1052 1099 ATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATGGC 1148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1053 ATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATGGC 1102 1149 TCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTCGA 1198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1103 TCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTCGA 1152 1199 TATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTG-ATACATGG-CTCTGC 1246 ||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||||||||*|||||| 1153 TATATTGGTTAATAAAAATGGTATACATTTTTTGGATACATGGGCTCTGC 1202 1247 ATACTCGTATTTAAACATATATTTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTAA 1296 ||||||||||*||||||*||||||||||||||||||||||||*||*|||| 1203 ATACTCGTATGTAAACACATATTTACTGTCTTGCTGATGATGGCGCTTAA 1252 1297 GTCCTCTCGTGTGAATTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCTG 1346 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1253 GTCCTCTCGTGTGAAGTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCTG 1302 1347 GGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGTTGTAAGGCCTTTCA 1396 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1303 GGTCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGCTGTAAGGCCTTTCA 1352 1397 ATGGATG-CCCAGCCTCGCTCTTTAACGGCCCATGGCTCGTGAAGCCCAA 1445 ||*||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||| 1353 ATTGATGGCCCAGCCTCGCTCTT-AACGGCCCATGGCTCGTTAAGCCCAA 1401 1446 GCTCGCTTCTAACGGCCCAGGATTCATTTGGGCCTATTGAACATGGAGCA 1495 *|*||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1402 CCGCGCTTCTAACGGCCCATGATTCATTTGGGCCTATTGAACATGGAGCA 1451 1496 TATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCCT 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1452 TATCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCCT 1501 1546 CTGCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTGA 1595 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1502 CTGCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTGA 1551 1596 AGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATTA 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||| 1552 AGGCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGAGCGGAATTGTATGTCATTA 1601 1646 GGACTGCGTTTGCAGTTGACCAGCTTGAGTTTTCCTTGTATACGGCAGAA 1695 |*|||||*|||||||||||**||||||||||||||*|||||||||||||| 1602 G-ACTGC-TTTGCAGTTGAT-AGCTTGAGTTTTCCCTGTATACGGCAGAA 1648 1696 GTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTCC 1745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1649 GTGGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTCC 1698 1746 ATGGGTTTATGTCCTTCATGGTAGAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGG 1795 |||||||||||||||||||||***|||||||||||||||||||||||||| 1699 ATGGGTTTATGTCCTTCATGGAGAAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGG 1748 1796 TTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTCC 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1749 TTGCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTCC 1798 1846 GTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGTCCAGTGGCGT 1895 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||| 1799 GTCATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGCCCTGTGGCGT 1848 1896 TAATGGGTACCTGGTTTCTATATTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAG 1945 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1849 TAATGGGTACCTGGTTTCTATACTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAG 1898 1946 CAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGCT 1995 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1899 CAGTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGCT 1948 1996 CAACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGG 2045 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 1949 CAACTTGACGTCTGTTGAGTCATTTGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGG 1998 2046 AACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCA--- 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*** 1999 AACGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCAGGG 2048 2093 --AATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCAT 2140 **|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2049 GAAATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCAT 2098 2141 AAAGCAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATT 2190 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2099 AAAGCAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATT 2148 2191 ATTGATGAAAGGGTATAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACATG 2240 ||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2149 ATTGATGAAAGGTTACAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATGAAATACATG 2198 2241 AAA-GCTATACAATATATTTAAAAATAGTTGCTGACGACGTCATCCTTCA 2289 |||*|||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||| 2199 AAAAGCTATACAATATATTTAAAAAAAGTTG-TGACGACGTCATC-TTCA 2246 2290 ACGAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACTCTGGTTAAGCC 2339 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2247 ACGAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACTCTGGTTAAGCC 2296 2340 CTCTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTGA 2389 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2297 CTCTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTGA 2346 2390 GTTTGTAACCCCAATCTTCTATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATCT 2439 |||||||*|||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||||| 2347 GTTTGTAGCCCCAATCTTCCATTTTGAAAGCCATATGTATGGCTCTATCT 2396 2440 ATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGGA 2489 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2397 ATTTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGGA 2446 2490 ATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCT-------------- 2525 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||************** 2447 ATTTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCTAGTAGTTTTGAATT 2496 2526 -------GATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCACGCACATTTC 2568 *******|||||||||||||*||||||||||||||||||*|*|||||||| 2497 CGACCCAGATCGAATTCTTCGTAATGCGACTGGATAGTCGCACACATTTC 2546 2569 TTGCTTTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAAT 2618 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2547 TTGCTGTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAAT 2596 2619 GAGAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGAT----------------------- 2645 |||||||||||||||||||||||||||*********************** 2597 GAGAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGATTTCTCTCTCCGCAATCGGTACTC 2646 -------------------------------------------------- ************************************************** 2647 AGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTACTCAATATATACATGAGTACCAAA 2696 -------------------------------------------------- ************************************************** 2697 TGGCATAGATGTAAATAATGGGAATATAATTTGAATTCAAAAGCGGCCAT 2746 ------------ ************ 2747 CCGTATAATATT 2758