NC_001933 AJ314740 1 TTCTC-TCTCCGCAATCGGTACTCAGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTA 49 **|***|**||||***|****||**|*|*||**|*|||*|********** 1 ACCGGATGGCCGCGCCCCCCGCTTTG-TGGTGGACCCCTC---------- 39 50 CTCAATATATACATGAGTACCAAATGGCATAGATGTAAATAATGGGAATA 99 |*|*|**|**|*|||****|||*****||*|****|*|*||***||***| 40 CCCCACGTGGAGATGTCCCCCACT---CAGAACGCTCACTAGGAGGTTCA 86 100 TAATTTGAATTGAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTACCGGATGGCCGCG 149 **||*|***|*|*****||****|***|||||**|******|*|*|*|*| 87 ACATGTTGGTGGCCCCACGATGTTGTTTATAACGTCTATA-ACGTCTGAG 135 150 CCCCCCTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCTCT 199 *|*||****||*||*||*******||||||**|||************|*| 136 ACTCCAAGCTTGTGATG-------CCACGT--ATG------------TGT 164 200 TTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCGCTTTATGGTGG 249 |**|*||**|*|**|*|*****||*|***************|||||***| 165 TATTTGTACTTCGTCTC-----GAAG---------------TTATGAGTG 194 250 CCCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAGCTTG 299 ****|||*|*|||**|||*||***|*|*||*|**|**||***||*|**|* 195 AGGGCCCTATGTGTGGATATCTAAC-CGCATATTGTGCG---AATGGAT- 239 300 TATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACA-AGTCGTCGCCTGT 348 ||*|*|||*******|*|*****|**|||||*|**|*|*|**|**||||| 240 TAAACGTGGCAAGATCATGCCGTTTATTGGGAACTATATTATTATCCTGT 289 349 ACAATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTTCCTGAGTCTGTCCACGGTTT 398 ****|||******||*||*||*|*********||*||*||||***|**|| 290 ----TGT------CTATA-TATA---------TGGGTATGTC---GTGTT 316 399 CCGGAGATCTTGCACATGGTGATTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTATACC 448 *|||||||||*||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 317 TCGGAGATCT-GCACATGGTGGTTTCAGGATGAGAAGAGGTGCCTATACC 365 449 CCCCGTTCTACTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGTAA 498 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 366 CCCCGTTCTAGTCCATTCCCTCGTGACCGGAGATCGTATAATGCCGGTAA 415 499 GGGTAGATCATTTCGTTCGTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCATTAG 548 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 416 GGGTAGATCATTTCGTTCTTACCGTCGTCGTGGACCTGTTCGTCCATTAG 465 549 CTCGTCGGAATCTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATAAG 598 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 466 CTCGTCGGAAACTGTTTGGTGATGACCATGCACGTGCATTCACGTATAAG 515 599 ACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATACATAATAATAA 648 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 516 ACCTTATCGGAGGATCAATTTGGACCGGACTTTACCATGCATAATAATAA 565 649 TTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGTTAAAACACGTGCCCTTAGCG 698 |||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||||||||||| 566 TTATAAGTCATCGTATATATCTATGCCTGCCAAAACACGTGCCCTTAGCG 615 699 ATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAGGT 748 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 616 ATAACAGGGTAGGTGATTATATCAAACTTGTAAATATATCATTTACAGGT 665 749 ACAGTGTGTATAAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGCCCAATGTT 798 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||**||||||| 666 ACAGTGTGTATTAAAAACAGCCAGATGGAGTCTGACGGAAGTTCAATGTT 715 799 GGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCCCCC 848 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 716 GGGCCTGCATGGGCTGTTTACTTGTGTATTGGTCCGGGATAAGACCCCTC 765 849 GTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTTGGG 898 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 766 GTATATATTCTGCCACTGAGCCTTTGATACCTTTCCCACAGTTGTTTGGG 815 899 TCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAGGA 948 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 816 TCCATAAACGCGAGCTATGCGGATTTGTCTATACAAGACCCATATAAGGA 865 949 TCGGTTCACAGTTATCCGTCAGGTGTCATACCCAGTTAATACGGAGAAGG 998 |||||||||||||||||||||*|||||*|||**||||||||||||||||| 866 TCGGTTCACAGTTATCCGTCATGTGTCTTACTTAGTTAATACGGAGAAGG 915 999 GTGATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTCGTTTTGGTGGTAGATAC 1048 ||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||||||| 916 GTTATCATATGTGTCGTTTCAAAGGCACTCGTTGTTTTGTTGGTAGATAC 965 1049 CCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCGGG 1098 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 966 CCTATCTGGACTAGTTTTAAAGATGATGGTGGCAGTGGAGATTCATCGGG 1015 1099 ATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATGGC 1148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1016 ATTATATAGTAATACGTATAAAAATGCCATACTTGTATATTATGTATGGC 1065 1149 TCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTCGA 1198 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1066 TCAGCGACGTATCGTCACAATTGGAAATGTATTGTAAATATGTAACTCGA 1115 1199 TATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTTGATACATGGCTCTGCAT 1248 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 1116 TATATTGGTTAATAAAAATGTTATACATTTTTGGATACATGGCTCTGCAT 1165 1249 ACTCGTATTTAAACATATATTTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTAAGT 1298 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 1166 ACTCGTATTTAAACACATATTTACTGTCTTGCTGATGATGTCGTTTAAGT 1215 1299 CCTCTCGTGTGAATTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCTGGG 1348 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1216 CCTCTCGTGTGAAGTGGTCCGATCCTACTTGTGATACTGACTTTCCTGGG 1265 1349 TCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGTTGTAAGGCCTTTCAAT 1398 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1266 TCCAATGCGTCTGGGTTGAGCCGGTTTAGTTGGCTGTAAGGCCTTTCAAT 1315 1399 GGATG-CCCAGCCTCGCTCTTTAACGGCCCATGGCTCGTGAAGCCCAAGC 1447 *||||*|||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*| 1316 TGATGGCCCAGCCTCGCTCTT-AACGGCCCATGGCTCGTTAAGCCCAATC 1364 1448 TCGCTTCTAACGGCCCAGGATTCATTTGGGCCTATTGAACATGGAGCATA 1497 *||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||| 1365 GCGCTTCTAACGGCCCATGATTCATTTGGGCCTATGGAACATGGAGCATA 1414 1498 TCTCATGGATCTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCCTCT 1547 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1415 TCTCATGGATTTGGATCCTATTAGACTTGGGCCTTGGACCAGTTTCCTCT 1464 1548 GCTGGGCTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTGAAG 1597 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1465 GCTGGGTTTTCCGACCCACTGACCAGAAATCAATGTCCCTCTCAGTGAAG 1514 1598 GCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATTAGG 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1515 GCCTTGCTCAGTATCTCGATTTTGGGAGATCGGAACTGTATGTCATTAG- 1563 1648 ACTGCGTTTGCAGTTGACCAGCTTGAGTTTTCCTTGTATACGGCAGAAGT 1697 |||||*||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||| 1564 ACTGC-TTTGCAGTTGAC-AGCTTGAGTTTTCCCTGTATACGGCAGAAGT 1611 1698 GGACCCCGTTGATGACGTTTGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTCCAT 1747 ||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1612 GGACTCCGTTGATGACGTTGGTGTCTACGACCCTGTACATAACCCTCCAT 1661 1748 GGGTTTATGTCCTTCATGGTAGAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGGTT 1797 |||||||||||||||||||***|||||||||||||||||||||||||||| 1662 GGGTTTATGTCCTTCATGGAGAAGAACGATGAAGAATAGTAGTGAAGGTT 1711 1798 GCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCAGCCTGTTTTGAGTCTCCGT 1847 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||| 1712 GCAGTTGCATTGGACGGGAATAGTAAATTCTGCCTGTTTTGAGTCCCCGT 1761 1848 CATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGTCCAGTGGCGTTA 1897 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||||||||| 1762 CATGCAGTCTTTGGTCGTGAATTTCAATGATGACATGCCCTGTGGCGTTA 1811 1898 ATGGGTACCTGGTTTCTATATTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAGCA 1947 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1812 ATGGGTACCTGGTTTCTATACTCTAGGACGATGTGGTCTATTTTGCAGCA 1861 1948 GTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGAAGAGATGGAAAGCTCA 1997 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1862 GTGACCCTTGAGGAGCGATATTTTGTTATCCAGGAGAGATGGAAAGCTCA 1911 1998 ACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGGAA 2047 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1912 ACTTGACGTCTGTTGAGTCATTGGTTAACTCATATTCAACTCTTTCGGAA 1961 2048 CGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATTGGCCCCGCA----- 2092 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||***** 1962 CGAAGATACGCTGCATTGCTACTATTATTCTCCATAGGCCCCGCAGGGGA 2011 2093 AATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGCATAA 2142 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2012 AATGCTTAAAAATTAAGCCCAGTGCAGAAGAAATAATTTAATGTGTATAA 2061 2143 AGCAAAGCCCAAAGCGTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATTAT 2192 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2062 AGCAAAGCCCAAAGCTTAATAAATAGCTAAAGGCATATATATTATATTAT 2111 2193 TGATGAAAGGGTATAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACATGAA 2242 ||||||||||**|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2112 TGATGAAAGGTCACAAGAGCATCCACGTGGCAGTGGATTAAATACATGAA 2161 2243 A-GCTATACAATATATTTAAAAATAGTTGCTGACGACGTCATCCTTCAAC 2291 |*|||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||*|||||| 2162 AAGCTATACAATATATTTAAAAAAAGTTG-TGACGACGTCATC-TTCAAC 2209 2292 GAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCTGAGGACTCTGGTTAAGCCCT 2341 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 2210 GAATGGAACCGGAAACCCTAATCCATCTCCGAGGACTCTGGTTAAGCCCT 2259 2342 CTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATTTTTGAGT 2391 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2260 CTAGTAGTATGTCACATGTTTCCGGTGTCATGTGGTAGTAATATTTGAGT 2309 2392 TTGTAACCCCAATCTTCTATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATCTAT 2441 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 2310 TTGTAACCCCAATCTTCCATTTTGAAGGCCATATGTATGGCTCTATCTAT 2359 2442 TTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAATTGGAGGTAATAGGAAT 2491 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 2360 TTCTGGTAACAGATCCATATCTTGTTCTTCGAAGTGGAGGTAATAGGAAT 2409 2492 TTGAACCAGTCGCGATGTAAGATTGATGTCTGCT---------------- 2525 |*|||||||||||||||*|||*||||||||*|||**************** 2410 TGGAACCAGTCGCGATGGAAGGTTGATGTCGGCTAGTAGTTTTGAATTCG 2459 2526 -----GATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCACGCACATTTCTT 2570 *****||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||| 2460 ACCCAGATCGAATTCTTCATAATGCGACTGGATAGTCGCACACATTTCTT 2509 2571 GCTTTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAATGA 2620 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2510 GCTGTGTTGCAAGAAGGAATAGTTAGTTTGGGAAGACATAGGAAGAATGA 2559 2621 GAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGAT------------------------- 2645 |||||||||||||||||||||||||************************* 2560 GAATGATGTTGGGTTTAAGTGGGATTTCTCTCTCCTCAATCGGTACTCAG 2609 -------------------------------------------------- ************************************************** 2610 ATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTACTCAATATATACATGAGTACCAAATG 2659 -------------------------------------------------- ************************************************** 2660 GCATAGATGTAAATAATGGGAATATAATTTGAATTCAAAAGCGGCCATCC 2709 ---------- ********** 2710 GTATAATATT 2719