NC_001932 AY730035 1 TTCTCTCTCCTCAATCGGTACTCAGATAGTTTAGCCCCCATATTAGGTAC 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 TCAATATATACATGAGTACCAAATGGCATAGATGTAAATAATGGAAATAT 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 AATTTGAATTCAAAAGCGGCCATCCGTATAATATTACCGGATGGCCGCGC 150 ***********************************||||||||||||||| 1 -----------------------------------ACCGGATGGCCGCGC 15 151 CCCCCTCTTTATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCTCTT 200 |||||||||||||||||********************************* 16 CCCCCTCTTTATGGTGG--------------------------------- 32 201 TATGGTGGTCCCCCCCACGTGGATGGCCGCGCCCCCCGCTTTATGGTGGC 250 *************************************************| 33 -------------------------------------------------C 33 251 CCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAGCTTGT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 34 CCCCCCCACGTGGAGATGTCCCCCACTCAGAACGCTCGCTCAAAGCTTGT 83 301 ATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACAAGTCGTTGCCTGTAC 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 84 ATATGTGTGGTCCCCCTTTAAGTACTTGGGCAACAAGTTGTTGCCTGTAC 133 351 AATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTCCCTGAGTCTGTCCACGGTTTCC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 134 AATGTGGGACCCTTTACTAAACGAGTTCCCTGAGTCTGTCCACGGTTTCC 183 401 GGTGTATGCTCGCCGTGAAATACCTTCAGCTGGTTGAATGTACTTATTCT 450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 184 GGTGTATGCTCGCCGTGAAATACCTTCAGCTGGTTGAATGTACTTATTCT 233 451 CCTGATACACTCGGTTACGATTTAATTAGAGATTTGTTCTCTGTTATTAG 500 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 234 CCTGATACACTCGGTTACGATTTAATTAGAGATTTGATCTCTGTTATTAG 283 501 GGCGAAGAATTATGTCGAAGCGACCAGCAGATATCATAATTTCTACTCCA 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 284 GGCGAAGAATTATGTCGAAGCGACCAGCAGATATCATAATTTCAACTCCA 333 551 GGCTCGAAGGTTCGTCGCCGTCTGAACTTCGACAGCCCATACAGCAGCCG 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 334 GGCTCGAAGGTTCGTCGCCGTCTGAACTTCGACAGCCCATACAGCAGCCG 383 601 TGCGGCTGTCCCTACTGTCCGCGTCACAAAAAGACAATCCTGGACAAACA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 384 TGCGGCTGTCCCTACTGTCCGCGTCACAAAAAGACAATCCTGGACAAACA 433 651 GACCCATCAATCGGAAGCCCAGGTGGTATCGGATGTATAGAAGCCCAGAT 700 |||||||*||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||| 434 GACCCATGAATCGGAAGCCCAGGTGGTATCGGATATACAGAAGCCCAGAT 483 701 GTTCCTAAGGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTCGAGTCGAG 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 484 GTTCCTAAGGGCTGTGAAGGCCCATGTAAGGTCCAGTCGTTCGAGTCGAG 533 751 ACACGATGTGGTCCATATAGGTAAGGTCATGTGCATCTCTGATGTCACTC 800 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 534 ACACGATGTGGTCCATATAGGTAAGGTCATGTGCATCTCTGACGTCACTC 583 801 GTGGAATTGGGCTTACACATCGGGTGGGTAAGAGGTTTTGCGTTAAGTCC 850 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 584 GTGGAATTGGGCTTACTCATCGGGTGGGTAAGAGGTTTTGCGTTAAGTCC 633 851 ATTTACATCCTGGGCAAGATATGGATGGATGAAAACATTAAGACCAAGAA 900 *||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 634 GTTTACATCCTTGGCAAGATATGGATGGATGAAAACATTAAGACCATGAA 683 901 TCACACGAATAGCGTAATGTTCTTCCTTGTAAGGGATCGTAGGCCTGTTG 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 684 TCACACGAATAGCGTAATGTTCTTCCTTGTAAGGGATCGTAGGCCTGTTG 733 951 ATAAGCCTCAGGATTTTGGTGAAGTATTTAATATGTTTGATAATGAGCCC 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 734 ATAAGCCTCAGGATTTTGGTGAAGTATTTAATATGTTTGATAATGAGCCC 783 1001 AGTACAGCTACCGTGAAGAACATGCATCGTGATCGCTATCAAGTTCTCAG 1050 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 784 AGTACAGCTACTGTGAAGAACATGCATCGTGATCGCTATCAAGTTCTCAG 833 1051 GAAGTGGCATGCCACGGTCACTGGTGGTCAGTATGCGAGCAAGGAGCAGG 1100 |||||||**||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 834 GAAGTGGAGTGCCACTGTCACTGGTGGTCAGTATGCGAGCAAGGAGCAGG 883 1101 CTTTAGTTAGGCGTTTTTTTAGGGTTAATAATTATGTTGTGTATAACCAG 1150 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 884 CTTTAGTTAGGCGTTTCTTTAGGGTTAATAATTATGTTGTGTATAACCAG 933 1151 CAAGAGGCTGGGAAATATGAGAACCATACTGAGAATGCATTAATGTTGTA 1200 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 934 CAAGAGGCTGGGAAATATGAGAACCATACTGAGAATGCGTTAATGTTGTA 983 1201 CATGGCGTGTACTCATGCCTCTAATCCTGTATACGCTACGTTGAAGATTA 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 984 CATGGCGTGTACTCATGCCTCTAATCCTGTATACGCTACGTTGAAGATTA 1033 1251 GAATTTATTTCTATGATTCAGTGAGCAATTAATAAATATTTAATTTTATT 1300 ||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1034 GAATCTACTTCTATGATTCAGTGAGCAATTAATAAATATTTAATTTTATT 1083 1301 AAATTAGACTGCTCAACACGGTCAGTCCCATGGATTACATTGTACAATAC 1350 |||||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||| 1084 AAATTAGACTGCTCAACACTGTTAGTCCCATGGATTACATTGTACAATAC 1133 1351 ATGCTCTACGGCTTTTACAATAGTATTAATACTTATAACTCCTAAGCTAT 1400 ||||||||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1134 ATGCTCTACGGCGTTTACAACAGTATTAATACTTATAACTCCTAAGCTAT 1183 1401 CTAAGTATTTCAATACTTGGGTCTTAAATACCCTCAAGAAACGCCAGGTC 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1184 CTAAGTATTTCAATACTTGGGTCTTAAATACCCTCAAGAAACGCCAGGTC 1233 1451 TGAGGCTGTAAGGTCGTCCAGACCTTGAAATCCATCCAGCATTGATGTAG 1500 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1234 GGAGGCTGTAAGGTCGTCCAGACCTTGAAATCCATCCAGCATTGATGTAG 1283 1501 TCCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGTATCTGGACGGTTATTA 1550 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1284 TCCCAACGCTTTCCTCAGGTTGTGGTTGAATCGTATCTGGACGGTTATTA 1333 1551 TGTCCTGGTTCATTACGAACGGTCTGTTGTCGTGTTGAATGATCTTGAAA 1600 |||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||||| 1334 TGTCCTGGTTCATTACGAACGGTCTGTGGTCGTGCTGAATGATCTTGAAA 1383 1601 TAGAGGGGATTTGGTACCTCCCAGATAAAGACGCCATTCATCGCCTGAGC 1650 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1384 TAGAGGGGATTTGTTACCTCCCAGATAAAGACGCCATTCATCGCCTGAGC 1433 1651 TGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTGTGGCAGTTAATG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1434 TGCAGTGATGAGTTCCCCTGTGCGTGAATCCATGGTTGTGGCAGTTAATG 1483 1701 TGGACGTAGTACGAGCACCCGCAGTTGAGATCTACCCTTTTACGCCGGAT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1484 TGGACGTAGTACGAGCACCCGCAGTTGAGATCTACCCTTTTACGCCGGAT 1533 1751 GCGTTTACGCTTAGCAGCTCTGTGTTGGACCTTGATTGGTACCTGAGTAT 1800 |**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1534 GGCTTTACGCTTAGCAGCTCTGTGTTGGACCTTGATTGGTACCTGAGTAT 1583 1801 AGTGGTCCTTCGAGGGAGATGAAGGTCGCATTTTTCAGAGCCCAGGCTTT 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1584 AGTGGTCCTTCGAGGGAGATGAAGGTCGCATTTTTCAGAGCCCAGGCTTT 1633 1851 TAATGCGCTATTCTTTTCCTCGTCCAGGAATTCTTTATAGCTGGAATTGG 1900 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1634 TAATGCGCTATTCTTTTCTTCGTCCAGGAATTCTTTATAGCTGGAATTGG 1683 1901 GGCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATACCTCCTTTAATTTGAACT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1684 GGCCTGGATTGCAGAGGAAGATAGTGGGAATACCTCCTTTAATTTGAACT 1733 1951 GGCTTACCGTACTTGGTGTTTGATTGCCAGTCC-TCTGGGCCCCCATGAA 1999 |||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1734 GGCTTTCCGTACTTGGTGTTTGATTGCCAGTCCCTCTGGGCCCCCATGAA 1783 2000 TTCTTTTGAAGTGCTTTAGGTAGTGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTG 2049 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1784 TTCTTT-GAAGTGCTTTAGGTAGTGGGGATCGACGTCATCAATGACGTTG 1832 2050 TACCATGCATCATTGTTGTAGACCTTAGGACTTAAATCCAGGTGTCCACA 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1833 TACCATGCATCATTGTTGTAGACCTTAGGACTTAAATCCAGGTGTCCACA 1882 2100 TAGGTAATTATGTGGACCCAATGCACGGGACCACATGGTCTTGCCCGTCC 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1883 TAGGTAATTATGTGGACCCAATGCACGGGACCACATGGTCTTGCCCGTCC 1932 2150 GACTATCGCCTTCGATTACGATTGATTTTGGTCTCAAAGGCCGCGCACGA 2199 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1933 GACTATCGCCTTCGATTACGATTGATCTTGGTCTCAAAGGCCGCGCACGA 1982 2200 CCCATCACGTTTTCGTGGAACCACTCGTCGAGTTCTTCTGGAACTCGGTC 2249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1983 CCCATCACGTTTTCGTGGAACCACTCGTCGAGTTCTCCTGGAACTCGGTC 2032 2250 AAACGAAGAGAGAGGGAAAGGGTTCTCATATGGAGGTGGTGGTTTTGTAA 2299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2033 AAACGAAGAGAGAGGGAAAGGGTTCTCATATGGAGGTGGTGGTTTTGTAA 2082 2300 AAATCCGATCCAGGTTTGAACTGATGTGATGGAAGTCCCTAAGATAATCC 2349 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2083 AAATCCGATCCAGGTTTGAGCTGATGTGATGGAAGTCCCTAAGATAATCC 2132 2350 CTAGGTGCTAATTCTCTAAGGATCTTAAGAGCCTCTGATTTACTGCCGCT 2399 ||||||||||||||*||||||||*||*||||||||||||||||*|||||| 2133 CTAGGTGCTAATTCCCTAAGGATATTTAGAGCCTCTGATTTACAGCCGCT 2182 2400 GTTAAGTGCCGCGGCGTAAGCGTCGTTTGCAGATTGTTGACCCCCTCTGG 2449 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2183 GTTAAGTGCTGCGGCGTAAGCGTCGTTTGCAGATTGTTGACCCCCTCTGG 2232 2450 CTGATCGTCCATCGATCTGAAATGTTCCCCATCTCCAAGTATCACCGTCC 2499 |*||||||||||||||||||||||||||||||**|*|*|||||||||||| 2233 CCGATCGTCCATCGATCTGAAATGTTCCCCATTCCAAGGTATCACCGTCC 2282 2500 TTGTCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTT 2549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2283 TTGTCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTGGATTTAGCTCCCTGAATGTT 2332 2550 TGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGTGATACCAGGTCGAAGAATCGCT 2599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2333 TGGATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGTGATACCAGGTCGAAAAATCGCT 2382 2600 GATTCTGGCATTTGTATTTGCCTTCGAACTGGATGAGCACGTGCAGATGA 2649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2383 GATTCTGGCATTTGTATTTGCCTTCGAACTGGATGAGCACGTGCAGATGA 2432 2650 GGCTCCCCATTCTCATGTAGCTCCCTGCATATTTTGATGAATTTAGGGTT 2699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2433 GGCTCCCCATTCTCATGTAGCTCCCTGCATATTTTGATGAATTTAGGGTT 2482 2700 TGTAGGTGTTTGAAAGTTCCTAATTTGAGAGAGAGCCTCTTCTTTAGTTA 2749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2483 TGTAGGTGTTTGAAAGTTCCTAATTTGAGAGAGAGCCTCTTCTTTAGTTA 2532 2750 AGGAGCATCGAGGGTAAGTGAGGAAATAGTTTTTAGCGTTTATTTGAAAG 2799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2533 AGGAGCATCGAGGGTAAGTGAGGAAATAGTTTTTAGCGTTTATTTGAAAA 2582 2800 CGCTTAGGTGGTGACA---------------------------------- 2815 ||||||||||||||||********************************** 2583 CGCTTAGGTGGTGACATTCTCTCTCCTCAATCGGTACTCAGATAGTTTAG 2632 -------------------------------------------------- ************************************************** 2633 CCCCTATATTAGGTACTCAATATATACATGAGTACCAAATGGCATAGATG 2682 -------------------------------------------------- ************************************************** 2683 TAAATAATGGGAATATAATTTGAATTCAAAAGCGGCCATCCGTATAATAT 2732 - * 2733 T 2733