NC_006573 AY179173 1 GCGCACCGGGGATCCTAGGCATTTTTGGTTGCGCAATTCAAGTGTCCTAT 50 ********************||||||||||||||*||||||||||||*|| 1 --------------------ATTTTTGGTTGCGCTATTCAAGTGTCCCAT 30 51 TTAAAATGGGACAAATAGTGACATTCTTCCAGGAAGTGCCTCATGTAATA 100 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 31 TTAAAATGGGACAAATAGTCACATTCTTCCAGGAAGTGCCTCATGTAATA 80 101 GAAGAGGTGATGAACATTGTTCTCATTGCACTGTCTGTACTAGCAGTGCT 150 ||||||||||||||||||||*||||||||*||||||*|||||||*||||| 81 GAAGAGGTGATGAACATTGTCCTCATTGCGCTGTCTATACTAGCTGTGCT 130 151 GAAAGGTCTGTACAATTTTGCAACGTGTGGCCTTGTTGGTTTGGTCACTT 200 |||*|||||||||||*|||||*||*||||||||*||||||||*||**||| 131 GAAGGGTCTGTACAACTTTGCGACATGTGGCCTCGTTGGTTTAGTTGCTT 180 201 TCCTCCTGTTGTGTGGTAGGTCTTGCACAACCAGTCTTTATAAAGGGGTT 250 |||||*||||||||||*|||||||||||||*|||||||||*||||||||| 181 TCCTCTTGTTGTGTGGCAGGTCTTGCACAAGCAGTCTTTACAAAGGGGTT 230 251 TATGAGCTTCAGACTCTGGAACTAAACATGGAGACACTCAATATGACCAT 300 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 231 TATGAGCTCCAGACTCTGGAACTAAACATGGAGACACTCAATATGACCAT 280 301 GCCTCTCTCCTGCACAAAGAACAACAGTCATCATTATATAATGGTGGGCA 350 |||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||| 281 GCCTCTCTCTTGCACAAAGAACAACAGTCATCATTACATAAGGGTGGGCA 330 351 ATGAGACAGGACTAGAACTGACCTTGACCAACACGAGCATTATTAATCAC 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||* 331 ATGAGACAGGACTAGAACTGACCTTGACCAACACCAGTATTATTAATCAT 380 401 AAATTTTGCAATCTGTCTGATGCCCACAAAAAGAACCTCTATGACCACGC 450 ||||||||||||||*||||||||*|||||*||||||||*||||||||||| 381 AAATTTTGCAATCTATCTGATGCTCACAAGAAGAACCTTTATGACCACGC 430 451 TCTTATGAGCATAATCTCAACTTTCCACTTGTCCATCCCCAACTTCAATC 500 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 431 TCTTATGAGCATAATCTCAACTTTCCACTTGTCCATCCCAAACTTCAATC 480 501 AGTATGAGGCAATGAGCTGCGATTTTAATGGGGGAAAGATTAGTGTGCAG 550 |||||||||||||||||||*|||||*||*||*|||||||||||||||||| 481 AGTATGAGGCAATGAGCTGTGATTTCAACGGAGGAAAGATTAGTGTGCAG 530 551 TACAACCTGAGTCACAGCTATGCTGGGGATGCAGCCAACCATTGTGGTAC 600 |||||||||||*|||||||||||||*||||||||||||*||||||||*|| 531 TACAACCTGAGCCACAGCTATGCTGTGGATGCAGCCAAACATTGTGGCAC 580 601 TGTTGCAAATGGTGTGTTACAGACTTTTATGAGGATGGCTTGGGGTGGGA 650 *||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||*| 581 AGTTGCAAATGGTGTCTTACAGACTTTCATGAGGATGGCTTGGGGTGGAA 630 651 GCTACATTGCTCTTGACTCAGGCCGTGGCAACTGGGACTGTATTATGACT 700 ||||||||||||||||*|||||||*|||*|**|||||||||||||||||| 631 GCTACATTGCTCTTGATTCAGGCCATGGTAGATGGGACTGTATTATGACT 680 701 AGTTATCAATATCTGATAATCCAAAATACAACCTGGGAAGATCACTGCCA 750 ||||||||||||||*|||||*||*|||||||||||||||||||||||||| 681 AGTTATCAATATCTAATAATTCAGAATACAACCTGGGAAGATCACTGCCA 730 751 ATTCTCGAGACCATCTCCCATCGGTTATCTCGGGCTCCTCTCACAAAGGA 800 ||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*|||| 731 ATTCTCAAGACCATCTCCCATTGGTTATCTCGGGCTCCTCTCACAGAGGA 780 801 CTAGAGATATTTATATTAGTAGAAGATTGCTAGGCACATTCACATGGACA 850 |||||||*||||||||||||||||||*|*|||||||||||*||||||||| 781 CTAGAGACATTTATATTAGTAGAAGACTACTAGGCACATTTACATGGACA 830 851 CTGTCAGATTCTGAAGGTGAAGACACACCAGGGGGATATTGTCTGACCAG 900 ||||||||*||||||||**|*||||||||||||||||||||||||||||| 831 CTGTCAGACTCTGAAGGCAAGGACACACCAGGGGGATATTGTCTGACCAG 880 901 GTGGATGCTAATTGAGGCTGAACTAAAATGCTTCGGGAACACAGCTGTGG 950 *||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||| 881 ATGGATGCTAATTGAAGCTGAGCTAAAATGCTTCGGGAACACAGCTGTGG 930 951 CAAAATGTAATGAGAAGCATGATGAGGAATTTTGTGACATGCTGAGGCTG 1000 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 931 CAAAATGTAATGAGAAACATGATGAGGAATTTTGTGACATGCTGAGGCTG 980 1001 TTTGACTTCAACAAACAAGCCATTCAAAGGTTGAAAGCTGAAGCACAAAT 1050 |||||||||||*||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||| 981 TTTGACTTCAATAAACAAGCCATTCAAAGGCTGAAAACTGAAGCACAAAT 1030 1051 GAGCATTCAGTTGATCAACAAAGCAGTAAATGCTTTGATAAATGACCAAC 1100 ||||||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||||||||| 1031 GAGCATTCAGTTGATCAATAAAGCAGTGAATGCTTTGATAAATGACCAAC 1080 1101 TTATAATGAAGAACCATCTACGGGACATCATGGGAATTCCATACTGTAAT 1150 |*|||||||||||*|||*|*||||||||*||||||||||||||||||||| 1081 TAATAATGAAGAATCATTTGCGGGACATAATGGGAATTCCATACTGTAAT 1130 1151 TACAGCAAGTATTGGTACCTCAACCACACAACTACTGGGAGAACATCACT 1200 |||||||*||||||||||||*|||||||||||||||||*|*||||||||| 1131 TACAGCAGGTATTGGTACCTTAACCACACAACTACTGGAAAAACATCACT 1180 1201 GCCCAAATGTTGGCTTGTATCAAATGGTTCATACTTGAACGAGACCCACT 1250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||*|| 1181 GCCCAAATGTTGGCTTGTATCAAATGGTTCATACCTGAACGAGACCCGCT 1230 1251 TTTCTGATGATATTGAACAACAAGCTGACAATATGATCACTGAGATGTTA 1300 |||||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1231 TTTCTGACGATATTGAACAACAAGCTGACAACATGATCACTGAGATGTTA 1280 1301 CAGAAGGAGTATATGGAGAGGCAGGGGAAGACACCATTGGGTCTAGTTGA 1350 |||||*|||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 1281 CAGAAAGAGTACATGGAAAGGCAGGGGAAGACACCATTGGGTCTAGTTGA 1330 1351 CCTCTTTGTGTTCAGCACAAGTTTCTATCTTATTAGCATCTTCCTTCACC 1400 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1331 CCTCTTTGTGTTCAGCACAAGTTTCTATCTCATTAGCATCTTCCTTCACC 1380 1401 TAGTCAAAATACCAACTCATAGGCATATTGTAGGCAAGTCGTGTCCCAAA 1450 ||||*||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||||||||* 1381 TAGTTAAAATACCGACTCATAGGCATATTGTGGGCAAGTCATGTCCCAAG 1430 1451 CCTCACAGATTGAATCATATGGGCATTTGTTCCTGTGGACTCTACAAACA 1500 ||||||||*||||||||*||||||||*||||||||*||||||||*||||| 1431 CCTCACAGGTTGAATCACATGGGCATATGTTCCTGCGGACTCTATAAACA 1480 1501 GCCTGGTGTGCCTGTGAAATGGAAGAGATGAGACCCTTGTCAGGGCCCCC 1550 |||*|||||||||||*|||||||||||*||||||*|***||||||||||| 1481 GCCCGGTGTGCCTGTAAAATGGAAGAGGTGAGACTCCCATCAGGGCCCCC 1530 1551 GTGACCCACCGCCTATTGGCGGTGGGTCACGGGGGCGTCCATTTACAGAA 1600 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1531 GTGACCCACCGCCTATTGGCGGTGGGTCACGGGGGCGTCCATTTACAGGA 1580 1601 CGACTCTAGGTGTCGATGTTCTGAACACCATATCTCTGGGCAGCACTGCT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||| 1581 CGACTCTAGGTGTCGATGTTCTGAACACCATGTCTCTGGGTAGCACTGCT 1630 1651 CTCAAAACCGATGTGTTCAGTCCTCCTGACACTGCTGCATCAAACATGAT 1700 ||||**|||*||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 1631 CTCAGGACCAATGTTTTCAGTCCTCCTGATACTGCTGCATCAAACATGAT 1680 1701 GCAGTCCATTAGTGCACAGTGAGGGGTTATTTCCTCTTTACCGCCTCTTT 1750 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1681 GCAGTCCATCAGTGCACAGTGAGGGGTTATTTCCTCTTTGCCGCCTCTTT 1730 1751 TCTTCTTTTCAACAACGACACCTGTGTGCATGTGGCATAAGTCTTTATAC 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||| 1731 TCTTCTTTTCAACAACGACACCTGTGTGCATGTGGCATAGGTCTTTGTAC 1780 1801 TGGTCCCAGACTGCATTTTCATACTTCCTGGAATCAGTTTTACTGAGGTC 1850 ||*||||||||||||||*||||||||*|||||*||||*|||**|||||*| 1781 TGATCCCAGACTGCATTCTCATACTTTCTGGAGTCAGCTTTGTTGAGGGC 1830 1851 AATATCAATTAGTTTAATGTCTTTTCTTCCTTGTGATTCAAGGAGTTTCC 1900 |||||||||||**||*||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1831 AATATCAATTAACTTGATGTCTTTTCTTCCTTGTGACTCAAGGAGTTTCC 1880 1901 TTATGTCATCGGACCCCTGACAGGTAATGACCATATTCCGGGGGAGTGCA 1950 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1881 TTATGTCATCGGACCCCTGACAGGTAATGACCATGTTCCGGGGGAGTGCA 1930 1951 TCAATGACAGCACTGGTCAAGCCCGGTTGTGTAGCGAAGAGGTCTGTGAC 2000 ||*||*|||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||* 1931 TCTATAACAGCACTGGTCAAGCCCGGTTGTGCAGCAAAGAGGTCTGTGAT 1980 2001 ATCAATCCCATGTGAGTACTTAGCATCCTGCTTGAACTGCTTTAAATCAG 2050 ||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||*||||||| 1981 ATCAATCCCATGTGAGTATTTAGCATCTTGCTTGAACTGCTTCAAATCAG 2030 2051 TAGGTTCACGGAAGAAGTGTATGTAGCAGCCTGAACTTGGTTGATAGAGG 2100 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2031 TAGGTTCACGGAAGAAGTGTATGTAGCAGCCTGAACTTGGTTGATAAAGG 2080 2101 GCAATTTCCACTGGATCTTCAGGTCTTCCTTCAATGTCCATCCAGGTCTT 2150 |||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2081 GCAATTTCCACCGGATCTTCAGGTCTTCCTTCAATGTCCATCCAAGTCTT 2130 2151 AGCATTTGGGTCAAGTTGCAGCATTGCATCCTTGAGGGTCATCAGCTGAG 2200 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||| 2131 AGCATTTGGGTCAAGTTGCAGCATTGCATCTTTGAGGGTCATAAGCTGAG 2180 2201 AATAGGTAAGCCCAGCGGTAAACCCTGCCGACTGCAGGGATTTACTGGAA 2250 |*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||**||||| 2181 AGTAGGTAAGCCCAGCGGTAAACCCTGCCGATTGCAGGGATTTGTTGGAA 2230 2251 TTGTTGCTGTCAGCTTTCTGTGGCTTCCCATCTGATTCCAGATCAACGAC 2300 |||||||||*||||||||||||||||**|||||||||||||||||||*|| 2231 TTGTTGCTGCCAGCTTTCTGTGGCTTTTCATCTGATTCCAGATCAACAAC 2280 2301 AGTGTTTTCCCAGGCCCTTCCTGTTATTGAGGTTCTTGATGCAATATATG 2350 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2281 AGTGTTTTCCCAGGCTCTTCCTGTTATTGAGGTTCTTGATGCAATATATG 2330 2351 GCCATCCATCTCCTGACAAACAAATCTTGTAGAGTATGTTTTCATAAGGA 2400 ||||*||*||*|||||||*||||||||||||||||||||||||||||||* 2331 GCCACCCGTCCCCTGACAGACAAATCTTGTAGAGTATGTTTTCATAAGGG 2380 2401 TTCCTTTCACCAGGGGTGTCTGAAATGAACATTCCAAGAGCCTTCTTGAC 2450 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 2381 TTCCTTTCACCAGGGGTGTCTGAAATGAACATCCCAAGAGCCTTCTTGAC 2430 2451 CTTTAAAATGGATTTGAGGATACCATCCATTGTCTGAGGTGACACCTTGA 2500 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 2431 CTTTAAAATGGATTTGAGGATGCCATCCATTGTCTGAGGTGACACCTTGA 2480 2501 TTGTCTCCAACATATTGCCACCATCCAGCATGCAAGCTCCTGCCTTCACA 2550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2481 TTGTCTCCAACATATTGCCACCATCCAGCATGCAAGCTCCTGCCTTCACA 2530 2551 GCTGCACCCAAGCTAAAATTATAACCTGAGATATTCAAAGAGCTTTTCTT 2600 |||||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||| 2531 GCTGCACCCAAGCTAAAGTTATAACCTGAGACATTCAAAGAGCTTTTCTT 2580 2601 GGTGTCAATCATATTTAGGATGGGATGACTTTGAGTCAGCCTGTCTAAGT 2650 *||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||*|*|| 2581 TGTATCAATCATATTTAGGATGGGGTGACTTTGAGTCAGCCTATCCAGGT 2630 2651 CTGAAGTGTTGGGATACTTTGCTGTGTAGATCAAACCCAAATCTGTCAAT 2700 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2631 CTGAAGTATTGGGATACTTTGCTGTGTAGATCAAACCCAAATCTGTCAAT 2680 2701 GCTTGTACTGCATCATTCAAGTCAACCTGCCCCTGTTTTGTCAGACATGC 2750 ||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||*|*|||||| 2681 GCTTGTACTGCATCATTCAAGTCAACTTGCCCTTGTTTTGTTAAACATGC 2730 2751 CAGTGTCAGACTTGGCATGGTCCCGAACTGATTACTGAGCAACTCTGCAT 2800 *||||||||*|||||||||||||||||*|||||**||||||||||||||| 2731 TAGTGTCAGGCTTGGCATGGTCCCGAATTGATTGTTGAGCAACTCTGCAT 2780 2801 TTTTCACATCCCAAACTCTCACCACTCCATCTCTCCCAGCCCGAGCCCCT 2850 |||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||| 2781 TTTTCACATCCCAAACTCTCACCACCCCATCTCTCCCAGCCCGAGCTCCT 2830 2851 TGATTACCACCACTCATTCCTATCATATTCAGGAGAGCTCTTCTTTGGTC 2900 |||||*|*||||*||||||||||||||*|*||*|||||||**|||||||| 2831 TGATTGCTACCATTCATTCCTATCATACTTAGAAGAGCTCGCCTTTGGTC 2880 2901 AAGTTGCTGTGAGCTTAGGTTGCCCATATAGACACCTGCACTTAATGGCC 2950 |||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2881 AAGTTGCTGTGAGCTCAGGTTGCCCATATAGACACCTGCACTCAATGGCC 2930 2951 TTTCTGTTCTGATCACCTTTGACTTTAACTTCTCTAGATCAGCGGCTAAG 3000 |||||||*|||*||||*|||||**|*|||||||||||||||||*|||||| 2931 TTTCTGTCCTGGTCACTTTTGATCTCAACTTCTCTAGATCAGCAGCTAAG 2980 3001 ATTAATAAGTCATCTGAGGTTAGAGTCCCAACTCTCAGTATACTCTTTTG 3050 |*||**|||||||||||||||||||||||||||||*||*|*||||||||| 2981 ACTAGCAAGTCATCTGAGGTTAGAGTCCCAACTCTTAGCACACTCTTTTG 3030 3051 TTGAGTTGATTTTAATTCAACAAGATTGTTGACCGCTTGATTTAGGTCCC 3100 ||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 3031 TTGAGTTGATTTCAATTCAACAAGGTTGTTGACCGCTTGATTTAGGTCCC 3080 3101 TCAACCGTTTCAAATCATTGTCATCCCTTCTCTCCTTGCGCATCAACCGT 3150 |||||||*|||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||*|||| 3081 TCAACCGCTTCAAATCACTATCATCCCTTCTCTCCTTGCGCATCAGCCGT 3130 3151 TGAACATTACTGACTTCGGAGAAGTCAAGTCCATGTAAAAGAGCCTGGGC 3200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||*||||| 3131 TGAACATTACTGACTTCGGAGAAGTCAAGTCCATGCAGAAGAGCTTGGGC 3180 3201 ATCTTTCACCACCTGTAGTTTGATGTTGGAGCAGTAACCAGATAATTCCC 3250 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||*||||||| 3181 ATCTTTCACCACCTGCAGTTTGATGTTGGAGCAGTAACCGGACAATTCCC 3230 3251 TCCTCAAAGATTGTGTCCACAAAAAGGATTTTATTTCCTTTGAGGCACTC 3300 ||||||||||||||||||||||*|||||*||||*|||||||||||||||| 3231 TCCTCAAAGATTGTGTCCACAAGAAGGACTTTACTTCCTTTGAGGCACTC 3280 3301 ATCGCCAGATTGTTGTGTTGTATGCACACAACAAAGAACTGAGACTATCT 3350 ||||||||||||||||||||*||*|||*||*||**||*|||||*|||||| 3281 ATCGCCAGATTGTTGTGTTGAATACACGCAGCAGGGAGCTGAGGCTATCT 3330 3351 GCCAAAA-TGACAAAAGCAAAGCGCAATCCAATAGCCTAGGATCCACTGT 3399 |||||||*|||||||||||||||||||||||||***************** 3331 GCCAAAAATGACAAAAGCAAAGCGCAATCCAATT---------------- 3364 3400 GCG 3402 *** ---