NC_005888 AF110999 1 CATGCTCACCTGAAAGCATATGCAAAAATAAATGAGGAATCTTTAGATAG 50 |||||*||*||*|||||*|||||||||||*||*|||||||||||*|||*| 1 CATGCACATCTAAAAGCTTATGCAAAAATTAACGAGGAATCTTTGGATCG 50 51 AGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTATAACTGTTTATTGTGGGGCGAGC 100 *|||||**|||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||*||** 51 GGCTAGACGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACCAACTATATTTCGAGATTAAGAACTTGGTTATCCACACCT 150 |||**||*||*|||||||||||**|**|**|*||||||||*||*||*||| 101 CTACTGTAACAAACTATATTTCCCGCCTCCGTACTTGGTTGTCAACTCCT 150 151 GAAAAATACAGAGGAAAAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 |||||*||*|||||*|**||||||||*||||||||||||||||||||||| 151 GAAAAGTATAGAGGCAGGGATGCCCCGACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGTGGCGCAGGGAGGCAGAAATAAGACTCAGGGAGTTAGAAAAT 250 ||||||||||||*||||||||||||||*|***||**||****|||||||* 201 AATCCAAGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACATCTACGGCTACTAGAAAAC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGGAGAAGAAGAGTTAAAACCACAATTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||*|||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCCAGCG 350 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||*|| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCTCTTCACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCGCGTACTTCTAGGGACCACCACAGATCTCCCT 400 ||||||||||||||||||*||||*|||*||***|||||||*||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCACCGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGGAATAAAGACCCCGCTCGTCATAAACTGGGGAAGTTATCCGG 450 ||||||||*||||||***||*|||*|*|||*|**|*||*||*||*||*|| 401 CGCCTAGGAAATAAATTACCTGCTAGGCATCACTTAGGAAAATTGTCAGG 450 451 ATTGTATCAAATGAAGGGCTGTGAGTTTAACCCCCAATGGAAAGTACCTG 500 *||*||||||||||||||||||***||||||||**|*||||||||*|||| 451 TTTATATCAAATGAAGGGCTGTACTTTTAACCCAAATTGGAAAGTTCCTG 500 501 ATATTTCTGATACTCATTTTAATTTAGATATAATTAATGAGTGCCCTTCC 550 |||||||*||||||||||||*||*|*||**|*|**||||||||||||||| 501 ATATTTCGGATACTCATTTTGATATTGACGTTACAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 AGAAATTGGAAATACCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 *|||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCAGCGCATTCAGGGGTTAAACCCAAGTATCCGGATGACGTGG 650 |||||||||****||**|||||||||||**|||||||||*||**|*|||* 601 CTACTTTCCTATACAGGCAGGGGTTAAAAACAAGTATCCTGACAATGTGA 650 651 CAGGACATGAGCAAATAGTGGGTCAATATTTAACCAAGCTCTTTGAAGCG 700 ****||||||***||||||*|||*|||||||*|*||||||||*||||||* 651 TGCAACATGAATCAATAGTAGGTAAATATTTGAGCAAGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGAGAATCTAAACATTTGGTCACTTTTAAGGGAAC 750 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*|||||*|||** 701 GGAATCCTTTATAAGCGAGTATCTAAACATTTGGTCACATTTAAAGGACA 750 751 CCCTTATCAGTGGGAACGACAATACCTTGTCAATCAACCTGCTGATTTAC 800 *||||||*|*||||||||||||||||||||||||||||*|***|****** 751 ACCTTATAATTGGGAACGACAATACCTTGTCAATCAACATCTAGTACCTG 800 801 ATGGGGCAGCAACCAGCAAAATCAATGGCAGAAAGAAGAGTCGAAGGAGC 850 ||||||||*||*|*||||||||||||||**|***|*|||*|||||||||* 801 ATGGGGCAACATCAAGCAAAATCAATGGATGCTCGGAGAATCGAAGGAGG 850 851 GGAACTCCTCCTTCAACAATTGGCCGGAAGGATGATCCCAAAAGGGACGG 900 *|||*|*||**|**|*|||*||||*|||*|*|||||*|||||||||||*| 851 AGAAATACTTTTAAATCAACTGGCAGGACGCATGATACCAAAAGGGACAG 900 901 TCACATGGTCAGGAAAATATCCTACCATGGAACACGTTATGGACCATGTG 950 |*||*|||||*||*||||**||**|*||*||*|||||*|||||*|||||| 901 TAACTTGGTCCGGGAAATTCCCATCAATAGATCACGTGATGGATCATGTG 950 951 CAAACAATGGAAGAGATAAACACCATGCAACAACAAGGGGCTTGGCCGGA 1000 ||||||||||||||*|||||||||*|||||*||||*||*||*|||||*|| 951 CAAACAATGGAAGAAATAAACACCCTGCAAAAACAGGGTGCCTGGCCAGA 1000 1001 AGGAGCAGGGAGGAGACTGGGACTAACCAACCCAGCTCCCCCTGCCGCTC 1050 |||*|||||*|||||**|*||*||*||*|||||**|*||*|**|****|| 1001 AGGGGCAGGAAGGAGGGTAGGTCTCACGAACCCTACCCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CGGTGATAAATTGGACACCGGAAGAGGACGCCAAGGCCCGAGAATATTTC 1100 |********|*||||||||*|||||*||****||*||*||*||***|||* 1051 CTCAACCCCACTGGACACCAGAAGAAGATCAGAAAGCTCGGGAGGCTTTT 1100 1101 AGAAGATATCAAGAAGAGAGACCAAAGGAAACCACCACCATTCCTCCCAC 1150 *|*||||||||*|||||*|||||****|||||||||||||||||*||*|| 1101 CGCAGATATCAGGAAGAAAGACCTCCAGAAACCACCACCATTCCACCAAC 1150 1151 AAGTCCACCGAAAACTCAGTGGGAGCTGAAACCCGGAGA---TCCTCTCC 1197 |***|||******||||*||||*|*|||*|||||||*||***|||||||| 1151 A---CCA------ACTCCGTGGAAACTGCAACCCGGGGACGATCCTCTCC 1191 1198 TCAGCACGCAACC---ACT-GTACCGAC-CAGCAGAACCAG----CGGAA 1238 |**|*||**|**|***|||*|*|*||***|*|||*|*||||****|*||* 1192 TGGGAACCAAGTCGTTACTAGAAACGCGACTGCAAACCCAGAATTCCGAG 1241 1239 CCGGATATTCCGGTCATCAAAACACCGAAAGTCCCGAAGAA---AATGTC 1285 ||*|***|*||*||*||*||****||****|||**||||||***|||||| 1242 CCAGCCGTGCCTGTAATAAAGTACCCCCTCGTCAAGAAGAAGAAAATGTC 1291 1286 TTCTACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAGGAT 1335 |**|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*| 1292 TGGTACCTTCGGGGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAAGCT 1341 1336 TTTTCTTGTTGATAAAAATTCTAGAAATACTGCGGAGGCTAGACTGGTGG 1385 ||||||||||||||||*||||||||||||||*||||*||||||*|||||| 1342 TTTTCTTGTTGATAAATATTCTAGAAATACTACGGAAGCTAGATTGGTGG 1391 1386 TGGATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAACATGCAATGCGCTTTCCAAAA 1435 |||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||*| 1392 TGGATCTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAATGCAATGCGCTTTCCAAGA 1441 1436 TACTGGAGCCCAAATCTCTCCACATTACGTAGGATCCTGCCCGTGGGGAT 1485 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1442 TACTGGAGCCCAAATCTCACCACATTACGTAGGATCCTGCCCGTGGGGAT 1491 1486 GCCCAGGATTTCTTTGGACCTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTA 1535 |||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1492 GCCCAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTA 1541 1536 ATCCTGCATGTAGCAGCAGGCTTGCTATATCTGACGGACAACATGTCTAC 1585 |||||||**|||||||||||||||||*|||||||||||||||**|||||| 1542 ATCCTGCTAGTAGCAGCAGGCTTGCTGTATCTGACGGACAACGGGTCTAC 1591 1586 TATTTTCGCAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCA 1635 ||||||*|*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1592 TATTTTAGGAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCA 1641 1636 TCTCTTCACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTT 1685 ||||||||||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||||||| 1642 TCTCTTCACTACTGCCCTCGGATCAGAAATCTCTCGTCGCTTTAATGTTT 1691 1686 GGACTTTTACTTATATGGACGACTTCCTCCTCTGTCACCCAAACGCTCGT 1735 |||||||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||| 1692 GGACTTTTACTTATATGGATGACTTCCTCCTCTGCCACCCAAACGCTCGT 1741 1736 CACCTTAACTCAAGGAGCCACGCTGTCTGCTCTTTTCTTCAAGAGCTAGG 1785 |||||||||||||**|||||||||||||||*|||||||*||||||||||| 1742 CACCTTAACTCAATTAGCCACGCTGTCTGCACTTTTCTACAAGAGCTAGG 1791 1786 AGTGAGAATAAACTTCGACAAAACAACTCCTTCACCAGTAACTGAGATAA 1835 |*|**||||||||||*||||||||*||*||*||*||*||*|*|||*||*| 1792 AATCCGAATAAACTTTGACAAAACCACACCATCTCCGGTCAATGAAATTA 1841 1836 AATTCCTCGGTTACCTGATCGACGATAAATTTATGAAAATTGAGGATCAA 1885 *|||||||||*||*|**||*||**||*|*|**|||||*|||||*||**** 1842 GATTCCTCGGATATCAAATTGATCATCACTACATGAAGATTGAAGAAAGC 1891 1886 CGCTGGAATGAACTACGTCAAGTAATAAAGAAGATTCAAATCGGAAAATG 1935 *|*|||||*|||*||*|****|||||*|||||*|||*||***|||*|||| 1892 AGATGGAAAGAATTAAGAACTGTAATTAAGAAAATTAAACCAGGAGAATG 1941 1936 GTATGACTGGAAATGTATCCAACGATTTATTGGACATTTAAACTTCATTT 1985 ||||||||||||||||||*|||||||||*||||*|||||||||||**|*| 1942 GTATGACTGGAAATGTATTCAACGATTTGTTGGGCATTTAAACTTTGTAT 1991 1986 TACCTTTCACAAAAGGAAATGTAGAAATGTTAAAACCAATGTATCATGCT 2035 |||||||*||*|||||*|||*|*||||||||*|||||||*||||**|||| 1992 TACCTTTTACTAAAGGTAATATTGAAATGTTGAAACCAACGTATGCTGCT 2041 2036 GTGACTCATAAAGTGAATTTTAGTTTTTCTAGTAGCTATAGGACTTTGTT 2085 *|*|||*|*|||||*||*|||||*||*|||**|***||||||||||||*| 2042 ATTACTAACAAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTCTGCTTATAGGACTTTGCT 2091 2086 GTATAAATTAACAATGGGTGTCTGTAAACTTAGATTGAATCCAAAGGTCT 2135 *||||||*||||*||||||||*||||||*|***|*|*|||||||||**|| 2092 ATATAAACTAACTATGGGTGTTTGTAAATTGCAAATAAATCCAAAGTCCT 2141 2136 CTTTACCTTTGCCACGTGTTGCCACAGATGCAACTCTAACACATGGCGCA 2185 ||*||||||||||||||||*|||||*|||||*||*|*||||||||||||| 2142 CTGTACCTTTGCCACGTGTAGCCACTGATGCTACACCAACACATGGCGCA 2191 2186 ATATCCCATATCACCGGCGGGTGCGCAGTGTTTACCTTTTCAAAGGTTAG 2235 |||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||*|| 2192 ATATCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTTTGCCTTTTCAAAGGTCAG 2241 2236 AGATATCCACATTCAGGAGCTTTTGATGGCATGTTTGGCTAAGTTAATGA 2285 *||*||*||*||*|||||*||**|*||||*||||||*||||*|*|||||| 2242 GGACATTCATATCCAGGAACTGCTTATGGTATGTTTAGCTAGGATAATGA 2291 2286 TTAAACCAAGATGTTTGCTCACAGATTCCACCTTTGTGATCCATAAACGT 2335 |||||||*||||||*|**|**||||*|||||||||||***|||*|||||* 2292 TTAAACCCAGATGTATCTTATCAGACTCCACCTTTGTTTGCCACAAACGA 2341 2336 TATCAGACGTTGCCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAACTTATGCA 2385 ||||||||*||*|||||||||||||||*||***||*||||||*|**|*** 2342 TATCAGACATTACCATGGCATTTTGCTATGTATGCTAAACAATTGCTATC 2391 2386 GAACATACAGTTGTACTTTGTCCCCAGTAAATACAATCCTGCTGATGGCC 2435 *****||||*|||||||||||*||*||||||||||||||||||||*|||| 2392 TCCTGTACAATTGTACTTTGTTCCTAGTAAATACAATCCTGCTGACGGCC 2441 2436 CAACCAGGCATAAACCTCCTGATTGGACAGCACTTACATACACCCCTCTC 2485 ||*|||||||*||*||*||||||||||||||*|||||||||||||||||| 2442 CATCCAGGCACAAGCCGCCTGATTGGACAGCTCTTACATACACCCCTCTC 2491 2486 TCGAAAGCAATATATATCCCACATAGGCTATGTGGGACTTAAGA-TTACA 2534 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||*||||| 2492 TCGAAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATGTGGAACTTAAGAATTACA 2541 2535 CCCCTCTCCATTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTATTTTTACGTCGTCTTTGC 2584 |||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||**|*|||| 2542 CCCCTCTCC-TTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTATATTTACGTCTACATTGC 2590 2585 TGTTGTTCCTTGTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCT 2634 ||||||****|*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|| 2591 TGTTGTCATGTTTGACTGTACCTTTGGTATGTACCATCGTTTATGATACT 2640 2635 TGCTTATGTATGGATATCAACGCTTCAAGAGCTTTAGCTAATGTATATGA 2684 |||||||*|||||||*|*||*|||||*|||||||||||*|||||*||||| 2641 TGCTTATATATGGATGTTAATGCTTCTAGAGCTTTAGCCAATGTGTATGA 2690 2685 TTTGCCAGATGATTTCTTTCCAAAGATTGATGATTTAGTTAGAGATGCTA 2734 |*||||*|||||||||||||||||*|||||*|||*|*||*||*||||||| 2691 TCTGCCTGATGATTTCTTTCCAAAAATTGAGGATCTTGTAAGGGATGCTA 2740 2735 AAGATGCTTTAGAGCCTTATTGGAGAAATGATTCAATAAAGAAACATGTT 2784 |*||||||||*||*||||||||||*|**|||*|||||||||||||||||* 2741 AGGATGCTTTGGAACCTTATTGGAAATCTGACTCAATAAAGAAACATGTA 2790 2785 TTAATTGCAACTCACTTTGTGGATCTCATTGAGGATTTCTGGCAAACCAC 2834 |||||*||*|||||*|||||*|||||*|||||||||||*|||||*||*|| 2791 TTAATCGCTACTCATTTTGTTGATCTTATTGAGGATTTTTGGCAGACTAC 2840 2835 TCAGGGTATGCATGAAATAGCAGAGGCACTGAGAGCTATAATTCCTGCCA 2884 *|||||||||||||||||*||*||*||**|*||*||**|*|||||**|*| 2841 ACAGGGTATGCATGAAATCGCTGAAGCTATAAGGGCAGTGATTCCACCGA 2890 2885 CTACTGCTCCAGTACCTCAGGGATTTCTGGTCCAACACGAAGAAGCTGAA 2934 |*||||||||*||*||****||||*|||**||||*||*||*||||||||| 2891 CAACTGCTCCTGTTCCCTCTGGATATCTCATCCAGCATGACGAAGCTGAA 2940 2935 GAGATACCTTTGGGTGAACTTTTTAGGTATCAGGAAGAAAGACTAACTAA 2984 |||||*||*||*||*||**|*||*|***|*|||||*|||||**||**||* 2941 GAGATTCCATTAGGGGATTTATTCAAAGAACAGGAGGAAAGGATAGTTAG 2990 2985 CTTTCAACCAGATTATCCAGTTACCGCCAGAATT 3018 *||||||||*||*||||||*|*||*||*|||||| 2991 TTTTCAACCTGACTATCCAATAACAGCGAGAATT 3024