NC_005888 AY494849 1 CATGCTCACCTGAAAGCATATGCAAAAATAAATGAGGAATCTTTAGATAG 50 ||||||||**|||||||*|||||||||||*||*||||||||**|*||||| 1 CATGCTCATTTGAAAGCTTATGCAAAAATTAACGAGGAATCACTGGATAG 50 51 AGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTATAACTGTTTATTGTGGGGCGAGC 100 *||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||*||** 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTACAACTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACCAACTATATTTCGAGATTAAGAACTTGGTTATCCACACCT 150 ||*|*|||||*|||||||||||**|*||**|*||||||||*||*||*||| 101 CTCAAGTTACTAACTATATTTCTCGTTTGCGTACTTGGTTGTCAACTCCT 150 151 GAAAAATACAGAGGAAAAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 ||*|||||*|||||*|*|||||||||*||||||||||||||||||||||| 151 GAGAAATATAGAGGTAGAGATGCCCCGACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGTGGCGCAGGGAGGCAGAAATAAGACTCAGGGAGTTAGAAAAT 250 ||||||*|||||*||||||||||||||*|**|||**|||***|||||||* 201 AATCCAGGTGGCTCAGGGAGGCAGAAAAACAACTACGGGTACTAGAAAAC 250 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGGAGAAGAAGAGTTAAAACCACAATTGTCTAT 300 |||||||||||||||||||*|||||||*|||||||||||||*|||||||| 251 CTCGTGGACTCGAACCTAGAAGAAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCCAGCG 350 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*|| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCCGGGAAAGGAGAGCCCCTACACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCGCGTACTTCTAGGGACCACCACAGATCTCCCT 400 ||||||||||||||||||*||||*|||*||***||||||*|||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTAGTTCGAGCAGCCACCATAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGGAATAAAGACCCCGCTCGTCATAAACTGGGGAAGTTATCCGG 450 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 401 CGCCTAGGAAATAAAGACCCCGCTCGTCATAAACTGGGGAAGTTATCCGG 450 451 ATTGTATCAAATGAAGGGCTGTGAGTTTAACCCCCAATGGAAAGTACCTG 500 |*|*||||||||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||||||| 451 ACTATATCAAATGAAGGGATGTGATTTTAACCCTCAATGGAAAGTACCTG 500 501 ATATTTCTGATACTCATTTTAATTTAGATATAATTAATGAGTGCCCTTCC 550 ||||||||||||||||||||||*||*||||||||*||||||||||||||| 501 ATATTTCTGATACTCATTTTAAATTGGATATAATAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 AGAAATTGGAAATACCTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||| 551 AGAAATTGGAAATACCTGACTCCAGCCAAATTCTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCAGCGCATTCAGGGGTTAAACCCAAGTATCCGGATGACGTGG 650 |||||||||||**|||*|||||||||||||*||||||||||||||||||| 601 CTACTTTCCAGTACATACAGGGGTTAAACCAAAGTATCCGGATGACGTGG 650 651 CAGGACATGAGCAAATAGTGGGTCAATATTTAACCAAGCTCTTTGAAGCG 700 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 651 CAGGACATGAGCAAATAGTGGGTCAATATTTAACTAAGCTCTTTGAAGCG 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGAGAATCTAAACATTTGGTCACTTTTAAGGGAAC 750 |||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 701 GGAATCCTTTATAAGCGGGAATCTAAACATTTGGTCACTTTTAAGGGAAC 750 751 CCCTTATCAGTGGGAACGACAATACCTTGTCAATCAACCTGCTGATTTAC 800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 CCCTTATCAGTGGGAACGACAATACCTTGTCAATCAACCTGCTGATTTAC 800 801 ATGGGGCAGCAACCAGCAAAATCAATGGCAGAAAGAAGAGTCGAAGGAGC 850 |||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 801 ATGGGGCAGTATCCAGCAAAATCAATGGCAGAAAGAAGAGTCGAAGGAGC 850 851 GGAACTCCTCCTTCAACAATTGGCCGGAAGGATGATCCCAAAAGGGACGG 900 *||||||||||||||||||*||||*||**|*||||||||||||||*||*| 851 AGAACTCCTCCTTCAACAACTGGCTGGGCGAATGATCCCAAAAGGAACTG 900 901 TCACATGGTCAGGAAAATATCCTACCATGGAACACGTTATGGACCATGTG 950 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||| 901 TCACATGGTCAGGAAAGTATCCTACCATGGAACACGTCATGGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAAGAGATAAACACCATGCAACAACAAGGGGCTTGGCCGGA 1000 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 951 CAAACAATGGAAGAGATAAATACCATGCAACAACAAGGGGCTTGGCCGGA 1000 1001 AGGAGCAGGGAGGAGACTGGGACTAACCAACCCAGCTCCCCCTGCCGCTC 1050 |||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||||||||||| 1001 AGGAGCAGGGAGGAGACTGGGGCTAACCAACCCATCTCCCCCTGCCGCTC 1050 1051 CGGTGATAAATTGGACACCGGAAGAGGACGCCAAGGCCCGAGAATATTTC 1100 ||||**||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1051 CGGTAGTAAACTGGACACCGGAAGAGGACGCCAAGGCCCGAGAATATTTC 1100 1101 AGAAGATATCAAGAAGAGAGACCAAAGGAAACCACCACCATTCCTCCCAC 1150 |*||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||*|| 1101 AAAAGATATCAAGAGGAGAGACCAAAAGAAACCACCACCATTCCTCCTAC 1150 1151 AAGTCCACCGAAAACTCAGTGGGAGCTGAAACCCGGAGATCCTCTCCTCA 1200 |***||*||*||*|||||||||||||||||*||*||||||||*||||||| 1151 ATCACCTCCAAAGACTCAGTGGGAGCTGAAGCCAGGAGATCCGCTCCTCA 1200 1201 GCACGCAACCACTGTACCGACCAGCAGAACCAGCGGAACCGGATATTCCG 1250 ||||*||||||||||||||||||||*********|||||||||*|||||* 1201 GCACTCAACCACTGTACCGACCAGC---------GGAACCGGAAATTCCA 1241 1251 GTCATCAAAACACCGAAAGTCCCGAAGA---AAATGTCTTCTACCTTCGG 1297 ||*|||||||||||*|||||||||||||***||||||||||||||||||| 1242 GTAATCAAAACACCAAAAGTCCCGAAGAGAAAAATGTCTTCTACCTTCGG 1291 1298 GGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAGGATTTTTCTTGTTGA 1347 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1292 GGGAATACTAGCTGGCCTAATCGGATTACTGGTAGGATTTTTCTTGTTGA 1341 1348 TAAAAATTCTAGAAATACTGCGGAGGCTAGACTGGTGGTGGATTTCTCTC 1397 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1342 TAAAAATTCTAGAAATACTGAGGAGGCTAGACTGGTGGTGGATTTCTCTC 1391 1398 AGTTCTCCAAAGGGAAACATGCAATGCGCTTTCCAAAATACTGGAGCCCA 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1392 AGTTCTCCAAAGGGAAACATGCAATGCGCTTTCCAAAATACTGGAGCCCA 1441 1448 AATCTCTCCACATTACGTAGGATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAGGATTTC 1497 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 1442 AATCTCTCCACATTACGTAGGATCCTGCCCATGGGGATGCCCAGGATTTC 1491 1498 TTTGGACCTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTGCATGTA 1547 |*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||**||| 1492 TCTGGACTTATCTCAGGCTTTTTATCATCTTCCTCTTAATCCTGCTAGTA 1541 1548 GCAGCAGGCTTGCTATATCTGACGGACAACATGTCTACTATTTTCGCAAA 1597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1542 GCAGCAGGCTTGCTATATCTGACGGACAACATGTCTACTATTTTCGCAAA 1591 1598 GCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTTCACTAC 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1592 GCTCCAATGGGAGTCGGTCTCAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTTCACTAC 1641 1648 TGCCCTCGGATCCGAAATCGCTCGTCGCTTTAATGTTTGGACTTTTACTT 1697 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1642 TGCCCTCGGATCCGAAATCTCTCGTCGCTTTAATGTTTGGACTTTTACTT 1691 1698 ATATGGACGACTTCCTCCTCTGTCACCCAAACGCTCGTCACCTTAACTCA 1747 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1692 ATATGGACGACTTCCTCCTCTGTCACCCAAACGCTCGTCACCTTAACGCA 1741 1748 AGGAGCCACGCTGTCTGCTCTTTTCTTCAAGAGCTAGGAGTGAGAATAAA 1797 |**||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1742 ATTAGCCACGCTGTCTGCTCTTTTCTTCAAGAGCTAGGAGTAAGAATAAA 1791 1798 CTTCGACAAAACAACTCCTTCACCAGTAACTGAGATAAAATTCCTCGGTT 1847 |||*||*|||||*||*||*||||||||*||*||*||*||||||||*||*| 1792 CTTTGATAAAACGACACCATCACCAGTGACGGAAATCAAATTCCTGGGAT 1841 1848 ACCTGATCGACGATAAATTTATGAAAATTGAGGATCAACGCTGGAATGAA 1897 |||||||*||*|||||||**|||||*|||||||||||||||||||||||| 1842 ACCTGATTGATGATAAATACATGAAGATTGAGGATCAACGCTGGAATGAA 1891 1898 CTACGTCAAGTAATAAAGAAGATTCAAATCGGAAAATGGTATGACTGGAA 1947 |||||*||||||||||||||*||||||*|*|||||||||||||||||||| 1892 CTACGACAAGTAATAAAGAAAATTCAAGTTGGAAAATGGTATGACTGGAA 1941 1948 ATGTATCCAACGATTTATTGGACATTTAAACTTCATTTTACCTTTCACAA 1997 ||||||*|||||*||||||||||||||*||*||*||*||*|||||||||| 1942 ATGTATTCAACGGTTTATTGGACATTTGAATTTTATCTTGCCTTTCACAA 1991 1998 AAGGAAATGTAGAAATGTTAAAACCAATGTATCATGCTGTGACTCATAAA 2047 |||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||*| 1992 AAGGAAATGTAGAAATGTTGAAACCAATGTATCATGCTGTAACTCATAGA 2041 2048 GTGAATTTTAGTTTTTCTAGTAGCTATAGGACTTTGTTGTATAAATTAAC 2097 ||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2042 GTTAATTTTAGTTTCTCTAGTAGCTATAGGACTTTGCTGTATAAATTAAC 2091 2098 AATGGGTGTCTGTAAACTTAGATTGAATCCAAAGGTCTCTTTACCTTTGC 2147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2092 AATGGGTGTCTGTAAACTTAGATTGAATCCAAAGGTCTCTTTACCTTTGC 2141 2148 CACGTGTTGCCACAGATGCAACTCTAACACATGGCGCAATATCCCATATC 2197 ||||*|||||*||*|||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2142 CACGAGTTGCAACCGATGCAACTTTAACACATGGCGCAATATCCCATATC 2191 2198 ACCGGCGGGTGCGCAGTGTTTACCTTTTCAAAGGTTAGAGATATCCACAT 2247 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 2192 ACCGGCGGGTGCGCAGTGTTTACTTTTTCAAAGGTTAGAGATATCCACAT 2241 2248 TCAGGAGCTTTTGATGGCATGTTTGGCTAAGTTAATGATTAAACCAAGAT 2297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2242 TCAGGAGCTTTTGATGGCATGTTTGGCTAAGTTAATGATTAAACCAAGAT 2291 2298 GTTTGCTCACAGATTCCACCTTTGTGATCCATAAACGTTATCAGACGTTG 2347 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 2292 GTTTGCTCACAGATTCCACCTTTGTGATCCACAAACGTTATCAGACGTTG 2341 2348 CCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAACTTATGCAGAACATACAGTT 2397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2342 CCATGGCATTTTGCTGTGCTAGCCAAACAACTTATGCAGAACATACAGTT 2391 2398 GTACTTTGTCCCCAGTAAATACAATCCTGCTGATGGCCCAACCAGGCATA 2447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2392 GTACTTTGTCCCCAGTAAATACAATCCTGCTGATGGCCCAACCAGGCATA 2441 2448 AACCTCCTGATTGGACAGCACTTACATACACCCCTCTCTCGAAAGCAATA 2497 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2442 AACCTCCTGATTGGACAGCACTTACATACACCCCTCTCTCGAAAGCAATA 2491 2498 TATATCCCACATAGGCTATGTGGGACTTAAGATTACACCCCTCTCCATTC 2547 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2492 TATATCCCACATAGGCTATGTGGGACTTAAGATTACACCCCTCTCCATTC 2541 2548 GGAGCTGCTTGCCAAGGTATTTTTACGTCGTCTTTGCTGTTGTTCCTTGT 2597 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2542 GGAGCTGCTTGCCAAGGTATTTTTACGTCGTCTTTGCTGTTGTTCCTTGT 2591 2598 GACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTATGTATGG 2647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2592 GACTGTACCTTTGGTATGTACCATTGTTTATGATTCTTGCTTATGTATGG 2641 2648 ATATCAACGCTTCAAGAGCTTTAGCTAATGTATATGATTTGCCAGATGAT 2697 |||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2642 ATATCAACGCTTCAAGAGCTTTAGCCAATGTATATGATTTGCCAGATGAT 2691 2698 TTCTTTCCAAAGATTGATGATTTAGTTAGAGATGCTAAAGATGCTTTAGA 2747 ||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2692 TTCTTTCCTAAAATTGATGATTTAGTTAGAGATGCTAAAGATGCTTTAGA 2741 2748 GCCTTATTGGAGAAATGATTCAATAAAGAAACATGTTTTAATTGCAACTC 2797 *||*||||||||||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||| 2742 ACCGTATTGGAGAAATGACTCAATAAAGAAACATGTTTTGATTGCAACTC 2791 2798 ACTTTGTGGATCTCATTGAGGATTTCTGGCAAACCACTCAGGGTATGCAT 2847 |||||||*|||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2792 ACTTTGTAGATCTTATTGAAGATTTCTGGCAAACCACTCAGGGTATGCAT 2841 2848 GAAATAGCAGAGGCACTGAGAGCTATAATTCCTGCCACTACTGCTCCAGT 2897 |||||||||||||||||*|||||**|*||||||||||||||||||||||| 2842 GAAATAGCAGAGGCACTAAGAGCCGTGATTCCTGCCACTACTGCTCCAGT 2891 2898 ACCTCAGGGATTTCTGGTCCAACACGAAGAAGCTGAAGAGATACCTTTGG 2947 *||||||||||||||**|*||*|||||*|||||||||||||||||||||| 2892 GCCTCAGGGATTTCTTATTCAGCACGAGGAAGCTGAAGAGATACCTTTGG 2941 2948 GTGAACTTTTTAGGTATCAGGAAGAAAGACTAACTAACTTTCAACCAGAT 2997 |*||**|*||||***|*||*||||||||**||***|**||*|||||*||* 2942 GAGATTTATTTAAACACCAAGAAGAAAGGATAGTAAGTTTCCAACCCGAC 2991 2998 TATCCAGTTACCGCCAGAATT 3018 |||||**||||*||*|||||| 2992 TATCCGATTACGGCTAGAATT 3012