NC_005890 AY494852 1 CATGCTCATTTGAAAGCATACGCTAAGATTAATGAGGAATCCTTGGATAA 50 |||||*||||||||||||||*||*||*||||||||||||||||||||*|| 1 CATGCGCATTTGAAAGCATATGCGAAAATTAATGAGGAATCCTTGGACAA 50 51 GGCTAGGAGATTGCTTTGGTGGCATTATAATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 |||**||*||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 51 GGCCCGGCGATTGCTTTGGTGGCACTATAATTGTTTACTGTGGGGAGAAG 100 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGTTTACGTACTTGGTTATCAACACCT 150 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 101 CTAACGTTACTAATTATATTTCTCGTTTACGTACTTGGTTATCAACACCT 150 151 GAGAGATATAGAGGTAGAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GAAAGATATAGAGGTAGAGATGCCCCAACCATTGAAGCAATCACTAGACC 200 201 AATCCAAGTGGCTCAGGGAGGCAGAAATAAAACTCAGGGTTCTAGAAAAC 250 |||||||||||**||||||||||||||*|*||||**||||*|||||||*| 201 AATCCAAGTGGTACAGGGAGGCAGAAAAACAACTTCGGGTACTAGAAAGC 250 251 CTCGTGGATTGCAACCTAGAAGAAGGAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 ||||||||*|||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 251 CTCGTGGACTGCAACCTAGAAGGAGAAAAGTTAAAACCACAGTTGTCTAT 300 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGATAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 301 GGGAGAAGACGTTCAAAGTCCAGGGAAAGGAGAGCCCCTTCACCCCAACG 350 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCACGTCCTTCAACTAGTCACCACCGATCTCCCT 400 ||||||||||||||||||*||||||||||**|||||||||*||||||||| 351 TGCGGGCTCCCCTCTCCCGCGTCCTTCAAGCAGTCACCACAGATCTCCCT 400 401 CGCCTAGGAAATAAAGAACCTGCAAGGCATCATTTAGGTAAATTGTCAGG 450 ||||||||||||||****||||||||||||||*||*||*||*|||||||| 401 CGCCTAGGAAATAAGTCTCCTGCAAGGCATCACTTGGGGAAGTTGTCAGG 450 451 ATTATATCAAATGAAGGGTTGTGAATTTAATCCTGCATGGAAAGTACCAG 500 *||*||||||||||||||*|||||*|||||*||||*||||||||||||** 451 TTTGTATCAAATGAAGGGCTGTGAGTTTAACCCTGAATGGAAAGTACCTA 500 501 AACTTTCGGATACTCATTTTAATATTGATATAAAAAATGAGTGCCCTTCC 550 |*|||||||||||||||||*||*||*|||||*|||||||||||||||||| 501 ATCTTTCGGATACTCATTTCAAAATAGATATTAAAAATGAGTGCCCTTCC 550 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 551 CGAAATTGGAAATATTTGACTCCAGCCAAATTTTGGCCCAAGAGCATTTC 600 601 CTACTTTCCAGTACATGCAGGGGTTAAACCAAAATATCCTGACAATGTGA 650 |||||||||*|||||*|*|||||||||||||||||||||||||||*|||| 601 CTACTTTCCTGTACAAGTAGGGGTTAAACCAAAATATCCTGACAACGTGA 650 651 TGCAACATGAGCAAATTGTAGGTAAATATTTAACCAGGCTCTATGAAGCA 700 ||||*||||||**|||*|||||*|||||||||**|||||||||||||||| 651 TGCAGCATGAGGCAATCGTAGGCAAATATTTACACAGGCTCTATGAAGCA 700 701 GGAATCCTTTATAAGCGGATATCAAAACATTTGGTAACATTTAAAGGTCG 750 |||||||||||||||||**||||||||||||||||*|||||||||||||* 701 GGAATCCTTTATAAGCGAGTATCAAAACATTTGGTCACATTTAAAGGTCA 750 751 GCCTTATCCTTGGGAACAGCAATACCTTGTCAATCAACATCTTGACAAAA 800 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 751 GCCCTATCCTTGGGAACAGCAATACCTTGTCAATCAACATCTTGACAAAA 800 801 ATGGGCCAAACACCAGCAAAATCAATGGATGTGAGAAGAATAGAAGGAGG 850 |||||*|||***|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 801 ATGGGGCAACATCCAGCAAAATCAATGGATGTGAGAAGAATAGAAGGAGG 850 851 AGAGATTTTATTGAATCAACTAGCAGGAAGAATGATCCCAAAAGGGACTG 900 |||**|*|||*|||||||*|||||||||||||||||*||*|||||*||*| 851 AGAATTATTACTGAATCAGCTAGCAGGAAGAATGATACCGAAAGGAACAG 900 901 TCACATGGTCGGGCAAATATCCAACGATAGATCACCTATTAGACCATGTG 950 |*|||||||||||||||||*|||||*|||||||||*|||||||||||||| 901 TAACATGGTCGGGCAAATACCCAACAATAGATCACTTATTAGACCATGTG 950 951 CAAACAATGGAAGAAATAAATACTCTTCAGCAACAAGGTGCGTGGCCTCA 1000 ||||||||||||||*|||||*||||||||*||||||||*||*|||||**| 951 CAAACAATGGAAGAGATAAACACTCTTCAACAACAAGGAGCATGGCCAGA 1000 1001 AGGGGCGGGAAGGAGATTGGGATTGGAAAATCCCAATCCTCAAGAGATTC 1050 |||*|||||||||||||||||*||****||*||||||||||||||||||| 1001 AGGCGCGGGAAGGAGATTGGGGTTAACGAACCCCAATCCTCAAGAGATTC 1050 1051 CTCAGCCCGTTTGGACTCCAGAGGAAGATCAACGTGCACGAGAGGCTTTT 1100 |*||*||*||*|******|*||*||*||||||***||*|||||||||||* 1051 CCCAACCTGTATTCTTGGCCGAAGACGATCAAAAAGCCCGAGAGGCTTTC 1100 1101 CAAAAATATCAAAAGGAAAGACCTCCAGAAGAGATTCCGAGTCCTTCGAA 1150 *|||**|||||**|*||*|||||||*||||************|||***** 1101 AAAAGGTATCAGGAAGAGAGACCTCGAGAAA-----------CCT----- 1134 1151 AAGGCCACCCGAAGAAACAAAAATTCCACCCTCAACTCCTCAGTGGAAAC 1200 ****|||||*************|||||*||*|||*||||||||||||||| 1135 ----CCACC-------------ATTCCTCCATCACCTCCTCAGTGGAAAC 1167 1201 TGCAACCCGGAGATTCTCTCCTGGGAAATCAATCCTTACTGGAGACTCAT 1250 |||||||*||*|||*|*|||||||||||||||||**|*||||||||*||| 1168 TGCAACCAGGGGATCCCCTCCTGGGAAATCAATCACTGCTGGAGACACAT 1217 1251 CCGTTATACCGGAATCCGGAACCAGCAGTCCCAGTGATAAAAACTCCCAG 1300 |||**|||||*||||||*||*|||||*||*||*||*||*|||||*||*|| 1218 CCGCGATACCAGAATCCCGAGCCAGCGGTTCCTGTCATCAAAACACCGAG 1267 1301 ACTGAAAAAGAAGATGTCTGGTTCCTTCGAGGGAATACTAGCTGGCCTAA 1350 |*|*||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1268 AATCAAGAAGAAAATGTCTGGTTCCTTCGAGGGAATACTAGCTGGCCTAA 1317 1351 TCGGATTACTGGTAAGCTTTTTCTTGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTG 1400 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1318 TAGGATTACTGGTAAGCTTTTTCTTGTTGATAAAAATTCTCGAAATACTG 1367 1401 AGGAGGCTAGATTGGTGGTGGATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGGAAAAAT 1450 ||||*||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1368 AGGAAGCTAGACTGGTGGTGGATTTCTCTCAGTTCTCCAAAGGAAAAAAT 1417 1451 GCAATGCGCTTTCCAAGATACTGGAGCCCAAATCTCTCCACACTACGTAG 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||||**|*||||||*||||||| 1418 GCAATGCGCTTTCCAAGATACTGGAGCCCAAACTTATCCACATTACGTAG 1467 1501 GATCTTGCCCGTGGGGATGCCCAGGATTTCTTTGGACTTATCTCAGGCTT 1550 ||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1468 GATCCTGCCCGTGGGGATGCCCAGGATTTCTCTGGACTTATCTCAGGCTT 1517 1551 TTTATCATCTTCCTTTTAATCCTGCTAGTAGCAGCCGGCTTGCTGTATCT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||*||||| 1518 TTTATCATCTTCCTTTTAATCCTGCTAGTAGTAGCAGGCTTGCTATATCT 1567 1601 GACGGACAACGGGTCTACTATTTTCGGAAAGCTCCAATGGGAGTCGGCCT 1650 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|| 1568 GACGGACAACGGGTCTACTATTTTAGGAAAGCTCCAATGGGAGTCGGTCT 1617 1651 TAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTTCACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCG 1700 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1618 CAGCCCTTTTCTCCTCCATCTCTTCACTACTGCCCTCGGATCCGAAATCT 1667 1701 CTCGTCGCTTTAACGTTTGGACTTTCACTTATATGGATGACTTCCTCCTC 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1668 CTCGTCGCTTTAACGTTTGGACTTTCACTTATATGGATGACTTCCTCCTC 1717 1751 TGTCACCCAAACGCTCGTCACCTTCACGCAATTAGCAACTCTGTTTGCAA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*||||* 1718 TGTCACCCAAACGCTCGTCACCTTCACGCAATTAGCAACGCTGTCTGCAC 1767 1801 TTTTCTTCAAGAGTTAGGAATTCGGATCAATTTTGATAAAACCACACCTT 1850 ||||||*||||||||||||*|**|*||*||*|||||||||||*||*|||| 1768 TTTTCTACAAGAGTTAGGAGTCAGAATAAACTTTGATAAAACGACTCCTT 1817 1851 CTCCTGTAACTGAAATAAGATTCCTCGGATATCAAATTGATTCAAAATTT 1900 |||||||****|||||*|||||||||||*||**||||||||||||**|** 1818 CTCCTGTTCACGAAATCAGATTCCTCGGTTACGAAATTGATTCAACGTAC 1867 1901 ATGAGAATTGAAGACATGAGATGGACTGAAATAAGAAATGTCATTAAGAA 1950 ||||**||*|||||*|**|||||||**|||*|*||||*|||*||*||||| 1868 ATGAAGATCGAAGAAAGCAGATGGAAAGAACTGAGAACTGTTATAAAGAA 1917 1951 AATTAAAGTCGGAGAATGGTATGACTGGAAATGTATTCAAAGATTTGTTG 2000 |||*|||||*||*|||||||||||*||||||||||||||*|||||||||| 1918 AATAAAAGTTGGTGAATGGTATGATTGGAAATGTATTCAGAGATTTGTTG 1967 2001 GGCATTTAAACTTTGTATTACCTTTCACAAAAGGAAATACAGAAATGTTA 2050 ||||||||||||||||*||||||||*||||||||||**|||||||||||| 1968 GGCATTTAAACTTTGTGTTACCTTTTACAAAAGGAAGCACAGAAATGTTA 2017 2051 AAACCAATGTATACTGCTATTTCCAATCAAGTAAATTTTAGCTTCTCTTC 2100 ||||||||||||*|||||||**|*||||||||*||*|||||||||||||| 2018 AAACCAATGTATGCTGCTATAACGAATCAAGTTAACTTTAGCTTCTCTTC 2067 2101 GGCTTATAGGACTTTGCTTTATAAATTAACAATGGGAGTATGTAAATTGT 2150 *||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||* 2068 TGCTTATAGGACTTTGCTTTACAAATTAACTATGGGAGTATGTAAATTGC 2117 2151 CAATAAAACCAAAGGTCTCTGTTCCTTTGCCAAGAGTAGCCACGGATGCT 2200 *|||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||*||*|||||| 2118 AAATAAAACCAAAGGTCTCTGTTCCTTTGCCACGTGTAGCAACAGATGCT 2167 2201 ACACCAACACATGGCGCAATATCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTT 2250 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2168 ACCCCAACACATGGCGCAATATCCCATATCACCGGCGGGAGCGCAGTGTT 2217 2251 TACTTTTTCAAAGGTCAGAGACATTCATGTGCAAGAATTGCTGATGGCAT 2300 |*|||||||||||||||||||*||*|||||*||*|||||**|||||*|*| 2218 TGCTTTTTCAAAGGTCAGAGATATACATGTACAGGAATTATTGATGTCTT 2267 2301 GTTTAGCTAAGCTAATGATTAAACCTAGATGTTTGTTATCTGATTCTACT 2350 ||*|*||||||*||||||||||*||||||||*|||*|||||||||||||* 2268 GTCTCGCTAAGTTAATGATTAAGCCTAGATGCTTGCTATCTGATTCTACC 2317 2351 TTTGTTTGTCACAAAAGATATCATTCACTTCCATGGTCTTTTGCTATGTT 2400 |||||||||||*||*|*||**|||||*|||||||||**|||||||||||| 2318 TTTGTTTGTCATAAGAAATTCCATTCCCTTCCATGGCATTTTGCTATGTT 2367 2401 GGCAAAGCAATTGCTTAATCCTATACAATTGTACTTTGTACCCAGTAAAT 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 2368 GGCAAAGCAATTGCTTAATCCTATACAATTGTACTTTGTCCCCAGTAAAT 2417 2451 ACAATCCTGCTGATGGCCCATCCAGGCATAAACCGCCTGATTGGACAGCA 2500 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||* 2418 ACAATCCTGCTGATGGCCCATCCAGGCATAAGCCGCCTGATTGGACAGCT 2467 2501 CTTACATACACCCCTCTCTCGAAACGTATATATATTCCACATAGGCTATG 2550 ||||||||||||||||||||||||***||||||||||||||||||||||| 2468 CTTACATACACCCCTCTCTCGAAAGCAATATATATTCCACATAGGCTATG 2517 2551 TGGAACTTAAGAATTACACCCCTCTCCTTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTAT 2600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2518 TGGAACTTAAGAATTACACCCCTCTCCTTCGGAGCTGCTTGCCAAGGTAT 2567 2601 CTTTACGTCTACATTGCTGTTGTTCTTTGTGACTGTACCTTTGGTATGTA 2650 |||||||||||||||||||||||**|*||||||||||||||||||||||| 2568 CTTTACGTCTACATTGCTGTTGTCGTGTGTGACTGTACCTTTGGTATGTA 2617 2651 CCATTGTTTATGATTTCTGCTTATATATGGATGTCAATGCTTCTAGAGCC 2700 |||||||||||||||**|||||||||||||||||*||||||||||||||| 2618 CCATTGTTTATGATTCTTGCTTATATATGGATGTTAATGCTTCTAGAGCC 2667 2701 TTAGCTAATGTGTATGATCTGCCAGATGATTTCTTTCCAAAAATTGATGA 2750 |||||*||||||||||||||*||||||||||||||*||*||||||||||| 2668 TTAGCCAATGTGTATGATCTTCCAGATGATTTCTTCCCTAAAATTGATGA 2717 2751 TTTAGTTAGAGATGCAAAAGATGCTTTGGAACCTTATTGGAGATCTGAAT 2800 |*|*||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||*| 2718 TCTTGTAAGAGATGCAAAAGATGCTTTAGAACCTTATTGGAGATCAGATT 2767 2801 CAATAAAGAAACATGTTTTAATCGCAACTCATTTTGTTGATTTGATTGAA 2850 ||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||||||**|*|||||| 2768 CAATAAAGAAACATGTATTAATAGCAACGCATTTTGTTGACCTTATTGAA 2817 2851 GACTTTTGGCAGACTACACAGGGTATGCATGAAATTGCAGAGGCATTAAG 2900 |||||*||||||||||||||||||||||||||*||*||*||*||*|||*| 2818 GACTTCTGGCAGACTACACAGGGTATGCATGAGATAGCTGAAGCTTTACG 2867 2901 GGCTGTTATTCCACCTACCACTACGCCTGTTCCCCCGGGATATTTGATTC 2950 *||*|||||||||||||||||*||*||*|||||*||*||*|||||*||*| 2868 AGCAGTTATTCCACCTACCACAACACCAGTTCCTCCAGGTTATTTAATCC 2917 2951 AGCACGAAGAGGCTGAGGAAATTCCCTTGGGAGATTTATTTAAACATCAA 3000 |*|||||*||*|||||*||*|||||*||*||*|||*|*|||||||||||* 2918 AACACGAGGAAGCTGAAGAGATTCCTTTAGGGGATCTGTTTAAACATCAG 2967 3001 GAAGAAAGGATAGTTAGTTTCCAACCTGATTATCCTATTACTGCAAGAAT 3050 ||||||||*||*||||||||||||||*||||||||*||*||*||*||||| 2968 GAAGAAAGAATTGTTAGTTTCCAACCAGATTATCCCATCACAGCTAGAAT 3017 3051 T 3051 | 3018 T 3018