NC_005843 AY339619 1 ACCGGATGGCCGCGCCTTTTTTGACCCGGCCCATCTTCGGAAATTTCGTA 50 |||||||||||||||||||||*|||||||||||**|**|||||||||||* 1 ACCGGATGGCCGCGCCTTTTT-GACCCGGCCCAATTCTGGAAATTTCGTT 49 51 GAAATTTCATAGATAAAATTAGCCAATCAGTGCACGCGTGTGCGGTCTAA 100 |****|||*|*||||||*||||||||||||*|||||*|||||**|||||| 50 GGGCCTTCCTGGATAAAGTTAGCCAATCAGCGCACGAGTGTGTAGTCTAA 99 101 TTATTAATAACTTGGCGACTAAGTCGTTTTCTGGTCTATAAATTTGTCGT 150 |||||||*|||||||||||*||||*|||||*||||||||||||||||||| 100 TTATTAACAACTTGGCGACCAAGTTGTTTTGTGGTCTATAAATTTGTCGT 149 151 TATGTGTGTGGTCCAGATATACATATTTTGAAAATGCCTAAGCGGGATGC 200 |||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||| 150 TATGTGTGTGGTCCAGATATATAGATTTTGAAAATGCCTAAGCGGGATGC 199 201 CCCATGGCGTTTAATGTCGGGTACTCCTAAGGTTAGTCGCTCCTCTAATT 250 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||*|||| 200 CCCATGGCGTTTAATGTCGGGTACCCCTAAGGTTAGTCGATCCTCAAATT 249 251 ATGTCCCTCCTGATGGATTGGGCCGTAAATTTGATAAATCATCTGCTTGG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||*||| 250 ATGTCCCTCCTGATGGATTGGGCCGTAAATTTGATAAGTCGTCTGCCTGG 299 301 GCCAACAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGGACCGTAAGGTC 350 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 300 GCTAACAGGCCCATGTACAGAAAGCCCAGGATATATCGGACCGTAAGGTC 349 351 TGCCGATGTTCCTCGAGGCTGTGAAGGGCCTTGCAAGATTCAGTCGTTTG 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 350 TGCCGATGTTCCTCGAGGCTGTGAAGGGCCTTGCAAGATTCAGTCGTTTG 399 401 AGCAGCGTCACGATATATCTCATACTGGAAAGGTGATGTGTATCTCCGAT 450 ||||||||||||||||*|||||*||*||*||||||||||||||||||||| 400 AGCAGCGTCACGATATCTCTCACACAGGGAAGGTGATGTGTATCTCCGAT 449 451 GTTACTCGCGGTAATGGCATTACCCATCGGGTTGGTAAACGTTTCTGCGT 500 ||||||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 450 GTTACTCGAGGCAATGGCATTACCCATCGGGTTGGTAAACGTTTCTGCGT 499 501 GAAGTCCGTGTATATATTAGGGAAGATCTGGATGGACGATAACATCAAGC 550 *||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||| 500 TAAGTCCGTGTATATATTAGGGAAGGTTTGGATGGACGATAACATCAAGC 549 551 TCAAGAACCACACTAACAGCGTTATGTTCTGGTTAGTTAGGGATAGGAGG 600 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 550 TGAAGAACCACACTAACAGCGTTATGTTCTGGTTAGTTAGGGATAGGAGG 599 601 CCCAGCGGAACGGCTATGGATTTTGGTCACCTCTTCAACATGTTTGACAA 650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 600 CCCAGCGGAACGGCTATGGATTTTGGTCACCTCTTTAACATGTTTGACAA 649 651 TGAGCCTAGTACTGCCACTGTGAAGAACGATCTTAGAGATCGTTTCCAAG 700 ||||||||||||*|||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 650 TGAGCCTAGTACCGCCACTGTGAAGAACGATCTTCGAGATCGTTTCCAAG 699 701 TGCTGCACAGGTTTCATGCGAAGGTGACTGGTGGTCAGTATGCAAGCAAT 750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||| 700 TGCTGCACAGGTTTCATGCGAAGGTGACTGGTGGTCAGTATGCTAGTAAT 749 751 GAGCAGACGTTGGTGAAGCGTTTTCGGCGGGTGAATCAGCGTGTAACATA 800 ||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||*||||||||||| 750 GAGCAGACGTTGGTGAAGCGTTTTTGGCGGGTGAATCATCGTGTAACATA 799 801 TAATAATCAGGAGGCAGCTCGGTATGAAAACCATACGGAGAACGCCTTAA 850 |||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*||||||||||||| 800 TAATAATCAGGAGGCGGCTCGGTATGAGAACCATACCGAGAACGCCTTAA 849 851 TGTTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACTCTT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 850 TGTTGTACATGGCATGTACTCATGCCTCTAACCCTGTGTATGCTACTCTT 899 901 AAGATCCGGATCTATTTTTATGATTCGGTGTTAAATTAATAAATTTTGAA 950 ||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 900 AAGATCCGGATCTACTTTTATGATTCGGTATTAAATTAATAAATTTTGAA 949 951 TTTTATTGAATAATTCTCAAGTACATGATTTACATACCATCTGTCTGTTG 1000 |||||||||||*|||*|||||||||||||||||||||*||*|*||||||| 950 TTTTATTGAATGATTTTCAAGTACATGATTTACATACGATTTATCTGTTG 999 1001 CGAAGCGAACAGCTCTAATTACATTATTAATGCAAATAACGCCTAATCTA 1050 |||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||| 1000 CGAAGCGAACAGCTCTAATTACATTATTAATACAAATAACGCCTAACCTA 1049 1051 TCTAAATACAATAAGACTAAATATTTAAATCTACTTAAGTAAGTCGTCCC 1100 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||| 1050 TCTAAATACAATAAGACTAAATATTTAAACCTACTTAAGTAATTCGTCCC 1099 1101 AGAAGCTCGAACTGATGTCGTCCAGATTTGGTAGTTGAGGTACGCTTTGT 1150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1100 AGAAGCTCGAACTGATGTCGTCCAGATTTGGTAGTTGAGGTATGCTTTGT 1149 1151 GTAGACTCAACGCCTTCCTGAGGTTGTGGTTGAACCTTATTTGGATGTGG 1200 |||||*|||||||||||||*||||||||||||||||*||||||||||||| 1150 GTAGATTCAACGCCTTCCTCAGGTTGTGGTTGAACCGTATTTGGATGTGG 1199 1201 TAAATCCTGCTGTTGGTGTAAATTGGGTCCTCTGTTTTGATTATCGTGAA 1250 ||*||||||*||||*|||||*||||||||||||***|*|||||||||||| 1200 TATATCCTGGTGTTCGTGTAGATTGGGTCCTCTACATCGATTATCGTGAA 1249 1251 ATAGAGGGGATTTGGTACCTCCCAGATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGTT 1300 |||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1250 ATATAGGGGATTTGGAACCTCCCAGATAAAAACGGAATTCTCTGCCTGAT 1299 1301 CCACAGTGATGCTCTCCCCGGTGCGTGAATCCATTGTTGGCGCAGTCGAT 1350 ||*||||||||||||||||*|||||*||||||||*||||||*||*||||| 1300 CCGCAGTGATGCTCTCCCCTGTGCGAGAATCCATGGTTGGCACAATCGAT 1349 1351 GTGTTGGTAGAATGAGCAGCCACAGTTTAGGTCTATTCTCTTGCGACGAA 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1350 GTGTTGGTAGAATGAGCAGCCACAGTTTAGGTCTATTCTCTTGCGACGAA 1399 1401 TCCTGGACTTTGCAATCTTGTGCTTAGGCTTGATAGAGGGTGGAGTTGAG 1450 ||||*||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1400 TCCTAGATTTTGCAATCTTGTGCTTAGGCTTGATAGAGGGTGGAGTTGAG 1449 1451 GAAGATGAATTTTGCATTGTGGAGGGTCCAAGCTTTTAGTGCTGCATTTT 1500 ||||||||||||||||||||||||*|||||**|||||||||||||||||| 1450 GAAGATGAATTTTGCATTGTGGAGTGTCCAGTCTTTTAGTGCTGCATTTT 1499 1501 CCTCTTTTTCAAGGGAACATTTATAGCTGGCTCCCTCTCCTGGATTGCAG 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1500 CCTCTTTTTCAAGGGAACATTTATAGCTGGCTCCCTCTCCTGGATTGCAT 1549 1551 AGCACGATTGATGGTATCCCACCTTTAATTTGAACTGGCTTCCCGTATTT 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1550 AGCACGATTGATGGTATCCCACCTTTAATTTGAACTGGCTTTCCGTATTT 1599 1601 GCAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCAATCAGCTCTTTCCAATGTT 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1600 GCAGTTGGACTGCCAGTCCTTTTGGGCCCCAATCAGCTCTTTCCAATGTT 1649 1651 TCATCTTTAAATATTGCGGAGTGACGTCATCAATGACGTTGTACTCCACA 1700 ||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||| 1650 TCATCTTTAAATATTGTGGAGTTACGTCATCAATGACGTTGTACTCCACA 1699 1701 TCATTTGAGTAAACCCTAGGATTGAAATCCAAGTGTCCACTCAAATAATT 1750 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1700 TCATTTGAGTAAACCCTAGGATTGAAATCCAAGTGTCCACTCAAATAATT 1749 1751 ATGTGGTCCTAAAGCACGAGCCCACATCGTCTTTCCTGTCCTCGAATCAC 1800 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||||||| 1750 ATGTGGTCCTAAAGCACGAGCCCACATTGTCTTTCCGGTCCTCGAATCAC 1799 1801 CCTCGATGATTATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGCACCCCTA 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1800 CCTCGATGATTATACTAATAGGTCTCTCCGGCCGCGCAGCGGCACCCCTA 1849 1851 CCAAAATAATCATCAGCCCACTCTTGCATCTCGTCCGGAACGTTCGTGAA 1900 ||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||| 1850 CCAAAATAATCATCAGCCCATTCTTGCATCTCATCCGGAACGTTCGTGAA 1899 1901 GGAGGAGAGTGGAAACGGAGGAACCCATGGTTCCGGAGCCTTAGCGAATA 1950 |||*||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 1900 GGAAGAGATTGGAAACGGAGGAACCCATGGTTCCGGAGCCTTTGCGAATA 1949 1951 TCCTGTCTAAGTTACTAGACAGGTTGTGATATTGAAAAAGAAACTCTTTG 2000 |||||||||*|||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||* 1950 TCCTGTCTAGGTTACTAGACAGGTTGTGATACTGAAAAAGAAACTCTTTT 1999 2001 GGGAGCTTCTCTTTAATAATTCGCATGGCTTCTTCTTTCGAGGACGCATT 2050 ||||||||||||||||||||*|||||*||*|||||*||||||||*||||| 2000 GGGAGCTTCTCTTTAATAATCCGCATTGCCTCTTCCTTCGAGGAGGCATT 2049 2051 TAGGGCCTCTGCGGCAGCGTCGTTAGCTGTTTGCTGACCTCCTCTAGCAG 2100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2050 TAGGGCCTCTGCGGCAGCGTCGTTAGCTGTTTGCTGACCTCCTCTAGCAG 2099 2101 ATCTTCCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCCAATGTATCTCCATCCTTG 2150 ||||*||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 2100 ATCTGCCGTCGATCTGGAATTCTCCCCATTCGATTGTATCTCCATCCTTG 2149 2151 TCGATGTAGGACTTGACGTCGGAGCTTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGG 2200 ||||**||||||||||||||||*||||||*|||||||||||||*|||||| 2150 TCGACATAGGACTTGACGTCGGTGCTTGACTTAGCTCCCTGAACGTTCGG 2199 2201 ATGGAAATGTGCTGACCTGGTTGGGGATACCAGGTCGAACTGTCTTTGAT 2250 |||||||||||*||||||*||||*|||||||||||||||***||****|| 2200 ATGGAAATGTGTTGACCTAGTTGAGGATACCAGGTCGAAGAATCGGCAAT 2249 2251 TCGTGATTTGGATTTTCCCTTCGAACTGCATAAGCACGTGGAGATGATGT 2300 |*****|||*||*|||*|||||||||||*|||||||||||||||||||*| 2250 TTTGCGTTTTGAATTTGCCTTCGAACTGGATAAGCACGTGGAGATGATAT 2299 2301 TCCCCATTTTCGTGCAGTTCTCTGCAGATCTTGATGTATTTTTTGTTAGA 2350 |||||||*||||||||*||||||****||*|||||*||||||||*||||* 2300 TCCCCATCTTCGTGCAATTCTCTTGCAATTTTGATATATTTTTTATTAGT 2349 2351 AGGAAGTTGTATGGACAGTAGTTGATCTAGGGCTTCTTCTTTTGTAAGAG 2400 *||*******|*****|*||||||*|||||||*||||||*||*||*|*|| 2350 CGGGGTGCTCAACCGTAATAGTTGCTCTAGGGTTTCTTCCTTGGTTAAAG 2399 2401 GACATTGGGGGTATGTTAGGAAGATATTTTTTGCTTGAAGGCGAAAACGT 2450 *|||*||*|||||||||||*||***||||||*|**|**|****|||***| 2400 AACAGTGTGGGTATGTTAGAAAATAATTTTTAGAATTTATAATAAACTTT 2449 2451 TTAGGTGGT---GGCATTTTTGTAATTAA--TAGATGTACTCCGATTGCC 2495 ||*||***|***|||||||||||||*||***|||*|**||*||*||||** 2450 TTTGGAACTAAGGGCATTTTTGTAAATATAGTAGGTCGAC-CCAATTGAG 2498 2496 TCTTCTTACAAAAGTCTATATGAATTGGAG-TATTGGAGTACAATATATA 2544 ***||||**||||*||||*|*|||||||***||*|||******||*|||| 2499 CTCTCTTCAAAAACTCTA-AGGAATTGGGTATACTGGGTCCTTATTTATA 2547 2545 CTAGAAGGTCCTATAGAACTTTCAATCGTATCCGCTCACGTGGCGGCCAT 2594 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 2548 CTAGAAGGTCCTATAGAACTTTCAATCGCATCCGCTCACGTGGCGGCCAT 2597 2595 CCGTTTAATATT 2606 ||||*||||||| 2598 CCGTATAATATT 2609