NC_005321 AJ811439 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGGTCCCCGCATGCGCTGGTGTC 50 ************************************************** -------------------------------------------------- 51 CAATCCTATCCGCTCCTCAAAGCTTAATTATTAAGTGGTCCCCTATATAA 100 ************************************************** -------------------------------------------------- 101 CTTGGTCCCCAAGTACTAAAGCTAAACATGTGGGATCCTTTACTAAACGA 150 **************************||||||||||||||||*||||||| 1 --------------------------CATGTGGGATCCTTTAGTAAACGA 24 151 GTTTCCCGAGACCGTACATGGTTTCAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATT 200 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 25 GTTTCCCGATACCGTACATGGTTTCAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATT 74 201 TGCAACTGGTAGAAAATACGTACTCTCCAGATACATTAGGGCACGACTTA 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 75 TGCAACTGGTAGAAAATACGTACTCTCCAGATACATTAGGGCACGATTTA 124 251 ATTCGTGATTTAATTTCAGTTATTCGTGCTAGAGATTATGTCGAAGCGAC 300 |||||*||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 125 ATTCGCGATTTAATTTTAGTTATTCGTGCTAGAGATTATGTCGAAGCGAC 174 301 CCGCCGATATAGTCATTTCCACACCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTG 350 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 175 CCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTG 224 351 AATTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGT 400 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 225 AATTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCTGCTGCCCCTACTGTCCTCGT 274 401 CACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCA 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 275 CACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCAA 324 451 GGATGTACAGGATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCTCGTGGTTGTGAGGGT 500 ||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||* 325 GGATGTACCGGATGTACAAAAGCCCTGATGTTCCTCGTGGTTGTGAGGGA 374 501 CCATGTAAGGTCCAGTCGTATGAACAGCGTCATGATGTAGCACACGTAGG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|| 375 CCATGTAAGGTCCAGTCGTATGAACAGCGTCATGATGTAGCTCACGTTGG 424 551 TAAGGTAATTTGTGTGTCGGATGTTACCCGTGGTAATGGTTTGACTCATC 600 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||| 425 TAAGGTCATTTGTGTGTCGGATGTTACTCGTGGTAATGGTTTGACGCATC 474 601 GAGTCGGGAAGAGGTTTTGTGTTAAATCAGTCTATGTTTTGGGCAA---G 647 |||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||***| 475 GAGTCGGTAAGAGGTTTTGTGTTAAATCTGTCTATGTTTTGGGTAACATG 524 648 ATATGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACCAACACAGTCAT 697 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 525 ATATGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACCAACACAGTCAT 574 698 GTTTTTTCTAGTTCGTGATAGGAGACCATTTGGCACTCCACAGGATTTTG 747 |||||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||| 575 GTTTTTTTTAGTTCGTGATAGGAGACCTTTTGGCACTCCCCAGGATTTTG 624 748 GCCAGGTGTTTAACATGTATGATAATGAGCCTAGCACTGCTACTGTGAAG 797 |||||||||||||||||||*|||||||||||*||*||*|||||||||||| 625 GCCAGGTGTTTAACATGTACGATAATGAGCCGAGTACAGCTACTGTGAAG 674 798 AACGACAACAGGGATCGCTTTCAAGTTCTACGGCGTTTTCAGGCGACTGT 847 ||*||||||||||||||*||||||||||||||*||||||||||||||||| 675 AATGACAACAGGGATCGTTTTCAAGTTCTACGTCGTTTTCAGGCGACTGT 724 848 TACGGGTGGTCAGTATGCAAGTAAGGAGCAAGCAATAGTTAGGAAATTTA 897 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 725 TACTGGTGGTCAGTATGCAAGTAAGGAGCAAGCAATAGTCAGGAAATTTA 774 898 TGAAGGTTAACAACCATGTGACTTATAACCATCAAGAGGCTGCGAAGTAT 947 |||||||||||||*||||||||*|||||*||||||||*|||||||||||| 775 TGAAGGTTAACAATCATGTGACGTATAATCATCAAGAAGCTGCGAAGTAT 824 948 GATAACCACACAGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGC 997 ||*||*|||||||||||||||*|*|||||||||||||||||||||||||| 825 GACAATCACACAGAGAATGCTCTTTTATTGTATATGGCATGTACTCATGC 874 998 TAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAGGATCTATTTCTATGATT 1047 ||||||*||||||||||||||*||*||*||||||||||||||*||||||| 875 TAGTAACCCAGTGTATGCTACATTAAAAATCAGGATCTATTTTTATGATT 924 1048 CTGTTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATGAGAATGTGTTACA 1097 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||||| 925 CTGTTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATTTGAATGTGTTACA 974 1098 TATTCTGTTTTCTCCAATACATCCCATAATACATGATTACATGCTCTAAT 1147 ||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 975 TATTCTGTGTTTTCCAATACATCCCATAATACATGATTACATTCTCTAAT 1024 1148 TACATTGTTAATACTAATTACACCCATATTATCTAAATATTTCATACATT 1197 ||||||*|||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1025 TACATTATTAATACTAATTACACCCAAATTATCTAAATATTTCATACATT 1074 1198 GAACCCTAAATACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTC 1247 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1075 GAACCCTAAAAACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTC 1124 1248 CAGATCTGGAAGATCAGAAAACACTGGTGTATTCCCAATGCTTTCCTCAG 1297 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 1125 CAGATCTGGAAGATCAGAAAACACTGGTGTATTCCCAACGCTTTCCTCAG 1174 1298 GTTGTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGYCGTGGTTGGTGTTGA 1347 ||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*||||||||||| 1175 GTTGTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGTCGTTGTTGGTGTTGA 1224 1348 ATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGATC 1397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1225 ATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGATT 1274 1398 GTCCAGGTATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCC 1447 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1275 GTCCAGGTATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCC 1324 1448 TGTGCGAAAATCCATGATTTGCACAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCAC 1497 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1325 TGTGCGCAAATCCATGATTTGCACAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCAC 1374 1498 CCGCACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGAATGGGCCTCCTCTTGGCTAT 1547 ||*|||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1375 CCACACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGAATGGGCTTCCTCTTGGCTAT 1424 1548 TCTGTGTTGCACTTTGATTGGTACCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGGTG 1597 ||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||||| 1425 TCTGTGTTGCACTTTGATTGATACCTGAGTACAATGGGTTGTTGAGGGTG 1474 1598 ATGAATTCCGCATTCTTTAATGCCCAATCTTTTAATGCTGAATTTTTATC 1647 ||||||||||||||**|||||||||||||||||||*||*||||||||||| 1475 ATGAATTCCGCATTTCTTAATGCCCAATCTTTTAAAGCAGAATTTTTATC 1524 1648 CTCATTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGGCCTGGATTGCATAGGA 1697 |||*|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||| 1525 CTCGTTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGTCCTGGATTGCAAAGGA 1574 1698 AGATAGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAATGGCTTTCCCGTACTTAGTG 1747 |||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||||| 1575 AGATAGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAATTGGTTTCCCGTACTTAGTG 1624 1748 TTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAG 1797 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 1625 TTGCTTTGCCAGTCCCGTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAG 1674 1798 ATAGTGGGGGTCTACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTACTGT 1847 ||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1675 ATAGTGGGGGTCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTACTGT 1724 1848 ATACTTTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCC 1897 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1725 ATACCTTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCC 1774 1898 AGTGATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATCAC 1947 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1775 AGTGATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATCAC 1824 1948 AATACTCTTGGGTCTCCACGGCCGCGCAGCGGCACCACTCACGTTCTCAG 1997 ||||||*|||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||| 1825 AATACTTTTGGGTCTCCAAGGCCGCGCAGCGGCACCACTCACATTCTCAG 1874 1998 AAACCCACTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGA 2047 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1875 AAACCCACTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGA 1924 2048 AAAGGACAAACAAAAACCTCTATAGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATT 2097 ||*||||||||||*||||||||*|||||||||||||||*||||||||||| 1925 AATGGACAAACAATAACCTCTAAAGGAGGTGCAAAAATTCTATCTAAATT 1974 2098 ACTATTTAAATTATGAAACTGTAAAACGAAATCTTTAGGAGCCTTCTCCT 2147 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 1975 ACTATTTAAATTATGAAATTGTAAAACGAAATCTTTAGGAGCCTTCTCCT 2024 2148 TTAATATATTGAGGGCCGCTGGTTTGGACCTTGCATTGATTGCCTCGGCA 2197 |||||||||||||||||||||*||||||||*||*|||||||||||||||| 2025 TTAATATATTGAGGGCCGCTGCTTTGGACCCTGAATTGATTGCCTCGGCA 2074 2198 TATGCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCGAT 2247 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2075 TATGCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCGAT 2124 2248 TTGGAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTT 2297 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2125 TTGGAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTT 2174 2298 TAACATCTGTTGAGGTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCT 2347 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2175 TAACATCTGTTGAGCTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCT 2224 2348 GACCTGCTTGGGGAGGTGAGATCGAAGAATCTGTTGTTTTGGCACTTGAA 2397 ||||||*|||||||****||*||||||||||**|**||||*|||*|*||| 2225 GACCTGTTTGGGGATACCAGGTCGAAGAATCGTTGATTTTTGCATTGGAA 2274 2398 TTTGCCTCCGAACTGTATGAGGACATGCAGGTGAGGAGACCCATCTCCGT 2447 |||*|||*||||*||*|||||||||||||*||||||||*|||||||*||| 2275 TTTTCCTTCGAATTGGATGAGGACATGCAAGTGAGGAGTCCCATCTTCGT 2324 2448 GTAGTTCCCTGCAAATACGTATGAATAATTTATTAGTCGGGGTTGATAAG 2497 |||*|||||||||*||*||*|||||||||||||||||*||||||**|||| 2325 GTAATTCCCTGCAGATTCGAATGAATAATTTATTAGTTGGGGTTTCTAAG 2374 2498 GCTGAGATTTGGGAAAATGCCTCTTCTTTAGTAAGGGAGCAGTGTGGATA 2547 |||***||||||||||*|||*||*|||||*||*||*|||||||||||*|| 2375 GCTTTAATTTGGGAAAGTGCTTCCTCTTTGGTGAGAGAGCAGTGTGGGTA 2424 2548 AGTGAGGGAATAATTCTTGGCATTTATTAAAAATTTTTTTGGCTGAGGCA 2597 *||*|||*||||*||*||||||||||||***|||||*|||||**|||*|| 2425 TGTTAGGAAATAGTTTTTGGCATTTATTCTGAATTTATTTGGAGGAGCCA 2474 2598 TATTGACTGGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTGGCTATGCAATCGGGGAA 2647 |**|||||||||||||||***||||||||||||||||||||||*||*|** 2475 T--TGACTGGTCAATCGGTGTCTCTCAAACTTGGCTATGCAATTGGTGTC 2522 2648 TGGGTCCTTATTTATAGTTCAGGAC-CTAAATGGCATTATTGTAATTCCC 2696 ||||**|||||||||**||**||||*|*|||||||||||*|||||||*|* 2523 TGGGGTCTTATTTAT--TTGTGGACACCAAATGGCATTAATGTAATTTCT 2570 2697 AAAAGAAATTCAAAATTTGAATTTTGAATCCAAAAGCGGCCATCCGTATA 2746 **||||||||**||||||***********||||||||||||||||||||| 2571 TTAAGAAATTTCAAATTT-----------CCAAAAGCGGCCATCCGTATA 2609 2747 ATAT-----------------------------------T 2751 ||||***********************************| 2610 ATATACCGGATGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGTCCCGCAT 2649