NC_005321 AJ558125 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGGTCCCCGCATGCGCTGGTGTC 50 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||**|||| 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGGTCCCCCCATGCGCTCCTGTC 50 51 CAATCCTATCCGCTCCTCAAAGCTTAATTATTAAGTGGTCCCCTATATAA 100 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||| 51 CAATCCTATCCGCTCCTCAAAGCTTAATTATTAAGTAGTCCTCTATATAA 100 101 CTTGGTCCCCAAGTACTAAAGCTAAACATGTGGGATCCTTTACTAAACGA 150 |||||||||||||||*|*|*|**||||||||||||||||||||||||||| 101 CTTGGTCCCCAAGTAGTCACGTCAAACATGTGGGATCCTTTACTAAACGA 150 151 GTTTCCCGAGACCGTACATGGTTTCAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATT 200 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 151 GTTTCCCGATACCGTACATGGTTTCAGGTGTATGCTAGCAATTAAGTATT 200 201 TGCAACTGGTAGAAAATACGTACTCTCCAGATACATTAGGGCACGACTTA 250 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 201 TGCAACTGGTAGAAAATACGTACTCTCCAGATACATTAGGGCACGATTTA 250 251 ATTCGTGATTTAATTTCAGTTATTCGTGCTAGAGATTATGTCGAAGCGAC 300 |||||*||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 251 ATTCGCGATTTAATTTTAGTTATTCGTGCTAGAGATTATGTCGAAGCGAC 300 301 CCGCCGATATAGTCATTTCCACACCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTG 350 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 301 CCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCCGGCTG 350 351 AATTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGT 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 351 AATTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTCCTCGT 400 401 CACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCCA 450 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 401 CACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAAGCCAA 450 451 GGATGTACAGGATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCTCGTGGTTGTGAGGGT 500 ||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||* 451 GGATGTACCGGATGTACAAAAGCCCTGATGTTCCTCGTGGTTGTGAGGGA 500 501 CCATGTAAGGTCCAGTCGTATGAACAGCGTCATGATGTAGCACACGTAGG 550 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|| 501 CCATGTAAGGTCCAGTCGTATGAACAGCGTCATGATGTAGCTCACGTTGG 550 551 TAAGGTAATTTGTGTGTCGGATGTTACCCGTGGTAATGGTTTGACTCATC 600 ||||||*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*|||| 551 TAAGGTCATTTGTGTGTCGGATGTTACTCGTGGTAATGGTTTGACGCATC 600 601 GAGTCGGGAAGAGGTTTTGTGTTAAATCAGTCTATGTTTTGGGCAAGATA 650 |||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*|||||| 601 GAGTCGGTAAGAGGTTTTGTGTTAAATCTGTCTATGTTTTGGGTAAGATA 650 651 TGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACCAACACAGTCATGTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 651 TGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACCAACACAGTCATGTT 700 701 TTTTCTAGTTCGTGATAGGAGACCATTTGGCACTCCACAGGATTTTGGCC 750 ||||*|||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||| 701 TTTTTTAGTTCGTGATAGGAGACCTTTTGGCACTCCCCAGGATTTTGGCC 750 751 AGGTGTTTAACATGTATGATAATGAGCCTAGCACTGCTACTGTGAAGAAC 800 ||||||||||||||||*|||||||||||*||*||*||||||||||||||* 751 AGGTGTTTAACATGTACGATAATGAGCCGAGTACAGCTACTGTGAAGAAT 800 801 GACAACAGGGATCGCTTTCAAGTTCTACGGCGTTTTCAGGCGACTGTTAC 850 ||||||||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||| 801 GACAACAGGGATCGTTTTCAAGTTCTACGTCGTTTTCAGGCGACTGTTAC 850 851 GGGTGGTCAGTATGCAAGTAAGGAGCAAGCAATAGTTAGGAAATTTATGA 900 *||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 851 TGGTGGTCAGTATGCAAGTAAGGAGCAAGCAATAGTTAGGAAATTTATGA 900 901 AGGTTAACAACCATGTGACTTATAACCATCAAGAGGCTGCGAAGTATGAT 950 ||||||||||*||||||||*|||||*||||||||*||||||||||||||* 901 AGGTTAACAATCATGTGACGTATAATCATCAAGAAGCTGCGAAGTATGAC 950 951 AACCACACAGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTAG 1000 ||*|||||||||||||||*|*||||||||||||||||||||||||||||| 951 AATCACACAGAGAATGCTCTTTTATTGTATATGGCATGTACTCATGCTAG 1000 1001 TAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAGGATCTATTTCTATGATTCTG 1050 |||*||||||||||||||*||*||*||||||||||||||*|||||||||| 1001 TAACCCAGTGTATGCTACATTAAAAATCAGGATCTATTTTTATGATTCTG 1050 1051 TTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATGAGAATGTGTTACATAT 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||**||||||||||||||| 1051 TTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATTTGAATGTGTTACATAT 1100 1101 TCTGTTTTCTCCAATACATCCCATAATACATGATTACATGCTCTAATTAC 1150 |||||*||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1101 TCTGTGTTTTCCAATACATCCCATAATACATGATTACATGCTCTAATTAC 1150 1151 ATTGTTAATACTAATTACACCCATATTATCTAAATATTTCATACATTGAA 1200 |||*|||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1151 ATTATTAATACTAATTACACCCAAATTATCTAAATATTTCATACATTGAA 1200 1201 CCCTAAATACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTCCAG 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1201 CCCTAAATACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAGTCCAG 1250 1251 ATCTGGAAGATCAGAAAACACTGGTGTATTCCCAATGCTTTCCTCAGGTT 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1251 ATCTGGAAGATCAGAAAACACTGGTGTATTCCCAACGCTTTCCTCAGGTT 1300 1301 GTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGYCGTGGTTGGTGTTGAATG 1350 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 1301 GTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGTCGTGGTTGGTGTTGAATG 1350 1351 GTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGATCGTC 1400 ||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||| 1351 GTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATTTTGAAATATAGGGGATTTTTGATTGTC 1400 1401 CAGGTATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCCTGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1401 CAGGTATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCCCCTGT 1450 1451 GCGAAAATCCATGATTTGCACAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCACCCG 1500 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1451 GCGCAAATCCATGATTTGCACAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGCACCCG 1500 1501 CACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGAATGGGCCTCCTCTTGGCTATTCT 1550 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1501 CACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGAATGGGCTTCCTCTTGGCTATTCT 1550 1551 GTGTTGCACTTTGATTGGTACCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGGTGATG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 1551 GTGTTGCACTTTGATTGGTACCTGAGTACAATGGGTTGTTGAGGGTGATG 1600 1601 AATTCCGCATTCTTTAATGCCCAATCTTTTAATGCTGAATTTTTATCCTC 1650 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 1601 AATTCCGCATTCTTTAATGCCCAATCTTTTAAAGCAGAATTTTTATCCTC 1650 1651 ATTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGGCCTGGATTGCATAGGAAGA 1700 *|||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||| 1651 GTTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGTCCTGGATTGCAAAGGAAGA 1700 1701 TAGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAATGGCTTTCCCGTACTTAGTGTTG 1750 ||||||||||||||||||||||||||||*|*||||||||||||||||||| 1701 TAGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAATTGGTTTCCCGTACTTAGTGTTG 1750 1751 CTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1751 CTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATA 1800 1801 GTGGGGGTCTACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTACTGTATA 1850 |||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1801 GTGGGGGTCGACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTACTGTATA 1850 1851 CTTTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCCAGT 1900 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1851 CCTTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTCCCAGT 1900 1901 GATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATCACAAT 1950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1901 GATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATCACAAT 1950 1951 ACTCTTGGGTCTCCACGGCCGCGCAGCGGCACCACTCACGTTCTCAGAAA 2000 |||*|||||||||||*|||||||||||***|||||||||*|||||||||| 1951 ACTTTTGGGTCTCCAAGGCCGCGCAGC---ACCACTCACATTCTCAGAAA 1997 2001 CCCACTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGAAAA 2050 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1998 CCCACTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAAGAAAT 2047 2051 GGACAAACAAAAACCTCTATAGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATTACT 2100 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2048 GGACAAACAAAAACCTCTAAAGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAATTACT 2097 2101 ATTTAAATTATGAAACTGTAAAACGAAATCTTTAGGAGCCTTCTCCTTTA 2150 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 2098 ATTTAAATTATGAAATTGTAAAACGAAATCTTTAGGAGCCTTCTCCTTTA 2147 2151 ATATATTGAGGGCCGCTGGTTTGGACCTTGCATTGATTGCCTCGGCATAT 2200 ||||||||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||| 2148 ATATATTGAGGGCCGCTGCTTTGGACCTTGAATTGATTGCCTCGGCATAT 2197 2201 GCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCGATTTG 2250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2198 GCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCGATTTG 2247 2251 GAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTTTAA 2300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2248 GAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGCTTTAA 2297 2301 CATCTGTTGAGGTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGAC 2350 |||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||| 2298 CATCTGTTGAGCTTTTAGCTCCCTGTATGTTCGGATGGAAATGTGCTGAC 2347 2351 CTGCTTGGGGAGGTGAGATCGAAGAATCTGTTGTTTTGGCACTTGAATTT 2400 |||*|||||||****||*||||||||||**|**||||*|||*|*|||||| 2348 CTGTTTGGGGATACCAGGTCGAAGAATCGTTGATTTTTGCATTGGAATTT 2397 2401 GCCTCCGAACTGTATGAGGACATGCAGGTGAGGAGACCCATCTCCGTGTA 2450 *|||*||||*||*|||||||||||||*||||||||*|||||||*|||||| 2398 TCCTTCGAATTGGATGAGGACATGCAAGTGAGGAGTCCCATCTTCGTGTA 2447 2451 GTTCCCTGCAAATACGTATGAATAATTTATTAGTCGGGGTTGATAAGGCT 2500 *|||||||||*||*||*|||||*|||||||||||*||||*|**||||||| 2448 ATTCCCTGCAGATTCGAATGAAAAATTTATTAGTTGGGGCTCCTAAGGCT 2497 2501 GAGATTTGGGAAAATGCCTCTTCTTTAGTAAGGGAGCAGTGTGGATAAGT 2550 ***||||||||||*|||*||*|||||*||*||*|||||||||||*||*|| 2498 TTAATTTGGGAAAGTGCTTCCTCTTTGGTGAGAGAGCAGTGTGGGTATGT 2547 2551 GAGGGAATAATTCTTGGCATTTATTAAAAATTTTTTTGGCTGAGGCATAT 2600 *|||*||||*||*||||||||||||***|||||*|||||**|||*|||** 2548 TAGGAAATAGTTTTTGGCATTTATTCTGAATTTATTTGGAGGAGCCAT-- 2595 2601 TGACTGGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTGGCTATGCAATCGGGGAATGG 2650 |||||||||||||||***||||||||||||||||||||||*||*|**||| 2596 TGACTGGTCAATCGGTGTCTCTCAAACTTGGCTATGCAATTGGTGTCTGG 2645 2651 GTCCTTATTTATAGTTCAGGACCTAAATGGCATTATTGTAATTCCCAAAA 2700 |**||||||||||**|****|||*|||||||||||*|||||||*|***|* 2646 GGTCTTATTTATATGTGGACACC-AAATGGCATTAATGTAATTTCTTTAT 2694 2701 GAAATTCAAAATTTGAATTTTGAATCCAAAAGCGGCCATCCGTATAATAT 2750 ||||||||||*|*************||||||||||||||||||||||||| 2695 GAAATTCAAATT-------------CCAAAAGCGGCCATCCGTATAATAT 2731 2751 T 2751 | 2732 T 2732