NC_005321 AJ558117 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAAAGTGGTCCCCGC----ATGCGCTGG 46 ||||||||||||||||||||||||**|||||||||*|****|*|***||* 1 ACCGGATGGCCGCGATTTTTTTTAT-GTGGTCCCCACCACAAAGAAATGT 49 47 TGTCCAATCCTATCCGCTCCTCAAAGCTTAATTATTAAGTGGTCCCCTAT 96 **||||*|***|*|****|||||||||*||*|||*|******|||**||| 50 CCTCCACTTAAAACGCTCCCTCAAAGCCTATTTAATTCAAA-TCCGTTAT 98 97 ATA-ACTTGGTCCCCAAGTACTAAAGCTAAACATGTGGGATCCTTTACTA 145 |*|*||||||||||||||||*|*|*|**|||||||||||||||||||||| 99 AAATACTTGGTCCCCAAGTAGTCACGTCAAACATGTGGGATCCTTTACTA 148 146 AACGAGTTTCCCGAGACCGTACATGGTTTCAGGTGTATGCTAGCAATTAA 195 ||||||||||||||*||||||||||||||*||*||||||*||||*||||| 149 AACGAGTTTCCCGAAACCGTACATGGTTTTAGATGTATGTTAGCGATTAA 198 196 GTATTTGCAACTGGTAGAAAATACGTACTCTCCAGATACATTAGGGCACG 245 ||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||*||| 199 GTATTTGCAACTGGTAGAAAATACATACTCCCCAGATACATTAGGGTACG 248 246 ACTTAATTCGTGATTTAATTTCAGTTATTCGTGCTAGAGATTATGTCGAA 295 |*||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||||||| 249 ATTTAATTCGTGATTTAATTTCGGTTATTCGTGCTAGAGACTATGTCGAA 298 296 GCGACCCGCCGATATAGTCATTTCCACACCCGCATCCAAGGTGCGTCGCC 345 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 299 GCGACCCGCCGATATAGTCATTTCCACTCCCGCATCCAAGGTGCGTCGCC 348 346 GGCTGAATTTCGACAGCCCGTATGTCAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTC 395 ||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||| 349 GGCTGAATTTCGACAGCCCGTATGCCAGCCGTGCTGCTGCCCCCACTGTC 398 396 CTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAA 445 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 399 CTCGTCACAAACAAAAGGAGGTCATGGGTGAATCGGCCCATGTACCGAAA 448 446 GCCCAGGATGTACAGGATGTACAAAAGCCCTGATGTGCCTCGTGGTTGTG 495 |||||||||||||*||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 449 GCCCAGGATGTACCGGATGTACAAAAGCCCTGATGTTCCTCGTGGTTGTG 498 496 AGGGTCCATGTAAGGTCCAGTCGTATGAACAGCGTCATGATGTAGCACAC 545 |*||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||*||| 499 AAGGTCCATGTAAGGTTCAGTCTTATGAACAGCGTCATGATGTAGCGCAC 548 546 GTAGGTAAGGTAATTTGTGTGTCGGATGTTACCCGTGGTAATGGTTTGAC 595 |||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||*||*||||| 549 GTAGGTAAGGTCATTTGTGTGTCGGATGTTACTCGTGGTAACGGGTTGAC 598 596 TCATCGAGTCGGGAAGAGGTTTTGTGTTAAATCAGTCTATGTTTTGGGCA 645 |||||||||*||*|||||||||||||||||*||*|||||||||||||||| 599 TCATCGAGTTGGAAAGAGGTTTTGTGTTAAGTCTGTCTATGTTTTGGGCA 648 646 AGATATGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACCAACACAGTC 695 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||*||*||* 649 AGATATGGATGGATGAGAACATTAAGACCAAGAATCATACTAATACTGTG 698 696 ATGTTTTTTCTAGTTCGTGATAGGAGACCATTTGGCACTCCACAGGATTT 745 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 699 ATGTTTTTTCTAGTTCGTGATAGGAGACCATTTGGGACTCCACAGGATTT 748 746 TGGCCAGGTGTTTAACATGTATGATAATGAGCCTAGCACTGCTACTGTGA 795 |||*|||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||*| 749 TGGTCAGGTGTTTAATATGTACGATAATGAGCCTAGCACTGCTACTGTTA 798 796 AGAACGACAACAGGGATCGCTTTCAAGTTCTACGGCGTTTTCAGGCGACT 845 |||||||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 799 AGAACGACAACAGAGATCGCTTTCAAGTTCTACGCCGTTTTCAGGCGACT 848 846 GTTACGGGTGGTCAGTATGCAAGTAAGGAGCAAGCAATAGTTAGGAAATT 895 |||||*||||||||||||||*|||||||||||*||||||||*|||||||| 849 GTTACTGGTGGTCAGTATGCTAGTAAGGAGCAGGCAATAGTCAGGAAATT 898 896 TATGAAGGTTAACAACCATGTGACTTATAACCATCAAGAGGCTGCGAAGT 945 *||||||||*|||||||||||*||||||||*||||||||*|||||||||| 899 CATGAAGGTGAACAACCATGTTACTTATAATCATCAAGAAGCTGCGAAGT 948 946 ATGATAACCACACAGAGAATGCTTTGTTATTGTATATGGCATGTACTCAT 995 ||||*||*|||||||||||||||*|*||*||||||||||||||||||||| 949 ATGACAATCACACAGAGAATGCTCTTTTGTTGTATATGGCATGTACTCAT 998 996 GCTAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAGGATCTATTTCTATGA 1045 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 999 GCTAGTAATCCAGTGTATGCTACTTTGAAGATCAGAATCTATTTCTATGA 1048 1046 TTCTGTTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATGAGAATGTGTTA 1095 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**|||||||||| 1049 TTCTGTTCAGAATTAATAAAGATTGAATTTTATTATATTTGAATGTGTTA 1098 1096 CATATTCTGTTTTCTCCAATACATCCCATAATACATGATTACATGCTCTA 1145 |||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1099 CATATTCTGTTTTTTCCAATACATCCCATAATACATGATCACATGCTCTA 1148 1146 ATTACATTGTTAATACTAATTACACCCATATTATCTAAATATTTCATACA 1195 ||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||| 1149 ATTACATTGTTAATACTAATTACACCCAAATTATATAAATATTTCATACA 1198 1196 TTGAACCCTAAATACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGTTGTAAGCGAG 1245 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||**||||||||| 1199 TTGAACCCTAAATACTCTTAAGAAACGCCAAGTCTGAGGACGTAAGCGAG 1248 1246 TCCAGATCTGGAAGATCAGAAAACACTGGTGTATTCCCAATGCTTTCCTC 1295 ||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||| 1249 TCCAGATCTGGAAGATTAGAAAACACTGGTGTATTCCCAACGCTTTCCTC 1298 1296 AGGTTGTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGYCGTGGTTGGTGTT 1345 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 1299 AGGTTGTGGTTGAATTGTATTTGGATCGTTATGATGTCGTGGTTGGTGTT 1348 1346 GAATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGA 1395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1349 GAATGGTCTCTCGTGGTGCTTGGTTATCTTGAAATATAGGGGATTTTTGA 1398 1396 TCGTCCAGGTATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCC 1445 ||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1399 TCGTCCAGATATACACGCCACTCTCGCATTGAGTTGCAGTGAGTAATTCC 1448 1446 CCTGTGCGAAAATCCATGATTTGCACAATCTATGCCGAAGTAGTATGAGC 1495 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||| 1449 CCTGTGCGAAAATCCATGATTTGCACAATCTATTCCGGAGTAGTATGAGC 1498 1496 ACCCGCACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGAATGGGCCTCCTCTTGGCT 1545 |||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||||||*|||||||| 1499 ACCCGCACGTTAGATCAACTCTCCGTCTCCGGACGGGCCTCTTCTTGGCT 1548 1546 ATTCTGTGTTGCACTTTGATTGGTACCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGG 1595 |||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1549 ATTTTGTGTTGCACTTTGATTGGTACCTGAGTACAATGGGCTGTTGAGGG 1598 1596 TGATGAATTCCGCATTCTTTAATGCCCAATCTTTTAATGCTGAATTTTTA 1645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1599 TGATGAATTCCGCATTCTTTAATGCCCAATCTTTTAAAGCTGAATTTTTA 1648 1646 TCCTCATTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGGCCTGGATTGCATAG 1695 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|| 1649 TCCTCATTCAAGTACTCTTTATATGATGATGTTGGGCCTGGATTGCAAAG 1698 1696 GAAGATAGTTGGGATTCCACCTTTAATTTGAATGGCTTTCCCGTACTTAG 1745 ||||||||||||*||||||||||||||||||||*|*|||||||||||||| 1699 GAAGATAGTTGGAATTCCACCTTTAATTTGAATTGGTTTCCCGTACTTAG 1748 1746 TGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTT 1795 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1749 TGTTGCTTTGCCAGTCCCTTTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTT 1798 1796 AGATAGTGGGGGTCTACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCATCATTACT 1845 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1799 AGATAGTGGGGGTCTACGTCATCAATGACGTTATACCAAGCCTCATTACT 1848 1846 GTATACTTTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTC 1895 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1849 GTATACTCTTGGGCTTAGATCAAGATGTCCACACAAATAATTGTGTGGTC 1898 1896 CCAGTGATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATC 1945 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1899 CCAGTGATCTGGCCCACATTGTTTTACCCGTACGACTATCACCTTCTATC 1948 1946 ACAATACTCTTGGGTCTCCACGGCCGCGCAGCGGCACCACTCACGTTCTC 1995 |||||*||*||*||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||| 1949 ACAATGCTTTTCGGTCTCCATGGCCGCGCAGCGGCACCACTCACATTCTC 1998 1996 AGAAACCCACTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAATGAAGAAGAAA 2045 *||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*| 1999 GGAAACCCAGTCTTCAAGTTCTTCTGGAACTTGATCGAAAGAAGAAGACA 2048 2046 GAAAAGGACAAACAAAAACCTCTATAGGAGGTGCAAAAATCCTATCTAAA 2095 *|||||||||||||||*||||||***|||||***|||||||||||||||| 2049 AAAAAGGACAAACAAACACCTCTTGTGGAGGACTAAAAATCCTATCTAAA 2098 2096 TTACTATTTAAATTATGAAACTGTAAAACGAAATCTTTAGGAGCCTTCTC 2145 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||| 2099 TTACTATTTAAATTATGAAACTGTAAAACAAAATCTTTAGGGGCCTTCTC 2148 2146 CTTTAATATATTGAGGGCCGCTGGTTTGGACCTTGCATTGATTGCCTCGG 2195 ||||||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||| 2149 CTTTAATATATTGAGGGCCGCTGGTTTGGACCCTGAATTGATTGCCTCGG 2198 2196 CATATGCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCTTCCATCG 2245 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||| 2199 CATATGCGTCGTTGGCAGATTGGCAACCTCCTCTAGCTGATCGTCCATCG 2248 2246 ATTTGGAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGC 2295 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2249 ATTTGGAAAACTCCATGATCAAGCACGTCTCCGTCTTTTTCCATGTATGC 2298 2296 TTTAACATCTGTTGAGGTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTG 2345 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 2299 TTTAACATCTGTTGAGCTTTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTG 2348 2346 CTGACCTGCTTGGGGAGGTGAGATCGAAGAATCTGTTGTTTTGGCACTTG 2395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2349 CTGACCTGCTTGGGGAGGTGAGATCGAAGAATCTGTTGTTTTGGCACTTG 2398 2396 AATTTGCCTCCGAACTGTATGAGGACATGCAGGTGAGGAGACCCATCTCC 2445 |*|||||||*|||||||*||||||||||||||||||||||||||||||*| 2399 AGTTTGCCTTCGAACTGGATGAGGACATGCAGGTGAGGAGACCCATCTTC 2448 2446 GTGTAGTTCCCTGCAAATACGTATGAATAATTTATTAGTCGGGGTTGATA 2495 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2449 GTGTAGTTCCCTGCAAATACGTATGAATAATTTATTAGTCGGGGTTGATA 2498 2496 AGGCTGAGATTTGGGAAAATGCCTCTTCTTTAGTAAGGGAGCAGTGTGGA 2545 ||||||||||||||||||*||||||||||||*|||||||||||*|||||| 2499 AGGCTGAGATTTGGGAAAGTGCCTCTTCTTTGGTAAGGGAGCACTGTGGA 2548 2546 TAAGTGAGGGAATAATTCTTGGCATTTATTAAAAATTTTTTTGGCTGAGG 2595 |||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 2549 TAAGTGAGGAAATAATTCTTGGCATTTATTAAAAATTTTTTTGGTTGAGG 2598 2596 CATATTGACT-GGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTGGCTATGCAATCGGG 2644 |||*||||||*||||||||||||||||||||||||**||||||||||||| 2599 CAT-TTGACTTGGTCAATCGGGTCCTCTCAAACTTCCCTATGCAATCGGG 2647 2645 GAATGGGTCCTTATTTATAGTTCAGGACCTAAATGGCATTATTGTAATTC 2694 |||||||||||||||||||**|*||||||||||||||||||||||||*|* 2648 GAATGGGTCCTTATTTATATGTGAGGACCTAAATGGCATTATTGTAAATA 2697 2695 CCA-AAAGAAATTCAAAATTTGAATTTTGAATCCAAAAGCGGCCATCCGT 2743 ****||||||||||||||||**||******|||||||||||||||||||| 2698 GTTTAAAGAAATTCAAAATTCAAA------ATCCAAAAGCGGCCATCCGT 2741 2744 ATAATATT 2751 |||||||| 2742 ATAATATT 2749