NC_005331 AJ557452 1 ACCGGATGGCCGCGCGATTTTTTTCCCCCCTACGTGGCGCGCTGGTGACC 50 ||||||||||||*|**|||||||||||*|||||||||||||||||||||| 1 ACCGGATGGCCGGG--ATTTTTTTCCCTCCTACGTGGCGCGCTGGTGACC 48 51 ATTGGATACCGCTCTCCCTGGTGGTCCCCCTCCCAAGGTGTTACTCCCCC 100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 49 ATTGGATACCGCTCTCCCTGGTGGTCCCCCTCCCATGGTGTTACTCCCCC 98 101 CTCCCCGGCTGAATTCAATTGAGCGCTATTTTGGAGTCCGCGAAATGGGT 150 ||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99 CTCCCCGGCTCAATTCAATTGAGCGCTATTTTGGAGTCCGCGAAATGGGT 148 151 TAACCGCATTTTTTGACGTCCGCATACGATTGGTCCCTTTAATTTGAATT 200 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 149 TAACCGCATTTTTTGACGTCCGCATACGATTGGTCCCTTTAATTTGAATT 198 201 AAAGGATGTATAAATTCTATTGTCCAATCATTTCGCTCGGGTTGTCTCCT 250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|* 199 AAAGGATGTATAAATTCTATTGTCCAATCATTTCGCTCGGGTTGTCTTCC 248 251 CGCGCGACGCTCGCTTTTGCCCAACGGGATGAGATGTGATCTTGGTCGTT 300 |****||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 249 CCTCGGACGCTCGCTTTTGCC-AACGGGATGAGATGTGATCTTGGTCGTT 297 301 GGATAATAATATAATTTATTCAGCCTCTTTAATGTGAAATTTGAATTATT 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 298 GGATAATAATATAATTTATTCAGCCTCTTTAATGTGAAATTTGAATTATT 347 351 GGCGAG-CGTCGTACTACCATGTCCCATCGTACGAACTTGATGAGTTGGA 399 ||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 348 GGCGAGGCGTCGTACTACCATGTCCCATCGTACGAACTTGATGAGTTGGA 397 400 CCAGTCAAGTTGCACCTACAGAGTTAAATTGATCAAGGAATTTATGTTTA 449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 398 CCAGTCAAGTTGCACCTACAGAGTTAAATTGATCAAGGAATTTATGTTTA 447 450 AATTCCCTGGTGACAGATGGTGATATCAGGTTAATTTACCACGTCTATTG 499 |||||||||||||||||||||||||||||*||||||*||||||||||||| 448 AATTCCCTGGTGACAGATGGTGATATCAGTTTAATTGACCACGTCTATTG 497 500 TTTGAGTAGCTACAGTTAACGTTTGTGTGATAGTCAGTTTTAAAACATGT 549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 498 TTTGAGTAGCTACAGTTAACGTTTGTGTGATAGTCAGTTTTAAAACATGT 547 550 TTCCCAGTAGGTATAGACGTGGTTGGTCGTCTAATCAGCGACGAGGTTAC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 548 TTCCCAGTAGGTATAGACGTGGTTGGTCGTCTAATCAGCGACGAGGTTAC 597 600 ACACGTAATCCCGTGTTTAAGCGTTCTTATGTTGCTAAACGAAGTGAAGT 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 598 ACACGTAATCCCGTGTTTAAGCGTTCTTATGTTGCTAAACGAAGTGAAGT 647 650 AAAACGACGACCCAGTTATCCAAACAAGACCCAAGAAGAAGGGAAACTAG 699 ||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||| 648 AAAACGACGACCCAGTAATCCAAACAAGACCCAAGAAGAAGGGAAACTAG 697 700 CAGCCCAACGGATGCACGAGAACCAGTTTGGGCCTGAATTTGTTATGGGC 749 ||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 698 CAGCTCAACGGATACACGAGAACCAGTTTGGGCCTGAATTTGTTATGGGC 747 750 CATAATTCAGCCATTTCGACGTTCATCACTTACCCTTCGCTGGGGAAGGC 799 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 748 CATAATTCAGCCATTTCGACGTTCATTACTTACCCTTCGCTGGGGAAGGC 797 800 TCTCCCGAACCGATCCAGGTCATATATTAAGTTAAGACGACTGCGTTTTA 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 798 TCTCCCGAACCGATCCAGGTCATATATTAAGTTAAGACGACTGCGTTTTA 847 850 AGGGTACTGTCAAGGTTGAGCGTGTGCATGCTAACGTCAACATGGATGGG 899 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 848 AGGGTACTGTCAAGGTTGAGGGTGTGCATGCTAACGTCAACATGGATGGG 897 900 TCCAACCCAAAGGTGGAAGGAGTCTTCTCTCTTGTTGTTGTTGTGGATCG 949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 898 TCCAACCCAAAGGTGGAAGGAGTCTTCTCTCTTGTTGTTGTTGTGGATCG 947 950 TAAACCCCATCTGGGCTCATCTGGAGCCCTTCTTACATTTGATGAGTTAT 999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 948 TAAACCCCATCTGGGCTCATCTGGAGCCCTTCTTACATTTGATGAGTTAT 997 1000 TCGGTGCTAGGATCCACAGCCATGGTAATCTCGCGATAGTACCCTCTCTG 1049 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 998 TCGGTGCTAGGATCCACAGCCATGGTAATCTCGCGATAGTACCCTCTCTG 1047 1050 AAAGACCGTTTCTACATACGACACGTGTTCAAACGTGTGTTGTCCGTTGA 1099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1048 AAAGACCGTTTCTACATACGACACGTGTTCAAACGTGTGTTGTCCGTTGA 1097 1100 GAAGGATTCCATGATGGTGGACGTAGAAGGGACGACCACTCTAACTACCA 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1098 GAAGGATTCCATGATGGTGGACGTAGAAGGGACAACCACTCTAACTACCA 1147 1150 GGCGTTTTAGTTGTTGGTCTTCGTTTACGGATGTTGACCGTGAATCGTGT 1199 |||||||||||||||||||||||||||*|||*|||||||||||||||||| 1148 GGCGTTTTAGTTGTTGGTCTTCGTTTAAGGACGTTGACCGTGAATCGTGT 1197 1200 AACGGCGTCTATGCTAACATAAGCAAGAACGCCCTTTTAGTTTATTACTG 1249 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1198 AACGGCGTCTATGCTAACATAAGCAAGAACGCCCTTTTAGTTTATTACTG 1247 1250 CTGGATGTCGGATAATATTTCCAAGGCATCGACATTTGTTTCGTTTGACC 1299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 1248 CTGGATGTCGGATAATATTTCCAAGGCATCGACATTTGTATCGTTTGACC 1297 1300 TCGATTATATTGGCTAAATTGGAAATTTAATACAAGCTTAATGCAAATGA 1349 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||*||| 1298 TCGATTATATTGGCTAAATTGCAAATTTAATACAAGCTTAATGCAA-TGA 1346 1350 CCATATTTATATTTCAGTATTAAATATACATGTTCCTCTACAATAATCTC 1399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1347 CCATATTTATATTTCAGTATTAAATATACATGTTCCTCTACAATAATCTC 1396 1400 AGTGCAATGATTTGGGTTGAGAAGGGGTACAGTTACTGTTGATACATTCC 1449 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1397 AGTGCAATGATTTGGGTTGAGAAGGGGTACAGTTACTGTTGATACATTCC 1446 1450 TGGGCCGTGGCCCTAACTAGTTCTATCATCTGGGCCATTGACATCGTTAT 1499 |||||||||||||||||||||||**|*|*||||||||||||||||||||| 1447 TGGGCCGTGGCCCTAACTAGTTCGTTTAGCTGGGCCATTGACATCGTTAT 1496 1500 GTTGGATTGGGCCCTTTGAGCACCCACTATTGAGGCCGAGTCACCTGGGT 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1497 GTTGGATTGGGCCCTTTGAGCACCCACTATTGAGGCCGAGTCACCTGGGT 1546 1550 CTAGACTACTGGTTCCTAGCCTGTGCAGCTGCCTATATGGGTGCGCCGCG 1599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1547 CTAGACTACTGGTTCCTAGCCTGTGCAGCTGCCTATATGGGTGCGCCGCG 1596 1600 TTCTCTGCATCGGAGTCTGCGACTGAGTGACTGATCCCTACAGTGCTCCT 1649 |||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1597 TTCTCTGCATCGGAGTCTGCGTCTGAGTGACTGATCCCTACAGTGCTCCT 1646 1650 GACAGCCCAGGACTCTCCAGGCCTTAATTCAATTGGGCTGTGCAACCCAA 1699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1647 GACAGCCCAGGACTCTCCAGGCCTTAATTCAATTGGGCTGTGCAACCCAA 1696 1700 CACCCGATATGGACGCAGATCTGATCATCTTTCTCTCCCACTTTCCGTAG 1749 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1697 CACCCGATATGGACGCAGATCTGATCATCTTTCTCTCCCACTTTCCGTAG 1746 1750 CCAACGTGGCTGAAATCGATGTCCTTCTCTGTAAACTGCTTGGAGAGGAT 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1747 CCAACGTGGCTGAAATCGATGTCCTTCTCTGTAAACTGCTTGGAGAGGAT 1796 1800 CTTCACTGTTGGGGCACGGAAAGGTATGTCTACAGAGTGTTTGGCCGTCG 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1797 CTTCACTGTTGGGGCACGGAAAGGTATGTCTACAGAGTGTTTGGCCGTCG 1846 1850 ACAGCTTCAGCATTCCCTTGAATTTCGCGAAATGGGTCCTCTGATGGACG 1899 ||||*||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1847 ACAGTTTCAGCTTTCCCTTGAATTTCGCGAAATGGGTCCTCTGATGGACG 1896 1900 TTAGTGTCGCACACTCTGTAGTACAATTTCCATGGAATTGGGTCCTTGAG 1949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1897 TTAGTGTCGCACACTCTGTAGTACAATTTCCATGGAATTGGGTCCTTGAG 1946 1950 GGAGAAGAAGGACGAGGAAAAGTAATGGAGATCGATGTTGCATCGTATCG 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1947 GGAGAAGAAGGACGAGGAAAAGTAATGGAGATCGATGTTGCATCGTATCG 1996 2000 GAAACGTCCAGGACGCTTGCAGCGACTCGTTGTCAGTCATTCTCCTGTCA 2049 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 1997 GAAACGTCCAGGACGCTTGCAGCGACTCGTTGTCAGTCATTCTCTTGTCA 2046 2050 TGGATCTCCACGACGACGGAACCCACGGCGTTAATGGGTACCTGCTGTCT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2047 TGGATCTCCACGACGACGGAACCCACGGCGTTAATGGGTACCTGCTGTCT 2096 2100 GTATTCTATGACGCAATGGTCTATTTTCATACAGCTACGACTGAGCCGTG 2149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||| 2097 GTATTCTATGACGCAATGGTCTATTTTCATACAGCTGCGACTGAGCCGTG 2146 2150 CGCTTAATTGGGACGCCGTGGAGGGAAATTGAAGAAGAATCTCTGTTAGG 2199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2147 CGCTTAATTGGGACGCCGTGGAGGGAAATTGAAGAAGAATCTCTGTCAGG 2196 2200 TCATGAGAAAGCTGATATTCATCACGCTGAGACTCAATATAATTGAATGC 2249 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||| 2197 TCATGAGAAAGCTGATATTCATCACGCTGAGACTCAATGTAATTGAATGC 2246 2250 GTTTGGAGGATTCACTAGCTGAGATTCCATTGAATTTTAATATCAGAAAT 2299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 2247 GTTTGGAGGATTCACTAGCTGAGATTCCATTGAATTTTATTATCAGAAAT 2296 2300 AGGCCGCGCAGCGGGAACGACAGAGAAATTTGAACAGGTGAAACGATTAG 2349 ||||||**||***|||||||||||||||||||||||||||*||||||||| 2297 AGGCCGGCCACGTGGAACGACAGAGAAATTTGAACAGGTGGAACGATTAG 2346 2350 GTCTGAAAGACTTTAGGGTTTCTGTTGATGGTGAAAGAGTAAAGTTGAGA 2399 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||| 2347 GTCTGAAAGACTTTAGGGTTTCTGTTGATGGTGAAAGAGTAAAGTGGAGA 2396 2400 AGATGAACTTCTTGTTAACTGGTGTCGATAAGCTCTGTAATTGGGAAAGT 2449 ||||||*****|**|*||***|*||*|****|***|||*|*|||*****| 2397 AGATGA-----TAATGAAGACGAGTTGGGTTGGGTTGTTACTGGACGGAT 2441 2450 GTCTCCTCTTTGGTTAAGAAGCACTGTGGATAAGTCAAGAAATAATTCTT 2499 **********|**||***||*****|||**|*|*|||**||*|**|*||* 2442 TGAGAGGAGATATTTTCCAATTGAGGTGTTTCATTCAGCAACTCGT-CTG 2490 2500 GGCACTTATTTTAAAACGCTTTGG--CGG--TGGCATTTTTGTAATTAAG 2545 ****||**||**|*|**|**||*|**|||**||||||*|||||||*||*| 2491 ATTCCTCCTTAAATAGAGGATTAGTACGGAGTGGCATATTTGTAAATATG 2540 2546 GGGTGTACC-CCAATTGAGAGCTCGCTCTATAAGTCATATGAATTGGG-G 2593 *****|||**|||||||**||||*||||||*||*||||||||||*||**| 2541 ACCCTTACTACCAATTGGTAGCT-GCTCTAAAACTCATATGAATCGGTAG 2589 2594 TAATGGGGACAAT-ATATAGTAGAAGATCCTAAGGGGCTTTAAGCGGCCA 2642 |*||||***|**|*|||||*||*||**||*||||||*|||*||||||||| 2590 TTATGGTAGCTCTTATATACTACAACTTCTTAAGGG-CTTAAAGCGGCCA 2638 2643 TCCGCACTAATATT 2656 |||||||||||||| 2639 TCCGCACTAATATT 2652