NC_004612 DQ116882 1 ACCGAAAGGCCGCGAAAATTTTGACCCCCTTATCCTGACCGTTGATGCGT 50 ||||||*|||||||||||||||**||*|||*||||||*||||||*|**|| 1 ACCGAATGGCCGCGAAAATTTTT-CCGCCTCATCCTGTCCGTTGTTTTGT 49 51 AATCATTGCACGCCGTTATCCGTCCGATTTGCAACACGTGTATCCCACTA 100 |||||||*|||||||*|||||||||||||||||||||||||*|||||||| 50 AATCATTACACGCCGCTATCCGTCCGATTTGCAACACGTGTCTCCCACTA 99 101 ACAGACTTTATGGAAAATAAATGTGTGA-ATGCGTCTCTTTTCTGCATAT 149 ||||||||||||*|||*|||||||*|||*|||*||*|******|||*|*| 100 ACAGACTTTATGCAAA-TAAATGTCTGATATGTGTGTTCACAATGCTTTT 148 150 GTGTTCCCCATATGTCTTTATCGTACTTCTATTATATGCGTCTGTGGTCC 199 |||*|||||||||*|||||*||||||*||**||***|||||*|||||||| 149 GTGGTCCCCATATATCTTT-TCGTACATCATTTTAGTGCGTTTGTGGTCC 197 200 CCCCGCATTATATAAAGTCTTTCACATAAATCAAATTGCCTTCTTTGCTA 249 |||||||*||||||**||||******|||||*****|||**|||||**|| 198 CCCCGCACTATATATTGTCTGAATGGTAAATATGTGTGCAGTCTTTCTTA 247 250 TGTATATTTTGATCGGTCGAGATCAAAATTAATATGTTGCGAACATATCC 299 |****|||||||||||||*||||||||||||*|||****|*|**||**|* 248 TAGCAATTTTGATCGGTCCAGATCAAAATTATTATTGCTCTATGATGCCA 297 300 GTCGTTCGATCTTATGAGATATGCTTTAATTCAAACAATACTTGTTTGAA 349 **|||*|||||||||||*|**|||||||||||||||||||||||*||||| 298 ACCGTCCGATCTTATGATAGTTGCTTTAATTCAAACAATACTTGATTGAA 347 350 TTTTATGCACGCTGTACAATACTAGTTTATAAAACTGCTACATATGTGAC 399 ||||||*|||||****|||||*||*||*|||****|*|||*||||*|*|| 348 TTTTATACACGC----CAATAATA-TTAATA----TTCTATATATAT-AC 387 400 ATTACATGGTGTTTCCGTTGCCACACATTTCCTATCCCAGCCAAATGGCG 449 |*|||||*|||****||||||||||||||||*||||*|||**|||||||* 388 AATACATAGTGCCGTCGTTGCCACACATTTCTTATCTCAGATAAATGGCT 437 450 TTTCCCTCTCCTTATTCCACGCCTCGTCGTTCGGGTTACCCATTCAACAG 499 |||||*|||||*|||*||||*||*||*|||||*||||||||||||||||| 438 TTTCCTTCTCCGTATCCCACCCCCCGCCGTTCCGGTTACCCATTCAACAG 487 500 AACATACAACGGAAACAAGAGTTTCCGCTTGTGGAAGACCCGGAAGTATC 549 |||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||*|||||||*|**| 488 AACTTACAACGGAAACAAGAGTTTCCGTTTGTGGAAGTCCCGGAAATCCC 537 550 AAAACTGGAAGCGCTATCGCAGTACCCATTCCATAGCACGTTCTCCAACC 599 ||||*||||||||||||||||*||||||*|*|*|**|||||||*||*||* 538 AAAATTGGAAGCGCTATCGCAATACCCAGTTCCTCACACGTTCCCCTACA 587 600 GAACTGTTTGGCGATCCAATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCTG 649 |||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||| 588 GAACTGTTTGGTGATCCTATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCTG 637 650 TGAAACACAGGAGGGTTCGGAGTATCTGCTGCACAACAATCGTTACATGA 699 |||||||||*||*||*|||||*||||||||||||||||||||||||*||| 638 TGAAACACAAGAAGGATCGGATTATCTGCTGCACAACAATCGTTACGTGA 687 700 CGTCATATGTCACGTATCCATCAAAAACAAGAACTGGAACGGACAACCGC 749 |||||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||*|||||||| 688 CGTCATATGTCACTTATCCATCCAAAACAAGAACTGGAACGAACAACCGC 737 750 GTTCGTTCCTATATCAAGCTAAAGAGTCTGAACATATCTGGGACATTTGC 799 ||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||| 738 GTTCGTTCCTATATCAAGTTAAAGAGTCTGAACATATCTGGGACATTTGC 787 800 TGTTCGTAAATCTGACTTGATGACCGAAGTGGTGCAAACAAATGGTCTAT 849 |||||||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||*||*| 788 TGTTCGTAAGTCTGACTTGATGACCGAAGTCGTGCAAACAAATGGACTCT 837 850 ACGGAGTGATGTCTATAGTTGTAGTCCGCGATAAATCTCCAAAGATTTAT 899 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 838 ACGGAGTGATGTCTGTAGTTGTAGTCCGCGATAAATCGCCAAAGATTTAT 887 900 TCTGCGACCCAACCTTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGATCTGTTAA 949 ||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 888 TCAGCGACCCAACCCTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGTTCTGTTAA 937 950 TGCTTGCAGGGGCAGTCTGAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGCTTCG 999 ||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 938 TGCTTGCAGGGGAAGTCTGAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGCTTTG 987 1000 TACTTCTGAATCAAACATCCATCGTTGTCAATACCCCACATTCCAACGCT 1049 ||||*||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||*||| 988 TACTACTGAATCAAACATCCATCGTCGTCAATACCCCACATTCCAATGCT 1037 1050 ATCAAGAAATTCTGCATTCGTAACTGCATCCCAAGAACTTACACAACCTG 1099 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||||*|| 1038 ATCAAGAAATTCTGCATTCGTAACTGCATCCCAAGAACGTACACAACTTG 1087 1100 GGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCTA 1149 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*| 1088 GGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCAA 1137 1150 ACACCCTCCGAAATGCAATTATTTTATATTATGTATGGTTAAGCGATGTA 1199 |||||||**|||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||| 1138 ACACCCTTAGAAATGCAATTATTTTATATTATGTCTGGTTAAGCGATGTA 1187 1200 TCCTCACAAGTCGATCTTTACAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGATA 1249 |||||||||||||||||*||*||||||||||||||||||||||||||||| 1188 TCCTCACAAGTCGATCTCTATAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGATA 1237 1250 ATATATAAAAA-TGCAGAAGAAACATCTTATTTTTTGAATAAATTTGGCT 1298 |||||||||||*||||*|||||||||*||||||*|*|||||||||||*|* 1238 ATATATAAAAAATGCAAAAGAAACATTTTATTTAT-GAATAAATTTGACA 1286 1299 TAAAATTTATT-ACACGCTCTTCGATACTGGAGCATTTACATTGGATTTT 1347 **|||||||||*|*|*|**|||*||*|||||||||||||||||*|||*|| 1287 ACAAATTTATTTAAAAGTCCTTTGAAACTGGAGCATTTACATTTGATCTT 1336 1348 ATACATTGCTCTACAGTCTTCCGTAATTATATCTGCAATCTCTTCCCTTG 1397 ||||||||*|||||*||||||*|||||||||||*||||||||||||||*| 1337 ATACATTGTTCTACTGTCTTC-GTAATTATATCCGCAATCTCTTCCCTCG 1385 1398 TAATACTCCCCGCCTGTGATGCCGATGGACCTGGATCAATTGCCGAATCA 1447 ||||||||||*|*||||||*|||||*||*||||||||*|||||||||||* 1386 TAATACTCCCTGACTGTGAAGCCGACGGGCCTGGATCGATTGCCGAATCG 1435 1448 TCCAATCCGCTCAGATTTTTATATGGTCTGCTGGTGACGGACGAAAGTCC 1497 ||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||*|||| 1436 TCCAATCCGCTCAGGTTTTTGTATGGTCTGCTGGTGACGGACGAATGTCC 1485 1498 GATCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGACCTATAGCCAGATAGG 1547 *||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*||*|||||*| 1486 TATCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGTCCTATTGCTAGATATG 1535 1548 GTACCCGTAACGATCTTGAACTATGTCCCATTAACCTTGAACCATCTACA 1597 |||||||*|||||||*|||*|||||||||||*||*||||||||||||||| 1536 GTACCCGCAACGATCGTGAGCTATGTCCCATCAATCTTGAACCATCTACA 1585 1598 AGACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCCACAGACCAGAAATCAATGTCGTT 1647 |||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||*|||||||| 1586 AGACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCCACTGACCAAAAATCTATGTCGTT 1635 1648 CATAGTGAATTCCTTGGTCTGTATTTCTATCTTTGGTGGTCGGAATTCGA 1697 ||**|||||*||||||||||||||*||||||||*|||||||||||||||| 1636 CACGGTGAACTCCTTGGTCTGTATCTCTATCTTCGGTGGTCGGAATTCGA 1685 1698 CGTCAGTCGAATGTTTAGCCGACGACAGCTTCAATTTCCCTAGCATCTTA 1747 ||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||*|||||| 1686 CGTCAGTCGAATGTTTTGCCGACGACAGCTTCAATTTCCCGAGTATCTTA 1735 1748 CAGAAGTGTACCCCATTCACGACGTTTGTGTTCTCCACTCGGTATTCAAC 1797 ||||||||*||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||| 1736 CAGAAGTGCACCCCATTCACGACATTTGTGTTCTCTACTCGGTATTCAAC 1785 1798 TCTCCAAGGATTCTTATCCTTGAGAGAGAAGAATGAGGAAGAGTAGTAGT 1847 |||||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||||||||||| 1786 TCTCCAAGGATTCTTATCCTTGACAGAGAAGAATGATGAAGAGTAGTAGT 1835 1848 GCAGGTTGCAATTGCATTTGATCGGAATTGTGAATTCCGCTTGTTTTGTG 1897 |*|||||*||||||||||||||*||||||||*|||||*||*||||||||| 1836 GTAGGTTACAATTGCATTTGATTGGAATTGTAAATTCGGCCTGTTTTGTG 1885 1898 TCCCCCTCCGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTACCACGACATGACCAAC 1947 ||*|||||*|||||||||||||||||||||||||**|||||||||||||| 1886 TCTCCCTCTGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTATAACGACATGACCAAC 1935 1948 AGCATTAATTGGAACCTGACTGCGATATTCCAGAACTACGTGATCTATTT 1997 *|||||||||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||*|||| 1936 TGCATTAATTGGAACCTGACTGCGATATTCTAGGACTACGTGATCAATTT 1985 1998 TCATGCATCTATTCCTCAACTGGCTAAGCTTCTGCTCGAACATGGATGGA 2047 ||||*||||||||||||||||||||||*|||*||*|||||||||||*||| 1986 TCATACATCTATTCCTCAACTGGCTAATCTTTTGTTCGAACATGGAAGGA 2035 2048 AATGACAAGGTAACTTCTGCAGCATCGTTTGTGAGAGCGTACTCAACGCG 2097 |||||||||||*|||||||||||||||||||||||*||||||||*||||| 2036 AATGACAAGGTGACTTCTGCAGCATCGTTTGTGAGCGCGTACTCCACGCG 2085 2098 CTCAGATTGAATATACCCACCTACTCCCATACCCATACCATCATTTCCTA 2147 |||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||*|||||||||| 2086 CTCAGATTGGATATATCCACCTACTCCCATACCCATACCTTCATTTCCTA 2135 2148 TTGACATATTGGCCGCGCAGCGCAAAACCCACTGAAACACAGAAGGACAG 2197 |*||||||||||||||||||||*||*|||||*||||*||*||||**|||| 2136 TAGACATATTGGCCGCGCAGCGAAACACCCAGTGAATCAAAGAACCACAG 2185 2198 ACTACGATCAAAGAAACCCCGACGAAGAAGAAACCCTAGCAAACAACGAA 2247 ||*|*|||*|*||||||||*||***|||||||||||||||||**||*||| 2186 ACGAAGATAACAGAAACCCAGA---AGAAGAAACCCTAGCAATTAAGGAA 2232 2248 GTTGTTTTGCAAAGAACGGATGTAGATGGTTTTATAATGCTATTGCATGT 2297 |||||||||||||*|||*||**||*|||**||||||||**|*||*||||| 2233 GTTGTTTTGCAAACAACTGACTTACATGTATTTATAATTGTCTTCCATGT 2282 2298 CATGTCTATGTCATACCAATTACCCTAAAATGAACGGCACATATTTTTCT 2347 **||||***|||*||**||*||||*|*||||||||||||||||||||||* 2283 GTTGTCCCCGTCGTATTAAATACCTTCAAATGAACGGCACATATTTTTCG 2332 2348 ACGAAAAAGGAGTTGTGCA--TGCATATGGG-ATGTCTGTTTATTTACGG 2394 |*|||||||||**|||||***||*|||***|*||*|*|*|*|*||||*** 2333 ATGAAAAAGGAAATGTGCCATTGTATACATGCATCTATTTATTTTTATCT 2382 2395 TATAAATTGGAAGCCCAATT-TATTTAATTGGGCTGA-AGTTTAAATTCA 2442 ||||*****|||||||||||*|||**||||||||||**|||*|||**|** 2383 TATAC----GAAGCCCAATTGTATAAAATTGGGCTGCTAGTATAATATAT 2428 2443 GAAGAAGTCCATGAAATTGGCCCAGCATCCAGGTCCATTGTTAAAATGAC 2492 |||*|||*|||||||||||||||||||||*|*|||**|***|||||*||| 2429 GAAAAAGCCCATGAAATTGGCCCAGCATCGAAGTCGTTGTATAAAACGAC 2478 2493 ATCGTTTGTGTGTTATTGTGTGTATAGAAGTTAGAGAGAAGCAGCAGTTT 2542 ||||*||||||**|**|**||****|*|*||||||||||||****||||| 2479 ATCGCTTGTGTTGTCATACGTCAGCAAATGTTAGAGAGAAGTTAGAGTTT 2528 2543 CTCTCTCTAGAA-CTCATCGGGTGTCTCTCAACTTATCTATATAATTGGT 2591 |||||||||||**||*|***||*|||*||||||||||||||*|||||||| 2529 CTCTCTCTAGACTCTGAATCGGCGTCCCTCAACTTATCTATGTAATTGGT 2578 2592 GTCTGGAGTCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTG 2641 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 2579 GTCTGGAGTCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTT 2628 2642 TGAAAAGAAAATTACTTTAATTCAAATTCCCTATAGCGGCCTTTCGTATA 2691 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*|||||||| 2629 TGAAAAGAAAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTATA 2678 2692 ATATT 2696 ||||| 2679 ATATT 2683