NC_004612 AY939924 1 ACCGAAAGGCCGCGAAAATTTT-GACCCCCTTATCCTGACCGTTGATGCG 49 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 1 ACCGAAAGGCCGCGAAAATTTTTGACCCCCTTATCCTGACCGTTGATGCG 50 50 TAATCATTGCACGCCGTTATCCGTCCGATTTGCAACACGTGTATCCCACT 99 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 51 TAATCATTGCACGCCGTTATCCGTCCGATTTGCAACACGTGTATCCCACT 100 100 AACAGACTTTATGGAAAATAAATGTGTGAATGCGTCTCTTTTCTGCATAT 149 |||||||||||||||||*|||||||*||||||*||||||||*|||||||| 101 AACAGACTTTATGGAAA-TAAATGTCTGAATGTGTCTCTTTACTGCATAT 149 150 GTGTTCCCCATATGTCTTTATCGTACTTCTATTATATGCGTCTGTGGTCC 199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||| 150 GTGTTCCCCATATGTCTTTATCGTACTTCTATTATGTGCGTATGTGGTCC 199 200 CCCCGCATTATATAAAGTCTTTCACATAAATCAAATTGCCTTCTTTGCTA 249 ||||||||||||||||||||||*||||||||||||*||||*||||||||| 200 CCCCGCATTATATAAAGTCTTTTACATAAATCAAACTGCCCTCTTTGCTA 249 250 TGTATATTTTGATCGGTCGAGATCAAAATTAATATGTTGCGAACATATCC 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 250 TGTATATTTTGATCGGTCGAGATCAAAATTAATATGTTGCGAACATATCC 299 300 GTCGTTCGATCTTATGAGATATGCTTTAATTCAAACAATACTTGTTTGAA 349 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 300 GTCGTTCGATCTTATGAGATATGCTTTAATTCAAACAATACTTGTTTGAA 349 350 TTTTATGCACGCTGTACAATACTAGTTTATAAAACTGCTACATATGTGAC 399 ||||||||||*|||*|||||||||*||||||||||||||||||||*|||| 350 TTTTATGCACCCTGAACAATACTAATTTATAAAACTGCTACATATATGAC 399 400 ATTACATGGTGTTTCCGTTGCCACACATTTCCTATCCCAGCCAAATGGCG 449 |||*|||*||**|**||||||||||||||||*||||||||||||*||||* 400 ATTGCATAGTCCTGTCGTTGCCACACATTTCTTATCCCAGCCAA-TGGCT 448 450 TTTCCCTCTCCTTATTCCACGCCTCGTCGTTCGGGTTACCCATTCAACAG 499 ||||||||||||||||||||*|||||*|||||*||||||||||||||||| 449 TTTCCCTCTCCTTATTCCACCCCTCGCCGTTCCGGTTACCCATTCAACAG 498 500 AACATACAACGGAAACAAGAGTTTCCGCTTGTGGAAGACCCGGAAGTATC 549 |||||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||*|||| 499 AACATACAACGGAAACAAGAGTTTCCGTTTGTGGAATACCCGGAAATATC 548 550 AAAACTGGAAGCGCTATCGCAGTACCCATTCCATAGCACGTTCTCCAACC 599 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 549 AAAACTGGAAGCGCTATCGCAGTACCCATTCCATAGCACGTTCTCCAACC 598 600 GAACTGTTTGGCGATCCAATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCTG 649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 599 GAACTGTTTGGCGATCCAATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCTG 648 650 TGAAACACAGGAGGGTTCGGAGTATCTGCTGCACAACAATCGTTACATGA 699 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||| 649 TGAAACACAGGAGGGTTCGGAGTATCTACTGCACAACAATCGTTACATGA 698 700 CGTCATATGTCACGTATCCATCAAAAACAAGAACTGGAACGGACAACCGC 749 ||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 699 CGTCATATGTGACGTATCCATCGAAAACAAGAACTGGAACGGACAACCGC 748 750 GTTCGTTCCTATATCAAGCTAAAGAGTCTGAACATATCTGGGACATTTGC 799 ||||||||*||||||||||||||||||*||||*||||||||||||||||| 749 GTTCGTTCTTATATCAAGCTAAAGAGTTTGAATATATCTGGGACATTTGC 798 800 TGTTCGTAAATCTGACTTGATGACCGAAGTGGTGCAAACAAATGGTCTAT 849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 799 TGTTCGTAAATCTGACTTGATGACCGAAGTGGTGCAAACAAATGGTCTAT 848 850 ACGGAGTGATGTCTATAGTTGTAGTCCGCGATAAATCTCCAAAGATTTAT 899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 849 ACGGAGTGATGTCTATAGTTGTAGTCCGCGATAAATCTCCAAAGATTTAT 898 900 TCTGCGACCCAACCTTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGATCTGTTAA 949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 899 TCTGCGACCCAACCTTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGATCTGTTAA 948 950 TGCTTGCAGGGGCAGTCTGAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGCTTCG 999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 949 TGCTTGCAGGGGCAGTCTGAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGCTTCG 998 1000 TACTTCTGAATCAAACATCCATCGTTGTCAATACCCCACATTCCAACGCT 1049 |||||||||||||||||||||||||*|||||*|||||||||||*|||||| 999 TACTTCTGAATCAAACATCCATCGTCGTCAACACCCCACATTCTAACGCT 1048 1050 ATCAAGAAATTCTGCATTCGTAACTGCATCCCAAGAACTTACACAACCTG 1099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1049 ATCAAGAAATTCTGCATTCGTAACTGCATCCCAAGAACTTACACAACCTG 1098 1100 GGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCTA 1149 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1099 GGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCTA 1148 1150 ACACCCTCCGAAATGCAATTATTTTATATTATGTATGGTTAAGCGATGTA 1199 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1149 ACACCCTCCGAAATGCAATTATTTTATATTATGTATGGTTAAGCGATGTA 1198 1200 TCCTCACAAGTCGATCTTTACAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGATA 1249 ||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||| 1199 TCCTCACAAGTCGATCTTTATAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGATA 1248 1250 ATATATAAAAATGCAGAAGAAACATCTTATTTTTTGAATAAATTTGGCTT 1299 ||||||*||||||*|||||||||||*|||||**|**|||||||||||||| 1249 ATATATGAAAATGTAGAAGAAACATTTTATTGATA-AATAAATTTGGCTT 1297 1300 AAAATTTATTACACGCTCTTCGATACTGGAGCATTTACATTGGATTTTAT 1349 ||||||||||||||||||||||*||*|||||||||||||||||||||||| 1298 AAAATTTATTACACGCTCTTCGTTATTGGAGCATTTACATTGGATTTTAT 1347 1350 ACATTGCTCTACAGTCTTCCGTAATTATATCTGCAATCTCTTCCCTTGTA 1399 |||||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1348 ACATTGCTCTACAGTCTTC-GTAATTATATCTGCAATCTCTTCCCTTGTA 1396 1400 ATACTCCCCGCCTGTGATGCCGATGGACCTGGATCAATTGCCGAATCATC 1449 |||||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||||| 1397 ATACTCCCCGCCTGTGATGCCGACGGACCTGGATCGATTGCCGAATCATC 1446 1450 CAATCCGCTCAGATTTTTATATGGTCTGCTGGTGACGGACGAAAGTCCGA 1499 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1447 CAATCCGCTCAGATTTTTATATGGTCTGCTGGTGACGGACGAAAGTCCGA 1496 1500 TCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGACCTATAGCCAGATAGGGT 1549 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1497 TCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGACCTATAGCCAGATAGGGT 1546 1550 ACCCGTAACGATCTTGAACTATGTCCCATTAACCTTGAACCATCTACAAG 1599 ||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1547 ACCCGTAACGATCTTGAACTATGTCCTATTAACCTTGAACCATCTACAAG 1596 1600 ACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCCACAGACCAGAAATCAATGTCGTTCA 1649 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1597 ACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCCACAGACCAGAAATCAATGTCGTTCA 1646 1650 TAGTGAATTCCTTGGTCTGTATTTCTATCTTTGGTGGTCGGAATTCGACG 1699 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1647 TGGTGAATTCCTTGGTCTGTATTTCTATCTTTGGTGGTCGGAATTCGACG 1696 1700 TCAGTCGAATGTTTAGCCGACGACAGCTTCAATTTCCCTAGCATCTTACA 1749 ||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1697 TCAGTCGAATGTTTTGCCGACGACAGCTTCAATTTCCCTAGCATCTTACA 1746 1750 GAAGTGTACCCCATTCACGACGTTTGTGTTCTCCACTCGGTATTCAACTC 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1747 GAAGTGTACCCCATTCACGACGTTTGTGTTCTCCACTCGGTATTCAACTC 1796 1800 TCCAAGGATTCTTATCCTTGAGAGAGAAGAATGAGGAAGAGTAGTAGTGC 1849 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1797 TCCAAGGATTCTTATCCTTGAGAGAGAAGAATGAGGAAGAGTAGTAGTGC 1846 1850 AGGTTGCAATTGCATTTGATCGGAATTGTGAATTCCGCTTGTTTTGTGTC 1899 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1847 AGGTTGCAATTGCATTTGATCGGAATTGTGAATTCCGCTTGTTTTGTGTC 1896 1900 CCCCTCCGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTACCACGACATGACCAACAG 1949 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1897 CCCCTCCGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTACCACGACATGACCAACAG 1946 1950 CATTAATTGGAACCTGACTGCGATATTCCAGAACTACGTGATCTATTTTC 1999 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1947 CATTAATTGGAACCTGACTGCGATATTCCAGAACTACGTGATCTATTTTC 1996 2000 ATGCATCTATTCCTCAACTGGCTAAGCTTCTGCTCGAACATGGATGGAAA 2049 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||| 1997 ATGCATCTATTCCTCAACTGGCTAAGCTTCTGCTCGAACATGGACGGAAA 2046 2050 TGACAAGGTAACTTCTGCAGCATCGTTTGTGAGAGCGTACTCAACGCGCT 2099 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2047 TGACAAGGTAACTTCTGCAGCATCGTTTGTGAGAGCGTACTCAACGCGCT 2096 2100 CAGATTGAATATACCCACCTACTCCCATACCCATACCATCATTTCCTATT 2149 |||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||||| 2097 CAGATTGAATATACCCACCTACTCCCATACCAATACCATCATTTCCTATT 2146 2150 GACATATTGGCCGCGCAGCGCAAAACCCACTGAAACACAGAAGGACAGAC 2199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 2147 GACATATTGGCCGCGCAGCGCAAAACCCACTGAAACACAGAAGGACGGAC 2196 2200 TACGATCAAAGAAACCCCGACGAAGAAGAAACCCTAGCAAACAACGAAGT 2249 ||||||||||||||||||*|||*|*||||||||||||||||||||||||| 2197 TACGATCAAAGAAACCCCAACGGATAAGAAACCCTAGCAAACAACGAAGT 2246 2250 TGTTTTGCAAAGAACGGATGTAGATGGTTTTATAATGCTATTGCATGTCA 2299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2247 TGTTTTGCAAAGAACGGATGTAGATGGTTTTATAATGCTATTGCATGTCA 2296 2300 TGTCTATGTCATACCAATTACCCTAAAATGAACGGCACATATTTTTCTAC 2349 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||** 2297 TGTCTATGTCATACCAATTACCCTAAAATGAACGGCACATATTTTTCTTT 2346 2350 GAAAAAGGAGTTGTGCATGCATATGGGATGTCTGTTTATTTACGGTATAA 2399 |*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||||* 2347 GGAAAAGGAGTTGTGCATGCATATGGGATGTCTGTTTATTTATGGTATAT 2396 2400 ATTGGAAGCCCAATTTATTTAATTGGGCTGAAGTTTAAATTCAGAAGAAG 2449 ||*|||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||| 2397 ATGGGAAGCCCAATTTATTTAATTGGGCTGGAGTTTAAATTCAGAAGAAG 2446 2450 TCCATGAAATTGGCCCAGCATCCAGGTCCATTGTTAAAATGACATCGTTT 2499 *||||||||||||||*||||||||||||||||*||||||||||||||||* 2447 CCCATGAAATTGGCCTAGCATCCAGGTCCATTTTTAAAATGACATCGTTC 2496 2500 GTGTGTTATTGTGTGTATAGAAGTTAGAGAGAAGCAGCAGTTTCTCTCTC 2549 ||||||||||*|*||||||*|||||||||||||||||||||||||||||| 2497 GTGTGTTATTATATGTATAAAAGTTAGAGAGAAGCAGCAGTTTCTCTCTC 2546 2550 T----AGAACTCATCGGGTGTCTCTCAACTTATCTATATAATTGGTGTCT 2595 |****||||||*|||*||||||||||||||||||||||||||||||||*| 2547 TCTCTAGAACTGATCTGGTGTCTCTCAACTTATCTATATAATTGGTGTAT 2596 2596 GGAGTCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTGTGAA 2645 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||***** 2597 GGAGTCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATT----- 2641 2646 AAGAAAATTACTTTAATTCAAATTCCCTATAGCGGCCTTTCGTATAATAT 2695 *************************************************| 2642 -------------------------------------------------T 2642 2696 T 2696 | 2643 T 2643