NC_004612 AY438563 1 ACCGAAAGGCCGCGAAAATTTTGACCCCCTTATCCTGACCGTTGATGCGT 50 ||||||||||||||||||||||***||||||||||||||||||||||||| 1 ACCGAAAGGCCGCGAAAATTTTT--CCCCTTATCCTGACCGTTGATGCGT 48 51 AATCATTGCACGCCGTTATCCGTCCGATTTGCAACACGTGTATCCCACTA 100 |||||||||*|*||*|||||||**||||||**|||||||||||||||||| 49 AATCATTGCGCCCCCTTATCCGCACGATTTTGAACACGTGTATCCCACTA 98 101 ACAGACTTTATGGAAAATAAATGTGTGA-ATGCGTCTCTTTTCTGCATAT 149 *|||||||||||*||**|||||||*||**||**||*|||****||||||| 99 GCAGACTTTATGCAAT-TAAATGTCTGGTATCTGTGTCTACAATGCATAT 147 150 GTGTTCCCCATATGTCTTTATCGTACTTCTATTATATGCGTCTGTGGTCC 199 |||*|||||||||*|**|**||||||||||**|**|||||**||*||||| 148 GTGGTCCCCATATTTAGTG-TCGTACTTCTTGTTAATGCGCATGAGGTCC 196 200 CCCCGCATTATATAAAGTCTTTCACATAAATCAAATTGCCTTCTTTGCTA 249 |||||||*|||*|||*||**|****|*|||****|*|||*|||*|*|||* 197 CCCCGCACTATGTAATGTTATCATTACAAAGTGGAGTGCATTCCT-GCTG 245 250 TGTATATTTTGATCGGTCGAGATCAAAATTAATATGTTGCGAACATATCC 299 |****|||||||*||||*||||||||||||||||||||*|||||||**|* 246 TCCCAATTTTGAACGGTTGAGATCAAAATTAATATGTTCCGAACATGCCA 295 300 GTCGTTCGATCTTATGAGATATGCTTTAATTCAAACAATACTTGTTTGAA 349 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 296 GTCGTCCGATCTTATGAGATATGCTTTAATTCAAACAATACTTGTTTGAA 345 350 TTTTATGCACGCTGTACAATACTAGTTTATAAAACTGCTACATATGTGAC 399 ||||||**||*|**||*|||||||*||||*|||||||||||||||*|||| 346 TTTTATCGACCCCTTAAAATACTAATTTACAAAACTGCTACATATATGAC 395 400 ATTACATGGTGTTTC-CGTTGCCACACATTTCCTATCCCAGCCAAATGGC 448 |||*|*|*||*|*|**||||||||||||||||*|||||||||*||||||| 396 ATTCCTTCGTTTATGTCGTTGCCACACATTTCTTATCCCAGCTAAATGGC 445 449 GTTTCCCTCTCCTTATTCCACGCCTCGTCGTTCGGGTTACCCATTCAACA 498 *|||||*|||||||||*||||*|||||||||||*||||||||*|*|||*| 446 TTTTCCTTCTCCTTATGCCACACCTCGTCGTTCCGGTTACCCTTCCAATA 495 499 GAACATACAACGGAAACAAGAGTTTCCGCTTGTGGAAGACCCGGAAGTAT 548 |||||||||*||||||*|*|||||||||*|||||||||*|||||||||** 496 GAACATACACCGGAAAGAGGAGTTTCCGTTTGTGGAAGTCCCGGAAGTCC 545 549 CAAAACTGGAAGCGCTATCGCAGTACCCATTCCATAGCACGTTCTCCAAC 598 ||*|||||||||||||||*|||||||*|||*|||***||||||||||||| 546 CAGAACTGGAAGCGCTATGGCAGTACTCATCCCACGTCACGTTCTCCAAC 595 599 CGAACTGTTTGGCGATCCAATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCT 648 *|||||*|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 596 TGAACTATTTGGAGATCCAATCTCCAAACAATATACGCGTAAGGAAATCT 645 649 GTGAAACACAGGAGGGTTCGGAGTATCTGCTGCACAACAATCGTTACATG 698 |||||||*||||||||*|||||||||*|*||*||*||||||||||*|*|| 646 GTGAAACTCAGGAGGGGTCGGAGTATGTCCTCCATAACAATCGTTGCGTG 695 699 ACGTCATATGTCACGTATCCATCAAAAACAAGAACTGGAACGGACAACCG 748 |||||||||||**|*|||||**||||*|||||||||||||||*||||||| 696 ACGTCATATGTATCATATCCTGCAAAGACAAGAACTGGAACGAACAACCG 745 749 CGTTCGTTCCTATATCAAGCTAAAGAGTCTGAACATATCTGGGACATTTG 798 |||||||||*|||||||||||*||||||||*||||||||||||||||||| 746 CGTTCGTTCTTATATCAAGCTGAAGAGTCTCAACATATCTGGGACATTTG 795 799 CTGTTCGTAAATCTGACTTGATGACCGAAGTGGTGCAAACAAATGGTCTA 848 ||||*||*|*|||*|||*|||||||||||||*|*||||||||||||*||| 796 CTGTGCGCACATCGGACATGATGACCGAAGTTGGGCAAACAAATGGGCTA 845 849 TACGGAGTGATGTCTATAGTTGTAGTCCGCGATAAATCTCCAAAGATTTA 898 |||||||||||||||*|||||||||||||*|||||||||||||||||||| 846 TACGGAGTGATGTCTGTAGTTGTAGTCCGTGATAAATCTCCAAAGATTTA 895 899 TTCTGCGACCCAACCTTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGATCTGTTA 948 |||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 896 TTCTGCGACGCAACCGTTAATACCGTTTGTTGAGCTATTTGGATCTGTTA 945 949 ATGCTTGCAGGGGCAGTCTGAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGCTTC 998 ||||||||||*||*||**|*||||||||||||||||||||||||||*||* 946 ATGCTTGCAGAGGAAGGGTTAAAGTGGCAGAACGCCACCATGAACGTTTT 995 999 GTACTTCTGAATCAAACATCCATCGTTGTCAATACCCCACATTCCAACGC 1048 |||||*||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||*||||| 996 GTACTGCTTAATCAAACATCCATCGTCGTCAATACCCCACATTCTAACGC 1045 1049 TATCAAGAAATTCTGCATTCGTAACTGCATCCCAAGAACTTACACAACCT 1098 |||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*| 1046 TATCAAGAAATTCTGCATTCGCAACTGCATCCCAAGAACTTACACAACTT 1095 1099 GGGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCT 1148 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||* 1096 GGGTAACGTTCAAGGACGAAGAAGAAGATAGCTGTACTGGACGATATTCA 1145 1149 AACACCCTCCGAAATGCAATTATTTTATATTATGTATGGTTAAGCGATGT 1198 ||||||||**|||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1146 AACACCCTTAGAAATGCAATTATATTATATTATGTATGGTTAAGCGATGT 1195 1199 ATCCTCACAAGTCGATCTTTACAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGAT 1248 |*|||||||*||||||*|*||*|||||||||||||||||||||||||||| 1196 ACCCTCACAGGTCGATTTGTATAGCAATGTAATTCTTAATTACATTGGAT 1245 1249 AATATATAAAAATGCAGAAGAAACATCTTATTTTTTGAATAAATTTGGCT 1298 *||*|||*||||||||**|||||**|*||||||*||*||||||||||||| 1246 GATGTATGAAAATGCACTAGAAATGTGTTATTTATT-AATAAATTTGGCT 1294 1299 TAAAATTTATTACACGCTCTTCGATACTGGAGCATTTACATTGGATTTTA 1348 ||||||||||||||||**|||*||*|*|||||||*|||||||*|||**|| 1295 TAAAATTTATTACACGTCCTTTGACATTGGAGCAGTTACATTAGATAATA 1344 1349 TACATTGCTCTACAGTCTTCCGTAATTATATCTGCAATCTCTTCCCTTGT 1398 ||||||*||||||*|||||**|||||||||||*||||||||||||||||| 1345 TACATTTCTCTACTGTCTTT-GTAATTATATCAGCAATCTCTTCCCTTGT 1393 1399 AATACTCCCCGCCTGTGATGCCGATGGACCTGGATCAATTGCCGAATCAT 1448 *|||||||||||*|||||*|||||*|||||||||||*|||||||||||*| 1394 GATACTCCCCGCTTGTGAAGCCGACGGACCTGGATCGATTGCCGAATCGT 1443 1449 CCAATCCGCTCAGATTTTTATATGGTCTGCTGGTGACGGACGAAAGTCCG 1498 |||||||||||||*|||||||||||||||||**|||||||||||*||||| 1444 CCAATCCGCTCAGGTTTTTATATGGTCTGCTCATGACGGACGAATGTCCG 1493 1499 ATCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGACCTATAGCCAGATAGGG 1548 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||*|| 1494 ATCTCCGATCTGCTTGCCCATGATTCGTTCGGACCTATTGCCAAATATGG 1543 1549 TACCCGTAACGATCTTGAACTATGTCCCATTAACCTTGAACCATCTACAA 1598 |||*|||||||||||*||||||||||||*||||*|*|||||||||*|||| 1544 TACACGTAACGATCTCGAACTATGTCCCCTTAATCGTGAACCATCGACAA 1593 1599 GACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCCACAGACCAGAAATCAATGTCGTTC 1648 |||||||||||||||||||||||||*||||||||*||||||||*||*||* 1594 GACGCCTTGTTTGTGGTTTGGAACCGACAGACCAAAAATCAATATCATTT 1643 1649 ATAGTGAATTCCTTGGTCTGTATTTCTATCTTTGGTGGTCGGAATTCGAC 1698 |**|||||*|||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||| 1644 ACTGTGAACTCCTTTGTCTGTATTTCGATCTTTGGTGGTCGGAATTCGAC 1693 1699 GTCAGTCGAATGTTTAGCCGACGACAGCTTCAATTTCCCTAGCATCTTAC 1748 *||||||||||||||*|||||*|||||||||||||||||||||||||||| 1694 ATCAGTCGAATGTTTTGCCGAAGACAGCTTCAATTTCCCTAGCATCTTAC 1743 1749 AGAAGTGTACCCCATTCACGACGTTTGTGTTCTCCACTCGGTATTCAACT 1798 |||||||*||*||||||||||||||||*|||||||||||**||||||||| 1744 AGAAGTGCACTCCATTCACGACGTTTGCGTTCTCCACTCTATATTCAACT 1793 1799 CTCCAAGGATTCTTATCCTTGAGAGAGAAGAATGAGGAAGAGTAGTAGTG 1848 ||||||||||||||||||||||||||||||*||||*|||||||||||*|| 1794 CTCCAAGGATTCTTATCCTTGAGAGAGAAGTATGATGAAGAGTAGTAATG 1843 1849 CAGGTTGCAATTGCATTTGATCGGAATTGTGAATTCCGCTTGTTTTGTGT 1898 |||||||||||||||||||||*||||||||*|||||*||||||||||||| 1844 CAGGTTGCAATTGCATTTGATTGGAATTGTAAATTCTGCTTGTTTTGTGT 1893 1899 CCCCCTCCGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTACCACGACATGACCAACA 1948 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1894 CCCCCTCCGTCAATCTCATGTCGTGTATCTCTATCACGACATGACCAACA 1943 1949 GCATTAATTGGAACCTGACTGCGATATTCCAGAACTACGTGATCTATTTT 1998 |||||||||||*||||||*||||||||||*||*||*|||||||||||*|| 1944 GCATTAATTGGTACCTGATTGCGATATTCGAGGACGACGTGATCTATCTT 1993 1999 CATGCATCTATTCCTCAACTGGCTAAGCTTCTGCTCGAACATGGATGGAA 2048 |||||||*||||||||||||||||||**||||||||*|||||*||*|||| 1994 CATGCATTTATTCCTCAACTGGCTAATTTTCTGCTCAAACATCGACGGAA 2043 2049 ATGACAAGGTAACTTCTGCAGCATCGTTTGTGAGAGCGTACTCAACGCGC 2098 ||||||||||*|||||*|*||||||*||||||||*||||||||*|||||| 2044 ATGACAAGGTGACTTCCGTAGCATCATTTGTGAGTGCGTACTCTACGCGC 2093 2099 TCAGATTGAATATACCCACCTACTCCCATACCCATACCATCATTTCCTAT 2148 |||||*||*|||||||||||||||||||*|||||**||*||||||||||| 2094 TCAGACTGTATATACCCACCTACTCCCAGACCCAACCCTTCATTTCCTAT 2143 2149 TGACATATTGGCCGCGCAGCGCAAAACCCACTGAAACACAGAAGGACAGA 2198 ||||||||||*||||||||||*||*||||||***|||**||*|*||**|| 2144 TGACATATTGTCCGCGCAGCGGAACACCCACCAGAACGAAGGAAGATGGA 2193 2199 CTACGATCAAAGAAACCCCGACGAAGAAGAAACCCTAGCAAACAACGAAG 2248 |**|||***|||||||||**|||||||||||||||||*||||*||||||| 2194 CGTCGAAGCAAGAAACCCTAACGAAGAAGAAACCCTACCAAAGAACGAAG 2243 2249 TTGTTTTGCAAAGAACGGATGTAGATGGTTTTATAATGCTATTGCATGTC 2298 ||||||*||||||||*|*|*|||||||||||||||||****||*|||||* 2244 TTGTTTGGCAAAGAAAGAAGGTAGATGGTTTTATAATTGCGTTACATGTG 2293 2299 ATGTCTATGTCATACCAATTACCCTAAAATGAACGGCACATATTTTTCTA 2348 ||||||||*||||**|||*||||*|*|||||||||||||||||||*|||| 2294 ATGTCTATTTCATGACAAATACCATCAAATGAACGGCACATATTTCTCTA 2343 2349 CGAAAAAGGAGTTGTGCATGCATATGGGATGTCTGTTTATTTACGGTATA 2398 |||||||||***|||||*|||*|||*|*||*|*|**|*|*|****||*|| 2344 CGAAAAAGGTAATGTGCCTGCGTATCGCATTT-TACTGAGTGCTTGTGTA 2392 2399 AATTGGAAGCCCAATTTATTT-AATTGGGCTGAAGTTTAAATTCAGAAGA 2447 *||*|||||||||||||||||*||||||||||*|||**||***||||||| 2393 TATGGGAAGCCCAATTTATTTTAATTGGGCTGCAGTACAATGACAGAAGA 2442 2448 AGTCCATGAAATTGGCCCAGCATCCAGGTCCAT-TGTTAAAATGACATCG 2496 ||*||||||||*|||||||*|||**|*||||||*|***||||*|||||*| 2443 AGCCCATGAAACTGGCCCAACATGTAAGTCCATATCCAAAAAAGACATGG 2492 2497 TTTGTGTGTTATTGTGTGTATAGAAGTTAGAGAGAAGCAGCAGTTTCTCT 2546 ***|||*|||*|||**|*||||*||**||||||||||**|*||||||||| 2493 CAGGTGGGTTGTTGGTTCTATATAAAGTAGAGAGAAGTTGGAGTTTCTCT 2542 2547 CTCTAGAACTCATCGGGTGTCTCTCAACTTA-TCTATATAATTGGTGTCT 2595 ||||||||||||||*|||||||||||||||**|||||*|||||||||||| 2543 CTCTAGAACTCATCTGGTGTCTCTCAACTTTCTCTATGTAATTGGTGTCT 2592 2596 GGAGTCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTGTGAA 2645 |||||||*|||||||||||||||||||||||||||*|||||||||*||*| 2593 GGAGTCCCATATATAGGTAAGACACCATATGGCATAATTGTAATTCTGGA 2642 2646 AAGAAAATTACTTTAATTCAAATTCCCTATAGCGGCCTTTCGTATAATAT 2695 ||||||||||||||||*|||||*||||||*|||||||||||||||||||| 2643 AAGAAAATTACTTTAACTCAAAATCCCTAAAGCGGCCTTTCGTATAATAT 2692 2696 T 2696 | 2693 T 2693