NC_004611 AY939926 1 TAATATTACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTAGGTGGGCCCTCAACCAATG 50 *******||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1 -------ACCGAATGGCCGCGCAAATTTTTAGGTGGGCCCTCAACCAATG 43 51 AAATTCACGCTACATGGCCTATTTAGTGCGTGGGGATCAATAAATAGACT 100 ||||||||||||||||||*|||||||||********************** 44 AAATTCACGCTACATGGCTTATTTAGTG---------------------- 71 101 TGCTCACCAAGTTTGGATCCACAAACATGTGGGATCCATTATTGCACGAA 150 *********************************||||||||||||||||| 72 ---------------------------------ATCCATTATTGCACGAA 88 151 TTTCCCGAAAGCGTTCATGGTCTAAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 200 |||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 89 TTTCCAGAAAGCGTTCATGGTCTAAGGTGCATGCTAGCTGTAAAATATCT 138 201 CCAAGAGATAGAAAAGAACTATTCACCAGACACAGTCGGCTACGATCTTA 250 ||||||||||||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||* 139 CCAAGAGATAGAGAAGAACTATTCCCCAGACACAGTCGGCTACGATCTTG 188 251 TTCGAGATCTCATTCTTGTTCTCCGAGCAAAGAACTATGGCGAAGCGACC 300 |*|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 189 TCCGAGATCTCATTCTTGTTCTCCGAGCAAAGAACTATGGCGAAGCGACC 238 301 AGCAGATATCATCATTTCAACGCCCGCATCGAAGGTACGCCGACGTCTCA 350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 239 AGCAGATATCATCATTTCAACGCCCGCATCGAAGGTACGCCGACGTCTCA 288 351 ACTTCGACAGCCCCTATGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 289 ACTTCGACAGCCCCTATGGAGCTCGTGCAGTTGTCCCCATTGCCCGCGTC 338 401 ACCAAAGCAAAGGCCTGGACCAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 450 ||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 339 ACAAAAGCAAAGGCCTGGACCAACAGGCCGATGAACAGAAAACCCAGAAT 388 451 GTACAGAATGTATAGAAGTCCCGACGTGCCAAGGGGCTGTGAAGGCCCTT 500 |||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||| 389 GTACAGAATGTATAGGAGTCCCGACGTGCCAAGGGGCTGTGAAGGCCCTT 438 501 GTAAAGTGCAGTCCTTTGAATCTAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 550 ||||*||||||||*|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 439 GTAAGGTGCAGTCTTTTGAATCTAGGCACGATGTCTCTCATATTGGCAAA 488 551 GTCATGTGTGTTAGTGATGTTACCCGAGGAACTGGACTCACACATCGCGT 600 ||||||||*||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 489 GTCATGTGCGTTAGTGATGTTACTCGAGGAACTGGACTCACACATCGCGT 538 601 AGGGAAGCGATTCTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGAAAGATATGGA 650 *|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*|||||||||| 539 GGGGAAGCGATTTTGTGTGAAATCTGTCTATGTGCTGGGGAAGATATGGA 588 651 TGGATGAAAACATCAAGACAAAAAACCATACTAACAGTGTCATGTTTTTT 700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 589 TGGATGAAAACATCAAGACAAAAAACCATACTAACAGTGTCATGTTTTTT 638 701 CTGGTTCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCTCCCCAGGATTTCGGGGAAGT 750 *|*||||||||||||||||||||||||||*||*||*|||||*|||||||| 639 TTAGTTCGTGACCGTCGTCCTACAGGATCCCCTCAAGATTTTGGGGAAGT 688 751 GTTTAATATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 800 *|||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 689 TTTTAACATGTTTGACAATGAACCGAGCACAGCAACGGTGAAGAACATGC 738 801 ATCGTGATCGTTATCAAGTCTTACGGAAGTGGCATGCGACTGTGACGGGA 850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 739 ATCGTGATCGTTATCAAGTCTTACGGAAGTGGCATGCGACTGTGACGGGA 788 851 GGAACATATGCATCTAAGGAGCAAGCATTAGTTAGGAAGTTTGTTAGGGT 900 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 789 GGAACATATGCATCTAAGGAGCAAGCATTAGTTAGGAAGTTTGTTAGGGT 838 901 TAATAATTATGTTGTTTATAATCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 950 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 839 TAATAATTATGTTGTTTATAATCAACAAGAGGCCGGCAAGTATGAGAATC 888 951 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTATATGGCCTGTACTCACGCATCAAAT 1000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 889 ATACTGAAAACGCATTAATGTTGTATATGGCCTGTACTCACGCATCAAAT 938 1001 CCTGTATATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTACTTTTATGATTCGGCCAC 1050 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*||| 939 CCTGTATATGCTACTTTGAAAATCCGGATCTACTTTTATGATTCGGTCAC 988 1051 AAATTAATAAATATCCAGTTTTATATCATACGAAGTCCATACATCAATTG 1100 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 989 AAATTAATAAATATCCAGTTTTATATCATACGAAGTCCATACATCAATTG 1038 1101 TTTGCTCCAATACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1150 ||**|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1039 TTCCCTCCAATACATTATCCAATACATGATAAACTGCTCTTATTACATTA 1088 1151 TAAATTCCTATGACACCTAACATATCCAGGTACTTAAGGACCTGGGTTTT 1200 |||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||||| 1089 TAAATTCCTATGACACCTAACATATCCAGGTACCTAAGGACCTGGGTTTT 1138 1201 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1250 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1139 GAAGACTCTCAAGAAAATCCCAATCTGAGGGCGTAAGCCCGTCCAGATTT 1188 1251 TGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGTCCCAGGGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1189 TGAAAGTTAGAAAACACTTGTGAAGTCCCAGGGCTTTCCGCAGGTTGTGG 1238 1301 TTGAACTGTATTTGAATCTTGATTATGTCGTGCTGTGTTAGGAAGGGCCT 1350 |||||*|||||||||||||||||*|||||||||||||||||||||||||| 1239 TTGAATTGTATTTGAATCTTGATGATGTCGTGCTGTGTTAGGAAGGGCCT 1288 1351 GCTGTCGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1400 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1289 GCTGTCGTGTTTCAAAATTTTGAAATACAGGGGATTTCGAATTTCCCAGG 1338 1401 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGTATTCCCCTGTGCGT 1450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||| 1339 TATATACGCCACTCTCTGCTCGATCCGCAGTGATGTACTCCCCTGTGCGT 1388 1451 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATCGATATGTAATACGAACAACCACACG 1500 ||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||*|||*||||||| 1389 GAATCCGTGATCATGGCAGTTGATCGATATATAATACGTACACCCACACG 1438 1501 GTAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGGGAGAGC 1550 **|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|*|||| 1439 TCAGATCAACTCGCCTCCTGCGAATGCTCTTCTTCTTCTTCTGTGGGAGC 1488 1551 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATGAAGACTG 1600 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1489 GATGTTTTCGCGACCGGAATAGAGTGGTTCTTCGAGTGTGATGAAGACTG 1538 1601 CATTCTTGATTGCCCACTGCTTCAGTGCTGCATTTTTTTCTTCATCCAGA 1650 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||| 1539 CATTCTTGATTGCCCACTGCTTCAGTGCTGCATTTTTTTCTTCGTCCAGA 1588 1651 TATTCCTTATAGCTGCTGTTTGGACCTTTATTGCACAGGAAGATAGTGGG 1700 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1589 TATTCCTTATAGCTGCTGTTTGGACCTTTATTGCACAGGAAGATAGTGGG 1638 1701 AATTCCACCTTTAATCATGACCGGCTTTCCGTACTTCGTGTTGCTTTGGC 1750 |||*|||||||||||||||||*||||||||||||||||||||||||||*| 1639 AATACCACCTTTAATCATGACTGGCTTTCCGTACTTCGTGTTGCTTTGCC 1688 1751 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGGGGA 1800 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1689 AGTCACGCTGGGCCCCCATGAATTCTTTAAAGTGCTTTAGATAGTGGGGA 1738 1801 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCATCATTGCTATAGACCTTTGG 1850 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||| 1739 TCAACGTCATCAATGACGTTGTACCAGGCATCATTGCTATACACCTTTGG 1788 1851 GCTCAGATCAAGATGTCCACACAAGTAATTGTGTGGTCCTAAGCACCGAG 1900 |||||||||||||||||||||*|||||||||||*|||||||||||*|||| 1789 GCTCAGATCAAGATGTCCACATAAGTAATTGTGGGGTCCTAAGCAACGAG 1838 1901 CCCACATCGTTTTGCCCGTCCTACTATCCCCCTCTATGACTATGCTTATG 1950 |||||||*|||||*||*||*|||||||||||||||||||||||||||||| 1839 CCCACATTGTTTTCCCTGTTCTACTATCCCCCTCTATGACTATGCTTATG 1888 1951 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACAACATTAGACGAGACCCAATC 2000 |||||||||||||||||||||||||||||||||||******|*||||||| 1889 GGCCTAAAAGGCCGCGCAGCGGCACACACAACATTGACACTGGCCCAATC 1938 2001 GACGAGGTCTGCCGGAACTCTGTCGAAGGATGAAATTGAAAATGGAGAAA 2050 |||*||*||||**||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 1939 GACAAGTTCTGGAGGAACTCTGTCGAAGGATGAAATTGAAAATGGAGAAA 1988 2051 CATAAACCTCGGAAGGAGGTTGAAAAATACGATCTAAATTGGTATTTAAA 2100 |*||||||||*|||*|||||||||||||*||||||||||||*|**||||| 1989 CGTAAACCTCAGAACGAGGTTGAAAAATGCGATCTAAATTGCTTATTAAA 2038 2101 TTGTGAAACTGCAGAACGTAATCTTTTGGGGCTAATTCCTTTAATACTCT 2150 |||||||||||||||||*|||||*||||||||||||||||||||||||*| 2039 TTGTGAAACTGCAGAACATAATCCTTTGGGGCTAATTCCTTTAATACTTT 2088 2151 CAAAGCATCGTCTTTATTTCCCGTGTTAATCGCCTGGGCATATGCATCGT 2200 *||*|||||*||||||||*||||||||||||||||**||||||||*|||| 2089 TAATGCATCTTCTTTATTCCCCGTGTTAATCGCCTTAGCATATGCGTCGT 2138 2201 TCGCCGTTTGTTGACCACCACGGGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2250 |*||*||*||*|||||||||||*||||||||||||||||||||||||||| 2139 TGGCTGTCTGCTGACCACCACGAGCAGATCGTCCATCGATCTGGAAAACA 2188 2251 CCCCATTCTAGAACGTCTCCATCTTTGGCGATGTAGTTTTTGACGTCCGA 2300 |||||||||||||||||||||||||||*|||||||***||||||*||*|| 2189 CCCCATTCTAGAACGTCTCCATCTTTGTCGATGTATGCTTTGACATCTGA 2238 2301 CGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCGACTTG 2350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2239 CGCTGATTTAGCTCCCTGAATGTTCGGATGGAAATGTGCTGACCGACTTG 2288 2351 GGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTTTTGCACTGGAATTTCCCTTCG 2400 ||||||||||||||||||||||||||||*||||||||||||||||||||| 2289 GGGAAACCAAGTCGAAGAATCTGTTATTCTTGCACTGGAATTTCCCTTCG 2338 2401 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCTTCGTGAAGCTCTCT 2450 |||||||||||||||||||||||||||||||||||*|||||||||||||| 2339 AATTGGATGAGAACATGGATATGCGGAGACCCATCCTCGTGAAGCTCTCT 2388 2451 ACAGATCTTGATGAATTTCTTCTTCGTCGGGGTTTCTAGGGTTTGCAATT 2500 ||||||||||||||||||||||***||*|||||||||||||||||||||| 2389 ACAGATCTTGATGAATTTCTTCGCAGTTGGGGTTTCTAGGGTTTGCAATT 2438 2501 GGGAGAGTGCCTCTTCTTTAGTTAGAGAGCACTTTGGATATGTGAGGAAA 2550 ||||*||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2439 GGGAAAGTGCCTCTTCTTTAGTTAGAGAGCACTTTGGATATGTGAGGAAA 2488 2551 TAGTTTTTGGCATTTACTCTAAAACGACGTGGCGAAGCCATAAAACTTGT 2600 |||||||||||||*||*|||*|||||||||||||*||||||||||||||| 2489 TAGTTTTTGGCATCTATTCTGAAACGACGTGGCGGAGCCATAAAACTTGT 2538 2601 CGTTTTGATTCGGCGTCCCTCAACTTA-TCTATATGATTGGTGTCTGGAG 2649 ||||||||||||||||||||||||||**|||||*|*|||||*||||||*| 2539 CGTTTTGATTCGGCGTCCCTCAACTTCCTCTATGTAATTGGCGTCTGGCG 2588 2650 TCCTATATATAGGTAAGACACCATATGGCATTATTGTAATTTTGAAAAGA 2699 |||*|||||||||||*|||*|*|*||||||**|||||||||||||||||| 2589 TCCCATATATAGGTAGGACGCTAAATGGCAGAATTGTAATTTTGAAAAGA 2638 2700 AAATTACTTTAATTCAAATTCCCTAAAGCGGCCATTCGTA------ 2739 ||||||||||||||||||*|||**|*|||||||||||||******* 2639 AAATTACTTTAATTCAAAATCCTCATAGCGGCCATTCGTTAATATT 2684